Конфигурация аминокислот

Другая обычная хираль ная молекула, аминокислота L-серин, много лет использовалась как ключ для определения относительной конфигурации аминокислот. Ниже приводится проекционная формула L-серина. Имеет ли он конфигурацию R или S [c.87]

Рис. 24.1. Соотношение конфигураций аминокислот и углеводов.

Хроматографические методы разделения энантиомеров применяются прежде всего при определении конфигурации аминокислот, для исследования рацемизации и для препаративного выделения небольших количеств энантиомеров. Некоторые аминокислоты могут быть разделены на оптические [c.62]

Являются ли наблюдаемые в земных условиях конфигурации ( -аминокислоты, Л-сахара) делом случая и может ли в принципе существовать где-то в космосе планета с жизнью, построенной на основе Д-аминокислот, -сахаров [c.660]

Последним пунктом нашей задачи было установление конфигурации аминокислот. Этот вопрос можно решить при помощи ферментативного [c.480]

Ранние работы в области аминокислот и белков начаты примерно одновременно с работами в области углеводов. Конфигурация аминокислот основывается на таковой для L-серина (46) (R = H20H). Однако в связи с тем, что все природные аминокислоты являются а-аминосоединениями, символы D/L в данном случае неизбежно относятся к асимметрическому атому, имеющему наименьший локант, в противоположность тому, как это принято в номенклатуре углеводов (основанной на при-писании этих символов асимметрическому атому, имеющему наибольший локант). В настоящее время доказано, что абсолютная конфигурация -серина отвечает символу 5, как и для большинства других природных аминокислот. Специалисты де-СООН [c.171]

Часто, однако, сравнивают конфигурацию аминокислот с конфигурацией Ь-серина и обозначают генетический ряд как Ь-ряд. [c.454]

Все эти аминокислоты, кроме глицина, имеют асимметрические центры и оптически активны. По своей конфигурации аминокислоты, получаемые гидролизом белков, одинаковы и принадлежат к одному и тому же конфигурационному ряду, что и Ь-(—)-глицериновый альдегид. [c.536]

Стереохимию аминокислот принято оценивать не по оптическому вращению, а исходя из абсолютной конфигурации всех четырех замещающих групп, расположенных вокруг асимметрического атома углерода в вершинах модели тетраэдра. Абсолютную конфигурацию аминокислот принято соотносить стереохимически с соединением, произвольно взятым для сравнения, а именно с глицериновым альдегидом, также содержащим асимметрический атом углерода. Ниже представлены Ь- и О-стереоизомеры глицеринового альдегида. Рядом показаны пространственные конфигурации Ь-и О-аланина [c.39]

Конфигурации аминокислот. Как отмечалось выше, методом сравнения оптических свойств было установлено, что природный (- -)-ала-нин, полученный из белков, имеет ту же конфигурацию, что и (-Ь)-молочная кислота. Непосредственным путем было показано, что эта кислота имеет ту же конфигурацию, что и L-глицериновый альдегид следовательно, природный правовращающий аланин имеет конфигурацию L. [c.384]

Широко распространено использование ферментов с известной субстратной специфичностью для выбора между конфигурациями а-аминокислот. Например, способность служить субстратом для оксидазы /)-аминокислот считается строгим подтверждением -конфигурации аминокислоты. Окислительное отщепление а-водорода этим ферментом происходит лишь в том случае, если атом водорода находится в том положении, какое он имеет в серии [c.236]

Вслед за этим первым результатом Вейганд и сотр. [20, 22] разделили ряд диастереомерных пар метиловых эфиров ТФА-ди-пептидов, главным образом на капиллярных колонках. Эти обнадеживающие результаты сразу же были применены к определению конфигурации аминокислот в природных и синтетических пептидах, в особенности для исследования рацемизации в пептидном синтезе. [c.171]

Аминокислоты, за исключением глицина, содержат асимметрический атом углерода в а-положении. Поэтому существуют две структуры, являющиеся зеркальными изображениями одна другой (энантиомеры, гл. 2). Абсолютную конфигурацию аминокислот удобно относить к абсолютной конфигурации о- или ь-глицеральдегида (рис. 12.2). В природных белках аминокислоты относятся к ь-ряду исключение составляет очень небольшое число необычных белков, выделенных из микроорганизмов. [c.263]

Еще одной важной проблемой в стереохимии природных соединений является установление строения полипептидных антибиотиков, продуцируемых бактериями и грибами. Такие полипептиды часто содержат в своей структуре неприродные аминокислоты, т. е. имеющие в-конфигурацию или обладающие структурой, не обнаруженной в белках. Очистка и установление структуры таких сложных соединений, часто вьщеляемых в очень небольших количествах, требует квалифицированного разделения и точных аналитических методов. В этом отнощении исключительно важным является непосредственное определение конфигурации аминокислот методом хиральной хроматографии. Особенно большое значение имеет применение хиральной ГХ для хирального аминокислотного анализа и создания аминокислотных карт гидролизатов. Приведенный ниже пример [24] должен проиллюстрировать сказанное. [c.182]

Абсолютная конфигурация аминокислот. После того как работы Куна и других исследователей на основании теоретических представлений, связанных с явлением вращательной дисперсии (стр. 427), и в особенности работы Бийво по рентгеноструктурному анализу (1956) привели к установлению абсолютной конфигурации винной кислоты, а отсюда и многих углеводов, очередной задачей стало установление конфигурационной связи между аминокислотами и этими соединениями. [c.368]

Для удобства написания пептидных фрагментов предложено пользоваться сокращенными названиями аминокислотных остатков, которые состоят из первых трех букв тривиального названия аминокислоты, например Ala для L-аланина и Met для L-метионина (сокращения для других аминокислот см. в табл. 1-1). Оптическая конфигурация аминокислоты указывается символами, причем специально отмечаются только о- и DL-амино-кислоты, например о-А1а и DL-Met. длло-Соединения обозначаются символом а , например alle для алло-ь-изолейцина. [c.11]

Интересным подтверждением этих идей явилось наблюдение, что смена конфигурации аминокислоты [L- на D-) приводит к тому, что конформация (156), благоприятствующая уходу R, заменяется конформацией (157), способствующей потере Н и трансаминированию схема (100) . Перекрестную реакционную способность можно продемонстрировать на примере -серингидроксиметилазы последняя катализирует реакцию переаминирования D-аланина [125]. [c.642]

После установления абсолютной конфигурации молочной кислоты на основании расчета дисперсии вращения (Кун, 1935 г.) и винной кислоты с помощью рентгеноструктурного анализа (Бийвй, 1951 г.) нужно было установить однозначные стерические связи природных аминокислот с этими гидроксикислотами. Это удалось Ингольду и др. в 1951 г. они осуществили перевод о(-I-)-бромпропионовой кислоты в ь(-I-)-молочную кислоту и в ь(- -)-аланин. Эти превращения протекают по 8 2-механизму, и, как показано кинетическими исследованиями, обусловливают обращение конфигурации у асимметрического атома углерода. Таким образом была однозначно установлена абсолютная конфигурация аминокислот. [c.28]

Димерный белок тирозил-тРНК-синтетаза, для которой сделан рентгеноструктурный анализ с разрешением 0,27 нм, характеризуется М 90 ООО и размером молекулы 13 нм. Узнавание ферментом нужной аминокислоты и тРНК происходит с исключительной точностью. Комплекс фермент — аминокислота образуется путем электростатического взаимодействия с элементами белковой структуры, а также за счет полярных и гидрофобных связей с боковой цепью аминокислоты. Условием для образования комплекса является наличие правильной конфигурации аминокислоты. [c.389]

Это довольно необычные аминокислоты, которые присутствуют и в других микробиологических продуктах. При введении в полипеп-тидную цепь они вызывают образование циклических структур, существенно более стабильных, чем образованные дисульфидными мостиками. Хиральная ГХ позволила также определить конфигурации аминокислот в низине [26], субтилине [27] и анковенине [28]. Исключительная полезность метода иллюстрируется рис. 8.7, на котором показано, что в области выхода пиков 3-метиллантонина при хроматографировании полного гидролизата низина присутствует только один (28, 38, 6К) из четырех возможных стереоизомеров, которые в этих условиях все прекрасно разделяются. [c.183]

К счастью, несколько иная методика измерения была разработана рядом хроматографистов, одним из которых был Г. Поллок, работающий в том же самом Научном центре в Эймсе. Основанный на газовой хроматографии, метод Поллока требует всего лишь нескольких микрограммов пробы и может быть применен к сложным смесям атаино-кислот. Первым этапом методики была этерификация аминокислот чистым (только одним энантиомером) 7 -2-бутанолом. Полученный эфир имел два асим метрических центра и мог существовать в виде-двух диастереомеров ЯЯ и где первая буква относится к конфигурации спирта, а вторая — к конфигурации аминокислоты. Затем эфиры были переведены в амиды обработкой трифторуксусным ангидридом для уменьшения полярности амино-группы и повышения летучести производных аминокислот, что позволило проводить успешное их хроматографирование. Используя капиллярные колонки, имеющие характеристики, приведенные на рис. 17-16, Поллок получил хроматограмму смеси диастереомерных производн ых аминокислот. Заметим, что каждая аминокислота дает пару пиков. Эксперименты доказали, что каждый пик отвечает одному из двух диастереомеров и что характеристики удерживания диастереомеров, которые отличаются только конфигурацией при асимметрическом углеродном атоме, как оказалось, были вполне достаточными, чтобы можно было проводить их разделение на газохр оматографической колонке. Таким образом, относительные количества Я- и 5-энантиомеров для некоторых отличающихся между собой аминокислот можно было определить хроматографированием,, сравнивая относительные высоты ЯЯ- и 5-пиков для каждого производного аминокислоты, причем для обнаружения требуется всего несколько нанограммов каждой аминокислоты. [c.585]

Биосинтез остатка тиглиновой кислоты (30) в метелоидине (23) и родственных алкалоидах аналогичен биосинтезу тиглиновой кислоты в организмах животных. Исходным веществом является изолейцин (28), который теряет аминогруппу, превращаясь в 2-метил-масляную кислоту (29) [32, 33]. -Изолейцин является также предшественником 2-метилбутаноильного остатка в молекуле (31, сохраняющего абсолютную конфигурацию аминокислоты [34. [c.547]

Окислительное дезаминирование а-аминокислот в а-кетокислоты и моноаминов в альдегиды. Окислительное дезаминирование а-аминокислот катализируют флавопротеиды—оксидазы L-аминокислот, катализируюш,ие окисление природных аминокислот L-ряда, и оксидазы D-аминокислот, действующие на неприродные аминокислоты D-ряда. Ферменты высокоспецифичны по отношению к стереохимической конфигурации аминокислот и малоспецифичны по отношению к боковой цепи, а-Аминокислота при каталитичес-, ком действии флавопротеида дегидрогенизируется до иминокислоты, об- разующийся дигидро-ФАД передает водород на молекулярный кислород, а иминокислота неферментно превращается в а-кетокислоту [369] [c.565]

Не следует путать префиксы, написанные прописными и заглавными буквами и О, / и Ь. Последние до сих пор часто используются для обозначения абсолютной конфигурации аминокислот и сахаров. Если в проекции Фишера с атомом С наверху функциональная группа у определяющего стереоцентра находится справа, то это абсолютная конфигурация В, если слева — Ь. Для аминокислот определяющим стереоцентром является атом С , а для сахаров — стереоцентр с наивысшим локантом. [c.268]

СКОЛЬКО сотен тысяч лет. К сожалению, ученые не получили, в результате этого эксперимента никакой информации о. биохимической активности на Земле около трех миллиардов лет назад. Еще одно интересное открытие, основанное на этом, же методе, было недавно сделано в лаборатории Квенвольдена. Анализ структурных конфигураций аминокислот, полученных в результате гидролиза метеоритного экстракта, показал, ч то метеориты содержали эквимолярные количества R- и 5-энантиомеров следовательно, они являются включениями не земного происхождения и, по всей вероятности, не синтезированы биологически, а образовались в результате органических химических реакций, протекающих где-нибудь за пределами Земли. [c.586]

Ответ. Две молекулы, являющиеся зеркальным отображением друг друга (стереоизомеры), одинаково стабильны следовательно, левовинтовые спирали могут образовываться. Однако поскольку при синтезе белков образуются исключительно правовинтовые структуры, то, ио-ви-димому, здесь либо 1ыеет место кинетический эффект, либо ь-конфигурация аминокислот стабилизирует правовинтовую спираль. Заметим, что левовинтовые спирали ь-кислот не являются зеркальными отображениями правовинтовых спиралей ь-кислот. [c.380]

При установлении конфигурации аминокислот их принято сравнивать с - и Д-молочными кислотами, конфигурации которых установлены по и О-гляцериновым альдегидам (см. стр. 591). [c.779]

Совершенно очевидно, что метиловые эфиры N-ТФА-дипептидов, образующихся при частичном гидролизе высшего пептида,— это не единственно возможные диастереомерные производные, пригодные для определения конфигурации аминокислот методом ГЖХ. Исследуемый пептид можно подвергнуть также полному гидролизу, а получающиеся аминокислоты превратить затем в подходящие производные, вводя для образования разделяемых ГЖХ диастереомеров второй асимметрический центр. Длг этой цели успешно используются метиловые эфиры N-ТФА-аминокислот, если, как сообщалось Гил-Авом [32], применять стеклянный капилляр, покрытый оптически активной жидкой фазой в таких условиях разделение энантиомерных производных l- и о-амино-кислот достигается за счет образования водородносвязанного дцастереомерного ассоциативного комплекса с жидкой фазой. В качестве производного можно взять также эфир с оптически активным спиртом, согласно Чарльзу [37] и Гил-Аву [38, 39], применившими 2-бутиловые или 2-н-октиловые эфиры. Аналогичной методикой пользовались Поллок и сотр. [40—42, 78]. [c.172]

Обе реакции проводились с изучением кинетики оказалось, что они протекают по типу 5n2, следовательно, в каждой из них происходило обращение конфигурации. Азидопропионовая кислота была каталитически восстановлена в (+)-аланин (ХС)—при этой реакции, по-видимому, конфигурация не изменяется. Поскольку для молочной кислоты еще ранее была классическими методами найдена корреляция с глицериновым альдегидом (стр. 168), а для аланина—с серином, исследованные реакции позволили установить непосредственную связь между стандартной конфигурацией (1) ДЛЯ (+)-глицеринового альдегида и стандартной конфигурацией II для природного (—)-серина оба стандарта оказались эквивалентными, и установленные ранее конфигурации, аминокислот, сводимые к серину, заменяются также конфигурациями сводимыми к глицериновому альдегиду. , - [c.181]

Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.70 , c.72 ]

Названия органических соединений (1980) -- [ c.196 ]

Хроматографическое разделение энантиомеров (1991) -- [ c.13 ]

Органическая химия (1963) -- [ c.384 ]

Общая химия (1974) -- [ c.678 ]

Основы стереохимии (1964) -- [ c.244 , c.252 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.30 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология