Карбодиимид реакция конденсации

Важно отметить, что цианамид NHj— = N, таутомерная форма карбодиимида HN = = NH, мог бы играть роль примитивного конденсирующего агента в первых реакциях полипептидного синтеза. В высшей степени вероятно, что на первобытной Земле для реакций конденсации необходимы были высокореакционноспособные соединения. [c.186]

Замечание. Реакция специфична для карбодиимидов, побочных продуктов при конденсации не образуется. Поглощение увеличивается линейно (в зависимости от концентрации карбодиимида) в течение 6 ч, в этих же ус- [c.316]

Реакция конденсации идет при комнатной температуре с перемешиванием суспензии в течение ночи. По окончании ее сорбент обильно промывают 50%-ным этанолом, 3—4 объемами 1 М Na l и, наконец, деионизованной водой. Блокировать оставшиеся свободными спейсеры нет нужды впрочем, это можно сделать так же, как прп пспользованпи карбодиимида. Хранят сорбент уравновешенным буфером для аффинной хроматографии на холоду, с добавкой бактериостатического агента. [c.384]

Для реакций конденсации могут с успехом применяться также полимерно связанный карбодиимид [482, 483], полимерно связанный трифенилфос-фин/2,2 -дипиридилсульфид [4841 и поли-(1-этоксикарбонил-2-этокси-1,2-дигидрохинолин) (III). Последний может быть получен из 6-изопро-пенилхинолнна, стирола н дивинилбензола с последующим взаимодействием с этиловым эфиром хдормуравьиной кислоты и этанолом в присутствии триэтиламина [485]. С III можно проводить конденсацию фрагментов без рацемизации. [c.200]

Применение [62] в 1955 г. карбодиимида для пептидного синтеза оказалось одним из наиболее значительных достижений в пептидной химии. С тех пор и до настоящего времени Л ,Л -дицикло-гексильное производное (71) наиболее широко используется для создания пептидной связи. Популярность объясняется доступностью эюго реагента, простотой применения и при использовании подходящего растворителя, эффективностью и быстротой реакций конденсации. При получении коротких растворимых пептидов крайне малая растворимость второго продукта — М,М -дициклогексилмо-чевины в большинстве растворителей, кроме низших спиртов, облегчает процесс очистки. Недостатками дициклогексилкарбодиимида являются его токсичность, склонность к рацемизации не имеющих уретановых защит аминокислот (и пептидов), а также возможное образование побочного продукта, получающегося в результате перегруппировки активированных интермедиатов. Эти два последние недостатка могут быть сведены к минимуму путем тщательного подбора условий реакции, в частности добавлением к реакционной смеси некоторых производных гидроксиламина (см. ниже). Карбодиимиды реагируют с аминами относительно медленно, так что активация карбоксикомпоненты может достигаться в присутствии аминокомпоненты. На практике реагент обычно просто добавляют к смеси карбокси- и аминопроизводных, растворенных в подходящем растворителе. Более подходящим для этой цели растворителем является относительно неполярный растворитель, такой как дихлорметан, однако если позволяет растворимость веществ, можно использовать диметилформамнд и другие полярные среды. [c.391]

Для образования пептидов могут быть использованы трити-ловый эфир у-алкил-Ь-глутаминовой кислоты [103], дитритил-L-гистидин, тритил-ОЬ-метионин и тритил-ОЬ-триптофан [11]. Эти реакции представляют особый интерес, так как те же замещен-ные аминокислоты в виде их смешанных ангидридов с угольной кислотой не вступали в реакции конденсации. Этот факт был приписан пространственным затруднениям [10] ангидрид или вообще не образовывался или реагировал дальше с образованием карбоната [210]. Другое объяснение этому факту состоит в том, что стадия образования ангидрида становится настолько медленной, что преобладает реакция эфира хлоругольной кислоты с триэтиламином. Эта побочная реакция невозможна в случае карбодиимидов и тогда пептиды образуются. [c.222]

Синтез пептидов осуществляли преимущественно азидным методом [63, 184, 590, 685, 724, 940, 1022, 1032, 1249, 1828, 1993, 2134, 2214, 2628, 2630, 2642]. Исследования Шнабеля и Цана [1945] показали, что при получении азида из СЬо-ь-Туг-Gly-NHNH2 избыток нитрита натрия нитрозирует ароматическое ядро преимущественно в орго-положение по отношению к гидроксильной группе, а последующая реакция с бензиловым эфиром ОЬ-аланина приводит к бензиловому эфиру карбобензокси-ь-нитрозотирозилглицил-оь-аланина. Гофманн и сотр. [1033] при реакции СЬо-ь-Ser-ь-Туг-Ыз с триэтиламмониевой солью L-Met-Glu(NH2)-0H наблюдали образование производных мочевины, получающихся вследствие перегруппировки азида в изоцианат. При синтезе фрагментов биологически активных полипептидов часто применяли конденсацию N-защищенных пептидов, содержащих С-концевой остаток тирозина, с аминокомпонентом при помощи N, N -дициклогексилкарбодиимида [232, 272, 1200, 1308, 1824, 1827, 2016, 2017, 2344, 2422, 2604, 2696] и 1-цик-логексил-3-(2-морфолиноэтил)-карбодиимида [1827]. Конденсация СЬо-ь -Val-L -Туг-ОН с эфиром тетрапептида сопровождается рацемизацией [1821]. Шварц и Бампус [1992] также отмечали, что остаток тирозина в СЬо-ь-Val-ь-Туг-ОН имеет ярко выраженную склонность к рацемизации. Определенные преимуще- [c.288]

В качестве растворителя для хлористого водорода был предложен диоксан, не содержащий перекисей. Этот реагент исключает ацетилирование и теперь более широко используется при твердофазном синтезе. На некоторых стадиях синтеза гептадекапептида ангио-тензинилбрадикинина защитные группы не удавалось удовлетворительно удалять действием хлористого водорода в уксусной кислоте, в то время как применение хлористого водорода в диоксане позволило успешно провести синтез [75]. При конденсациях с использованием карбодиимида присутствие муравьиной кислоты в диметилформамиде также может быть причиной прекращения роста пептидных цепей поэтому весь диметилформамид, используемый в качестве растворителя для реакций конденсации, необходимо тщательно очищать. [c.49]

Схема реакций, представленная на фиг. 52, очень напоминает механизм реакций конденсации с отщеплением воды [34] при участии диалкилкарбодиимидов (R—N= =N—R )- Диалкил-карбодиимиды издавна широко используются в препаративной органической химии для синтеза фосфорных эфиров нуклеозидов, полинуклеотидов (фосфодиэфиров), полипептидов, фосфамидов, лактонов, эфиров карбоновых кислот, циклических фосфатов, пирофос тов и смешанных ангидридов кислот [34]. Хотя эти синтезы проводятся обычно в неводных растворителях, было по- [c.218]

Однако маловероятно, чтобы в условиях первобытной Земли сложные алкилкарбодиимиды могли присутствовать в сколько-нибудь значительных количествах. В то же время вполне возможно, что в реакциях конденсации в качестве агента, способствующего отщеплению воды, мог участвовать цианистый водород. Из схемы, представленной на фиг. 52, следует, что предполагаемая способнось цианида участвовать в формировании пептидной связи с образованием формамида (НСО—NH2) в качестве побоч-. пого продукта реакции в основе своей подобна тем свойствам замещенных карбодиимидов, которые позволяют использовать их в, качестве конденсирующих агентов в органической химии. При этом происходит химическое удаление молекул воды из соответствующих центров реагирующих молекул. Такое взаимодействие, может происходить при образовании пептидов в растворах цианида аммония при нагревании, а также при облучении электронами смесей газов в экспериментах, моделирующих первобытную атмосферу, о чем уже говорилось ранее. [c.219]

Модификацию карбоксильных групп в коротких пептидах осуществляют с помощью водорастворимого карбодиимида путем конденсации с соответствующими диаминами (1,2-диамнноэта-ном или диаминометаном). При соответствующем выборе диамина остатки аспарагиновой кислоты превращаются в аналог лизина [112]. Реакцию конденсации пептида с 2 М диамином проводят при pH 4,75 в присутствии 0,4 М солянокислого 1-этил-3-(3-диэтиламинопропил) карбодиимида при 20 °С в течение 1 ч. Затем добавляют вторую порцию карбодиимида и инкубируют еще в течение 5 ч. Модифицированные пептиды отделяют от продуктов реакции и избытка реагентов путем гель-фильтрации. В результате происходит необратимая модификация всех карбоксильных групп белка. Возможности использования этого типа реакции для модификации высокомолекулярных белков не исследовались. Указанным способом был модифицирован 29-членный пептид глюкагон это самый крупный пептид, подвергнутый такой модификации. [c.146]

Прямое присоединение пептидов к носителю происходит по бимолекулярному механизму. При конденсации очень малых количеств пептида высокий выход реакции возможен только при очень высокой эффективной концентрации нуклеофильных групп носителя (обычно это аминогруппы). Поскольку последние присутствуют в большом молекулярном избытке, то кинетически возможна реакция псевдопервого порядка. Однако концентрация аминогрупп пептида мала, и поэтому не требуется их защита в ходе присоединения (за исключением особых случаев [64]). Аминогруппы следует блокировать в тех случаях, когда перед добавлением носителя пептид предварительно активируется. При одностадийных присоединениях редко нужна защита N-концевых групп. Если же она все-таки необходима, то при помощи 2-гр г-бутилоксикарбонилоксиимино-2-фенил-ацетонитрила [1] вводят 2-т/ вг-бутилоксикарбонил (БОК) группу [1]. Аналогичная защита аминогруппы нужна и перед активацией карбоксильных групп карбодиимидом при конденсации по С-концевому карбоксилу [85], когда при последующей инкубации в щелочных условиях карбоксильные функции боковых цепей аминокислот превращаются в стабильные N-ацилмочевины, а часть активированных С-концевых аминокислот— в реакционноспособные оксазолиноны. [c.444]

Наиболее общий вариант иммобилизации пептида — присоединение по С-концевой карбоксильной группе. В качестве конденсирующих агентов используются водорастворимые карбодиимиды (например, К-этил-Ы -диметиламииопропилкарбодиимид). Как правило, а-аминогруппа пептида предварительно защищается с помощью легко удаляемой трет-бутоксикарбонильной группы или ФТК-груп-пь1, образующейся при реакции с ФИТЦ. В отличие от перечисленных выше методов, выходы при конденсации с помощью кар-бодиимида непредсказуемы и колеблются в диапазоне О — 90%. Легче других присоединяются к носителю короткие аргининсодержащие пептиды. [c.65]

Также образование олигомерных соединений в замороженной среде было описано в работе [29], когда с помощью водорастворимого карбодиимида конденсация олигонуклеотидных блоков пен-та(2 -0-метилинозин-3 -фосфата) проводилась в присутствии комплиментарной матрицы полицитидина. Было найдено, что в случае реакции при -15 °С в замороженной системе степень полимеризации и выход продукта были выще, чем те же показатели синтеза в жидкой среде при О °С. Отсюда следовало, что проведение таких реакций в умеренно замороженных системах способствовало образованию цепных молекул. [c.75]

Эта реакция была использована для частичной модификации карбоксильных групп в белках [46, 146, 147]. Хоар и Кошланд [146] использовали 1-бензил-3[3-диметиламино-(М)-пропил]-кар-бодиимид в виде /г-толуолсульфоната, Хориниши с сотр. [147] применяли 1 -этил-3[3-морфолино-(4)-пропил]-карбодиимид ЭМП К. В качестве аминного компонента обе группы исследователей использовали метиловый эфир глицина. Степень модификации определяют потенциометрическим титрованием или аминокислотным анализом. При модификации лизоцима в присутствии указанных реагентов конденсация идет соответственно по 8 и 6 карбоксильным группам (из 11). В присутствии реагента, предложенного Хориниши, модификация идет по 1 из 2 карбоксилов бацитрацина и по 3 и 6 карбоксилов инсулина. [c.365]

Хлорангидриды [269, 270], ангидриды серной кислоты [38], смешанные карбонаты [269], хлорокись фосфора [37], эфиры тногликолевой кислоты [271] и дицикл огексилкарбодиимид [272, 273] применялись для конденсации а-ациламинокислот с фенолом. Однако попытки конденсировать а-ациламинокислоту с амидом салициловой кислоты с применением дициклогексилкарбодиимида успехом не увенчались [274]. Применение эфиров фенолов для образования пептидных связей имеет несколько преимуществ 1) эфиры фенолов, особенно п-нитрофениловые эфиры, представляют собой стойкие кристаллические соединения, которые можно сохранять до тех пор, пока они не потребуются 2) фениловые эфиры позволяют применять свободную аминокислоту, а не ее эфир, и таким образом отпадает необходимость в очистке продукта реакции с использованием противоточного распределения 3) группу, защищающую а-аминофунк-цию, можно отщепить от пептида, не затрагивая эфира фенола. Последнее преимущество является особенно ценным при синтезе циклических пептидов. Превращение а-ациламинокислот в эфиры фенолов с помощью карбодиимидов позволяет избежать загрязнения конечного пептида М-ацилмочевиной, которая может образоваться, если карбодиимид применять непосредственно для синтеза пептида [272]. [c.240]

Харрис и Мак-Уильям [942] ацилировали незащищенные аденозин-5 -фосфат и уридин-5 -фосфат N-защищенными пептидами с помощью карбодиимида. Более того, эту реакцию можно проводить и со свободными пептидами в смеси пиридина, 1 н. соляной кислоты и воды. Виланду и Енике [2536] также удалось осуществить конденсацию 2-азидизокапроновой кислоты с адениловой кислотой карбодиимидным методом. Гидрогенолиз продукта конденсации привел к смешанному ангидриду адениловой кислоты и лейцина. Этот ангидрид реагирует с аминокислотами в физиологических условиях (вода, pH 7,5), образуя пептиды [2046, 2536]. [c.388]

При синтезе брадикинина [72] — первого пептида, полученного твердофазным методом с использованием грег-бутилоксикарбониламинокислот, Мэррифилд применял для удаления этих защитных групп 1 М раствор НС1 в безводной уксусной кислоте. Этот реагент впоследствии был использован при синтезе многих пептидов. Однако некоторые синтезы показали, что рост пептидной цепи на полимере прекращался из-за того, что а-аминогруппа блокировалась какой-то стойкой защитной группой [128]. Наиболее логичным объяснением этой нежелательной побочной реакции явилось предположение о том, что часть уксусной кислоты переносилась со стадии деблокирования на стадию конденсации, активировалась карбодиимидом и образовавшееся производное ацетилировало некоторую часть пептидных цепей. Чтобы преодолеть это затруднение, [c.48]

Смотреть страницы где упоминается термин Карбодиимид реакция конденсации: [c.200] [c.161] [c.643] [c.531] [c.61] [c.187] [c.154] [c.394] [c.641] [c.314] [c.211] [c.157] [c.248] [c.248] [c.41] [c.157] [c.56] [c.274] [c.339] [c.505]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология