Сегмент, богатый

Известно, что кинетические свойства самой обычной низкомолекулярной жидкости не могут быть охарактеризованы одним временем релаксации, напротив, имеется спектр времен релаксации, отвечающий различным видам движения кинетических единиц. В гл. IV указывалось, что спектр времен релаксации особенно богат и разнообразен в случ-ае полимеров. Каждое время релаксации отражает определенный вид движения, например тот или иной вид конформационных изменений в макромолекулах в результате перемещения сегментов. [c.130]

Набор из 46 митотических хромосом человека называют его кариотипом. Цитологические методы, разработанные в начале 70-х гг., позволяют безошибочно идентифицировать каждую хромосому в кариотипе человека. Для этого специально подготовленные препараты митотических хромосом обрабатывают красителями, способными флуоресцировать только при связывании с определенными типами последовательностей ДНК. Несмотря на то, что эти красители обладают очень низкой избирательностью [их использование позволяет в основном отличать участки ДНК, обогащенные АТ-парами (О-полосы) от участков с ОС-богатыми последовательностями (К-полосы)], обработка ими митотических хромосом выявляет в каждой из них характерную картину чередования темных и светлых полос (сегментов) (рис. 9-39). Распределение [c.121]

Богатые урацилом последовательности присутствуют также в сегментах М, N3, КА, НА и КР, которые не дают жизнь главным ДИ РНК (см. табл. 24). Поскольку РНК вируса гриппа в общем смысле богаты урацилом [45], присутствие в последовательности кластеров урацила, расположенных в непосредственной, близости в нескольких местах соединения, может быть случайным. [c.263]

Для эффективной транскрипции ранней области необходимы G -богатые элементы размером 21/22 п.н. и левый сегмент длиной приблизительно 90 п.н однако их ориентация относительно друг друга и сайтов начала транскрипции несущественна. Так. весь повтор из 21/22 п.н. может быть инвертирован без снижения эффективности транскрипции. Точно так же левый элемент размером 72 п.н. стимулирует правильную инициацию транскрипции, находясь в любой ориентации. В то же время, в отличие от повтора из 21/22 п.н., который функционирует только в том случае, когда он находится на своем обычном месте, положение сегмента из 72 п. н. не играет роли. Транскрипция ранней области начинается в правильном месте с нормальной эффективностью, даже если этот сегмент перемещен в интрон ранней области или на сотни и даже тысячи пар оснований вправо или влево от единицы транскрипции и находится в любой ориентации. Однако важно отметить, что сам по себе элемент из 72 п.н. не стимулирует транскрипцию, как и в том случае, если он и элемент из 21/22 п.н. содержатся в разных молекулах ДНК. [c.51]

В. Окрашивание митотических хромосом флуоресцентными красителями позволяет в основном отличать ДНК, богатую АТ-парами нуклеотидов (О-сегменты), от ДНК, обогащенной ОС-парами (К-сегменты). [c.137]

В 1938 г. Зелиг Хехт (Selig He ht) открыл, что для возбуждения палочки (клетки) сетчатки человека достаточно одного фотона. Рассмотрим молекулярную основу исключительно высокой чувствительности этих клеток. Палочки представляют собой тонкие удлиненные структуры диаметром обычно 1 мкм и длиной 40 мкм. Основные функции этой клетки четко разделены пространственно (рис. 37.22). Наружный сегмент палочки специализирован для фоторецепции. В нем содержится примерно 1000 дисков, сложенных стопкой (рис. 37.23). Диски представляют собой закрытые уплощенные мешочки толщиной около 160 А. Эти мембранные структуры насыщены фоторецепторными молекулами. Мембраны дисков и плазматическая мембрана наружного сегмента не соприкасаются. Тонкая ресничка соединяет наружный сегмент с внутренним сегментом, богатым митохондриями и рибосомами. Во внутреннем сегменте с очень высокой скоростью вырабатывается АТР и идет активный синтез белков. Диски наружного сегмента имеют срок жизни всего лишь 10 дней и постоянно обновляются. Внутренний сегмент соприкасается с ядром, расположенным рядом с синаптическим тельцем. Синаптическое тельце, в котором содержится много синаптических пузырьков, образует синапс с биполярными клетками. [c.340]

Теперь мы обратимся к краткому рассмотрению того, как описанные фотохимические изменения превраш,аются в электрический импульс, который стимулирует мозг. Существуют доказательства, что одиночный квант света может вызвать раздражение палочки сетчатки. Однако поглощение одного кванта еще не создает эффекта зрения. Для этого требуется попадание нескольких квантов (согласно разумной оценке, от двух до шести квантов) в одну и ту же палочку в течение относительно короткого временного промежутка. Но даже в этом случае процесс весьма эффективен, а энергия конечной реакции существенно превосходит энергию, поглощенную зрительным пигментом. Поглощение света инициирует цепь реакций, черпающих энергию из метаболизма. Тем самым зрительное возбуждение является результатом усиления светового сигнала, попадающего в сетчатку. Фоторецептор служит биологическим эквивалентом фотоумножителя, который преобразует кванты света в электрический сигнал с большим усилением и низким шумом (см. гл. 7). И фоторецептор, и фотоумножитель достигают большого коэффициента усиления с помощью каскада стадий усиления. Зрительные пигменты представляют собой интегральные мембранные белки, которые находятся в плазме и мембранах дисков внешнего сегмента фоторецептора. Фотоизомеризация ретиналя вызывает серию конформационных изменений в связанном с ним белке и тем самым образует или раскрывает ферментативный активный центр. Следует каскад ферментативных реакций, которые в конце концов дают нервный импульс. Электрический ответ начинается с кратковременной гиперполяризации, вызванной закрытием нескольких сотен натриевых каналов в плазматической мембране. Таким способом молекулы-посредники (мессенджеры) передают информацию от диска рецептора к мембране плазмы. Вероятным кандидатом на роль мессенджера является богатый энергией циклический фосфат цГМФ (гуанозин-3, 5 -цикломонофосфат), возможно, в сочетании с ионами Са +. Было показано, что катионная проводимость плазматических мембран палочек и колбочек прямо контролируется цГМФ. Таким образом светоиндуцированные структурные изменения диска активируют механизм преобразования, который сам генерирует потенциал, распространяющийся по плазматической мембране. В настоящее время детали механизмов преобразования и усиления продолжают исследоваться. Была предложена схема, основной упор в которой делается на центральную роль фосфодиэстеразы в процессе контроля за кон- [c.241]

Кроме гистонов в хроматине присутствует большое количество различных негистоновых белков, характер взаимодействия которых с нуклеосомной ДНК пока не ясен. Наиболее богато представлены негистоновые белки HMG 14 и 17, функция которых остается все еще не изученной. H.MG 14 и 17 —это близкие по структуре белки, несущие большое количество заряженных групп. Они состоят соответственно из 68 и 74 аминокислотных остатков. Две молекулы этих белков способны к кооперативному связыванию с нуклеосомой, причем каждый белок взаимодействует с концевым участком ДНК и вторым сегментом, расположенным на расстоянии примерно 20 п. о. от ее конца. Эти две области нуклеосомной ДНК в основном свободны от гистонов (см. рис. 125). HMG 14 и 17 связываются с обращенной внутрь нуклеосо.мы стороной двойной спирали ДНК и не меняют существенным образом общую форму нуклеосомы. Создается впечатление, что этн два белка занимают свободную внутреннюю область ДН К нуклеосомы. [c.242]

НЗ—Н4>2, имеющий подковообразную форму. К ветвям подковы обратимо присоединены два димера умеренно лизин-богатых Г. (Н2А-Н2В). На пов-сть октамера навивается ДНК (ок. 160 пар остатков нуклеотидов), образующая два витка левой суперспирали. Г. группы HI присоединяется своей глобулярной частью к периферии нуклеосомы, фиксируя места выхода из нее ДНК, а также располагается иа межнуклеосомных участках ДНК. Этот же Г. с помощью длинных подвижных концевых сегментов осуществляет поперечные сшивки между нуклеосомами и ответствен за сворачивание их цепочки в структуры высшего порядка. [c.575]

Способ, благодаря которому кремнезем собирается около зародышей полимеризации в специфических центрах организма, остается вопросом предположений и гипотез. Для того чтобы образовались твердые частицы кремнезема в сусиензии в водной среде, необходимо сильное пересыщение раствора мономера, Однако если какое-либо органическое вещество оказывается способным адсорбировать монослой кремневой кислоты, которая затем полимеризуется до образования пленки кремнезема, то кремнезем будет продолжать осаждаться на таком участке нз раствора при условии небольшого пересыщения в этой области. Так, на основании изучения состава стенок клеток нескольких разновидностей диатомей Хекки и др, [390в] предположили, что кремневая кислота способна связываться на богатой гидроксильными группами клеточной поверхности белка, на которой содержатся большие количества серина и тропеонина. Такой белковый слой удерживается на полисахаридах клеточной стенки. Гидроксильные группы аминокислотных сегментов полисахаридов формируют поверхность, на ко- [c.1088]

Оба эти гормона (8 и 9) являются модифицированными изопреноидами [8а]. Самый богатый природный источник ЮГ (8) — брющной сегмент самца бабочки павлиноглазка Нуа1рНога сесгор1а — содержит не более 1—2 цг на особь. Тем не менее, 8 довольно быстро стал доступным соединением благодаря тем огромным усилиям, которые были затрачены на его полный синтез [8Ь]. Выяснение роли и успешный синтез ЮГ вызвали целую лавину исследований, направленных не только на изучение механизма действия этого вещества, но и на создание многочисленных его синтетических аналогов, некоторые из которых нашли практическое применение как инсектициды нового поколения. [c.20]

При помощи стандартных цитологических и генетических методов можно доказать, что единицы наследственности — гены расположены линейно вдоль хроматидной нити и таким образом переходят к хромосомам. По мере того как хроматидиая нить формируется и становится лучше видимой, все яснее вырисовывается, что она представляет собой цепочку узелков, богатых легко окрашиваемой нуклеиновой кислотой, которые разделены менее интенсивно окрашенными сегментами, состоящими главным образом из белков. В течение телофазы некоторые участки хро-матид не диспергируют, превращаясь в неоформленный материал, а сохраняются в виде хорошо заметных интенсивно окрашенных узелков. Такой материал называется гетерохроматином, он особенно четко выражен вблизи ядрышка, где он образует связанный с ядром хроматин. Остальная часть хроматид называется эухро-матином. [c.135]

Некоторые данные о репликации вируса саркомы Рауса служат довольно ясным намеком на механизм онкогенеза, индуцированного РНК-содержащими вирусами. Оказалось, что уже на ранних стадиях инфекции вирусом саркомы Рауса должен происходить синтез ДНК, и при этом необходимо, чтобы ДНК функционировала на протяжении всего процесса репликации вируса [24] — обстоятельство, прямо противоположное тому, что наблюдается с репликацией всех неонкогенных РНК-содержащих вирусов. Высказывалось предположение, что РНК — ДНК-гибрид может представлять собой эквивалент репликативной формы (РФ) этих онкогенных вирусов [24]. Существует также предположение об образовании двух-ценочечных ДНК-провирусов, включенных в геном хозяина [497] Опыты по гибридизации ДНК хозяина и РНК вируса саркомы Рауса или РНК какого-нибудь другого вируса лейкоза показали, что небольшие сегменты этих РНК, особенно богатые аденином, комплементарны к ДНК-хозяина 1180, 181]. [c.276]

Как отмечалось выше (см. разд. 9.2.3), в гаплоидном наборе митотических хромосом млекопитающих при окрашивании можно обнаружить приблизительно 2000 темных АТ-богатых сегментов (О-полосы), разделенных светлыми ОС-богатыми участками (К-полосы). Примечательно, что АТ-богатая и СС-богатая ДПК различаются по времени репликации в 8-фазе. Эксперименты, подобные приведенном на рис. 9-60, показали, что большая часть СС-богатых полос реплицируются в первой половине 8-фазы, а большинство АТ-богатых - во второй ее половине. Отсюда можно сделать вывод, что гены домашнего хозяйства (конститутивные) находятся главным образом в СС-богатых полосах, а гены, активность которых характерна для специализированных клеток, относятся к АТ-богатым сегментам. Остается загадкой, почему геном млекопитающих должен подразделяться на такие большие чередующиеся блоки хроматина, многие из которых по размеру приближаются к целому бактериальному геному. Пеизвестпо также, сколько точек начала репликации из каждой репликационной единицы активируется одновременно. Возможно, в поздно реплицирующихся репликонах хроматин остается в конденсированном состоянии даже после окончания М-фазы и деконденсируется лишь в середине 8-фазы, открывая в репликоне сразу все точки начала репликации. В таком случае координированная репликация ДПК в пределах одной репликационной единицы, проходящая по принципу все или ничего , может отражать кооперативную природ процесса деконденсации хроматина (см. разд. 9.1.21). [c.141]

Полную последовательность 5-го сегмента РНК получили для двух штаммов — A/PR/8/34 [276, 294 и неопубликованные данные W. Min Jou, 1981] и A/NT/60/68 [107]. Сегмент 5 РНК состоит из 1565 нуклеотидов, включая в случае мРНК некодирующий 5 -участок из 45 нуклеотидов и некодирующий З -участок из 20 нуклеотидов. Кодирующая область из 1494 нуклеотидов кодирует 498 аминокислот, которые дают предсказанную м.м. 56 101 для NP, что очень близко по значению к молекулярной массе, рассчитанной по поведению NP в электрофорезе [58, 150, 204, 257]. Белок богат аргинином и имеет положительный заряд -Ы4 при pH 6,5. У него нет групп основных остатков, наличие которых можно было предположить для взаимодействия кислотных фосфатных остатков РНК с молекулами NP, и, следовательно, РНК ассоциирована со многими з частками молекулы NP, нейтрализуя заряды. На основании общей длины генома вируса гриппа. (13 588 нуклеотидов) и количества молекул NP, ассоциированных с одной вирусной частицей [54], можно рассчитать, что приблизительно 20 нуклеотидов взаимодействуют с одной белковой субъединицей. Можно также предположить, что РНК связана с наружной частью рибонуклеопротеидной структуры, так как она может замещаться поливинилсульфатом (84, 204] и чувствительна к расщеплению рибонуклеазой без разрушения структуры РНП [68.., [c.49]

Были определены полная последовательность сегмента 7 (М) РНК двух штаммов - A/PR/8/34 (H1N1) [2, 122] и A/Udom/72 (H3N2) 157], а также частичные последовательности ряда штаммов [35]. Вслед за первым кодоном АУГ в плюс-цепи кодируется белок 252 остатка, гидрофобный и богатый аргинином. Структуры триптических пептидов из очищенного белка М штамма PR8 [35] хорошо соответствовали ожидаемым из последовательности аминокислот, предсказанной по последовательности гена. [c.153]

Пятый — самый большой — сегмент РНК кодирует NP. Для шта ма PR8 NP представляет собой основную, богатую аргинино молекулу, состоящую из 498 аминокислот [280]. В основном пол. -гали, что транскрипция вирусной РНК осуществляется в комплез сах, состоящих из одного или бо.тее белков Р, так же как и NP, подобные комплексы, выделенные из инфицированных клеток проявляли транскрипционную активность [35, 42, 106, 211, 24С Однако недавно появилось сообщение о выделении активно] комплекса транскриптазы РНК, содержащего только три белка I NP был удален двумя циклами центрифугирования в S2SO4 [lit Большое количество мутантов с ts-повреждениями в гене NP ок. залось дефектным по последним стадиям цикла репликации вир са, включая синтез вРНК и созревание вируса. [c.224]

Сульфидные образования этих гидротермальных полей богаты п и обеднены Си, в них также отмечаются очень высокие концентрации Ка, Аи и Ag (см. табл. 6.3). Постройки сложены сфалеритом, вюртцитом и аморфным кремнием, осажденными на внутренних частях внешних стенок, состоящих из марказита и барита. Особенностью состава сульфидных отложений горы Осевой является большое содержание золота, сопоставимое лишь с сульфидами южного сегмента хребта Эксплорер [275]. [c.205]

Район талии у-иепей ие обнаруживает статистически значимой гомологии с доменами константного и вариабельного районов. Этот факт следует иметь в виду в связи с проблемой организации структурных генов для тяжелых цепей иммуноглобулинов (см. гл. 5). Уже на основании сведений, полученных при изучении первичной структуры, закономерно заключить, что район талии кодирует ген, имеющий иное филогенетическое происхождение, нежели гены, кодирующие Ун- и Сн-домены. Ген для района талии эволюционировал независимо от С-генов, и в ходе его эволюции сформировалось семейство сходных в структурном отношении генов, кодирующих соответствующие районы иммуноглобулинов различных классов (подклассов). Несомненное близкое структурное родство по крайней мере группы генов, кодирующих районы талии IgG человека различных подклассов, следует из того факта, что гомология по этому району достигает 70%. Подобие первичной структуры районов талии у IgG и IgA человека очевидно. Оба подкласса IgA содерлсат три полуцистиновых остатка и богаты пролином. Заметна дупликация небольших сегментов последовательности в IgA 1 Pro—Ser —Thr—Pro—Pro—Thr—Pro. [c.67]

Взаимодействие фактора транскрипции Spl с G -бо-гатыми кластерами повторов из 21 /22 п. н. Сегменты ДНК, содержащие повторы из 21 22 п.н., инкубировали с очищенным белком Spl и затем обрабатывали диметилсульфатом. Остатки G в трех G -богатых кластерах (они окрашены наиболее интенсивно) оказываются [c.56]

Аминокислотная последовательность фактора TFIIIA из X. laevis (использовано однобуквенное обозначение аминокислот см. рис. 1.24 Последовательность расположена на рисунке таким образом, чтобы выделить повторяющиеся злементы. Молекула состоит иэ следующих сегментов N-концевого участка (остатки 1-12), девяти повторов (остатки 13- 276), богатого лизином участка вблизи С-конца и короткого концевого участка. Вверху представлена каноническая последовательность-пронумерованные от 1 до 30 обозначения, заключенные в кружки,- которая иллюстрирует характерные особенности типичного повтора. Конечная точка [c.98]

Говоря об организации, мы имеем в виду три ее уровня. Первый уровень-это отдельные гены и соответствующие регуляторные элементы об этом щла речь в гл. 8. Здесь в результате изучения структуры и функций генов удалось установить наиболее важные факты и некоторые общие принципы. Второй уровень предмет обсуждения данной главы-это число генов и других сегментов ДНК и их взаимное расположение. Здесь получено довольно много данных, но общие принципы организации геномов окончательно не выяснены. Впрочем, установлен один интересный факт протяженные СС- и АТ-богатые последовательности (изохоры), обнаруженные у теплокровных животных, находятся в К- и С-областях хромосом соответственно. Лищь в очень немногих случаях относительное расположение генов подчиняется определенной закономерности. В качестве примера можно привести полицистронные опероны, характерные для прокариот и нетипичные для эукариот. Имеющиеся данные позволяют высказать предположение о значительной свободе в организации генетической информации, хотя реальная картина может оказаться несколько иной. Третий уровень относится к структуре хроматина и к ее влиянию на линейную организацию и экспрессию генов. Связь между экспрессией генов и структурой хроматина очевидна, но о ее механизме известно очень мало (разд. 8.7.а). [c.156]

У D. melanogaster примерно 160 генов 5S-pPHK собраны в тандемный повтор в хромосоме 2. Каждая повторяющаяся единица содержит упомянутый выше кодирующий участок длиной 120 п.н., транскрибируемый спейсер длиной примерно 15 п.н. на З -конце транскрипционной единицы и нетранскри-бируемый спейсер длиной 250 п.н. (рис. 9.7). По-видимому, все 160 повторяющихся единиц образуют единый, ничем не прерываемый кластер. Свыще 20 тандемных повторов было клонировано в виде одного сегмента длиной более 8 т. п. н. АТ-богатый участок в спейсере содержит внутренний повтор и имеет разную длину (примерно + 5 п. н.). [c.166]

Ретрогены. По геному перемещаются также разнообразные сегменты ДНК, не обладающие специфическими структурными и кодирующими свойствами транспозонов или ретротранспозонов. В отличие от мобильных элементов других классов, они весьма гетерогенны по размеру и структуре. У них нет концевых повторов, а на одном из концов часто присутствует АТ-богатая последовательность. К элементам этого класса, называемым ретрогенами, относятся процессированные псевдогены и SINE-последовательности они обнаружены у различных эукариот, но особенно обильно представлены у млекопитающих. Транспозиция ретрогенов, по-видимо-му, происходит через образование РНК с последующей обратной транскрипцией. Однако этот процесс скорее всего пассивный в том смысле, что данные элементы не кодируют необходимых для транспозиции активностей (т. е. обратную транскриптазу). [c.228]

Сайты-мишени. До сих пор, говоря о транспозиции у прокариот, мы рассматривали сами транспозирующиеся элементы. Что же представляют собой те сегменты ДНК, в которые они встраиваются,-сайты-мишени Одни транспозирующиеся элементы довольно разборчивы и охотнее встраиваются в короткие геномные сегменты, гомологичные концам самого элемента. Другие менее капризны и не отдают явного предпочтения никаким сайтам-мишеням, хотя наблюдается некоторая тенденция к встраиванию их в АТ-богатые участки. Некоторые элементы высокоспецифичны в отношении определенных палиндромных сайтов-мишеней (например. [c.232]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология