Спираль параметры

Определение основных гидродинамических параметров перемешиваемой жидкости. Рассмотрим течение жидкости в плоскости, перпендикулярной осн вращения лопасти. Изучение линий токов показывает, что они являются семейством логарифмических спиралей (рис. 9.19). Касательные в различных точках спирали образуют с нор- [c.280]

При конструировании вначале задаются внутренним диаметром спирали, расстоянием между спиралями, а также шириной листа спирали, которую обычно. принимают равной 350—750 мм. Основным характеризующим параметром спиральных испарителей является шаг спирали. [c.84]

Интересно и важно для дальнейшего, что спираль оказалась двойной две цепи с одинаковым направлением гликозидных связей тесно связаны водородными связями и закручены в правую спираль с шагом 26 А. Такая двойная спираль является довольно устойчивым образованием. Геометрические параметры каждой отдельной цепи диктуются конформацией повторяющегося звена 19 и хорошо обосновываются теоретическими методами современного конформационного анализа полимеров. Шаг этой спирали достаточно велик, так что между соседними витками остается большой промежуток ( пружина сильно растянута). В этот промежуток точно укладываются витки второй спирали причем таким образом, что между соседними остатками из двух разных цепей возникают водородные связи, поддерживающие стабильность всей конструкции. [c.166]

Согнутую полоску, смоченную маслом, вводят внутрь стеклянной трубки посредством вспомогательной спирали из медной проволоки. Масло из колонки вымывают эфиром, а медную спираль либо вывинчивают, либо растворяют ее в азотной кислоте. Рабочие параметры такой колонки длиной 430 мм, измеренные при помощи смеси н-гептана с метилциклогексаном, приведены в табл. 22. Следует обратить внимание на очень низкую величину задержки. Эта колонка пригодна для перегонки небольших количеств, особенно при работе в вакууме. [c.243]

На рис. 5.3 приведены кривые зависимости между углами ф, ijj) (рис. 2.2) и параметрами спирали d и п. Спираль с п <2 невозможна. Имеется всего лишь несколько линейных групп, в которых нет стерических затруднений и которые стабилизированы водородными связями либо в пределах цепи (например, а-спирали), либо между соседними цепями (например, Р-складчатый лист, коллаген). Параметры наиболее важных линейных групп даны в табл. 5.1. [c.84]

Отдельная полипептидная цепь левой спирали недостаточно упорядочена. Элементом группы левой спирали одиночной пептидной цепи следует считать триплет, поскольку он является элементом группы суперспирали. Идентичны не все, а только каждые третьи пары значений углов (0, vf). Однако отклонения в углах (0, г з) для всех остатков невелики и составляют около 10°. Поэтому структуру отдельной цепи можно аппроксимировать спиралью (линейной группой) с одним остатком в качестве элемента группы, которой отвечает одна конформационная точка на карте (0, i ) (рис. 2.3). Параметры спирали одиночной полипептидной цепи прд ведены в [c.90]

Остатки с низкими относительными статистическими весами значительно укорачивают среднюю длину спирали. Чтобы оценить спиральный потенциал данного белка, было использовано одно значение параметра инициации а = 5 10 (разд. А.4). Кроме того, были введены три различные значения х для всех типов остатков. Так, 5 -= 0,385 соответствовало остаткам, прерывающим спираль (В), 5 1, 00 — индифферентным к спирали (/) и з=1,5 — образующим спираль (Н) (табл. 6.1). Значения а и х получают по наклонам и температурным переходам зависимостей, описывающих переходы спираль — клубок в синтетических полипептидах, используя уравнения (А. 18) и (А.20). Спиральная конформация предсказывается для всех положений остатков I, для которых / , больше средней величины В результате получаются непрерывные потенциальные функции, поскольку уравнение (6.2) учитывает кооперативность модели Зимма — Брэгга, согласно которой спирали должны иметь определенную длину (рис. А. 1). Этот метод предсказания дает спиральные сегменты длиной около 10 остатков, что намного меньше длины, ожидаемой для данного значения а гомополимеров при 5= 1, т. е. Ь 1/"5 10 = 40 (уравнение (А.17)). Такое укорочение спирали является следствием включения остатков с низкими значениями 5. [c.139]

Параметры Я и Я, . характеризующие склонность остатков входить в а-спираль и а Р [c.144]

В случае перехода спираль — клубок, индуцируемого изменением температуры, параметр нуклеации можно оценить по наклону кривой в точке перегиба. Как показано выше, экспериментальную кривую индуцируемого изменением температуры перехода спираль — клубок можно сопоставить с теоретической кривой, если известна величина АЯ. Это сопоставление позволяет получить параметр нуклеации. Однако во многих случаях величина АЯ бывает неизвестна. Тем не менее оценить величину о можно. Согласно уравнению (А.15) при учете (А.10) наклон кривой перехода в точке перегиба (х = 1) должен быть равен [c.302]

Параметр кооперативности а, вводимый при рассмотрении переходов типа спираль — клубок в полипептидах или полинуклеотидах [16] и являющийся мерой числа звеньев, входящих [c.59]

Наблюдаемая сильная зависимость tn от п определяется тем, что X должно убывать с увеличением п. Из опыта следует, что X резко убывает в области между п = 4 и п = 5. Это означает, что п = 4 есть критический размер матрицы, при котором новая цепь может, по-видимому, образовывать с матрицей двойную спираль. Оценки параметров дают N/k 1 мин, к 30 Л/ мин- ki N мин К [c.547]

Прп кожухах большего диаметра (порядка 100—125 мм) рекомендованы [35] несколько другие значения конструктивных параметров наружная спираль Der. 1— (О,/ ч- 0,8)Dp, (1>0- l,5)D a. 1, 6 — (0,12ч- [c.214]

Спираль, параметры спирали и развертка поверхности спирали. п. — чнсло остатков на виток, —аксиальное смещение на остаток, —шаг спирали, г —радиус спирали. Для получения развертки поверхностн спнраль проецируют иа коаксиально расположенный цилиндрический лист бумаги, этот лист разрезают параллельно оси спирали и затем разворачивают. Развертку поверхности называют также Цилиндрической диаграммой. Она делает наглядными геометрические соотношения между остатками. Изменение лицевой стороны обрезанного листа ведет к зеркальному изображению той же цилиндрической диаграммы. [c.83]

Полосы регулярности связаны с регулярной конформацией макромолекул [34, 39, 57]. Они возникают в спектре в том случае, когда конформационно-регу-лярная последовательность мономерных звеньев достигает некоторой критической, характерной для данной макромолекулы величины. Положение и интенсивность полос регулярности зависят от строения и длины регулярных фрагментов макромолекулы. Макромолекула может иметь конформацию плоского зигзага, но в большинстве случаев это регулярная спираль, параметры которой можно определить. В ИК спектре такой спирали проявляются только те колебания, при которых соседние звенья колеблются в фазе или же сдвиг по фазе равен углу закручивания спирали. Полосы регулярности не связаны с агрегатным состоянием полимера. В аморфных и жидких образцах, а также в растворах могут существовать цепи, приближающиеся к одномерной бесконечной спирали. Появление полос регулярности при кристаллизации полимера вызвано стабилизацией регулярной спирали в кристалле. [c.16]

Как только я увидел рентгенограмму, у меня открылся рот и бешено забилось сердце. Распределение рефлексов было неизмеримо проще, чем все, что получали раньше для А-формы. Более того, бросавшийся в глаза черный крест мог быть лишь результатом спиральной структуры. Пока речь шла об А-форме, доказательства спиральности оставались косвенными и тип спиральной симметрии был неясен. Но для В-формы можно было получить некоторые важнейшие параметры спирали, просто посмотрев на рентгенограмму. Не исключено, что всего за несколько минут можно будет установить число цепей в молекуле. Расспросив Мориса, что же они извлекли из этой рентгенограммы, я узнал, что его коллега Р. Д. Б. Фрэзер уже успел серьезно поработать над трехцепочечными моделями, но ничего интересного у него до сих пор не получилось. Хотя Морис соглашался, что доказательства спиральности теперь неоспоримы (теория Стоукса - Кокрена - Крика ясно указывала на существование спирали), он не считал это главным. В конце концов, он и раньше думал, что получится спираль. Трудность, по его мнению, заключалась в отсутствии какой бы то ни было гипотезы, которая позволила бы им расположить основания регулярно внутри спирали. Конечно, при этом они исходили из предпосылки, что Рози права, стремясь расположить [c.96]

В последние годы параметры В-, А- и Z-форм двойных спиралей ДНК удалось уточнить высокоразрешающим рентгеноструктурным анализом монокристаллов самокомплементарных синтетических олигонуклеотидов, образующих короткие двойные спирали (дуплексы). При этом можно оценить конформацию каждой нуклеотидной пары в дуплексе. Оказалось, что внутри двойной спирали сушествует конформационная микрогетерогенность в зависимости от последовательности нуклеотидных пар конформации сахаров в нуклеотидных остатках несколько отличаются. 2 го приводит к отличиям в межнуклеотидных расстояниях вдоль оси спирали и к различному наклону пар оснований к этой оси. Такие зависящие от первичной структуры различия во вторичной структуре ДНК, по-видимо.му, чрезвычайно важны для ее функционирования. [c.29]

Ранее предложено несколько схем поэтапного расчета структуры -спиральных белков tS.IIl. Они базируются на первоначальном расчете низкоэнергетичных конформаций пар соседних а-спиралей, и их последупцей взаимной укладке. На этом пути достигнуты неплохие результаты. Так, в работе (5J по известной схеме взаимодействия пар -спиралей в достаточно ограниченном конформационном простра1ютве изменения параметров взаимной [c.141]

При расчете третичной структуры осуществлялось задание случайных расположений о-спиралей в аадактоА области минимизации с помощью датчика случайных чисол. Выбиралась достаточно большая область минимизации, охватывапцая большую часть возможных конформационных состояний данной белковой молекулы, учитывающая, что а-спирали связаны между собой небольшими участками полипептидной цепи. Параметры области минимизации, опре-делящие отклонение в обе стороны от начального расположения, приведены ниже [c.146]

Конформация цепей полимеров виниловых мономеров определяется конфигурацией последоват. асимметрич. атомов С, фрагмента — HR—. В изотактич. полимерах (—СН — HR—) плоская зигзагообразная конформация цепи невозможна из-за стерич. отталкивания соседних групп R. Вследствие этого происходит последоват. транс-гош-ориентация связей и цепь приобретает спиральную конформацию, закрученную влево или вправо. Изотактич. макромолекулы могут образовывать спирали разных видов, а синдиотактические-могут существовать не только в виде спирали, но и в виде плоского зигзага. В тех полимерах, у к-рых радикалы не слишком объемны, спираль содержит три мономерных звена на виток (тип 3,), как, напр., у изотактич. полипропилена (табл. 2). В случае полимеров, содержащих объемные боковые группы, образуются более развернутые спирали. Так, спираль в макромолекуле поли-винилнафталина содержит четыре звена в витке (тип 4,). Спирально-упорядоченные структуры макромолекул характерны для полипептидов, белков, нуклеиновых к-т. Форма и размер заместителей в мономерном звене С.п. определяют не только параметры спиральной конформации цепей в решетке, их т-ры плавления, но и скорость кристаллизации, р-римость и осн. деформац.-прочностные св-ва. Изотактич. полимеры, содержащие очень объемные заместители, характеризуются высокими т-рами плавления и стеклования (табл. 2). [c.429]

Конформационные параметры Рц, Рр и Р( представляют собой частоты встречаемости данной аминокислоты в составе а-спирали, р-структуры или р-изгиба (по данным для 15 белков с известной структурой), деленные на среднюю частоту встречаемости данной аминокислоты в молекуле. Аминокислотные остатки в таблице расположены в порядке убывания их способности образовывать спираль. Символы - —1- , + , сл. , безр. , анти. и анти.+ означают, что аминокислота характеризуется соответственно сильной тенденцией к образованию данной структуры, умеренной тенденцией, слабой тенденцией, что ей безразлично, в какой структуре она будет находиться, что она противодействует нли сильно противодействует образованию структуры данного типа [29]. [c.100]

Подобно белкам, нуклеиновые кислоты могут денатурировать. Этот процесс состоит в расхождении цепей двойной спирали ДНК и двухспиральных участков молекулы РНК (в частности, тРНК рис. 2-24). Денатурацию можно вызвать добавлением кислоты, щелочи, спиртов или удалением стабилизирующих структуру молекулы противоионов, например Mg +. В результате денатурации каждая из цепей молекулы приобретает форму беспорядочно свернутого клубка, поэтому данный процесс называют переходом спираль—клубок. Тепловая денатурация нуклеиновых кислот, как и белков, носит кооперативный характер (гл. 4, разд. В.7) и происходит в довольно узком интервале температур характерным параметром процесса является температура плавления. [c.142]

Возможно существование нескольких различных спиральных структур, возникающих при образовании водородных связей между структурными элементами пептидной связи (NH- и СО-группы), из которых наиболее известна а-спнраль (рис. 3-14) с параметрами п = 3,6, i = 0,15 нм и h = Oi54 нм. В случае а-спирали за счет внутримолекулярных водородных связей образуется 13-членная кольцевая структура. Правильно назвать такую структуру можно так а(3,6)з)-спираль. Другими упорядоченными конформациями спирального типа для остова молекулы белка являются Зю-спираль, 7г(4,4) -спираль и 7(5,117)-спираль. [c.378]

В структурном отношении спаренная (двутяжевая) часть каждой шпильки и черешка представляет собой двойную спираль. Двойная спираль РНК характеризуется 11 парами нуклеотидных остатков на виток. Параметры этой спирали близки к таковым А-формы ДНК Это и есть основной элемент вторичной структуры тРНК (рис. 18). Кроме канонических (Уотсон —Криковских) пар оснований О С и А и, в двуспиральных участках тРНК нередко реализуется пара О и, наиболее близкая по пространственным параметрам к каноническим парам (рис. 19 см. цветную вкладку). [c.35]

Другой характер носит вторичная структура неспаренных участков, таких как петли и акцепторный еССА-конец. Здесь часто имеется односпиральное расположение нескольких остатков, поддерживаемое межплоскостными взаимодействиями ( стэкинг ) оснований. Структура антикодоновой петли представляет особый интерес (рис. 20) три основания антикодона и два последующих основания, примыкающие к нему с З -стороны, находятся в едином стэкинге друг с другом и образуют однотяжевую правозакрученную спираль со своеобразными параметрами, так что первое основание антикодона помещается на самой [c.36]

Правильные спирали полностью описываются парой двугранных углов. Строение этих спиралей показано на рис. 5.4, а их параметры приведены в табл. 5.1. Зю-, а- и я-Спирали стабилизированы водородными связями между пептидными амидной и карбо- [c.85]

Вытянутые полипептидные цепи могут взаимодействовать между собой посредством водородных связей и образовывать слоистые структуры. Кроме а-спиралей в качестве возможных упорядоченных структур полипептидной цепи, образованных водородными связями, Полинг и Кори [204) постулировали плоские параллельный и антипараллельный Р-складчатые листы (рис. 5.8). И в том, и в другом типах р-структур цепь образует линейную группу с одним остатком в качестве элемента группы, (спиральные) параметры которой приведены в табл. 5.1. Углы (ф, г )) в обоих случаях находятся в разрешенной области (рис. 2.3), а образуемые водородными связями диполи находятся на одной линии. Расположение водородных связей схематически показано на рис. 5.8, б и 5.8, в. Если смотреть вдоль полипептидного остова, видно, что боковые цепи ориентированы поочередно то по одну, то по другую стороны средней плоскости складчатого листа, причем связи —Ср приблизительно перпендикулярны плоскости (рис. 5.8, а). Возможны смешанные па-раллельно-антипараллельные слои, для чего требуется некоторое изменение углов (ф, г )). [c.93]

Большинству р-складчатых листов свойственна левая закрутка цепей. При п = +2,0 (табл. 5.1) пептидные цепи, образующие параллельные и антипараллельные 5-структуры, постулированные Полингом и Кори [204 , имеют общую среднюю плоскость. Такая плоская (антипараллельная) р-структура была найдена, например, в глутатионредуктазе [1241. Однако большинство складчатых листов являются неплоскими [43, 205] они характеризуются левой закруткой, если смотреть вдоль плоскости листа перпендикулярно его вытянутым цепям, как показано на рис. 5.10, г (если смотреть по направлению цепей, то скручивание будет считаться правым). Отдельную цепь скрученного листа можно в хорошем приближении описать линейной группой с одним остатком в качестве элемента. Это очень растянутая левая спираль, углы (ф, V )) и спиральные параметры которой приведены соответственно на рис. 2.3 и в табл. 5,1. Как схематично показано на рис. 5.10, б, такая левая спираль отвечает правому повороту карбонильной и амидной групп примерно на 60° на два остатка. Поэтому водородные связи между соседними цепями могут образоваться только в том случае, если направления цепей образуют друг с другом угол около 25 (рис. 5.10, в). Это и приводит к скручиванию слоя. Длина скрученного листа неограниченна. 5-фиброин шелка содержит, по-видимому, очень длинные скрученные ленты р-складчатого листа. [c.95]

Параметры инициации, полученные из данных по синтетическим полимерам, хорошо коррелируют с частотами встречаемости остатков на концах спирали. Чоу и Фасман [201] сравнили также параметры инициации а, полученные при рассмотрении переходов спираль — клубок (разд. А.5), с частотами встречаемости остатков на концах спиралей в глобулярных белках. Как и в работах Лифсона и Ройга [375], в данном случае было проведено усреднение по обоим [c.140]

Проблема самосборки есть проблема физической динамики. Вторичная структура может служить блоком в самосборке, если, во-первых, она формируется значительно быстрее, чем третичная, во-вторых, если она существует достаточно долго и, в-третьих, если она достаточно велика и гидрофобна, чтобы включиться в сильное гидрофобное взаимодействие. И а-спирали, и -формы удовлетворяют этим требованиям. Для расчета вторичной структуры необходимы параметры равновесия (величины я, с. 100) между различными возможными структурами для всех остатков. Соответствующий математический аппарат, использующий модель Изинга (с. 101), развит в работах Птицына и Финкельштейна. Гидрофобные остатки стабилизуют а- и -формы, короткие гидрофильные, а также Гли и Про — дестабилизуют. Удается найти пространственную структуру ряда белков. Расхождение между вычисленным и наблюдаемым распределениями а- и -участков не превышает 20% (рис. 4.15). Самосборка глобулы происходит двумя путями формирование плоской -структуры с последующим прилипанием к ней а-спирали и формирование -шпильки или пары а-спиралей с последующим изломом. Распределенгив гидрофобных групп, благоприятствующее формированию а- или [c.109]

Двойная спираль ДНК замыкается в кольцо в клетках бактерий (например, в Е. oli), в частицах бактериофагов и т. д. Можно рассматривать ДНК — кольцевую или незамкнутую — на основе модели упругого стержня, характеризуемого двумя энергетическими параметрами — жесткостью на изгиб оси и жесткостью на кручение (см. с. 256). Персистентная длина ДНК велика (с. 228)—двойная спираль обладает высокой жесткостью на изгиб. [c.231]

Остов полипептидной цепи может образовывать спиральные структуры с параметрами, близкими к двойной спирали ДНК в В- и 4-формах. Как показали конформационные расчеты н построение молекулярных моделей, стереохимически возможны два типа спиральных структур, одна из которых (/) имитирует структуру повторяющихся Г -метилпирролкарбоксамидных единиц дистамицина, а вторая (g) представляет собой регулярную спираль, в которой карбонильные группы остова могут образовывать водородные связи с 2-аминогруппами гуанина, находящимися в одной и той же полинуклеотидной цепи (рис. 8.18). Две антипараллельные, И или tg, пептидные цепи можно расположить в узкой бороздке таким образом, что образуются водородные связи между пептидными группами двух цепей и ос-Еованиями ДНК. Этот структурный мотив был обнаружен экспериментально. [c.292]

Оказалось, что рассеяние рентгеновских лучей под сравнительно большими углами дает информацию о конформационном ближнем порядке в синтетических полимерах и в глобулярных белках [49, 50]. Было установлено, в частности, что параметр (4яД)з1п0 для максимумов интенсивности имеет. разные значения для а-спиралей и р-форм белков. Неупорядоченные участки максимумов не дают вовсе, и, следовательно, этот метод позволяет изучать денатурацию. [c.284]

Третья методика расчетов Л мех основана на определении составляющих энергозатрат. Предложенные зависимости для вычисления отдельных составляющих общей мощности громоздки и малопригодны для инженерной практики. Однако с методической стороны они представляют определенный интерес, особенно прп проведении исследовательских работ с целью оптимизации параметров шнека, выбора материала кожуха н конструкции рабочего органа, а также режима работы конвейера. Так, в работах 33, 35] определяются со ставляющие мощности, идущие на удар вращающейся спирали о поступающий материал в момент загрузки и сообщения ему кинетической энергии, на трение материала о кожух и спираль, на перемешивание, на трение спирали о кожух ИТ. д., но не рассчитываются компоненты Л мех, расходуемые на транспортирование материала. Результаты этих вычислений, по-видимому, весьма условны. [c.206]

Обобщенпе теоретических и экспериментальных результатов исследований двухспиральных шнеков при транспортировании ряда сыпучпх материалов [19, 23, 35, 36, 56] позволяет предложить следующие зависимости для определения конструктивных параметров рабочих органов наружная спираль Z) n i = = (0,80-> 0,90) Z)d, (0,80 ч- 1,20) Den. i, = (0,15 ч- 0,20) Den. внутренняя спираль Den, 2 = (0,75 ч- 0,85) (Den. i — 2oi), = (1,0 ч- 1,40) Den. 21 62 = (0,15 4- 0,20) Den. 2 [c.214]

Выбор шага (пиралей и s-i. Эти параметры выбираются также ио аналогии с односпиральным шнеком, т. е. основным критерием и в этом случае служит минимальный коэффициент сопротивления перемещению материала W. Последнее возможно лишь в том случае, если угол подъема вхштовой линии наружной спирали несколько меньше соответствующего угла внутренней спирали. Кроме того, необходимо, чтобы спирали обладали равной усталостной прочностью. Поэтому их шаги следует прхшимать соответственно в пределах = (0,8 ч--7- 1,0) Den. 1 и Sa = (1,0 ч- 1,2) Den. 2 Добавим, что отношение шагов обеих спиралей должно быть обратно пропорционально отношению частот их вращения [19, 56]. [c.215]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология