Субстраты и их аналоги

Общее свойство гликозидаз — довольно высокое сродство их активных центров к отщепляемому моносахаридному остатку. Как правило, величина константы ингибирования для моносахаридов — ПродуКТОВ ферментативного гидролиза — близка к величине константы Михаэлиса для соответствующего субстрата. Аналоги или некоторые производные таких моносахаридов являются, по-видимому, наиболее эффективными конкурентными ингибиторами гликозидаз, известными к настоящему времени. В качестве приме- [c.28]

Субстраты, аналоги субстратов, ингибиторы [c.130]

Концентрация субстрата [5] как аналог концентрации компонента газовой смеси в мембране зависит от скорости его поступления извне / (5) и расхода в реакции Т г(5) [c.35]

Селекция устойчивых микроорганизмов к токсичному субстрату в проточных условиях или в почвенных колонках облегчается при наличии в среде субстрата - аналога. [c.341]

На рис. 39, а дана найденная на опыте зависимость левой части уравнения (4.17) от концентрации и природы соли. Для сравнения на рис. 39, б приведено изменение с концентрацией той или другой соли коэффициентов активности бензола и его производных. Эти соединения следует рассматривать как структурные аналоги боковой цепи в молекуле субстрата (они же являются классическими конкурентными ингибиторами). При сравнении рис. 39, а н б видно, что эффективность образования комплекса Михаэлиса изменяется с ионной силой при [c.144]

И для таких случаев рассматривалась возможность влияния каких-то других сил па суммарный поток. Кроме того, предполагалось, что степень аномальности потоков, т. е. в какой мере они отклоняются от приведенных простых соотношений, может дать представление о величине этих внешних сил, какова бы ни была их природа. Измерения отношения потоков при попытке выяснить природу потока воды привели к представлению об объемном потоке , согласно которому молекулы воды движутся через мембрану не по отдельности, а в виде кластеров. В ряде близких по существу исследований были измерены аномальные потоки ацетамида и тиомочевины при наличии осмотического потока воды, и из этих опытов был сделан вывод, что данные субстраты — аналоги мочевины, — проникая через эпителиальные мембраны, пользуются водными каналами, причем растворитель несет субстраты, усиливая их поток. [c.195]

Энергети- ческий Да, субстрат, аналог (+) Нет Да, более выгодн. субстрат Нет Да, субстраты (+), (-) Да, АТР -) АМР, ADP (+) [c.99]

Катионные ПАВ, полученные из аналогов в (—)-эфедрина, обнаруживают различную каталитическую эффективность при гидролизе д-нитрофениловых эфиров о- и ь-миндальной кислоты [165]. Для о ( — )-изомера ПАВ гидролиз рацемической смеси протекает медленнее, чем гидролиз энантиомеров можно предположить, что в каждую мицеллу включается больше одной молекулы субстрата. Следовательно, энантиомерная молекула субстрата нарушает мицеллярную структуру и образующийся комплекс [c.290]

В разд. 1.1 межфазный катализ был определен как двухфазная реакция между солями (в твердой форме или в виде водных растворов), кислотами или основаниями и субстратами, находящимися в органических растворителях, протекающая в присутствии так называемых межфазных катализаторов. Типичными представителями таких катализаторов являются ониевые соли или вещества, образующие комплексы с катионами щелочных металлов, такие, как краун-эфиры, криптанды или их аналоги с открытой цепью. Как уже указывалось в разд. 1.1, определение МФК основано скорее на наблюдаемых эффектах, а не на каком-либо едином механизме. Впрочем, широкие исследования этих эффектов привели к выяснению механизма многих реакций МФК. [c.44]

Используя аналогию, можно полагать, что приток субстрата S< S соответствует сорбции компонента газовой смеси на по- [c.34]

Наличие алкильных групп или цепей также может влиять на биологическую активность субстрата или лекарственного препарата. Интересны в этом отношении антималярийные препараты — производные 6-метокси-8-аминохинолина (1-29) (аналоги прима-хина). Активность соединений, для которых п — любое число от [c.24]

Из двух этих примеров следует, что для функционирования полимера как эффективного катализатора должно соблюдаться определенное соотношение между нейтральными и ионизованными группами в полимере. Полиметакриловая кислота и поли-4-винил-пиридин можно рассматривать соответственно как анионную и катионную смолы (по аналогии с ионообменными смолами). Лет-цингер одним из первых нашел применение способности субстрата связываться с полимерным катализатором, пользуясь концепцией электростатического взаимодействия. [c.295]

Внутримолекулярное (псевдомономолекулярное) превращение фермент-субстратного комплекса. Кинетические закономерности катализа в условиях, когда фермент насыщен субстратом (при [КУ] >> К ), несколько другие. В этом случае кинетика ферментативного процесса определяется внутримолекулярным химическим превращением комплекса ХЕ-ЯУ и следует уравнению (2.8). Это уравнение удобно записать по аналогии с (2.17) иначе [c.41]

Константы скоростей комплексообразования субстратов (или их аналогов) с различными ферментами [см. схему (6.9)] [c.271]

Чтобы определить химическую основу связывающей способности тиаминзависимых ферментов, была изучена [337] реакция тиамин-РР и метилацетилфосфоната в водном растворе карбоната натрия. Этот субстрат — аналог пировиноградной кислоты — связывается с пируватдегндрогеназой, но не может участвовать во всех многостадийных ферментативных процессах. [c.466]

Субстрат - индуктор и источник питания ксенобиотик (косубстрат) -не индуктор и не источник питания. Такая ситуация характерна для трансформации галогенсодержащих соединений при росте на негалогенированных субстратах-аналогах. Происходит частичное превращение косубстрата и накопление продуктов трансформации. После утилизации субстрата рост микроорганизмов прекращается, но в результате действия индуцированной ферментной системы трансформация косубстрата [c.365]

Индекс класскф. фермент. Наименование фермента Источник выделения Колич. субъед. Признаки флип- флоп — механиз- ма Субстраты, аналоги субстратов, ингибиторы Лит. [c.134]

Идея самоуничтожающихся ингибиторов или инактиваторов ферментов может получить широкое распространение, если хими-кам-органнкам удастся синтезировать правильно спроектированные аналоги субстратов определенных ферментов. Естественно, что создание новых самоуничтожающихся инактиваторов ферментов подразумевает все более высокий уровень химических знаний. В основном работы по самоуничтожающимся ингибиторам выполнены на кепротеолитических ферментах, в частности на пиридоксаль- и флавинзависимых ферментах. [c.452]

Амфибо- лический Иногда Иногда Иногда Иногда Да, субстраты, аналоги (+) Да, конечные продукты (-) АТР (-) ADP (+) [c.99]

Помимо изученных стадий, в реакциях аспартатаминотранс-феразы наблюдали более быстрые спектральные изменения, кинетику которых нельзя было проанализировать при использовании методики температурного скачка. С целью замедления скорости этих реакций было исследовано взаимодействие с ферментом некоторых модифицированных субстратов. Аналог субстратов — Ь-а-метиласпарагиновая кислота — является конкурентным ингибитором аминокислотных субстратов. Она не способна образовывать альдимин с пиридоксальфосфатом на ферменте. Однако из-за наличия метильной группы в а-положении трансаминирование протекать не может. ВСинетическое изучение этой системы комбинированным методом остановленной струи — температурного скачка обнаружило, что реакция протекает в три стадии [c.182]

Кинетические модели трансформации органических веществ основаны на аналогиях с простейшими моделями химических, биохимических, трофодинамических (связи субстрат — организмы или хищник —жертва ) процессов (табл. VI-3). Наиболее широко используется химическая аналогия, особенно уравнение простой реакции 1-го порядка. Широкое использование этого-уравнения объясняется его простотой и возможностью легко рассчитывать константу скорости по экспериментальным данным, а также получать аналитические решения упрощенных уравнений турбулентной диффузии неконсервативного вещества. [c.151]

Можно провести много аналогий между гетерогенным ката лизом при полимеризации олефинов и тем способом, которьш осуществляется катализ природных химических реакций, в ча стности ферментативный катализ. Действительно, гетерогенны катализ во многих отношениях напоминает ферментативный. Мо лекула субстрата сталкивается с активным центром на поверхно сти твердого катализатора, образуя адсорбционный комплекс Адсорбированный субстрат реагирует в одну или несколько ста дий под влиянием каталитических групп активного центра. на конец продукт десорбируется (пли удаляется) из активного цент ра. Таким образом, и для ферментативного, и для гетерогенного катализа говорят об активном центре и образовании комплекса субстрата с активным центром. Осмысление этих понятий помогает сопоставить неферментативный и ферментативный катализ. Тем не менее существует и принципиальное различие, поскольку большипстпо ферментов несут только один активный центр па молекулу, тогда как в гетерогенных катализаторах на одну ча- [c.198]

Субтнлизин, сериновая протеаза бактериального происхождения, также проявляет, подобно а-химотрипсину, обращенную специфичность к D-K TI [103]. Это предполагает, что оба фермента обладают сходной специфичностью к конфигурации их субстратов. Такая общая специфичность ясно подтверждает близкую структурную аналогию первичных связывающих центров обоих ферментов, и, более того, она отражает эту аналогию. Близкая структурная аналогия объясняет, каким образом а-химотрипсин и субтилизин, имеющие абсолютно разное филогенетическое происхождение, в действительности замораживают свои субстраты в одинаковой активной конформации. [c.234]

Однако в 1968 г. Белло и Шевалье синтезировали из дифенового ангидрида уникальный фиксированный субстрат 3-метоксикарбо-нил-2-дибензазоцинон-1 [106]. Это бифенильное соединение с 2,2 -мостиком представляет собой аналог метилового эфира Ы-бензоил-фенилаланина (ВРМЕ). [c.235]

Используемая для краун-эфиров сокращенная номенклатура довольно проста первое число означает общее число атомов в кольце, а второе — общее число гетероатомов. Легко усмотреть аналогию между такими комплексами, имеющими полость для связывания лиганда Ь, и активным центром фермента, специфически узнающим свой субстрат. Размер макроцикла может меняться и тем самым обеспечивать связывание лигандов разных размеров. Циклические полиэфиры типа краун сравнительно легко можно получить и подвергнуть разнообразным структурным модификациям. Эту область химии Крам предложил назвать химией до-норно-акцепторного комплексообразования [134—136]. Напомним также о гипотезе замка и ключа , предложенной Фишером в 1894 г. для описания структурного соответствия между ферментом и его субстратом в ферментсубстратном комплексе. Помимо ферментативного катализа и ингибирования комплексообразование играет первостепенную роль в таких биологических процессах, как репликация, хранение и передача генетической информации, иммунный ответ и транспорт ионов. В настоящее время накоплено уже достаточно сведений о структуре таких комплексов, чтобы подтолкнуть химиков-органиков к созданию высокоструктурированных молекулярных комплексов и к изучению специфического химизма процессов комплексообразования. [c.266]

С этой целью в группе Гутри планируется синтезировать сте-роидимидазольный дпмер путем соедпиеиия двух кетонных аналогов ароматическим диамином. Предполагается, что в полученной трехмерной молекуле субстрат будет проглочен димерным ката-лизат< гром, в пастп которого гидрофобное связывание возникает уже с двух сторон реакционного центра субстрата. Пока получено бис(11)-кетопроизводное, и для него наблюдалось 1000-кратное увеличение скорости ио сравнению со скоростью реакции, катализируемой имидазолом. [c.316]

Напротив, субстраты, производные диазометилкетона, могут эффективно использоваться как специфичные к активному центру ингибиторы тиоловых протеаз. Например, карбобензоксифенилала-ниновый аналог реагирует стехиометрически с остатком цистеина [c.449]

Ароматические обратимые конкурентные ингибиторы. Яркие корреляции между ферментативным (4.10) и модельным (4.11) процессами обнаруживают данные, полученные для производных бензола [83, 84]. Эти соединения можно рассматривать как аналоги боковой группы R в молекуле специфических субстратов (фенилаланин, тирозин). В ряду монозамещенных бензолов отчетливо выявляются две группы ингибиторов (рис. 36). Если ввести в молекулу бензола (точка /) гидрофобный заместитель (точки 2—7), то это приводит к резкому усилению ингибирующих свойств данного соединения. Поскольку наклон соответствующей прямой IgKi—lgP равен единице, т. е. фактически имеем [c.139]

Термин полимерный субстрат обычно означает, что данный полимер служит объектом действия на него фермента. В ряде случаев в роли полимерных субстратов используются и синтетические поли- или олигомеры, но они, как правило, моделируют поведение природных полимеров и их фрагментов. Синтетические олигомеры зачастую более доступны, чем их природные аналоги, и их можно приготовить практически однородными (гомополимер-ными) в отношсиуи химической последовательности, в то время как природные полимеры, выделенные из клеток животного, растительного или микробного происхождения, могут содержать дефекты (в химическом отношении, а не с точки зрения биологической целесообразности). Именно этим вызвано в последнее время все возрастающее применение синтетических поли- и олигомеров для изучения механизма их ферментативной деструкции. [c.6]

Благодаря тому что кристаллы лизоцима, как и все известные кристаллы белков, содержат в большом количестве воду, молекулы многих водорастворимых веществ могут диффундировать в них без особых затруднений. Это позволило Филлипсу с сотр. в 60-х годах выполнить еще одну пионерскую работу — провести рентгеноструктурное изучение фермент-субстратного комплекса, точнее комплекса лизоцима с низкомолекулярным аналогом субстрата, три-Ы-ацетилхитотриозой. Схема, показывающая взаимодействия между лизоцимом и трисахаридом, показана на рпс. 17. На основа1ши полученных данных авторы работы [18] заключили, [c.150]

Лизоцим в зависимости от условий кристаллизуется с образованием ряда полиморфных форм — тетрагональной, триклииной, моноклинной, орторомбической [29, 30]. Наиболее известна тетрагональная структура, с использованием которой и было получено большинство рентгеноструктурных данных. По мнению самого Филлипса [5], тетрагональная структура кристаллического лизоцима имеет один серьезный недостаток — молекулы фермента в ней подходят друг к другу особенно плотно и взаимодействуют в области участков Е и Р активного центра, что не позволяет наблюдать связывание сахаров с данными участками без разрушения кристаллов. Это, видимо, стимулировало изучение других кристаллических форм лизоцима [29—31], хотя и без особого успеха в выявлении новых деталей строения активного центра и механизма его действия. Более того, выяснилось, что триклигшый лизоцим еще менее пригоден в данном отношении для исследований, поскольку у него в кристаллической ячейке взаимно блокированы три участка активного центра — О, Е и Е [32, 33]. По предварительным данным, моноклинная и орторомбическая формы кристаллического лизоцима страдают тем же недостатком [34, 34а]. В настоян ее время надежды возлагаются на лизоцимы из других источников, такие как лизоцим из белка яиц черепахи [34], четвертичная структура которого практически идентична лизоциму из белка куриных яиц, но кристаллы содержат аномально большое количество воды. Возможно, и этом случае активный центр фермента будет более доступен для аналогов субстрата и эффекторов и соответствующий рснгеноструктурный анализ приведет к более определенным выводам о топографии связывающих участков активного центра. [c.154]

Помимо того что приведенные данные в принципе не могут служить указанием на существование деформации или напряжения субстрата в комплексе Михаэлиса, они, но мнению Чинмана и сотр. [89], вообще нуждаются в пересмотре. До последнего времени все расчеты по эффективности связывания сахаридных остатков субстратов и их фрагментов (аналогов) с отдельными участками (от А до F) активного центра лизоцима основывались на предположении, выдвинутом ранее Филлипсом [2, 18, 20], что конформация фермента в этих участках, расположение сахаридных звеньев в различных фермент-субстратных комплексах и эффективность взаимодействия сахаридных остатков с участками не изменяются при вариации субстратов. Это предполагаемое свойство системы, получившее название суперпозиции (см. [89]), в свою очередь, означало аддитивность величин свободных энергий взаимодействия сахаридных остатков с соответствующими [c.165]

В связи с тем что деформация субстратов нри нековалентном связыванин с лизоцимом маловероятна, особого внимания заслуживают так называемые аналоги переходного состояния в катализе лизоцимом [23, 90], или соединения, способные очен > эффективно связываться с ферментом и обладающие структурой, по ряду признаков подобной структуре субстрата в переходном состоянии реакции. Наиболее известным аналогом переходного состояния в катализе лизоцимом является 6-лактон, полученный окислением восстанавливающего сахаридного кольца 1 -ацетил-хитотетраозы [c.166]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология