-Концевые остатки в цепях

Наиболее успешным методом определения С-концевых остатков является не химический метод, а ферментативный. Селективное удаление С-концевого звена осуществляется при помощи фермента карбоксипептидазы (из поджелудочной железы), которая расщепляет лишь ту пептидную связь,которая расположена в а-положении к свободной а-карбоксильной группе в полипептид-ной цепи. Анализ можно повторить на укороченном пептиде с тем, чтобы идентифицировать новый С-концевой остаток и т. д. [c.1049]

Остаток инициатора входит в состав полимера в виде концевой группы цепи. [c.369]

Определение концевых групп заключается в идентификации аминокислотных остатков на концах пептидной цепи. Применяемая методика основана на том, что остатки на концах цепи отличаются по свойствам от всех остальных звеньев и друг от друга один (N-концевой остаток) содержит свободную аминогруппу, а другой (С-концевой остаток) — свободную карбоксильную группу в а-положении к пептидной связи. [c.1048]

Концевой остаток нуклеозида (или нуклеотида), связанный с полимерной цепью только через гидроксильную группу при С-5, принято называть З -конце-вым остатком полинуклеотидной цепи. Аналогично 5 -концевым остатком называется остаток нуклеозида (или нуклеотида), связанный с цепью полимера только через гидроксильную группу при С-3. При обычном способе написания сокращенных формул полинуклеотидов (для одноцепочечных полимеров) З -кон ценой остаток находится на формуле справа, а 5 -концевой — слева. [c.44]

Аминокислотные остатки на концах пептидной цепи отличаются по свойствам от всех остальных звеньев и друг от друга Ы-конце-вой остаток содержит свободную аминогруппу, а С-концевой остаток — свободную карбоксильную группу. Например [c.311]

Свободный радикал на конце цепи С быстро присоединяет протон, отрывая его от оксиметильной группы концевого звена цепи В. При этом образуется стабильный фрагмент цепи Е и цепь D, концевое звено которой в результате рекомбинации превращается в остаток левоглюкозана [c.182]

К ним остатков [31]. Следовательно, размеры участка связывания пептидов таковы, что обеспечивают взаимодействие с пятью остатками, причем предпоследний остаток цепи оказывает заметное влияние на кинетику реакции. Присутствие остатков некоторых о-аминокислот в положениях, отличных от С-концевого, не препятствует взаимодействию с ферментом, однако если объемистая о-аминокислота является предпоследним остатком от С-конца, то гидролиз идет только в случае дипептидных субстратов [32, 33]. [c.507]

Санжер установил полную последователшость аминокислот в инсулине при помощи частичного гидролиза химотрипсином (1949—1950) и показал, что рассчитанный теоретически молекулярный вес (5734) близок к экспериментальным данным. Он нашел, что в молекуле белка одна полипептидная цепь (цепь А) имеет N-концевой глицин эта цепь связана дисульфидными связями со второй цепью (цепью В), имеющей N-концевой остаток фенилаланин. Окисление надмуравьиной кислотой расщепляет связь S—S, и образуются два цистеинилпептида. [c.698]

Расщепление гликогена в печени катализируется двумя ферментами гликоген-фосфорилазой и а-1,6-глюкози-дазой. Оба фермента высоко специфичны и к структуре отщепляемого остатка (отщепляют только концевой остаток а-В-глюкопиранозы), и к типу разрываемой связи (первый расщепляет только 1- 4-связи, второй — только 1- 6), и к структуре цепи, прилегающей к разрываемой связи со стороны восстанавливающего конца. [c.145]

Как уже упоминалось, ПК в качестве лигандов могут обладать как групповой специфичностью (для белков хроматина, факторов управления трансляцией, нуклеаз и др.), так и индивидуальной (для индивидуальных мРНК, белков-регуляторов транскрипции и др.). Во втором случае на аффинном сорбенте должны быть закреплены вполне определенные участки генома. Это стало возмолшым после создания способов отбора и наработки в достаточных количествах строго идентичных фрагментов ДНК методами генной инженерии. В последнее время возникла еще одна область использования иммобилизованных НК — в качестве праймеров матричного синтеза. Эти приложения предъявляют разные требования к характеру фиксации НК на матрице. В первом случае расположение точек закрепления на молекуле НК может быть произвольным, во втором определенные и достаточно протяженные участки полинуклеотидной цепи должны быть свободны для комплементарного взаимодействия, а в третьем закрепление НК на матрице желательно осуществить лишь по одному определенному концу молекулы. Что же касается возможности реакций с активированными матрицами, то вдоль всей молекулы НК во множестве располагаются химически эквивалентные группы аминогруппы нуклеиновых оснований, гидроксилы сахаров и др. В особом положении находится только концевой остаток фосфорной кислоты или сахара. [c.387]

По этой схеме вначале концевая альдегидная группа эпимери-зуется, причем остаток глюкозы переходит в фруктозу. Последняя через ряд промежуточных продуктов и отщепление от основной цепи полисахарида превращается в глюкоизосахариновую кислоту, которая в виде натриевой соли переходит в щелочной раствор. Возникающий при этом новый редуцирующий концевой остаток глюкозы реагирует аналогично. Такой процесс идет последовательно от звена к звену, укорачивая макромолекулу полисахарида. [c.363]

Многие сложные вопросы в этой области все еще остаются нерешенными, однако в результате проведенных последований удалось установить как структуру антигенных детерминант, так и генетическую основу групп крови системы ABO. Молекулы антигенных детерминант имеют невосстанавливающие концы двух типов (1 и 2), которые отличаются друг от друга характером связи с последующим остатком сахара эти связи могут быть либо 1—>-3, либо 1—у4 (см. приведенную ниже схему). У людей с группой крови А цепи обоих типов оканчиваются остатками а,Ы-ацетилгалактозам1ина, а у людей группы В — остатками галактозы. Для людей группы О характерен антиген Н, у которого отсутствует этот концевой остаток моносахарида, и его цепи, следовательно, на один остаток короче, чем цепи в антигенах, принадлежащих группам А и В. Люди с группами крови АВ гетерозиготны и содержат антигены, свойственные как группе А, так и группе В. [c.376]

Определение числа и природы С- и М-концевых аминокислотных остатков позволило добиться существенных успехов в выяснении структуры некоторых белков. Инсулин оказался первым белком, для которого полностью установлен порядок расположения всех аминокислот [102—107]. Сангер и его сотрудники путем окисления инсулина надмуравьиной кислотой получили два основных продукта, которые оказались пептидами, содержащими цистеиновую кислоту и состоящими из 21 и соответственно 30 аминокислотных остатков. Более короткая цепь (по обозначению Сангера — пептид А ) имеет Ы-концевой остаток глицина и С-концевой остаток аспарагина. В более длинной цепи (пептид В ) Ы-концевой аминокислотой оказался фенилаланин, а на С-конце цепи находится аланин. С помощью остроумных приемов, заключающихся в широком использовании метода получения динитрофенильных производных при помощи [c.27]

Определение числа пептидных цепей в белке путем количественного измерения скорости отщепления аминокислот может оказаться ненадежным, если два соседних аминокислотных остатка отщепляются почти с одинаковой скоростью. Это наблюдается в случае ростового гормона быка, в котором два остатка фенилаланина быстро отщепляются карбоксйпеп-тидазой, после чего происходит отщепление аланина, лейцина и серина. В этом белке имеются два К-концевых остатка, но расщепление гидразином позволило обнаружить только один С-концевой остаток фенилаланина. Полученные при расщеплении белка карбоксйпептидазой результаты объясняются тем, что С-концевой участок имеет состав —Фе.Фе.ОН [198]. [c.234]

Примером наиболее полного расщепления белковой цепи при действии лейцинаминопептидазы является гидролиз меркурипапаина. При низких концентрациях фермента первые девятнадцать аминокислотных остатков отщепляются за 24 час в примерно стехиометрических количествах. Реакция, по-видимому, прекращается тогда, когда остаток аргинина становится Й-концевым. При более высоких соотношениях фермент/субстрат расщепление происходит в большей степени, пока 2/з белка не расщепится До свободных аминокислот. Белковый остаток после активации полностью сохраняет активность (в расчете на 1 моль) по отношению к бензоил арг инил амиду. Это свидетельствует о том, что активный центр молекулы находится на С-концевом участке цепи. [c.237]

Биосинтез гликогена протекает следующим образом. Глюкозо-1-фосфат взаимодействует с УТФ с образованием УДФ-глюкозы и при этом отщепляется пирофосфат. Затем УДФ-глюкоза взаимодействует с остатком глюкозы в небольшом олигосахариде (затравка, содержащая не менее четырех остатков глюкозы из амилозной цепи). Глюкозильная группа УДФ-глюкозы переносится на концевой остаток глюкозы так, что образуется гликозидная связь между первым атомом углерода добавляемого глюкозильного остатка и четвертой ОН -группой концевого остатка глюкозы в амилозной цепи. Реакцию катализирует гликогенсинтетаза. Для образования связи (1->6) существует фермент амило-(1—>4, 1—>6)-трансгликолилаза, который катализирует образование связи между 6-7-членным олигосахаридом в главной цепи гликогена и шестой ОН-группой глюкозы той же или другой цепи гликогена. Так образуется связь [c.81]

В полипептидной цепи белка с одной стороны расположен аминокислотный остаток, несуший свободную а-аминогруппу (амино-или N-концевой остаток), а с другой—остаток со свободной а-карбоксильной группой (карбоксильный, или С-концевой остаток). Аналиэ концевых остатков играет важную роль в процессе определения аминокислотной последовательности белка. На первом этапе исследования он дает возможность оценить число полипептидных цепей, составляющих молекулу белка, и степень гомогенности исследуемого препарата. На последующих этапах с помощью анализа N-концевых аминокислотных оста ков осуществляется контроль за процессом разделения пептидных фрагментов. [c.37]

Аминокислотные остатки, примыкающие к Ы-концевой аминокислоте, можно определить, используя динитрофторбензольный метод (ДНФ-метод). При полном гидролизе ДНФ-полипентида образуется ДНФ-производное М-концевой аминокислоты, при частичном же гидролизе получается смесь ДНФ-пептидов, которые можно разделить и гидролизовать, а затем идентифицировать образовавшиеся аминокислоты. Например, Сенгеру удалось окислить инсулин надмуравьиной кислотой и выделить две фракции, в одной из которых (фракция В) содержался Ы-концевой остаток фенилаланина. В результате частичного гидролиза ДНФ-фенилаланиловой цепи был получен ряд ДНФ-пептидов из этих пептидов четыре были [c.29]

Брехбулер и Магат [29] исследовали поляризацию флуоресценции полистирола, молекулы которого имели на концах флуоресцирующую группу 1,2-диметил-5,б-бензакридипа. Вышеописанным методом они нашли объем концевых групп цепи полистирола, которые участвуют в броупов-ском вращении и на которых закреплены флуоресцирующие молекулы. Объем оказался равным (490 100) см (в грамм-молекулярном выражении). Из этого объема около 250 см приходится на долю самой флуоресцирующей молекулы 1,2-диметил-5,6-бепзакридина. Остаток составляет примерно удвоенный объем элементарной ячейки цепи полистирола ) (и=115 сж ). Авторы приходят к выводу, что в растворе испытывают броуновское вращение только концы полистирольных цепей и во вращении участвуют не более одного-двух элементов цепи макромолекулы полистирола. [c.338]

З -концевой остаток А представляет собой именно ту часть молекулы тРНК, с которой ковалентно связывается соответствующая ей аминокислота перед включением в растущую полипептидную цепь на рибосоме. Во-вторых, ряд оснований в тРНК специфическим образом модифицируется одни метилируются, другие дезаминируются, третьи восстанавливаются. Как мы увидим дальше (гл. 29), модифицированные основания располагаются во всех тРНК в определенных положениях. [c.916]

Полимераза дезоксирибонуклеиновой кислоты Е. oli имеет молекулярный вес 109 000 и состоит, вероятно, только из одной полипептидной цепи [59]. Это заключение основано на следующих фактах а) наблюдается отсутствие изменения молекулярного веса после разворачивания полипептидной цепи в растворе 6М гуанидингидрохлорида с 0,ЗМ -меркаптоэтанолом б) обнаружен только один N-концевой остаток метионина в) в присутствии денатурирующих агентов обнаружена только одна зона при электрофорезе в полиакриламидном геле. Насколько нам известно, еще не найден какой-либо другой фермент или белок, имеющий одну-единственную полипептидную цепь с молекулярным весом выше 100 000. Однако молекулы ферментов, состоящие из нескольких полипептидных цепей более высокого молекулярного веса, все же существуют (например, -галактозидаза Е. oli и миозин [60]). [c.396]

Следующая стадия в построении большого пептида — удаление одной из защитных групп, в результате которой цепь может быть удлинена. Например, при удалении (М-защитной группы и последующей реакции с другой М-защищенной аминокислотой и ДЦГК достраивается Ы-конец, а С-концевой остаток остается прежним. Процесс повторяют до тех пор, пока не будут присоединены все необходимые остатки. В конце синтеза удаляют все защитные группы и получают продукт (рис. 12.19). [c.275]

Конингсберг и Хилл ввели важное усовервгенствование в этот метод, а именно хроматографическое разделение очищенного деградированного пептида, что открыло возможность идентификации отщепленной N-концевой аминокислоты путем сравнения результатов аминокислотного анализа исходного и деградированного пептида. Благодаря этому реактив Эдмана занял теперь центральное место в арсенале средств, используемых для установления последовательности аминокислот. Определение концевой аминокислоты можно повторять многократно, идентифицируя один N-концевой остаток за другим (после того как будет отщеплен предыдущий). Теоретически так можно пройти по всей пептидной цепи, однако на практике приходится сталкиваться с трудностями, которые вынуждают ограничиться примерно пятью успешными определениями. [c.87]

При расщеплении полинуклеотидной цепи с разрывом связей Р—О (О при С-5 ) (такое расщепление может быть выполнено ферментативным гидролизом с помощью фосфодиэстеразы La toba illus a idophilis или селезенки телят, а в случае РНК — также при действии щелочи) образуются следующие характерные фрагменты нуклеозид, если З -концевой остаток полинуклеотидной цепи свободен, и нуклеозид-3, 5 -дифосфат, если 5 -концевой остаток фосфо-рилирован (в случае щелочного гидролиза — нуклеозид-2 (3 ),5 -дифосфат). [c.45]

В молекулах ДНК все функциональные группы углеводных остатков нуклеотидных звеньев, находящихся в середине полимерной цепи, замещены и свободными являются лишь гидроксильные группы концевых остатков дезоксинуклеотидов. В большинстве случаев природные дезоксиполинуклеотиды и дезоксиолигонуклеотиды— продукты их расщепления — содержат на 5 -конце цепи (см. примечание на стр. 44) остаток фосфорной кислоты. Таким образом, единственной свободной функциональной группой углеводных остатков является гидроксильная группа З -концевого остатка нуклеотида. В циклических ДНК даже эта единственная группа отсутствует. В противоположность этому в молекулах РНК каждое нуклеотидное звено, находящееся в середине полимерной цепи, содержит свободную гидроксильную группу при С-2 остатка рибозы, а З -концевой нуклеотид цепи имеет незамещенную 2, 3 -цис-тш-кольную группировку. В аминоацил-тРНК по одной из гидроксильных групп З -концевого остатка нуклеотида присоединяется сложноэфирной связью остаток аминокислоты. [c.511]

Рис. 18. Схема скручивания основной полипептидной цепи КПА. Сплошные линии соединяют атомы Сд (кружки) каждого аминокислотного остатка. Ион 2п(П) показан вблизи центра молекулы в виде заштрихованного кружка. Три белковых лиганда указаиы стрелками. Н-Концевой остаток изображен в нижней части рисунка, С-концевой — слева (Квошо и Липскомб [189]).

Конденсация 2,4-динитро-1-фторбензола (ДНФБ) со свободными аминогруппами инсулина в мягких условиях была описана Сэнджером в 1945 г. [1]. После гидролиза динитрофенилбелка (ДНФ-белка) в гидролизате были обнаружены ДНФ-производные глицина и фенилаланина, а также е-ДНФ-лизин. На молекулу с молекулярным весом 6000 приходилось по 1 моль ДНФ-глицина и ДНФ-фенилаланина. Было сделано заключение, что молекула инсулина состоит из двух различных цепей, одна из которых содержит К-концевой остаток глицина, а другая — Н-концевой остаток фенилаланина. Это подтвердилось при дальнейшем изучении последовательности аминокислот в инсулине [2]. [c.136]

Абсолютным условием для действия фермента является наличие свободной а-карбоксильной группы цепь, оканчивающаяся амидной группой, не атакуется. Связь, образованная ароматической аминокислотой, например фенилаланином, расщепляется легко С-кон-цевой аргинин, лизин или пролин, напротив, блокируют действие фермента. Лейцин и валин отщепляются медленнее, чем фенилаланин, но быстрее, чем остатки с более короткими или более полярными боковыми цепями. Концевые остатки, несущие свободные 5Н- или ЗОдН-группы, вероятно, не атакуются, однако концевой остаток цистина может отщепляться. [c.188]

При интерпретации полученных результатов трудности возникают в том случае, когда неизвестно точно, состоит ли белок из одной или из нескольких иолипептидных цепей. Всегда также нужно-учитывать возможность, что С-концевая последовательность представлена двумя идентичными остатками (как, например, -Фен-Фен-в бычьем гормоне роста) [10]. Известен ряд белков, которые не-атакуются карбоксипептидазой С-концевой остаток в таких слу- [c.189]

В реакции, катализируемой гликогенсинтетазой, глюкозильная группа УДФ-глюкозы переносится на концевой остаток глюкозы амилазной цепи с образованием а-(1 4)-глюкозидной связи. [c.175]

Механизм изомеризации двойной связи объясняет Баумгартен следующим образом. Сперва происходит нормальное присоединение серной кислоты по месту двойной связи у концевого атома цепи с образованием сложного эфира серпой кислоты у вторичного атома углерода. Часть серной кислоты затем отщепляется с образованием додецена-2. Последний в свою очередь присоединяет серную кислоту к 3 атому. Полученная таким образом додецил-(3)-серная кислота, распадаясь, частично образует додецен-3 последний далее присоедхшяет остаток серной кислоты к j и т. д. В результате происходит перемещение остатка серной кислоты из положения 2 в направлении середины углеродной цепи. [c.695]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология