Таксономический анализ

Таксономический анализ — это классификация и систематизация сложноорганизованных ПО, имеющих обычно иерархическую структуру. В результате таксономического анализа выделяют соподчиненные группы объектов ПО, называемые таксонами. [c.119]

Содержание Постановка задачи и план исследования. Обмен вопросами и ответами. Анализ ответов — система анализа в применении. Ограниченные и разработанные коды и процесс ответа на вопрос. Ответы пятилетних детей на вопросы с вопросительными словами (частные вопросы). Ответы матерей на вопросы детей. Ответы на частные вопросы и их отношение к теории Бернштейна. Приложение А — образцы транскрипций ответов матерей и детей обоснованность содержания таксономической схемы — эмпирические данные таксономическая схема — резюме и выводы. Приложение Б — схема записи ответов на вопросы с вопросительными словами. Приложение С — вопросы семилетних детей. [c.206]

Вторым этапом построения ФР-прототипов является таксономический анализ понятий ПО. На рис. 4.3 показаны таксономические схемы (иерархические структуры) понятий объектов [c.123]

В дальнейшем сравнивались особенности психофизиологической реактивности детей 7-8 лет в каждой из вьщеленных в результате таксономического анализа групп. [c.414]

Наконец, следует отметить еще одну важную особенность рассматриваемого метода конформационного анализа. Она явилась прямым результатом исследования простейших пептидов и заключается в создании структурной классификации аминокислотных последовательностей, охватывающей все многообразие пространственных форм и обоснованной экспериментально и теоретически. Главная ценность разделения пептидных структур на конформации, формы и шейпы состоит во впервые появившейся возможности перейти от необходимости анализа всех комбинаций низкоэнергетических конформаций свободных аминокислотных остатков, образующих данный пептид (их количество превышает 10", где п - число остатков в цепи), к анализу отдельных представителей, дающих объективную информацию о конформационных вариантах больших таксономических групп. [c.250]

В обзорной статье И. Н. Блохиной и Г. Ф. Левановой [24] приведено более 600 таксонов микробов, у которых определялось содержание ГЦ. Авторы приводят значительное число исследований, в которых определение соотношения нуклеотидов позволило уточнить или изменить систематическое положение отдельных видов бактерий. Резюмируя критический анализ литературы, авторы заключают, что данные о составе ДНК широко и с успехом применяются для выяснения таксономического положения родов и видов бактерий. [c.54]

Стандартный метод определения числа сапрофитных микроорганизмов за многие годы применения в практике санитарно-бактериологического анализа не претерпел существенных изменений. Это связано, вероятно, с тем, что этим методом определяют не какую-либо таксономическую единицу, а группу микроорганизмов, объединяемых едиными требованиями к условиям питания, температуре инкубации, близким по интенсивности развития при этих условиях. Сравнимые результаты могут быть получены только при строгом соблюдении всех условий метода — стандартная питательная среда, единая температура и сроки выращивания. [c.72]

Способность ДНК разного происхождения к гибридизации находится в строгой зависимости от наличия у них участков, идентичных по первичной структуре. Соответственно гибридологический анализ дает возможность выявлять степени сходства и различия между ДНК разного происхождения. Сведения подобного рода необычайно ценны при таксономических и генетических исследованиях. Гибридологический анализ НК как метод молекулярной биологии, несомненно, займет исключительно важное место в зарождающейся сейчас новой области биохимии — биохимической генетике и эволюции. [c.108]

Форма и размеры разных микроорганизмов описаны в таксономической литературе, однако следует помнить, что они могут изменяться в зависимости от условий культивирования. При анализе массопереноса и теплопередачи в биореакторах, а также процессов отделения микроорганизмов от конечного продукта часто пользуются понятием эквивалентный размер ( диаметр эквивалентной сферы ). Этот термин применяется - для [c.456]

Таким образом, полное определение у всех видов или же по крайней мере в действительно обширных выборках — вот идеал, к которому надо стремиться. В конце концов мы можем надеяться, что химический анализ станет неотделимой частью таксономического метода, но ясно, что время для этого еще не пришло. В целях экономии было бы хорошо, если бы скудный растительный материал использовался для проведения максимально возможного числа различных анализов (см. [5]). Далее, ввиду того что неизбежно царство растений на протяжении многих лет будет слабо охвачено химическими исследованиями, следует признать, что концентрация сил на обследовании ограниченного числа групп растений, представляющих, по общему мнению, особый интерес, была бы весьма полезной это позволило бы тщательно изучить эти таксоны вместо того, чтобы расходовать усилия на поверхностное изучение многих групп. Несомненно, концентрация усилий наиболее быстро выявила бы истинные возможности химической таксономии. (Обычная систематика испытывает такую же потребность, ибо многие систематики-практики согласятся, что рода и семейства необходимо пересматривать в мировом масштабе, а не в масштабе региональных флор, что неизбежно оставило бы коренные проблемы нерешенными.) [c.96]

Мы закончим этот раздел попыткой оценить действительный и потенциально возможный вклад исследования фенолов в таксономию и филогению растений. Рассмотрим сначала таксономию, которую мы определили выше как упорядоченное расположение растений в иерархической классификации, основанной на произвольно выбранных уровнях морфологического подобия. Изучение фенольных соединений может быть очень полезным для этой области но какие именно вещества оказались бы интересны, зависит от исследуемой группы растений и от таксономической шкалы, как отмечено выше. Если бы был проведен достаточно полный анализ растительного материала, то, несомненно, химические признаки можно было бы вместе с обычными морфологическими признаками использовать в системе классификации, что увеличило бы точность распознавания таксонов ). Однако на самом деле вклад химических исследований в систематику очень мал главным образом потому, что химическая информация является относительно скудной для эффективного включения ее в систему классификации, которая, несмотря на недостатки, основана на огромном количестве отдельных наблюдений и на принципе определения признаков у всех компонентов таксономических единиц. Это, конечно, серьезный аргумент в пользу программы, предложенной нами ранее в этой главе, а именно за сосредоточение усилий на таксономических единицах умеренной величины (родах или небольших семействах), о которых известно, что они химически гетерогенны и все еще представляют таксономические трудности. Однако необходимо повторить, что действительно удовлетворительными будут только определения исчерпывающие и, еще лучше, многократно повторенные. [c.98]

Несмотря на многие обнадеживающие начинания, исследования фенольных веществ мало влияли на классическую таксономию, и, возможно, еще пройдет много лет, прежде чем это произойдет, т. е. прежде чем данные химического анализа действительно помогут систематику-практику в его решениях. В филогенетических исследованиях, однако, положение представляется более обнадеживающим перейдем теперь к его рассмотрению. Как описано выше, обычно считают, что коррелированное наличие у различных таксономических единиц ряда независимых признаков указывает на общее происхождение, т. е. на филогенетическую связь между таксонами, имеющими общие признаки. Говорят, что такие таксономические единицы — естественные и такое утверждение всегда влечет за собой филогенетические выводы. Конечно, на всех уровнях таксономии существуют все степени естественности — от таксонов, для которых не может быть проведена естественная группировка (и с которыми соответственно очень трудно работать), до таких, в которых естественная классификация напрашивается даже при поверхностном ознакомлении. Химические признаки были (и, по-видимому, должны быть) наиболее полезными на промежуточных уровнях, т. е. на тех уровнях, где на основании обычных процедур систематики можно было предположить наличие филогенетических связей, но которые нельзя было считать окончательными из-за ненадежных корреляций или отсутствия дифференциальных признаков. В систематике встречается очень много случаев, когда целесообразность разделения одной таксономической единицы на две или слияния двух в одну вызывает споры у исследователей, по-разному интерпретирующих существующие данные. Привлечение нового признака может иногда помочь в решении подобной проблемы именно в этом случае очень полезными могут оказаться химические признаки. Необходимо отметить, каким может быть логический ход этой процедуры. В приведенных ниже примерах, взятых из литературы, авторы пытались найти корреляции между химическими признаками и группами ранее установленных морфологических признаков ход рассуждений был в сущности филогенетический, хотя результаты могут касаться систематики, [c.99]

Имя фраша — это слово, обозначающее некоторое понятие. Л/п-рибут фрейма — это одно из ключевых призначных свойств, выбранных ДЛЯ формулирования или описания смысла понятия, которое пытается сформулировать ЛПР при концептуальном и таксономическом анализе 0. Характеристика фрейма —это одна из форм или ОДИН из признаков проявления некоторого свойства. [c.119]

ГЭС может функщюнировать в следующих режимах инженер по знаниям и эксперт после предварительного концептуального и таксономического анализа знаний ПО по формализации ПО (разработка набора фреймов, формулировка ПП, формулировка текстов вопросов к пользователю) заполняют БЗ, используя средства РБЗ [c.304]

Инструменты систематика. Для систематика, исследования которого по существу сводятся к морфологическому анализу какой-ли-бо группы насекомых, не требуется много инструментов, кроме микроскопов, реактивов и материалов для изготовления срезов, энтомологических булавок и ящиков, этикеток и возможно простого оборудования для вскрытий. Другие, более специальные типы таксономического анализа требуют особой аппаратуры, многие образцы которой обсуждены Олд-ройдом [1501] в его работе Сбор, хранение и изучение насекомых . Россом [1679] опубликована превосходная, хорошо иллюстрированная монография о фотографировании насекомых, и каждому желающему использовать возможности фотографии в целях систематики полезно ознакомиться с этим трудом. Работа Уайта [2272] по цитологии животных является ценным пособием для каждого систематика, ис- [c.188]

Но мало указагь на разнообразие, надо увидеть в нем закономерность, структуру. Не]звой частью диатропики стал мероно-таксономический анализ Мейена, которым мы сейчас займемся. Второй частью - анализ случайности и закономерности разнообразия [Чайковский, 1983, 2001], о чем шла речь в п. 5-18 и еще пойдет не раз, а третьей учение о ядре и периферии, восходящее к Бэру (о нем пойдет речь в гл. 10). [c.234]

Рис. 17. Соотношение уровней различных показателей физической подготовленности у детей 7-8 лет (4 группы, вьщеленные в результате таксономического анализа . Условные обозначения 1 — бег 10 метров с хода (быстрота) 2, 3 — кистевая динамометрия (сила) 4 — становая динамометрия (сила) 5 — прыжок в длину с места б — метание набивного мяча (скоростно-силовые качества) 7 — наклон вперед (гибкость) 8 — бег 1000 м (выносливость) 9 — РЖС170 (физическая работоспособность)

Таксономический анализ проводили на основе результатов выполнения следующих моторньк тестов бег 10 метров с хода (скоростные способности), метание набивного мяча (1 кг) из положения сед ноги врозь (скоростно-силовые способности), п]сыжок в длину с места (скоростно-силовые способности), кистевая и становая динамометрия (силовые способности), наклон вперед стоя на скамейке (гибкость), (физическая рабо- [c.413]

Решающую роль в создании количественного метода сыграли положения о гармонии всех внутриостаточных и межостаточных взаимодействий и их преобладающем энергетическом влиянии над взаимодействиями белковой цепи с молекулами и ионами окружающей среды. Одно из этих положений позволило разделить проблему структурной организации белка на три менее громоздкие и поддающиеся последовательному решению частные проблемы ближних, средних и дальних взаимодействий. В результате специально разработанной классификации пептидных структур на конформации, формы и шейпы стало возможным получение достоверных количественных данных о конфор-мационных состояниях целых наборов структурных вариантов различных таксономических групп, ограничившись детальным анализом их отдельных представителей. Классификация настолько сократила объем вычислительных работ, что сделала реальным расчет трехмерных структур бе лков, на первых порах низкомолекулярных. Изложенные в книге результаты априорных расчетов структур трипсинового ингибитора, сложного фрагмента нейротоксина II и большого числа олигопептидов, состоящих из десятков аминокислотных остатков, свидетельствуют об адекватном отражении предложенными теориями (бифуркационной и физической) структурной самоорганизации белков и пептидов и реальности предсказания их нативных конформаций. [c.8]

Характерная особенность всех теоретических исследований пространственного строения ангиотензина II [22, 47-50] - отсутствие какой-либо классификации конформационных состояний молекулы, не говоря уже о такой, которая была бы обоснована с физической точки зрения и охватывала все возможные структурные варианты, систематизированные в соответствии с субординационными взаимоотношениями по таксономическим категориям. Отсутствие классификации - объективный признак непонимания самых существенных свойств изучаемых соединений, определяющих их единство и различие. Без структурной классификации, четко сформулированных принципов общей теории и физической модели (также отсутствующих в обсуждаемых работах) невозможен объективный выбор конформационных состояний. Все оценки оптимальных конформаций в расчетах Галактионова, Шераги, Де Коэна и соавторов вьшолнены на основе относительных величин общей энергии, без количественного анализа вкладов от отдельных внутри- и межостаточных взаимодействий в структурных вариантах всевозможных форм различных типов основной цепи. Поэтому результаты подобных расчетов не гарантированы от случайных пропусков и от неправильных оценок полученных данных. Подтверждением такому заключению является табл, 111,9. Все структуры, найденные в обсуждаемых работах для ангиотензина II, автоматически входили в процедуру изложенного здесь расчета, но не попали в окончательный набор конформаций (см. табл III.9), так как оказались менее предпочтительными по энергии. В то же время найденные в [32] низкоэнергетические конформации молекулы вообще оказались не замеченными авторами работ [22. 47-50]. [c.282]

Научный уровень отдельного исследования, как и целых областей естественнонаучных знаний, имеющих дело с множеством объектов или явлений, единичный анализ каждого из которых практически невозможен, определяется состоянием классификации изучаемых объектов или явлений, и не просто классификации, а естественной классификации, т.е. выполненной по совокупности самых существенных, внутренних признаков. К такому типу исследований, безусловно, принадлежит конформационный анализ пептидов и белков. Характерной особенностью всех рассматриваемых работ (см. табл. Ш.ЗЗ) является отсутствие какой-либо классификации конформационных состояний молекул этого класса, не говоря уже о такой, которая была бы обоснована с физической точки зрения и охватывала бы все возможные структурные варианты, систематизированные в соответствии с субординационными взаимоотношениями по таксономическим категориям. Отсутствие структурной классификации может служить объективным признаком принадлежности изучаемых соединений к чисто случайным образованиям (статистическому клубку) или непонимания самых существенных свойств их пространственной организации. Поскольку первое исключено, то справедливо альтернативное предположение. В этом причина того, что выполненные расчеты не гарантированы ни от случайных пропусков, ни от неправильных оценок получаемых результатов. Без структурной классификации, четко сформулированных принципов общей теории и физической модели (также отсутствующих в обсуждаемых работах) невозможен объективный выбор конформационных состояний. Все оценки оптимальных конформаций в расчетах Галактионова, Шераги, Де-Коэна и их сотрудников вьшолнены на основе относительных величин общей энергии, без количественного анализа вкладов от отдельных внутри- и межостаточных взаимодействий в структурных вариантах всевозможных форм различных типов. [c.401]

Достичь этой цели, т.е. предсказания по аминокислотной последовательности конформационно-жестких и лабильных участков, можно тремя способами. Один из них универсален, а два других, хотя и имеют частный характер, представляют самостоятельный интерес и могут дополнять и контролировать друг друга. Первый способ требует распределения пространственного строения пептидных участков фиксированной длины по определенным таксономическим группам - шейпам, обобщенным структурным элементам цепи, отражающим потенцию соседних остатков к средним взаимодействиям. По ряду причин оптимальными являются пентапептидные участки. Их структурная селекция по шейпам может быть осуществлена с помощью "скользящей рамки" с шагом в один остаток для всех белков, нативные конформации которых известны. Максимально возможное число шейпов у фрагмента из п остатков равно 2" при л = 5 оно составляет 16. Можно надеяться, что систематика белковых пентапептидных участков, количество которых превышает 100 тыс., по 16 группам и последующий анализ каждой группы приведут к установлению корреляций между составом и порядком аминокислот в пентапептидах, с одной стороны, и шейпам основной цепи, с другой. Такие корреляции, очевидно, не будут однозначными, и для большинства пентапептидов приемлемыми окажутся три-четыре, а то и большее число шейпов. Специальные расчеты, однако, показали, что и в этом случае конформационно-жесткие участки смогут обнаружиться по тенденции к снятию энергетического вырождения шейпов фрагментов, перекрывающихся по 1-4 остат- [c.592]

Очевидно, работа по компиляции этих данных будет очень трудоемкой. В то же время необходимая информация большей частью уже содержится в существующей литературе ее систематический анализ и выявление необходимых данных не представляют принципиальных трудностей и моглн бы выполняться стандартной автоматической системой хранения данных с соответствующей программой поиска информации, использующей перекрестные ссылки. Особая ценность такой системы как вспомогательного средства в биосинтетических исслелованиях заключается в том, что ее можно использовать, во-первых, для логического анализа структуры природных соединений с целью выявления звеньев первичных предшественников и, во-вторых, для установления таксономической корреляции индивидуальных соединений со Сходными метаболитами из других природных источников. Корреляции такого типа составляют основу гипотетических схем биосинтеза, которые затем проверяются экспериментально, обычно с помощью меченных изотопами предполагаемых предшественников. В настоящее время эти корреляции, как и структурный анализ, выполняются только путем кропотливого и длительного изучения множества источников информации, которые редко полностью Доступны каждому исследователю. [c.345]

Применяя методы типологии и системного анализа, сгруппируем изделия в таксоны, т. е. группы дискретных объектов, связанных той или иной степенью общности свойств и признаков и благодаря этому дающих основание для присвоения им определенной таксономической категории. При выделении таксона принимают во внимание разные свойства и признаки объектов общность строения, состав, форму, функции и т. д. В данном случае целесообразно сгруппировать изделия по конструктивному признаку, так как в ряде случаев только сложная форма не позволяет применить ультразвуковую дефектоскопию для контроля изделийЧ [c.66]

В последние годы появился значительный интерес к природе таксономии, т. е. к анализу того, что фактически делает таксономист, что он может и чего он не может сделать. Это привело к дискуссии полуфилософского характера, которая прояснила многие важные вопросы (см., например, [110], [111]), а также к попыткам, стимулированным современной вычислительной техникой, сделать таксономические процедуры количественными на более или менее объективной основе [112]. Полное обсуждение выходит, конечно, за рамки настоящей работы, однако приводимое ниже резюме может служить введением для использования фенолов, содержащихся в растениях, в ботанических целях. [c.94]

В химической таксономии ситуация совершенно иная. Ни для одной группы, даже такой величины, как род умеренных размеров, нет сколько-нибудь подробных данных о распределении хотя бы одной группы химических веществ а об идеале — полной осведомленности о распределении большинства классов химических соединений для больших таксономических групп растений — приходится только мечтать. Поэтому химическая таксономия развивалась посредством анализа выборок, которые неизбежно были не случайными европейские растения или растения, произрастающие в странах с умеренным климатом, исследованы значительно шире, чем растения тропических стран. Подобная ситуация была неизбежной однако на этой ранней стадии такую однобокость нельзя поставить в вину химическим таксономнстам, поскольку то же самое наблюдается и в обычной морфологической таксономии. Поэтому мы должны помнить, что обобщения, которые сейчас кажутся справедливыми, могут оказаться неверными, когда станут доступными результаты анализа выборок большей величины. По-видимому, это особенно важно для более редких компонентов. Например, распространение лейкоантоцианидинов, по-видимому, известно в настоящее время достаточно хорошо данные о корре- [c.95]

Бактерии явились первым объектом, на котором в ла боратории Чаргаффа были выявлены различия в нуклео тидном составе ДНК, послужившие основой для дальней шего анализа таксономической значимости этих факто (Vis her et al., 1949 hargaff, 1950, 1951, 1952, 1955 1957). [c.6]

В настоящее время изоплитным анализом исследовано еще незначительное число представителей различных групп микроорганизмов, но и у них получены обнадеживающие результаты, позволяющие считать сведения о характере распределения пиримидинов в бактериальных ДНК хорошим дополнением к данным о нуклеотйдном составе ДНК при решении ряда таксономических вопросов (Александрушкина, 1974 Имамов и соавт., 1974). [c.124]

Серологические исследования Кривенчик и Бергольда [155] показали, что антисыворотка против полиэдроза пилильщиков не реагировала ни с одним типом антигена 4 гранулезов и 11 классических полиэдрозов рода Borrelina. Метод агаровой диффузии также показал отсутствие каких-либо связей с остальными вирусами, причем протеины обеих болезней пилильщиков, который были испытаны серологически, были очень близкими [157]. Эта особенность, а также результаты опытов Гершензона [102] с перекрестным заражением бабочек и анализ состава их ДНК, проведенный Уайтом [315], показывают, что вирусы — возбудители кишечного ядерного полиэдроза перепончатокрылых насекомых — являются обособленной таксономической группой. [c.113]

Исследованию различных эфирных масел посвящено много статей, авторы которых проводили разделение и идентификацию компонентов этих масел методом ТСХ. Обсудить все эти работы практически невозможно, однако в табл. 30.11 мы привели перечень многих таких работ, кратко пояснив способ хроматографирования. Дополнительные ссылки можно найти в библиографиях, указанных во введении к этой книге. Вагуйфальви и др. [147—149] составили основанный на таксономической классификации растений перечень публикаций, в которых ТСХ использовалась для анализа соединений, содержащихся в растениях. [c.393]

Химико-таксономическое изучение рода Nyperi um. II. Идентификация компонентов эфирных масел у Nyperium. (Анализ эфирного масла 37 видов зверобоя и др. эфироносных растений). [c.130]

Были подвергнуты анализу даже очень мелкие организмы, и среди них в первую очередь насекомые взаимное соотпогаение аминокислот во многих случаях является специфичным для каждого вида, так что это обстоятельство может быть использовано для таксономических целей. [c.441]

В разработанном в последнее время новом таксономическом методе исследований принимаются во внимание корреляционные связи между свойствами микроорганизмов. В этом методе проводится селекция свойств и их упорядочение в иерархии по важности, учитывающей объективные критерии, полученные на основании корреляционного анализа. Этот метод был применен в таксономии Klebsiella [560]. [c.42]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология