Пептиды растворимость

По полярности боковой цепи Я различают полярные и неполярные аминокислоты. К неполярным аминокислотам относятся глицин и аланин, а также гидрофобные аминокислоты — валин, лейцин, изолейцин, пролин, метионин и фенилаланин. К полярным аминокислотам причисляют серин, треоиин, цистеин, аспарагин, глутамин и триптофан (нейтральные соединения), аспарагиновую и глутаминовую кислоты и тирозин (кислые гидрофильные аминокислоты), а также лизин, аргинин и гистидин (основные гидрофильные аминокислоты). Гидрофильные полярные соединения увеличивают растворимость пептидов и белков в водных системах, в то время как нейтрально-полярные аминокислоты ответственны за каталитическую активность ферментов. В противоположность неполярным гидрофобным аминокислотам полярные аминокислоты обычно находятся на поверхности молекулы белка. [c.17]

Пептиды, растворимые в кислоте и без горького вкуса [c.604]

При разделении аминокислот и пептидов обычно пользуются трехкомпонентными системами к насыщенному водой органическому растворителю добавляют кислоты, основания, некоторые спирты, кетоны и др. Это приводит, во-первых, к повышению растворимости воды в подвижной фазе (увеличению гидрофильности системы), во-вторых, к изменению диссоциации кислых и основных групп разделяемых соединений. Вследствие этого кислоты замедляют движение оснований, а основания — кислот. [c.126]

Аспарагин и глутамин представляют собой моноамиды (по р- и 7-карбоксильной группам) кислых аминокислот — аспарагиновой (а-аминоянтариой) и глутаминовой (г-аминоглутаро-вой). Для пептидов этих аминокислот характерна хорошая растворимость в воде. [c.351]

В гидролизате регенерировано 88—90 % общего белкового азота в форме пептидов, растворимых в 5 %-ной трихлор-уксусной кислоте Гидролизат очень хорошо растворим в воде и не имеет вкуса [c.606]

Апопротеины обычно готовят из липопротеинов путем экстракции липидов органическими растворителями (этанолом, смесями эфир — этанол, метанол — хлороформ), однако некоторые апопротеины частично растворимы в органических растворителях. Сывороточные липопротеины содержат фракцию низкомолекулярных пептидов, растворимых в этаноле и в меньшей степени в смеси этанол — эфир, тогда как высокомолекулярные липопротеины нерастворимы в органических растворителях [c.74]

Карты триптических пептидов (растворимых при pH 6.5) из S-карбокси-метилированного НА1 вируса Мет/71 дикого типа и одного из четырех вариантов, отобранных с продуцируемым гибридомой моноклональным антителом Н14/А2. [c.134]

Ввиду того, что различия в растворимостях полипептидов очень невелики, для выделения индивидуальных пептидов и.з смесей требуются специальные методы. К ним относятся фракционный диализ, распределительная хроматография (например, на колонке из бумажного порошка или листе бумаги), адсорбционная хроматография, ионнообменная хроматография, электрофорез и противоточное распределение по Крэйгу (т. е. распределение между двумя ограниченно смешивающимися жидкостями). Для характеристики выделенных пептидов и доказательства их однородности применяют противоточное распределение, количественный анализ аминокислотного состава и определение концевых групп полипептидной цепи. [c.383]

Активированные эфиры нового типа, были получены при обработке защищенных аминокислот или пептидов в ацетонитриле или в нитрометане Ы-этил-5-(3 -сульфофенил)-оксазолом. Получаемый при этом эфир даег с эфиром аминокислоты пептидное производное и растворимый в воде ароматический иродукт (Вудворд, 1961) [c.684]

На практике для разделения аминокислот и пептидов основного характера используют системы, содержащие фенол и крезол, для нейтральных — смеси с бутиловым спиртом и уксусной кислотой или с амиловым спиртом, а для кислых аминокислот и пептидов — системы, содержащие соединения основного характера (обычно пиридин). Если соединение плохо растворимо в подвижной фазе и остается на стартовой линии, следует увеличить гидрофильность системы, например, добавлением муравьиной кислоты, метанола или формамида. Если же вещество хорошо растворимо в подвижной фазе и движется вместе с фронтом растворителя, следует использовать органический растворитель с более выраженными гидрофобными свойствами, например изоамиловый, бензиловый спирты и др. [c.126]

Высаливающее действие ионов особенно подробно изучалось в области химии аминокислот и пептидов (см., например, [1]). Влияние ионов прибавляемых солей на вещества, ионизующиеся в водных растворах, не сводится просто к снижению растворимости при прибавлении небольшого количества соли вначале растворимость повышается, и только при дальнейшем повышении концентрации соли достигается эффект высаливания (см. рис. 224). [c.207]

III этап — внедрение РНК-а м и н о к и с л о т ы в структуру м икр ос о м. Внедрение аминокислот в микросомы проходит в присутствии гуанозинтрифосфата, роль которого пока совершенно неясна, и сопровождается внедрением в них растворимой РНК, что показано на препаратах РНК, меченных по пиримидиновому циклу. Меченая РНК, лишенная аминокислот, не внедряется в микросомы, причем с этой стадией реакции тесно связан процесс конденсации аминокислот в пептиды. [c.265]

Для исключения описанных побочных реакций и особенно для улучшения растворимости в органических растворителях пептидов, имеющих амидные группы, большое значение имеет обратимое блокирование амидных функций. Как известно, незамещенные амидные функции склонны к образованию внутри- или же межмолекулярных водородных связей. При этом растворимость в органических растворителях ухудшается и одновременно повышается растворимость таких производных в воде, что нежелательно при синтезе пептидов. [c.121]

N-Гидроксисукцинимидные эфиры, предложенные впервые Андерсоном и сотр., отличаются хорошей способностью к кристаллизации и высокой активностью при аминолизе. При этом следует особенно подчеркнуть низкую чувствительнрсть этих эфиров к гидролизу и алкоголизу, так что пептидный синтез можно проводить даже в воде. Соли аминокислот или пептидов, растворимые в системах этанол—вода, диоксан—вода или тет-рагидрофуран—вода, можно сочетать с гидроксисукцинимидными эфирами N-замещенных аминокислот, получая пептиды с хорошими выходами. Преимуществом является также то, что освобождающийся при аминолизе N-гидроксисукцинимид растворим в воде. [c.151]

Трудности, которые встречаются при ацильной перегруппировке от N к О, рассматривались выше (стр. 216—224). Однако в случае небольших пептидов, растворимых в органических растворителях, в разработанных Бейли [15] условиях реакции, по-видимому, можно успешно осуществить эту перегруппировку. [c.248]

Пептиды растворимы в воде, не свертываются при нагревании, ие осаждаются сульфатом аммония и обычно не дают биуре-товоп реакции. Эти вещества, представляющие собой продукт , конденсации аминокпслот, образуются при гидролизе белков многие из них получены также синтетически. В зависимости от числа алпгаокислот, из которых построены молекулы пептидов, они в свою очередь подразделяются на дипептиды, трипептиды, тетрапептиды и т. д. [c.419]

Полагают, что неудаленные сигнальные пептиды играют важную роль в реализации различных способов встраивания в мембрану, обнаруженных у трансмембранных белков. Все эти способы можно рассматривать как варианты той последовательности событий, в результате которой растворимый белок переносится в полость ЭР. В соответствии с современными представлениями, гидрофобный сигнальный пептид растворимого белка, кроме прочих функций, служит сигналом начала переноса и остается погруженным в мембрану все то время, пока остальная часть молекулы белка протаскивается сквозь нее в виде большой петли (рис. 8-45, А). Когда через мембрану проходит карбоксильный конец молекулы, белок остается связанным с ней только сигнальным пептидом. Следовательно, если этот пептид отрезается, белок высвобождается в полость ЭР. [c.47]

В технологии переработки белка одноклеточных исследованы процессы электрофлотационного извлечения белковых веществ на примере глобулина дрожжей при концентрациях ниже 1 г/л, при различных pH. Величина дисперсной фазы белковых веществ (глобулина) зависит от pH и способа получения гидролизата и варьируется в широких пределах (от 40% до 70%). Остальная часть белковых веществ представляет собой смесь растворимых соединений (альбуминов, пептидов, аминокислот) и не поддается извлечению в заданных условиях. Степень извлечения дисперсной фазы при рН=4,5, являющейся изоэлектрической точкой, наибольшая и составляет 60-90 % в зависимости от концентрагщи и объемной плотносга тока ( у = 100-200 мА/дм ). [c.133]

Если синтезируемые пептиды сравнимы по растворимости с ди-циклогексилмочевиной, то можно использовать водорастворимые кар-бодиимиды. Возможны различные методы, однако чаще всего добавляют дегидратирующий агент к смеси компонентов, из которых образуется пептид. [c.683]

Неудобство пептидного синтеза с использованием /г-нитрофенило-Бых эфиров и эфиров Ы-оксифталимида заключается в плохой растворимости побочных продуктов — п-нитрофенола и Ы-оксифталимида, в воде (Андерсон, 1963). Ы-Оксисукцинимид хорошо растворим в воде а его эфиры с рядом Ы-ациламинокислот являются кристаллическими, высоко реакционноспособными соединениями, которые позволили получить многообещающие результаты в пептидном синтезе, особенно в случае присоединения ациламинокислот к соли пептида в водном растворе. [c.687]

Описано фракционирование радиоактивно меченных пептидов трипсинового гидролизата белка на колонке Spherisorb ODS (0,46 25 см) линейным градиентом (0—62,5%) этанола в 4,5%-ном растворе НСООН. Фракционирование вели при температуре 40° со скоростью элюции 1,4 мл/мин в течение 95 мин [Smart et al., 1981]. В растворах с высоким содержанием этанола (как и ацетонитрила) растворимы ие все пептиды. Хроматографию труднорастворимых пептидов иногда удается осуществить, используя в качестве органического растворителя пропанол. В силу своей большей, чем у этанола, гидрофобности пропанол элюирует с октадециловых колонок даже крупные пептиды при концентрации менее 20%. Относительно высокая вязкость пропанола заставляет снижать скорость элюции, но для крупных пептидов это все равно необходимо делать ввиду их замедленной диффузии. [c.202]

При пептидных синтезах с незащищенной имидазольной функцией могут встречаться трудности, связанные с возможностью ацилирования имида-зольиого остатка, его слабой основностью, а также часто с низкой растворимостью таких пептидов. Эти трудности можно уменьшить блокированием имидазольной функции. Некоторые синтезы с незамещенной имидазольной функцией тем не менее были описаны, причем остаток гистидина был аминокомпонентом. Только после того, как в 1954 г. получили трет-бутилоксикарбонилгистидиназид (2-Н 8-ОН практически нерастворим в применяемых для пептидного синтеза растворителях), были проведены синтезы с не замещенными по имидазолу азидами гистидина [167]. Вообще же благоразумнее применять для пептидных синтезов гистидин с блокированной имидазольной функцией. Долгое время существовала только одна возможность блокирования азота имидазола бензильным остатком [168]. Приведенные в табл. 2-4 М -защитные группы довольно часто применяются в настоящее время в синтезе пептидов тем не менее трудная проблема защиты имидазольной функции все еще не решена. [c.128]

Рассмотрению возможностей обратнофазовой гидрофобной хроматографии белков в основном посвящен сравнительно недавно опубликованный обзор [Rubinstein, 1979]. Основные его выводы совпадают с тем, что было сказано выше при рассмотрении обратнофазовой гидрофобной хроматографии пептидов. Для белков с молекулярной массой в интервале 12—30 тыс. Дальтон автор отдает предпочтение силикагелям, модифицированным октилсиланом (Са). В качестве органического компонента элюента, по его мнению, следует предпочесть градиент концентрации пропанола, вплоть до 40%-ной концентрации, если позволяет растворимость белка. Для получения узких пиков рекомендуется в качестве водного компонента использовать буфер высокой (примерно 1 М) концентрации, подавляющий ионное взаимодействие белка с силанольными группами матрицы. При pH 5—6 разрешение получается обычно хуже, чем при pH 4 (формиатно-пиридиновый буфер) или 7,5 (Na-ацетатный буфер). Существенно указание на то, что скорость элюции следует снизить до 60—90 мл/см Ч. Продолжительность фракционирования белков при этом остается относительно небольшой — 1—3 ч. Белки целесообразно разделить предварительно на группы [c.210]

В основе метода динитрофенилирования лежит реакция свободных ЫНг-групп белка или пептида с 2,4-динитрофторбензолом (ДНФБ) в щелочной среде, при которой образуются соответствующие динитрофенильные производные (ДНФ-производные). В реакцию с ДНФБ, кроме свободных а-ЫНг-групп, вступают также е-ННг-группа лизина, 5Н-группа цистеина, ОН-группы оксиаминокислот и имидазольный гетероцикл гистидина. ДНФ-производное белка или пептида подвергают полному кислотному гидролизу. Ы-концевые ДНФ-амино-кислоты экстрагируют из гидролизатов эфиром, отделяя их от свободных аминокислот и ДНФ-производных по другим функциональным группам аминокислот, которые растворимы в воде. Идентификацию [c.145]

Реакцию проводят в маленьких пробирках (высота 40—45 мм, внутренний диаметр 3—4 мм) или в специальных пробирках, снабженных шлифом с краном. Образец пептида или белка (10—20 нмоль) вносят капилляром на дно пробирки. Содержимое пробирки высушивают в вакуум-эксикаторе. В пробирку добавляют 10—20 мкл 0,2 М раствора МаНСОз и снова высушивают в вакуум-эксикаторе. Цель высушивания состоит в удалении следов аммиака, мешающего проведению реакции. К высушенному образцу добавляют равные объемы (10—20 мкл) бидистиллированной воды, свободной от аммиака, и ДНС—С1 в ацетоне и инкубируют при 37°С 30—40 мин. Об окончании реакции можно судить по исчезновению желтой окраски раствора. Образец помещают в вакуум-эксикатор и упаривают досуха. Добавляют 30—60 мкл 5,7 н. НС1, после чего пробирки без шлифов запаивают, а пробирки со шлифом и краном подключают к вакуумному насосу, вакуумируют и герметически закрывают. Образцы подвергают гидролизу при 105°С в течение 4—18 ч. Пробирки охлаждают, вскрывают, образец высушивают досуха в вакуум-эксикаторе или на роторном испарителе. Описанная процедура разработана для пептидов и небольших белков, хорошо растворимых в воде или растворах бикарбоната натрия. Если белок не растворяется в этих условиях, дансили-рование можно проводить в 0,2 М растворе ЫаНСОз, содержащем [c.149]

Неоспоримое преимущество этого метода по сравнению с классическими методами синтеза пептидов состоит в том, что ни на одной из стадий он не требует выделения растущей полипептидной цепи. В силу чрезвычайно низкой растворимости аддукт пептида и полимера легко отмывается после каждой реакции от побочных продуктов, растворителей и избытка реагентов без потери пептида, после чего аддукт готов к следующей реакции- В настоящее время метод автоматизирован, и запрограммированные аминокислотные синтезаторы без труда могут присоединить шесть аминокислот к растущей полипептидной цепи за 24 ч. Эти приборы добавляют реактивы в падлен<ащей последовательности, меняют условия реакций, обеспечивают необходимое время реакции, отмывают побочные продукты, после чего начинают всю операцию сначала. При помощи метода ТФСП были синтезированы инсулин и фермент рибонуклеаза, состоящий нз 124 аминокислот. [c.406]

Применяющийся в пептидном синтезе в качестве конденсирующего агента 1-цик-логексил-3- (2-морфолиноэтил)карбодиимид [А] имеет преимущество перед ДЦК, так как образующаяся из А мочевина растворима в разбавленно11 кислоте и может быть отмыта от пептида, а) Напишите структурные формулы производных мочевины в случае А и ДЦК. [c.416]

Соль -ациламинокислоты или пептида получают путем точной нейтрализации кислоты в диметилформамиде метилатом калия илн метилатом фенилтриметкламменИя в метиловом спирте с последующим удалением спирта в вакууме при 50° [369, 372, 373]. При высушивании фенилтриметиламмониевых солей наблюдалось в небольшой степени разложение на диметилани-лин и метиловый эфир карбоновой кислоты [370]. Теперь для нейтрализации предпочитают применять метилат лития [5, 36, 370] вследствие относительно высокой растворимости литиевых солей о-ациламинокислот или пептидов в органических растворителях [375]. [c.279]

Исследователи, занимающиеся изучением этого важнейшего процесса, считают, что -высокополимерная, линейная микросомная РНК является матрицей. На этой матрице аминокислоты располагаются в определенной Последовательности, которая, по-ви димому, определяется чередованием оснований в полимерной РНК, и затем из активиро ванных аминоки слот образуются пептиды. Во зможно, что амино кислоты не переносятся на высоксполимерную РНК, а остаются на растворимой, низкомолекулярной РНК, которая реагирует с линейным уча-стком высокополимерной микросомной РНК, образуя водородные связи за счет оснований. [c.265]

Описанный способ не является универсально применимым, поэтому для защиты карбоксильной функции аминокислоты (или пептида), подлежащей-ацилированию, необходимо применять обратимо отщепляемые группировки. Для этой цели в первую очередь подходят различного типа эфиры. Амидные группы служат, как правило, достаточной защитой, если входят в состав растущего пептида. Для улучшения растворимости амидов пептидов в органических растворителях нужно блокировать амидную группу. Следует различать карбоксизашитные группы, которые по окончании синтеза пептида или пептидного фрагмента снимаются с регенерацией свободной карбоксильной группы и такие, которые после получения фрагмента либо прямо, либо после соответствующей обработки превращаются в группы, способные к дальнейшему аминолнзу. Эти защиты названы Вюншем [125] ка.к истинные, или потенциально активные, карбоксизащитные группы. Принята следующая классификация защитных групп [c.116]

Ока и Морихара [352], а также Семенов и Мартинек [466] описали синтезы с применением растворимых протеаз, при этом продукты синтеза не выпадали в осадок. В качестве катализатора для синтезов пептидов применялась также термитаза (Кёнек, Якубке [443]), хотя из-за высокой эстераз-ной активности фермента выходы бывали не всегда удовлетворительны. [c.169]

Речь идет, собственно, не о синтезе на полимерном носителе, так как растущая пептидная цепь постоянно находится в растворе. В реакцию с аминокомпонентом вводится нерастворимое активированное полимером карбоксильное производное, причем образуется растворимый защищенный пептид и освобождается полимер. Преимущество этого метода состоит в том, что полимерные реагенты могут вводиться в избытке, а отделение синтезированного пептида от нерастворимого полимера не представляет трудностей. Для этой цели подходят разные типы полимерных активированных эфиров. Метод был разработан одновременно группами Пачорника [478] и Виланда [479]. Такие полимерные реагенты должны быть механически устойчивы, обладать хорощей набухаемостью и иметь высокую химическую активность и малую стерическую затрудненность. Виланд и сотр. предложили вести процесс непрерывно (рис. 2-24). [c.199]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология