Расщепление пептидов

Расщепление пептидов до свободных аминокислот в тонком кишечнике завершают [c.592]

Ферментативное расщепление пептида с С-конца. [c.513]

Реакции последовательного расщепления пептидов путем конденсации реагента с -аминогруппой [c.230]

Понятие действия, или активности, относится к наиболее очевидным проявлениям свойств белка. Например, действие химотрипсина состоит в расщеплении пептида или полипептида. Вопрос, относящийся к действию что делает белок [c.273]

Первая стадия ферментативной реакции схема (28) включает образование тетраэдрического интермедиата (39), который,, образовавшись, может быстро переходить в исходные соединения схема (31), стрелки . Соединения типа (39) слишком реакционноспособны, в силу чего в обычных условиях зарегистрировать их не удается. Существует, однако, структурное доказательства их образования в процессе реакций, катализируемых сериновыми протеиназами. Природные белковые ингибиторы трипсина образуют весьма стабильные комплексы с ферментом. Трехмерные структуры таких комплексов [55] показывают, что нормальная реакция расщепления пептида, по-видимому, замораживается на стадии образования тетраэдрического интермедиата схема [c.492]

Аналогичный механизм был предложен для расщепления пептидов, содержащих триптофан [124] Было высказано предположение, что такой тип расщепления может быть распространен на пептиды, содержащие гистидин, причем условия расщепления могут быть выбраны таким образом, чтобы происходило селективное расщепление пептидных связей, содержащих тирозин, триптофан и гистидин [34, 148]. [c.399]

При успешном применении метода Эдмана удавалось отщепить последовательно 5—7 остатков при незначительном неспецифическом расщеплении. В некоторых случаях последовательное расщепление пептида осуществлялось удивительно легко. Заслужи- [c.172]

Расщепление пептидов при помощи изотиоцианата [c.208]

Такая последовательность реакций показывает, что протеолиз и синтез белка часто тесно связаны друг с другом и что, по крайней мере, в некоторых случаях гидролитический распад включает промежуточный синтез более крупных молекул. Необходимо, однако, помнить, что расщепление пептидов не обязательно означает гидролиз пептидов и что пептиды могут быть окислены непосредственно без образования свободных аминокислот. Возможность такой формы распада подтверждается наличием почти во всех органах дегидропептидаз [25]. Эти дегидро-пептидазы катализируют гидролиз дегидрированных пептидов [c.367]

Эту процедуру ступенчатого расщепления пептида с N-конца можно повторять многократно, идентифицируя последовательно одну аминокислоту за другой. Метод Эдмана используется в качестве химической основы для определения первичной структуры белков и пептидов. Он реализован в специальном приборе-секвенаторе (от англ. sequen e - последовательность), работающем в автоматическом режиме и позволяющем определить последовательность аминокислот с N-конца пептида до 50-60 аминокислотных остатков. [c.54]

Однако эти методы применяют в основном для определения строения сравнительно коротких пептидов, получаемых в результате частичного гидролиза. Недавно было произведено последовательное отщепление аминокислотных остатков у папаина с помощью лейщинаминопепти- дазы. Однако основным путем и до настоящего времени является частичное расщепление пептида или белка на отдельные пептиды и определение их строения. Из сопоставления полученных данных делается заключение о строении соединения. При этом исследователь напоминает археолога, который воссоздает здание по найденным обломкам. Преимущество исследователя в сравнении с археологом заключается в том, что с помощью синтеза он может проверить справедливость своих заключений. [c.514]

Для ступенчатого расщепления пептидов разработан метод [ИЗ, 114], по которому ФТК-пептид растворяют в 3 н. НС1 при комнатной температуре и ойределяют конец циклизации по изменению поглощения в диапазоне длин волн 235— 275 ммк. По мере образования ФТГ-производного N-концевой аминокислоты максимум поглощения смещается приблизительно от 240 до 262,5 ммк при минимуме около 240 ммк (рис. 13). Если реакция протекает медленно, то ее проводйт при более высокой температуре (например, при 40°). Обычно продолжительность реакции при комнатной температуре составляет 1,5—24 час. После завершения циклизации ФТГ-производное экстрагируют этилацетатом, а водный раствор выпаривают досуха при низкой температуре, чтобы избежать нежелательного действия кислоты и возможного гидролиза пептидных связей. [c.240]

Другой метод, основанный на использовании безводной трифторуксусной кислоты [100], которая очень хорошо растворяет белки [173], успешно применялся для циклизации (5 мин при 0°) ФТК-производных при последовательном расщеплении в пепсине участка Н.Илей.Глу.Асп.Глу— [90]. Этот метод можно применять также для обработки ФТК-производных других белков. Вследствие быстрого образования промежуточного реакционноспособного тиазолинона (см. схему на стр. 239), по-видимому, это соединение лучше экстрагировать после кратковременного проведения реакции и завершить циклизацию в Зн. НС1, которая не разрушает ФТГ-производных серина и треонина. Представляет интерес тот факт, что очень низкие выходы, полученные Шефердом и сотр. [284] при тщательном изучении расщепления пептидов из кортикотропина, обусловлены потерями (50—70%) на стадии циклизаций в среде ледяная уксусная кислота — НС1 при 75—80° в течение 15 мин. Поскольку тиазолинон образуется быстро и имеет высокую реакционную способность, подобные условия циклизации являются, по-видимому, рлишком жесткими. На основании экспериментальных результатов этих авторов можно предположить, что критическая фаза разложения наблюдается во время расщепления и циклизации или одного из этих процессов, так как в более мягких условиях выход аминокислот при регенерации из ФТК-пептидов оказался ниже, чем выход аминокислоты из ФТГ-производного аланина в аналогичных условиях. Этим можно объяснить, почему некоторые исследователи [108, 151, 242] предпочитают пользоваться методом вычитания, согласно которому N-концевая аминокислота обнаруживается по ее исчезновению. Несмотря на низкие выходы и случайное расщепление связей, Шеферду и сотр. [284] удалось обнаружить N-концевой остаток, так как его количество обычно в 5—10 раз превышает содержание других аминокислот а реакционной смеси. Однако в случае неустойчивой, неэкстрагируемой или встречающейся в пеп [c.244]

Осуществленный таким способом гидролиз пептидньк связей-это необходимый шаг в определении аминокислотного состава белков и последовательности составляющих их аминокислотных остатков. Пептидные связи могут быть гидро-лизованы также под действием некоторых ферментов, таких, как трипсин и химотрипсин, представляющие собой протеолитические (белок-расщепляю-щие) ферменты, секретируемые в кишечник и способствующие перевариванию, т. е. гидролитическому расщеплению, белков, входящих в состав пищи. Если кипячение пептидов с кислотой или щелочью приводит к гидролизу всех пептидных связей независимо от природы и последовательности соединенных при их помощи аминокислотных звеньев, то трипсин и химотрипсин осуществляют каталитическое расщепление пептидов избирательным образом. Трипсин гидролизует только те пептидные связи, в образовании которьсс участвуют карбоксильные группы лизина или аргинина. Химотрипсин же атакует только те пептидные связи, которые были образованы с участием карбоксильных групп фенилаланина, триптофана и тирозина. Как мы увидим дальше, такой избирательный ферментативный гидролиз оказьшается очень полезным при анализе аминокислотных последовательностей белков и пептидов. [c.130]

Подобный метод мог бы оказаться особенно пригодным для расщепления пептидов, не содержащих остатков серина или треонина (помимо N-концевых остатков), например пептидов, которые образуются при расщеплении белков методом, связанным с миграцией ацильной группы (см. стр. 216—224). [c.248]

Расщепление пептидов. В присутствии ВРз-эфирата СЬ-группу метионпнсодержащих пептидов можно количественно удалить гидро-геиолизом над палладиевым катализатором 1211. [c.40]

Катализ противоионами полиэлектролитов. Особый тип катализа полимерами представляет катализ, осуществляемый противоионами полиэлектролитов. В р-рах полиэлектролитов противоионы находятся в сольвати-рованном состоянии и в этом отношении напоминают так наз. свободные ионы в р-рах низкомолекулярных электролитов. Поэтому каталитич. реакции под действием этих ионов в обоих случаях могут протекать по одному и тому же механизму и характеризоваться совпадением кинетич. порядка реакции. С другой стороны, противоионы вследствие взаимодействия с полем, создаваемым макроионом, сосредоточены вблизи полимерной цепи. Поэтому естественно ожидать, что природа макроиона будет оказывать влияние на характер каталитич. процесса. В том случае, если субстрат или промежуточное соединение ассоциируется с полиионом, концентрация реагирующих веществ в области повышенной концентрации катализатора — противоиона, должна увеличиться, что, в свою очередь, приведет к изменению скорости процесса. Еслп субстрат имеет заряд, противоположный заряду полииона, или способен приобрести этот заряд па ранней стадии процесса, скорость этого процесса должна повышаться. Действительно, скорость гидролитич. расщепления пептидов под действием поливинилсульфокислоты и полистиролсульфокислоты [c.480]

Известно несколько десятков ферментов этого типа, из которых наиболее хорошо изучены ферменты желудочного сока — пепсин, трипсин и химотрипсин, а также папаин, содержащийся в растениях. Все они получены в кристаллическом состоянии. Иногда пептидазами называют ферменты, участвующие в расщеплении пептидов, а ферменты, катализирующие распад белков, называют протеиназами. Однако установлено, что действие того или иного фермента зависит не от размера молекулы (белки или пептиды), а в основном от его специфичности. В частности, показано, что типичные протеиназы— папаин и пепсин—могут расщеплять не только белки, но и пептиды. С действием протеолитических ферментов подробнее познакомимся при изучении белкового обмена в растениях. [c.65]

Ламри [213] использовал противоположный подход и пришел к заключению, что сближение реагентов в ферментативном катализе не имеет большого значения, поскольку ферментативный каталпз скорее связан с уменьшением АЯ+, а не с увеличением А5+. Очень кратко данные, на основании которых Ламри пришел к этому выводу, представлены в табл. (1-25). Если сравнить активационные параметры гидролиза глицилглицина, катализируемого ионом НзО+ и дауэкс 50(Н+) (в последнем случае расщеплению пептида предшествует его комплексообразование со смолой [215]), то можно заметить увеличение для реакции с дауэксом, как и следовало ожидать. Поскольку обе реакции катализируются ионами Н+, изменения ДЯ+ для них являются сравнимыми величинами. Эти результаты соответствуют ожи- [c.136]

При расщеплении пептида НгК-триптофан-метионин-аспара-гинат-фенилаланин-СОКНг после первого цикла было идентифицировано бмс-триметилсилилпроизводное метилтиогидантоина триптофана, после второго цикла — производные фенилаланина и метионина. Аспарагинат не был обнаружен. Авторы предполагают, что последний, вероятно, циклизуется с С-концевым амидом фенилаланина. [c.34]

Протеолитические ферменты катализируют гидролиз пептидных связей. Эти ферменты обычно подразделяют на два класса протеиназы (гидролизующие белки) и пептидазы (гидроли--зующие пептиды). Классификация эта, однако, не отличается строгостью, так как протеиназы способны расщеплять некоторые пептиды, а многие пептидазы действуют также на белки. Например, аминопептидазы разрушают полипептидные цепи путем последовательного отщепления N-концевой аминокислоты эта реакция может повторяться до тех пор, пока ббльшая часть белковой молекулы не разрушится. Кар-боксипентидазы осуществляют ступенчатое расщепление пептидов и белков, начиная с С-концевой аминокислоты. Известны, однако, некоторые пептидазы, которые действуют только на пептиды. Так, например, дипептидазы специфически гидролизуют дипептиды. Дипептидазы и аминопептидазы обнаружены у высших растений [9, 35]. Поскольку гидролитические ферменты распространены чрезвычайно широко, кажется вероятным, что систематические ноиски позволят обнаружить в растительных тканях целый ряд других пептидаз. [c.202]

Отличие аминокислотного состава пластеина от состава гидролизата навело на мысль, что не все пептиды, присутствующие в реакционной смеси, принимают участие в образовании пластеина [1068, 2285, 2378]. По-видимому, важная роль в этом принадлежит концевым аминокислотам [2380]. Аминокислоты и пептиды с очень короткой цепью не вступают в пластеиновую реакцию. С другой стороны, если пептидная цепь является слишком длинной, то образование пластеинов сопровождается расщеплением пептидов [2378]. Оптимальная длина пептидной цепи составляет от 5 до 8 аминокислотных остатков. На образование пластеинов влияет также концентрация гидролизата [2378]. Соли в больших концентрациях ингибируют протеолитическую активность ферментов, облегчая тем самым протекание пластеиновой реакции [2286]. Выходы пластеинов составляют 15—20% [2285, 2378, 2380] самый высокий выход (около 50%) получен при изучении гидролизата пластеина [2378]. [c.393]

Из табл. 26 следует, что действие фермента наиболее эффективно в отношении субстратов, содержащих более крупные боковые цепи. Ароматические остатки меиее чувствительны относительно медленно гидролизуются амиды аминокислот, имеющих полярные боковые группы. Скорости гидролиза пептидов зависят также от природы аминокислот, примыкающих к N-концевому остатку. В ряде случаев оказалось возможным частично выяснить N-концевую последовательность при подМощи лейцинаминонептидазы. Окисленные А и В-цепи инсулина легко гидролизуются ферментом до свободных аминокислот. Путем кинетического исследования удалось установить последовательность первых шести N-коицевых аминокислот В-цепи инсулина. При помощи лейцинаминопептидазы были получены важные данные об N-концевой последовательности ряда природных пептидов и пептидных фрагментов, полученных из белков. Некоторые белки, например рибонуклеаза, лизоцим, Zn-инсулин и сывороточный альбумин, устойчивы к действию фермента, но легко гидролизуются после окисления надмуравьиной кислотой или после удаления Zn (в случае инсулина). Полное расщепление пептида или белка до аминокислот указывает на L-конфигурацию всех входящих в его состав аминокислот. f [c.183]

Бэйл11 [30] предложил метод ступенчатого расщепления пептидов с карбоксильного конца, основанный на использовании К,0-мигра-ции ацильных групп в сочетании с восстановлением. По этой схеме избирательное отщепление С-концевых аминоспиртов от пептидов происходит в две стадии. [c.197]

Кеннер и др. [46] получили в мягких условиях высокие выходы промежуточно образуюш,ихся ацилтиогидантоинов при использовании в качестве реагента дифенилового эфира изотиоцианфосфор-ной кислоты. Этот реагент получают простым путем из дифенилового эфира хлорфосфорной кислоты [47] и изотиоцианата калия в ацетонитриле при комнатной температуре и затем перегоняют при 105° (0,1 мм рт. ст.). Расщепление пептидов осуществляют в запаянной ампуле при комнатной температуре в течение двух дней оно протекает по следующей схеме [c.209]

Смотреть страницы где упоминается термин Расщепление пептидов: [c.288] [c.336] [c.231] [c.202] [c.233] [c.40] [c.194] [c.46] [c.760] [c.157] [c.396] [c.396] [c.245] [c.341] [c.125] [c.288] [c.245] [c.220] [c.159] [c.290] [c.157]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология