ДНК в растворе нуклеозидов

При обработке слабощелочных растворов нуклеозидов кислородом в присутствии платинового катализатора происходит избирательное окисление первичной гидроксильной группы с [c.529]

Другим примером использования метода молекулярного щупа является исследование гидратации фосфатной группы нуклеозидов и нуклеотидов [149, 163]. В качестве гидратационной характеристики использовался эффект ионизации этой группы, наблюдаемый по скорости распространения ультразвука в растворе (изменения скорости ультразвука отражают изменения объема и сжимаемости при ионизации молекулы). На рис. 3.6 представлены схематические изображения исследо- [c.49]

Задача 0-77. Пиримидиновое основание и углевод, полученные при гидролизе нуклеозида, сожгли раздельно в избытке кислорода. Продукты сгорания углевода пропустили через трубку с оксидом фосфора (V), ее масса при этом увеличилась на 3,60 г. Продукты сгорания нуклеинового основания пропустили через избыток раствора щелочи при этом образовалось 27,6 г карбоната калия. Установите строение нуклеозида. [c.140]

На месте пептидов и белков появляются синие пятна. Через 1— 3 мин хроматограмму промывают 27о-ным раствором СНзСООН и высушивают на воздухе Окраска устойчива. Для пептидов эта реакция более чувствительна, чем нингидриновая. Реакцию дают также пуриновые и пиримидиновые основания, нуклеозиды, нуклеотиды и др. [c.131]

Действительно, первым этапом исследования нуклеиновых кислот явилось изучение продуктов, образующихся ири их гидролизе. При мягком щелочном гидролизе под действием 1 N едкого натра нри 37 , 0,1 /V едкого натра при 100° или под действием 2%-ного водного раствора аммиака полимерная молекулы РНК распадается на мононуклеотиды, содержащие гетероциклическое ядро, моносахарид и остаток фосфорной кислоты, которые и могут быть выделены при жесткой деструкции самого мононуклеотида. Изучение частичного гидролиза мононуклеотидов позволило выяснить ту последовательность, в которой связаны между собою эти три структурные единицы. При нагревании мононуклеотида с разбавленным аммиаком нри 145 от него отщепляется остаток фосфорной кислоты и образуется нуклеозид, при гидролизе которого в кислой среде получается гетероциклическое основание и моносахарид. С другой стороны, при гидролизе мононуклеотида в кис- [c.175]

Нуклеозиды и нуклеотиды. Для изучения пространственного строения нуклеиновых кислот широко используется метод рентгеноструктурного анализа моно-, олиго- и полинуклеотидов, который дает точные геометрические параметры молекул биополимеров и их компонентов в кристаллическом или твердом состоянии. Определение конформаций в растворах в настоящее время в основном про- [c.332]

Рентгеноструктурный анализ ряда рибо- и дезоксирибонуклео-зидов и их производных полностью подтвердил выясненные с помощью химических методов черты их строения. Кроме того, изучение дифракции рентгеновских лучей позволило получить дополнительные данные было показано, что не совсем плоское кольцо сахара располагается почти перпендикулярно к плоскому кольцу пурина (или пиримидина), причем гликозидная связь лежит в плоскости основания [45]. С помощью инфракрасных спектров поглощения, в частности спектров растворов нуклеозидов в тяжелой воде, была получена информация о таутомерном строении оснований в различных условиях [46, 47]. [c.21]

Исследования дисперсии оптического вращения указывают на то, что в водном растворе полифосфатная цепь аденозин-5 -трифосфата может изгибаться с образованием связи между р- и уфосфатными группами и аминогруппой аденина [26]. Хотя ионы кальция и магния при pH 7 не влияют на оптическую симметрию молекулы, под действием ионов цинка, по-видимому, образуется конформация, стабилизированная 2п-хелатными связями между концевой фосфатной группой и заместителем в положении 6 пуриновых или пиримидиновых пирофосфатов и трифосфатов, но не 5 -монофос-фатов [27]. Кривые спектрального титрования в присутствии или в отсутствие ионов магния показывают, что в растворе нуклеозид-5 -трифосфаты существуют, вероятно, в свернутой конформации, в которой ион Mg координационно связывает пирофосфатную структуру с гетероциклическим основанием. Небольшие сдвиги в сторону более низких значений рКкажущ в присутствии ионов (приблизительно на 0,3 единицы) найдены для трифосфатов, но не обнаружены для нуклеозидов [28]. Однако на основании спектров ядерного магнитного резонанса можно предположить, что хелатная конформация маловероятна и что комплекс металл — АТФ в растворе имеет вытянутую форму [29]. Полученные данные указывают также, что в образовании комплексов с магнием и кальцием принимают участие Р- и у-фосфатные группы [30]. [c.189]

Пуриновые и пиримидиновые основания сильно поглощают в ультрафиолетовой области спектра благодаря наличию я-электронов, Ятах 260 нм (6260 нм 10 ) ДЛЯ ббЛКОБ 1тах 280 НМ. Положение максимума поглощения зависит от структуры основания (отсюда следует, что и от pH раствора, поскольку с изменением pH преобладают различные таутомерные формы), от введения в гетероциклическое ядро заместителей, но незначительно— от структуры сахарного остатка. Такие свойства полезно знать при синтезе пуриновых и пиримидиновых производных, так как их можно характеризовать соответствующими максимумами поглощения в ультрафиолетовых спектрах, а при хроматографическом определении также идентифицировать по поглощению в ультрафиолетовой области, например для Ы-бензоилгуано-зина (синтезируемого бензоилированием основания и сахарного остатка нуклеозида бензоилхлоридом в пиридине с последующим удалением бензоильных групп с сахарного остатка гидроксидом натрия) [c.113]

Синтез проводят путем добавления раствор первого нуклеозида в тетра-гидрофураие к раствору фосфорилирующего агента в лутнднпе, выдерживания смеси в течение короткого времени и затем добавления раствора второго нуклеозида в тетрагидрофуране. Только иосле завершения реакции приступают к окислению, вводя кристаллический иод, растворенный в смеси вода — тетрагидрофуран. Окисление также проходит очень быстро. Конечно, такой порядок добавления реагентов приводит к образованию некоторого количества нежелательных (3 ->-3 )- и (5 5 )-изомеров. Наиример, если две молекулы первого нуклеозида реагируют с хлорофосфитом перед добавлением второго нуклеозида к реакционной смеси, произойдет образование (З З )-изомера.- [c.179]

Интересные работы К. Саган, Поннамперумы и Маринер привели к выводу, что ультрафиолетовое излучение (253,7 нм) способствует образованию в растворе аденозина, рибозы и фосфорной кислоты нуклеозида аденозина. Из аденина, рибозы и метафосфата удалось получить аденозинмоиофосфат, аденозиндифос-фат и аденозинтрифосфат, т. е. важнейшие компоненты энергетического механизма клетки. Отдельные стадии всех этих реакций мало изучены и вызывают споры, нов данном случае важен результат, а он свидетельствует о полной возможности накопления на поверхности Земли и в водоемах всего необходимого для начала биогенной эры. Оно ознаменовалось двумя переломными момен- [c.380]

Рассмотрим количественный анализ смесей нуклеозидов, входящих в состав нуклеиновых кислот растворы аденозина (А), цитидина (Ц), гуанозина (Г) и тимиди-на (Т) их смесей. Предварительно получают спектры поглощения каждого из этих компонентов при различных значениях pH. Это позволяет определять положение изобестических точек (длины волн). Коэффициенты поглощения двух форм различной степени ионизации одного и того же соединения в изобестических точках равны между собой. Измерения разности поглощения при длинах волн, совпадающих с изобес-тпческими точками для форм одного из компонентов, упрощают обработку экспериментальных данных. Действительно, пусть имеется смесь из двух компонентов АН и ВН с константами ионизации p/ i и рКъ где Я] и Яг —длины волн изобестических точек для соединения ВН, т. е. e (A,i) = eB-( i) и e ( 2) =e 2). Измеряя [c.280]

Нуклеиновые основания и нуклеозиды можно разделять ТСХ на целлюлозе, используя в качестве элюентов водно-солевые растворы [Bij, Lederer, 1983]. Основную роль в этих случаях играют гидрофобные взаимодействия нуклепновых оснований с целлюлозой и эффект высаливания. [c.496]

Рис 4.4. Хроматограмма нуклеозидов, полученная на колонке РКР-1 размером 150X4,1 мм, скорость потока 0,75 мл/мин, подвижная фаза — 85,7% 1М раствора азВОз, 14,3% ацетонитрила, рН=9,0 [c.101]

Механизм образования М-гликози-дов этого ряда может быть объяснен, основываясь на следующих предпосылках как правило, моносахара в водных растворах предпочтительно существуют в а-форме во-вторых, все нуклеозиды при этом имеют (З-конфигурацию [c.62]

При исследовании конформации нуклеозидов неизбежно использовался метод диффракции рентгеновских лучей. Большая работа в этой области проделана и обобщена Арноттом с сотр. [41] и Сандаралингамом с сотр. [12, 19, 42]. Для выяснения предпочтительной конформации нуклеозидов в растворе использованы также методы ЯМР [43], кругового дихроизма [44] и дисперсии оптического вращения [12]. [c.76]

Фосфорилхлорид в растворе триалкилфосфата интенсивно используется для фосфорилирования незащищенных нуклеозидов основным продуктом после гидролиза является 5 -фосфат [53] схема (25) . Точный механизм этой реакции не установлен причиной стереоселективности может являться образование объемистого комплекса между фосфорилхлоридом и растворителем. Нежелательное образование ди- и триэфиров при синтезе нуклеотидов можно предотвратить применением в качестве фосфорилирую-щего агента монохлорфосфорной кислоты (Н0)2Р0С1. Хотя эта кислота очень нестабильна, диэфиры монохлорофосфорной кислоты стабильны и интенсивно использовались в качестве фосфори- пирующих агентов. Предложен ряд диэфиров, позволяющих при- [c.155]

Несмотря на неясность механизма реакции фосфорилирования, легкость использования ДЦК привела к тому, что он был применен для синтеза многих фосфодиэфиров и олигонуклеотидов [50]. Карбодиимиды являются также ценными реагентами для получения внутримолекулярных фосфодиэфиров. Так, рибонуклео-зид-2 (30-фосфаты в разбавленных растворах превращаются в 2, 3 -циклофосфаты, в то время как нуклеозид-5 -фосфаты, например АМР, превращаются в 3 5 -циклофосфаты, например сАМР схемы (38), (39) . [c.162]

При дальнейших исследованиях кобальтсодержащего комплекса из гидролизата цианокобаламина, освобожденного от Л -1-аминопропанола-2, нуклеозида бензимидазола и фосфорной кислоты, после окисления 5%-ным раствором марганцовокислого калия было получено девять различных органических кислот. Из них шесть идентифицированы как,уксусная, щавелевая, янтарная, метилянтарная, диметилмалоновая и 2,2-диметил-З-кар-боксиадипиновая (XXV) кислоты (схема 130) [53, 1061 эти кислоты могут образоваться в результате окислительного расщепления циклической системы гептакарбоновой кислоты (III). [c.588]

Внешние воздействия, например повышение температуры, добавле ние органических растворителей и другие, приводят к изменению макроструктуры. Это проявляется вначале в расхождении тяжей друг от друга (этот процесс условно называют плавлением). При гидролизе в достаточно мягких условиях отдельные полииуклеотидные цепи могут распадаться на нуклеотиды. Последние далее отщепляют при действии растворов щелочей фосфорную кислоту и превращаются в соответствующие нуклеозиды. Наконец, в присутствии кислот может протекать также и гидролиз гликозидных связей с образованием 2-дезок-си-О-рибозы и гетероциклических азотистых оснований. [c.665]

Уолфром и Коиильяро [4] показали, что Т. к. а. э. избирательно ацилирует аминогруппу 2-амино-2-дезокси-о-глюкозы (раствор метилата натрия в метаноле, 24 час, комнатная температура, выход 73%). Авторы использовали эту защитную группу в синтезе пуриновых нуклеозидов. Защитную группу отщепляют под действии аммиака в метаноле. (Следует иметь в виду, что пуриновые нуклеозиды неустойчивы в кислой среде.) [c.294]

Масс спектры лазерной десорбционной ионизации были за регистрированы на этой системе для ряда нелетучих образ цов — аминокислот, пептидов нуклеозидов сахаридов В боль шинстве случаев предел обнаружения составлял 1 нг/ см и менее Основная трудность при работе с этой системой зак лючалась в отсутствии воспроизводимости как относительных интенсивностей пиков основных ионов так и их абсолютных интенсивностей Главный источник этих изменений — неодно родность покрытия поверхности ленты образцом примеси и фоновые загрязнения Непосредственное нанесение раствора образца на ленту с последующим испарением растворителя не дает удовлетворительных результатов так как степень смачи ва1шя ленты и движение жидкости по поверхности влияют на однородность слоя и как следствие на форму пиков [61] Для полного испарения растворителя при ограничении испаре ния образца необходим тщательный баланс между потоком растворителя и скоростью испарения [c.43]

Взаимное расположение углеводных остатков и гетероциклических оснований. Важнейшей характеристикой в определении конформаций нуклеиновых кислот является взаимное расположение углеводной и гетероциклической частей, которое определяется углом вращения вокруг N-гликозилной связи у, В кристаллическом состоянии большинство нуклеозидов, моно-, олиго- и полинуклеотидов имеют анти конформацию (х — О 90 ) (рис. 190). Исключения наблюдвются в тех случаях, когда при атоме С(8) пуринов (или при атоме С(6) пиримидинов] находится объемный заместитель. В растворе производные пиримидинов имеют ]мги-конфор-мацию, тогда как пурины могут принимать как син-, так и анти конформации. [c.333]

Смотреть страницы где упоминается термин ДНК в растворе нуклеозидов: [c.403] [c.468] [c.281] [c.208] [c.493] [c.495] [c.299] [c.213] [c.123] [c.34] [c.83] [c.94] [c.157] [c.161] [c.125] [c.374] [c.247] [c.22] [c.294] [c.558] [c.374] [c.360] [c.22] [c.558] [c.255]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология