Поли пролин

Весьма сходную с полиглицином П спиральную структуру имеет поли (L-пролин). Из-за присутствия больших по размеру боковых групп более предпочтительной оказывается левая спираль. Надо сказать, что для полипептидной цепи из L-аминокислот любой способ укладки в спираль будет приводить к разной стабильности правой и левой спиралей. [c.92]

Исследования с применением препаратов печени и почек показали, что L-пролин окисляется через глутаминовую кислоту до СОг и NH3. Участвующий в этом процессе фермент, пролин-оксидаза, действует также на L-оксипролин [367, 1092] по-видимому, она отличается от оксидазы L-аминокислот. Оксипролин окисляется в этой системе не до конца в процессе окисления накапливается продукт, 2,4-динитрофенилгидразон которого является, как предполагают, производным 7-полу альдегида [c.351]

Поскольку коллаген содержит большое числот остатков глицина и пролина, имеет смысл сначала рассмотреть данные о структуре двух синтетических полипептидов — полиглицина и поли-Ь-пролина — и лишь затем перейти к структуре коллагена. [c.250]

Поли-Ь-пролин. Поскольку пролин является иминокислотой, в поли-Ь-пролине нет атомов водорода, образующих водородные связи. Поэтому этот полимер не может иметь структуру а-спирали или какую-либо другую структуру, стабилизируемую водородными связями. Рентгенограмма поли-Ь-пролина указывает на существование винтовой оси третьего порядка с трансляцией остатка вдоль оси, равной 3,1 А. Неплоское кольцо пролина в [c.251]

В разд. 2 гл. XX мы уже говорили о том, что у нитритных мутантов ВТМ на месте пролина находится лейцин. Это замещение согласуется с приведенным выше кодом. Действительно, при дезаминировании цитозин превращается в урацил и соответственно изменяется кодовый триплет. Правильность кодовых триплетов, найденных при изучении невирусных систем, подтверждается также тем, что у нитритных мутантов ВТМ фенилаланин может появиться, но никогда не исчезает. Результаты экспериментов, в которых сополимеры синтетических нуклеотидов, обработанных азотистой кислотой и, следовательно, дезаминированных, вводились в синтезирующие белок бактериальные системы, согласуются с приведенными выше данными. После обработки поли-УЦ азотистой кислотой активность этого сополимера изменяется, причем в отношении стимуляции вклю- [c.377]

Для нативного коллагена характерно сильное отрицательное вращение ([ф]в около —400°) при денатурации происходит сильный сдвиг вправо до [ф в приблизительно —120° [94, 124]. Вращение поли-ь-пролина II при денатурации в присутствии [c.258]

Р и с. 47. Координаты для атомов скелета в поли-Ь-пролине II. [c.261]

Полученные значения можно сравнить с изменением вращения [125] (290°) при денатурации поли-ь-пролина II. [c.262]

Несколько иные результаты для температурной зависимости оптического вращения Р-казеина были получены Гарнье [236, 237]. Он анализировал данные по дисперсии оптического вращения (ДОВ) при переходе температуры от 5 к 40° С и нашел, что цепь Р-казеина частично свернута в спираль типа поли-Ь-пролин И и изменение в дисперсии оптической активности объясняется уменьшением содержания спирали типа поли- -пролин И и увеличением содержания а-спирали. Возможность существования в Р-казеине участков цепи с укладкой типа поли-Ь-пролин II (особенно при низких температурах) отмечается и в работах других авторов [238, 239]. [c.102]

Они были получены для растворов казеина в 6 М растворе мочевины — расчгворителя, способствующего образованию конформации статистического клубка. Значения для всех растворов казеинов были найдены равными 0 0 —60, что также характерно для Статистического клубка. Значения =—680 и = —630 были взяты в качестве эталонных значений параметров и для чисто спиральных (а-спираль) конформаций структур белков, так как в литературе принято характеризовать оптическое вращение чисто спиральных форм именно этими значениями параметров а,, и [248]. Значения о = —1950 и = 125 были взяты из данных по оптическому вращению для полипептидов поли- -пролина, которые в литературе [238] принято считать за эталонные для Р-струк-туры. [c.105]

В работах Пчелина и Кульмана [89—91] показана роль электростатических взаимодействий и pH среды в формировании адсорбционных слоев желатины, обнаруженная при исследовании поверхностного натяжения статическим методом. Полученные результаты для желатины (с = 0,5 г/100 мл) при 40 °С на границе с воздухом показали, что при формировании адсорбционных слоев в отсутствие соли электростатические взаимодействия приводят к замедленному образованию слоя. Однако конечные величины поверхностного натяжения в кислой области pH не зависят от заряда макромолекул. Отсутствие вклада в поверхностную активность желатины полярных остатков при подавлении их ионизации, а также неизменность поверхностного натяжения, характеризующего адсорбционные слои желатины в статических условиях десорбции при изменении pH, не может объясняться с классических позиций изменением поверхностной активности и ионизацией полярных групп. Авторы предположили, что аналогично известному аффекту мутаротации поли-/ -пролина в кислой области pH имеет место протонизация имидных связей в молекулах желатины. При этом снижается заторможенность вращения вокруг таких связей и повышается общая гибкость цепи, что способствует дифференциации сегментов по полярности и обусловливает существенно ббльшую поверхностную активность но сравнению со щелочной областью pH, где цени более жесткие. [c.179]

Известно, что молекулы поли-/--пролина могут иметь в растворе две различные спиральные формы. В воде, органических кислотах и некоторых органических растворителях, таких, как трифторэтанол, пoли-L-пpoлин принимает конформацию левой транс-спирали З1, которая характеризуется большой протяженностью молекулы в направлении оси спирали. Эта структура полностью идентифицирована по данным рентгеноструктурных исследований в кристаллическом состоянии (рис. 13.31) и обычно обозначается как форма II. В этой (конформации <р= 120°, г1з = 300° и со = 0. При синтезе пoл и-L-пpoлiинa из Ы-карбоксиангидрида с последующим осаждением из пиридина макромолекула принимает гораздо более компактную конформацию правой ц с-спирали Ю1, обозначаемую как форма I. Пространственная модель этой структуры по данным рентгенографии приведена на рис. 13.32. В этой конформации углы Ф и г ) приблизительно такие же, как и в форме II, но угол со=180°. Форма 1 является одной из самых компактных среди идентифици- [c.336]

Судя по относительным химическим сдвигам, наблюдаемым в протонных спектрах ЯМР полисаркозина и поли-Ы-метил-1-ала-нина (см. разд. 13.6.1 и 13.6.2), можно было бы ожидать, что а-протоны (сигналы которых наиболее легко идентифицируются в сложных спектрах этого полимера) будут сильнее экранированы в форме II, чем в форме I. В действительности же в уксусной кислоте, которая стабилизирует форму II, наблюдается обратная картина. На рис. 13.33 приведены спектры поли-/,-пролина (СП = 25) в форме I, растворенного в СОзСООО, записанные через 10 мин, [c.338]

Один из важных полипептидов, поли-1--пролин, является по-лпимпнокислотой и поэтому не способен к образованию внутримолекулярных водородных связей. Однако под влиянием стери-ческих факторов в полипролине возникает упорядоченная конформация (поли- -пролин II), представляющая собой спираль [c.24]

В полипептидах аминокислот, например, в полипролнне была также обнаружена особая конфигурация цепей. Она является следствием специфической стереохимии пирролидиновых колец. Цепь поли-ь-пролина — левая спираль с тремя остатками ъ обороте. [c.541]

Белки коллагеновой группы характеризуются относительно высоким содержанием остатков пролина и оксипролина. Как показали последние исследования, эти остатки вместе с остатками глицина скапливаются на отдельных участках молекулярных цепей. На этих учасшах возникают конфигурации, имеющие много общего с конфигурацией цепи поли-Ь-пролина. [c.543]

Последовательности нейротоксинов II и D на участке 1-23 различаются в двух местах Leu заменен на Met, Ser - на Pro . Влияние пролина рассмотрено выше. Что касается другой замены, то она также не вызывает осложнений. Для определения положения боковой цепи Met построена карта Xi X2 (при Xi = 180°), из которой следует, что наиболее предпочтительная ориентация боковой цепи Met отвечает углам Хь Хг 180, 180° (у Leu нейротоксина II 180, 60°). У нейротоксина 4 три остатка в рассматриваемом фрагменте отличаются от нейротоксина II (Thr", Gln и Pro вместо Pro", Lys и Ser ). Их основные цепи легко принимают значения углов ф, у соответствующих остатков исследованного фрагмента нейротоксина II, а боковые цепи включаются в его систему стабилизирующих контактов. Положения последних следуют из конформационных карт Х Хг Для Thr" и Gln , полученных в поле циклической структуры у Thr" из-за соседства с Рго приемлемо лишь одно значение угла Х 60° у Gln - наиболее предпочтительна ориентация боковой цепи ХьХг 180, 60° и Хз 90°. [c.424]

Дальнейшая расшифровка кода была основана на использовании синтетических статистических гетерополинуклеотидов определенного состава, задаваемого набором и соотношением субстратных нуклео-зиддифосфатов в полинуклеотидфосфорилазной реакции. Так, было показано, что статистический сополимер поли(и. С) кодирует включение в полипептидную цепь четырех аминокислот фенилаланина, лейцина, серина и пролина. Если соотношение U С в полинуклеотиде было 1 1, то все четыре аминокислоты включались в полипептид [c.14]

Эргоалкалоиды, среди которых преобладающим является эргота-мин, представляют собой частично циклизованные тетрапептиды, построенные из остатков лизергиновой кислоты и трех из числа следующих аминокислот аланина, пролина, фенилаланина, валина, лейцина, t-аминомасляной кислоты или аминопропанола. Они продуцируются спорыньей — нитчатым грибом lavi eps purpurea (см. с. 649), паразитирующим на зерновых культурах (чаще всего на ржи), и выделяются нз зрелой формы гриба — так называемых склероций. Заболевания от употребления зараженного зерна в пищу — эпилептические конвульсии ( злая корча ) и гангрена конечностей ( антонов огонь ) — в средние века носили массовый, эпидемический характер, В настоящее время успехи агротехники очистили поля от спорыньи, но ее стали разводить искусственно, так как эргоалкалоиды оказались ценными лечебными средствами они вызывают сокращения матки и широко применяются при родах и для прерывания беременности, а также успокаивают нервную систему, уменьшают тахикардию, лечат мигрень и т, д. Эргометрин также применяется в медицине, а его ближайший аналог — диэтиламид лизергиновой кислоты (ЛСД..= ) является одним из самых мощных галлюциногенов и поэтому принадлежит к числу опаснейших наркотиков (см, с, 649). [c.769]

Учитывая обращение химических сдвигов а-протонов в пoли-L-пролине, следует весьма осторожно делать выводы о конформациях подобных полимеров и использовать для этих целей модельные соединения. Например, сигналы а-протонов цис-конформера метилового эфира Н-ацетил-1-пролина расположены в более слабом поле, чем для транс-конформера, во всех применявшихся растворителях (СРзСООН, ОаО, СВзСМ, СОзСООО, СОзОО, сГе ДМСО и трифторэтанол), за исключением СОСЬ, в котором, так же как и в полимере, эти сигналы имеют обратное расположение. Как уже обсуждалось в разд. 13.6.1 и 13.6.2, отнесение цис- и гранс-конфор-меров основывается на результатах, полученных для Ы,Н-диметил-формамида, для которого найдено, что гранс-конформер является [c.338]

Рис. 13.33. Спектры растворов поли-1-пролина с СП=25 в СОзСООО при 30 °С

Наконец, несколько слов следует сказать о конформации полипролина. Как мы уже указывали, для пролина разность энергий транс- и г ис-амидной групп значительно меньше, чем для других аминокислотных остатков, и потому можно ожидать существования структур цис- н транс-поля-Ь-щолша, Ликвори [51, получив кривые U - p) для обеих форм полипролина (одна из этих кривых близка к кривой рис. 16, если не считать свернутой формы), нашел параметры спиралей, соответствующие оптимальным конформациям. Транс-тш-Ь-пролин дает левую спираль с п=3,04 и d=3,ll А (соответствующие экспериментальные значения, полученные из рентгеноструктурного анализа —п = 3,00 и d = 3,12 А [118]). Оптимальная конформация г ыс-поли-1-пролина соответствует правой спирали с п=3,25 и d=l,98 А (экспериментальные значения п = 3,3, rf=l,9 А [129]). [c.143]

Специфические типы внутримолекулярных связей, однако, не обязательны для сохранения в разбавленном растворе упорядоченных структур, присущих твердому кристаллическому состоянию. Так, синтетический поли-1-пролин, имитирующий структуру коллагена, может существовать в растворе как в форме клубка, так и в форме спирали [30]. Поскольку этот полимер является полииминокислотой, образование в нем внутримолекулярных водородных связей невозможно. Спиральная форма в этом случае несомненно сохраняется вследствие стерических ограничений, обусловленных громоздкими пирроли-диновыми кольцами. [c.60]

Разделяются только ацетилированные аминокислоты, так как свободные адсорбируются кремневым гелем. Метод количественный, Точность 5%. Пригоден для разделения моноаминомоно карбоновых кислот и серийных полу.микроопределенпй фенилаланина, лейцина, изолейцина, триптофана, валина, метионина, пролина, аланина и тирозина. [c.388]

Этот способ изучения кода был продолжен затем Ниренбергом и его сотрудниками, Очоа и его сотрудниками и другими исследователями, получившими много ценных сведений. Например, было показано, что поли-А направляет синтез полилизипа, а поли-1Ц способствует включению пролина в кислотонерастворимый материал. [c.273]

При взаимопревращениях пролина, орнитина и глутаминовой кислоты общим промежуточным продуктом является -полу-альдеГ Ид глутаминовой кислоты. Это соединение впервые получили Фогель и Дэвис [302], обнаружившие, что оно служит предшественником пролина. Реакция переаминирования между орнитином и кетокислотами доходит почти до конца как в печени, так и у Neurospora. Равновесие реакции смещено [c.226]

Образование коацерватов РЮР-9 относится к той группе процессов, которые стимулируются высокими температурами (при низкой температуре существует только одна фаза). Примерами подобных процессов являются полимеризация белков вируса табачной мозаики или гемоглобина, пораженного серповидноклеточной анемией, деление оплодотворенного яйца, преципитация поли-Ь-пролина выше 25 °С и другие. Лауффер [66] относит эти явления к разряду процессов переноса энтропии , предполагая, что их движущей силой является возрастание энтропии воды. Усиление гидрофобных взаимодействий также способствует протеканию этих процессов. [c.73]

Многие нативные белки имеют спиральную конформацию [87]. При денатурации происходит разрушение спиральной структуры и образуется более открытая и подвижная конформация [88, 89], часто называемая беспорядочным клубком ( random oil ). Эти конформационные изменения сопровождаются сильным изменением оптического враш,ения [90—92] было высказано предположение [93, 94], что спирали, как таковые, дают большой характеристический вклад в оптическое враш,ение. Особенно интересна а-спираль [95—100] (рис. 43), которая может, очевидно, встречаться как в правой [101—103], так и в левой [104] форме, и спираль поли-ь-пролина [94, 105] [c.257]

В данной работе использован электродиалпзный метод разделения пикратов, основанный иа миграции под действием электрического поля при pH 2,5 пикриновой кислоты к аноду, а -пролина ( -оксипролина) к катоду [c.66]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология