Дескрипторы структурные

Здесь — дескриптор (численный параметр, характеризующий структурный фрагмент и его окружение), а —число дескрипторов. [c.593]

Основной единицей АЖ является структурный концептуальный объект , с которым связаны дескрипторы. Эти объекты служат для отображения фактов, отношений, сценариев, событий, понятий й др. Формально все они являются списками свойств. Дескрипторы, заполняющие значения свойств, описывают объект разными способами могут указывать категорию и/или множество, к которым он относится указывать его роль в более сложном объекте задавать уникальное имя описывать его отношения с другими объектами содержать некоторый предикат, истинный для него, и пр. [78, 80, 81]. [c.238]

Все исследуемые соединения подразделены на массив обучения , содержащий молекулы с известными свойствами, и прогнозируемую группу молекул. Анализируемый массив обучения по исследуемому свойству разделён на две альтернативные группы ( активные - неактивные ). Созданные модели представляют уравнения логического вида Л = 7 (3 ), где Л - активность, (8) - решающий набор признаков (РНП) - комплекс фрагментов структурных формул и различных их комбинаций, так называемых суб-структурных дескрипторов. Оценка влияния фрагментов и их сочетаний на активность проводится на основании коэффициента информативности, изменяющегося в пределах от минус 1 до плюс 1. Чем выше абсолютное значение информативности, тем выше вероятность влияния данного признака на свойства. Знак плюс характеризует положительное влияние, минус - отрицательное . Р - алгоритм, с помощью которого осуществляется распознавание свойств исследуемых веществ. В процессе прогноза используются два алгоритма - геометрия (I) и голосование (II). Первый из них основан на определении расстояния в евклидовой метрике между исследуемым веществом и расчётным гипотетическим эталоном исследуемого свойства. Второй метод предусматривает анализ числа признаков ( голосов ) в структуре соединений, с положительной и отрицательной информативностью. Процедуры молекулярного дизайна описаны далее в разделе 5. [c.6]

Модели этой группы устанавливают связь между удерживанием и строением сорбатов, выраженным с помощью тех или иных структурных дескрипторов. Во многих случаях логарифм коэффициента емкости линейно связан с числом повторяющихся структурных фрагментов [c.79]

Аналогичные рассуждения, естественно, справедливы для связи параметров й и р с другими структурными дескрипторами Пс, X, собственно с площадями гидрофобных поверхностей сорбатов. Соотнощения (4.76) и (4.77) действительно наблюдаются в эксперименте. В табл. 4.24 приведены параметры этих уравнений. Значения коэффициентов корреляции не столь высоки, как в других случаях, однако, несомненно, отражают объективный характер связи Ь, р и lgP. [c.123]

Общее описание всех дескрипторов еще не закончено. Были созданы специальные правила для описания стереохимии, конформации и некоторых других структурных данных [204]. [c.28]

Для определения рамок интересующей его информации заказчик указывает структурную формулу конкретного вещества или типа соединений, а также словесные дескрипторы (слова и группы слов из заголовков, фамилии авторов, названия журналов, язык публикации, наличие биологической активности или другие облас- [c.109]

Основное внимание уделялось совершенствованию описания молекулярных структур. Использованные нами ранее структурные дескрипторы указывали на наличие отдельных структурных фрагментов в молекуле и не выявляли комбинаций структурных фрагментов, за исключением нескольких случаев. Так, 48-й дескриптор, а именно а-замещение, свидетельствует о появлении в молекуле метильной концевой группы и кольца, содержащего атом азота. Данный дескриптор характеризует вместе с тем взаимное расположение этих двух фрагментов. Метильная группа соединена с атомом углерода в кольце, который непосредственно связан с атомом азота. Использование приемов выделения признаков позволяет автоматически составлять дескрипторы, включающие несколько структурных фрагментов как единое целое. Дескриптор подобного рода называют множественным признаком. Множественные признаки, составляемые из структурных фрагментов перечня дескрипторов, не отражают позиционных соотношений. Не исключено, что выводить признаки, описывающие взаимное расположение фрагментов, удастся при ином подходе к изображению топологии молекулы вместо составления перечня дескрипторов. Рассматриваемые ниже множественные признаки указывают на комбинации фрагментов в молекулах, а не на позиционные соотношения между ними. [c.198]

Молекулярные структуры изображаются векторами образов, компонентами которых служат значения атрибутов (дескрипторов). Используемый здесь алгоритм ограничен бинарными атрибутами (нуль и единица). Поэтому предъявляемые алгоритму векторы образов состоят из 40 бинарных дескрипторов, отобранных из перечня дескрипторов, который охватывает 61 структурный фрагмент. [c.199]

Существенным недостатком традиционной книжной формы реализации указателя реакций является трудность поиска классов реакций по неполным значениям кодов. Этот недостаток может быть устранен только достижением возможности поиска реакций по произвольным частям кодов, т. е. по произвольным сочетаниям входящих в состав кодов символов образующихся и разрывающихся связей. С этой точки зрения представлялось целесообразным рассматривать различные виды образующихся и разрывающихся связей в качестве самостоятельных поисковых признаков. Такие признаки могут быть использованы как своеобразные структурные дескрипторы их отличие от словесных дескрипторов, используемых в документальных ИПС для описания отдельных аспектов содержания документов, заключается в том, что структурные дескрипторы реакций характеризуют особенности структурных схем реакций. [c.223]

Аналогичные структурные дескрипторы широко используются для приближенного кодирования структуры соединений как в автоматизированных ИПС (где они применяются главным образом в качестве фильтров , т. е. средств предварительного поиска), так и в многочисленных ручных и механизированных ИПС, реализуемых при помощи различного рода перфокарт. [c.223]

Охарактеризуем сначала группу дескрипторов, при помощи которых описывается структурная схема реакции. Основную часть этой группы поисковых признаков составляют дескрипторы, соответствующие различным видам рвущихся и образующихся связей. Так как рваться и образовываться могут одни и те же виды связей, то каждому виду связи соответствуют два разных дескриптора, которым приписаны два разных кодовых номера. Один из них обозначает разрыв связи, а другой — образование. Например, дескриптор образования связи С—Р имеет кодовый номер 6, а дескриптор разрыва связи С—Р — номер 206. [c.224]

Совокупности таких дескрипторов описывают химический тип реакции менее точно, чем приближенные коды скелетных схем, используемые в систематическом указателе. Поэтому поиск по таким дескрипторам может дать некоторое число лишних реакций, не удовлетворяющих запросу. Одиако существенное преимущество такого простейшего типа дескрипторного информационного языка без грамматики заключается в том, что наравне и в сочетании с поисковыми признаками, характеризующими структурную схему реакций, для поиска могут быть использованы дескрипторы, относящиеся к любым другим аспектам содержания информации, что позволяет намного уменьшить поисковый шум и получить ответы на весьма разнообразные многоаспектные информационные запросы. Для этих целей в ИПС-Р используются дополнительные группы дескрипторов, характеризующих условия проведения реакции, используемые [c.224]

Для проведения исследований QSAR/QSPR необходимы исходные данные - набор химических структур с известными значениями свойств или активностей. Для того, чтобы найти соотношения между свойством/активностью органических соединений и их структурой, необходимо представить химические структуры в численном виде. Такие численные характеристики получили наименование дескрипторов молекулярной структуры. Для моделирования какого-либо свойства важно отразить в значениях дескрипторов структурные особенности, определяющие это свойство. [c.113]

Примеры структурных дескрипторов, используемых в ИСП-Р для [c.225]

В ИПС-Р используется многочисленная группа структурных дескрипторов, характеризующих структурные особенности соединений, участвующих в реакциях, а также соединений, для которых не сообщаются данные о реакциях. Структурные признаки соответствуют наличию в соединениях функциональных групп, различного рода циклов, а также более крупных и мелких структурных фрагментов, представляющих интерес с точки зрения химии фторорганических соединений. Особенностью применяемых здесь признаков является использование двух различных [c.225]

Для формулировки информационных запросов используются обычно 4 — 7 дескрипторов. Например, в случае запроса о реакциях образования четырехчленных циклов в результате димеризации двух фторолефинов со структурной схемой поиск производится путем совмещения шести [c.228]

Разумеется, что упомянутые виды структурных дескрипторов реакций целесообразно применять в сочетании с неструктурными , характеризующими условия проведения реакций, используемые реагенты, катализато- [c.272]

Очевидно, что прежде всего необходимо обеспечить одновременный отбор и однократный ввод в систему информации о соединениях и реакциях. Автоматический отбор сведений из текстов публикаций и автоматический перевод с естественных языков на информациоппый пока остается отдаленной перспективой. Первичная обработка оригинальных публикаций, по-видимому, еще долгое время будет осуществляться высококвалифицированными химиками с целью однократного и исчерпывающего отбора всех видов химических сведений и их представлеиия в стандартизованной форме с максимальным использованием языка структурных формул. Для этого могут быть созданы стандартные бланки, иа которых должны регистрироваться, наряду с короткими рефератами на естественном языке, отражающими общую идею и теоретическую наиравлен-иость работы, структурные уравнения описываемых в работе конкретных реакций вместе с сопровождающей информацией, также представленной в стандартной форме, с нрименением словесных дескрипторов, структурных формул и числовых данных. При написании структурных уравнений реакций химик должен обозначить в явной форме образующиеся и разрывающиеся связи. Должны быть предусмотрены рациональные приемы компактной записи нескольких однотипных реакций одним обобщенным структурным уравнением, содержащим переменные радикалы, значения которых должны указываться отдельно в явной форме. Этим путем будет отражена одновременно большая часть информации об описываемых в работе химических соединениях. Остальные соединения и соировожда- [c.229]

Важной группой методов теории распознавания, имеющей большое значение для исследования каталитических процессов, является группа структурных методов распознавания [70, 71]. При анализе информации о структуре веществ каталитической системы прежде всего обрабатываются данные измерений с целью выделения признаков (дескрипторов), что позволяет получать новое представление о структуре со свернутым информационным содержанием. Обработка данных эксперимента может также сводиться к обнаруйсению и использованию регулярных структур-образов (комбинаторных регулярных структур [72]). Использование комбинаторной регулярности в качестве принципа описания структуры обеспечивает экономное привлечение средств описания. [c.92]

Код конкретной химической структуры представляется как набор таких дескрипторов, соответствующий всем возможным путям между соседними ДС, покрывающим структурную формулу. Нами проведены успешные эксперименты по исследованию связи структуры и биологического действия в языке ФКСП. В частности, разработан метод классификации химических соединений по пред- [c.120]

По справочным и патентным данным о фунгицидной активности органических соединений создан массив обучения, состоящий из 325 соединений 165 активных (класс А) н 160 неактивных (класс В). Аналогичный массив обучения для рострегулирующей активности со-дершгг 396 соединений, в т.ч. 194 активных (класс А) и 202 неакпшных (класс В). Анализ вкладов структурных элементов (дескрипторов) на проявление фунгицидной н рострегулирующей активности позволил сформировать информационный банк признаков, состоящий из 62 фрагментов первого, 83 второго и 111 третьего уровней сложности, в т1эм числе цикличе- [c.105]

Телесистема DAR дает возможность организовать поиск химического соединения в массивах СА с 1967 г., используя чисто структурный подход. В химические словари структурные элементы вводят с помощью таких дескрипторов, как название соединения, название фрагмента, кольцо, фрагмент молекулярной формулы и т. д. В этом массиве используют только структурные формулы или их фрагменты [9, 10]. [c.323]

Обязательными структурными элементами такого ИПТ являются дескрипторы, синонимы, старшие дескрипторы, младшие дескрипторы, ассоциативные дескрипторы и русские дескриторы, эквивалентные дескрипторам национальных вариантов. [c.230]

Чтобы усовершенствовать совокупность дескрипторов, к векторам образов добавляют дескрипторы другого типа. Это — субструктурные дескрипторы, характеризующие наряду с самим фактом наличия структурных особенностей и позиционные соотношения. [c.207]

При поиске соединений по номенклатуре в структурных базах данных Data-Star полезно знать, что структура систематического названия включает следующие основные элементы (в скобках указаны соответствующие квалификаторы, используемые для поиска так же, как при указании параграфов) основной фрагмент (HP) заместитель (SB) модификатор (NM) стереохимический дескриптор (не является поисковым признаком) определитель омографов (HD) линейная формула (не является поисковым признаком) функциональная категория (NM). [c.111]

Правило генерации может, например, предусматривать компактную запись, включающую кольцевую систему и ациклические фрагменты. В этом случае заранее может быть известен лишь общий класс фрагментов, которые будут выработаны алгоритмом. В соответствии с заранее сформулированными правилами алгоритм будет вырабатывать различные фрагменты, не будучи ограничен заранее их списком. Возможны и промежуточные варианты. При этом вовсе не обязательно, чтобы генерируемая запись включала именно фрагменты данной структурной формулы. Возможно алгоритмически вырабатывать дополнительную запись, свидетельствующую о принадлежности данной структуры к тому или иному общему классу соединений или же словесные наименования, характеризующие класс соединения, и т. д. В случае дескрипторных систем можно вводить отношения между дескрипторами и соответственно получать при автоматическом индексировании более репрезентативную характеристику структуры. Однако в последнем случае сложность системы возрастает. Итак, под автоматическим индексированием структурных формул понимается алгоритмически реализуемая процедура, ставящая в соответствие машинному коду структуры дополнительную запись, отображающую те или иные структурные особенности рассматриваемого соединения. [c.118]

В качестве классификационяых параметров в данной работе приняты обобш,енные структурные характеристики (дескрипторы), выбор которых [c.123]

Рассматриваемая система предназначалась для специализированной ИПС для класса соедипений с сопряженными связями, что оказало влияние на выбор дескрипторов. Было выбрано пять классов дескрипторов В — характеристика циклической разветвленности структурной формулы В — размер кольца В,—состав циклической системы В — число колец в циклической системе В," — состав заместителей. В рассматриваемой системе т -= 2 -н 15, т. е. каждый класс дескрипторов содержит от 2 до 15 отдельных дескрипторов. Автоматическое индексирование проводилось непосредствеппо по входным кодам структурных формул. В подобных случаях особое значение приобретает технологичность машинной расшифровки входных кодов. Это определяется том, насколько явно в коде отображена организация исходного графического изображения структурной формулы — скелет циклической системы, гетероатомы, заместители, связки и т. д. [c.123]

Так как различных видов связей очень много, то более редко встречающиеся связи в списке дескрипторов представлены в обобщенном виде. Для этого введены символы Ме для обозначения всех металлов и символ Z для обозначения любых элементов, отличных от С, Н, X (X = С1,Вг, I), кислорода, азота, серы, фтора и металлов. Используется также обобщенный вид связи, обозначаемый символом—, которому может соответствовать как простая связь, так и двойная или тройная. Например, образующуюся связь С—Р и С = Р обозначают одним и тем же дескриптором образовапие связи С — Р . Для некоторого уточнения описания структурной схемы реакций имеется группа дескрипторов, характеризующих измепения кратности связей, а также изменения циклов. Представление о всех упомянутых дескрипторах дает таблица структурных дескрипторов, извлеченных из списка поисковых признаков ИПС-Г (в том виде, в ( отором они использовались в одном из ранних вариантов системы [137]). [c.224]

В литературе [138, 139] описано несколько перфокартотечных ИПС для органических реакций, использующих дескрипторные системы индексирования, близкие к системе, применяемой в ИПС-Р. Механизированная поисковая система [139], разработанная для информационной службы ряда западноевропейских химико-фармацевтических фирм, реализована на машинно-сортируемых перфокартах, иа каждой из которых закодирован дескрипторный поисковый образ определенной реакции. Используются структурные фрагментарные дескрипторы для раздельной характеристики особенностей строения исходных и конечных соединений реакции, дескрипторы образующихся и разрывающихся связей, а также группы других дескрипторов для характеристики реагентов, условий проведения и дополнительных видов сведений о реакциях. В этой системе, наравне с единичными реакциями, регистрируются и индексируются в качестве реакций также многостадийные синтетические приемы. Отмечается хорошая точность поиска, обеспечиваемая сочетанием дескрипторов различных групп [139]. Есть основания полагать, что дескрипторные индексы реакций окажутся весьма эффективными поисковыми фильтрами в крупномасштабных автоматизированных ИПС для реакций. Вопросы совместного использования и сочетания в рамках таких систем различных методов кодирования реакций будут обсуждены в следующем параграфе. [c.228]

В большинстве случаев предварительный поиск по такого рода запросам можно начинать по одному из упомянутых трех поисковых массивов, построенных по кодам скелетных схем, которые используются в качестве фильтровой информации. Далее, внутри сравнительно небольшого числа групп или подгрупп реакций, скелетные схемы которых не противоречат условиям запроса, продолжается поатомный поиск непосредственно по полным линейным кодам совмещенных структурных уравнений конкретных реакций. В случае запросов, выражаемых наиболее общего вида структурными особенностями , может оказаться целесообразным проводить предварительный поиск не по скелетным схемам, а по дескрипторным поисковым образам структурных уравнений реакций. С этой целью необходимо выработать автоматически еще одип фильтровый поисковый массив реакц1 й, в котором в качестве дескрипторов должны использоваться отдельные виды изменяющихся связей и характеристики изменения циклов. Наряду с такими структурными дескрипторами реакций в этом поисковом массиве целесообразно отразить с помощью других дескрипторов также главные особенности условий проведения реакций, применяемые реагенты, катализаторы и другие неструктурные виды информации о реакциях. Это позволит проводить соответствующие виды поисков по запросам неструктурного или смешанного характера. Использование в дескрипторном фильтровом поисковом массиве реакций структурных дескрипторов, характеризующих особенности строения исходных или конечных соединений, не представляется целесообразным, Соответствующие поиски могут проводиться в подсистеме соединений с последующим переходом от соединений к реакциям с помощью имеющихся при соединениях отсылок на регистрационные номера реакций. Когда структурные условия на соединения, участвующие в реакции, лишь дополняют более сильные условия на структурный тип реакции, то проверка структурных особенностей соединений может проводиться непосредственно по структурным уравнениям конкретных реакций. [c.235]

В Советском Союзе в нескольких научно-исследовательских институтах созданы и уже действуют машинные информационно-поисковые системы по различным видам молекулярной спектроскопии. Наиболее широко известна оистема, реализованная на основе ЭВМ Минск-32 , Научно-информационного центра по молекулярной спектроскопии при Сибирском отделении АН СССР в Новосибирском институте органической химии [2—4]. В основе этой системы лежат машинные каталога по различным видам молекулярной спектроскопии, включая сведения о молекулярной формуле, физических свойствах и характеристических признаках спектральных кривых, машинный каталог структурных формул и библиотека программ. Машинный каталог по инфракр1асной спектроскопии включает более 60 тысяч спектральных дескрипторов, а каталог [c.248]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология