Конденсация фрагментов

Уги и сотр. [338] разработали метод, отличающийся от классического пептидного синтеза, который пригоден как для получения пептидных фрагментов, так и для конденсации фрагментов. [c.162]

Автор настоящей книги работал в 1962 г. младшим научным сотрудником ВНИИ химической технологи и оказался вовлеченным в это новое направление совершенно случайно, как это часто бывает. Моя трудовая деятельность в области физики, химии и технологии плазмы началась с того, что я был включен в группу физиков, занявшихся плазменной технологией разделения изотопов урана с помощью бегущей электромагнитной волны и плазменной центрифуги. В этой группе я был единственным, имевшим базовое химическое образование (я окончил в 1960 г. химический факультет Ленинградского государственного университета) и возможно поэтому, изучив хрестоматийный материал по свойствам плазмы различных газовых разрядов, обратил внимание на то, чем совершенно пренебрегали физики на радиационно-термическую и фотохимическую неустойчивость объекта разделения — молекул гексафторида урана. По моим расчетам выходило, что в условиях высокочастотных разрядов низкого давления молекулы UFe должны распадаться на молекулы UF5, UF4, UF3, F2 и атомы F кроме того, должны возникать положительно и отрицательно заряженные ионы, так что первоначальная задача разделить изотопы урана в молекулах UFe неизмеримо усложнялась. Однако еще большие осложнения в процессе разделения этих молекул возникали из-за конденсации фрагментов молекул UFe и в объеме. [c.17]

Применение современной техники разделения, особенно высокоэффективной жидкостной хроматографии, позволяет относительно хорошо очистить пептиды, содержащие 3—10 аминокислотных остатков. Для построения длинных полипептидов и небольших белковых молекул подходит только классический метод конденсации фрагментов. Синтез фрагментов производят либо в растворе путем ступенчатого удлинения пептидной цепи, либо [c.226]

Данные, приведенные в табл. 2-И, хотя и не полностью демонстрируют все достижения, однако они отражают тенденцию применения классического метода синтеза для получения белков. В общем объекты такой величины демонстрируют границы современного химического синтеза, правда в отдельных случаях этот предел может быть преодолей. На причины этого здесь уже многократно указывали. Наибольшие трудности встречаются при конденсации фрагментов из 50 или более аминокислотных остатков. [c.227]

Реакции рекомбинации феноксильных радикалов приводят к образованию новых С-С- и С-О-связей в структуре лигнина, что затрудняет делигнификацию. Рекомбинация же с участием пероксильных радикалов не может дать стабильных связей. Это различие в характере взаимодействия лигнина с кислородом при избытке и недостатке последнего приводит к тому, что присутствующий в древесине и в варочном растворе кислород при обычных щелочных варках может послужить причиной конденсации фрагментов лигнина, в том числе и с участием продуктов окислительного распада углеводов. Не исключается возможность радикальной прививки лигнина к полисахаридам. Поэтому, как уже указывалось ранее, роль вводимых при делигнификации в щелочную среду химических реагентов заключается также в ингибировании окислительных процессов. [c.492]

Последовательное наращивание и конденсация фрагментов 408 [c.8]

Наличие этой главы в книге объясняется стремлением автора обосновать общую систему реконструкции ядерного топливного цикла па основе новых методов аффинажа и плазменных процессов с включением в него и разделительного уранового производства. В отличие от других глав, построенных преимущественно па основе моих собственных работ, эта глава построена на опубликованных материалах моих коллег из Института молекулярной физики РНЦ Курчатовский институт и зарубежных источниках. Тем не менее следует сказать, что моя работа в области физики, химии и технологии плазмы началась с того, что я был включен в группу физиков, занявшихся плазменной технологией разделения изотопов урана с помощью бегущей электромагнитной волны и плазменной центрифуги. Объектом исследования был газообразный гексафторид урана, в экспериментах по разделению позднее стали использовать смеси гексафторидов урана и вольфрама. В этой группе я был единственным, имевшим базовое химическое образование (я окончил химический факультет Ленинградского государственного университета) возможно, поэтому, изучив хрестоматийный материал по свойствам плазмы различных газовых разрядов, я обратил внимание на то, чем совершенно пренебрегли физики на радиационно-термическую и фотохимическую неустойчивость объекта разделения — молекул гексафторида урана. Но моим расчетам выходило, что в условиях высокочастотных разрядов низкого давления молекулы иГб должны распадаться на молекулы ПРб, иГ4, иГз, Гз и атомы Г кроме того, должны возникать положительно и отрицательно заряженные ионы, так что первоначальная задача разделить изотопы урана в молекулах иГб неизмеримо усложнялась. Еще большие осложнения возникали из-за конденсации фрагментов молекул иГе и в объеме, и на стенках. Эти явления описаны в одном из параграфов следующей главы. Мои попытки минимизировать указанные процессы добавлением фтора в зону разряда позволили несколько уменьшить степень разложения иГб, но не подавить этот процесс даже в статических условиях, пе [c.465]

Свободнь е радикалы, возникающие при разрущении мостиковых связей, представляют собой молекулярные образования арома1ичес1. ой, алифатической нафтеновой природы. Они неустойчив ,I, имеют высокую реакционную способность и стремятся к стабилизации путем внутримолекулярной перестройки, а также конденсацией фрагментов ил1 присоединением атомарного водорода и свободных раяикалов [63]. [c.39]

Метиловые эфиры (-ОМе) и этиловые эфиры (-ОЕ1) применялись в пептидном синтезе уже Фишером и Курциусом. Снятие этих защит по окончании пептидного синтеза проводят мягким щелочным гидролизом в диокса-не, метаноле (этаноле), ацетоне, ДМФ с добавлением различных количеств воды. Названные алкиловые эфиры следует применять для синтеза коротких пептидов, так как с ростом цепи гидролитическое расщепление затрудняется, а применение жестких условий гидролиза повышает опасность побочных реакций. Следует избегать избытка щелочи, в противном случае может произойти рацемизация и другие побочные реакции. Оба алкильных эфира устойчивы к гидрогенолизу и мягкому ацидолизу. При гидразиноли-зе они переходят в гидразиды, что можно использовать для дальнейшей конденсации фрагментов с помощью азидного метода. При аммонолизе метиловые и этиловые эфиры дают амиды. Это применяют в тех случаях, когда С-концевая аминокислота должна нести амидную группу. [c.117]

В отличие от уже рассмотренных тактических защитных групп потенциально активируемые карбоксизащитные группы ведут себя во время пептидного синтеза как настоящие защитные группы. Другими словами, в этом случае можно пренебречь опасностью побочных реакций самоконденсации. В качестве прототипа таких защитных групп можно назвать 4-метилтиофениловый эфнр [151]. Получение его проводится по Ьаск1пв-оГГ-методу. Перед конденсацией фрагментов проводят активирование окислением пероксидом водорода или 3-хлорпербензойной кислотой [c.124]

Перечисленные методы получения пригодны и для пентафторфенило-вых эфиров, которые оказались превосходными ацилирующими агентами для синтеза различных пептидов. Комплекс пентафторфенола с производными изомочевины (F-комплекс), который имеет строение, аналогичное комплексу пентахлорфенола с карбодиимидом (X = F), можно использовать для конденсации фрагментов. [c.152]

Несмотря на указанные ограничения, ДЦГК-метод оказался наиболее продуктивным для образования пептидной связи. Поэтому внимание исследователей было направлено на исключение или хотя бы снижение образования N-ацилмочевины и опасности рацемизации при конденсации фрагментов. [c.155]

В 1966 г. Вюнш и Дресс [ЗОЗ], а также Вейганд и др. [304] нашли, что при одновременном введении 1 г-экв. ДЦГК и 2 г-экв. N-гидроксисукцинимида образование пептидной связи протекает практически без рацемизации и без образования ацилмочевины. Метод Вюнша — Вейганда стал теперь конкурентно способным азидному методу для случаев конденсации фрагментов. [c.155]

На примере карбодаимидиого метода с добавкой Ы-гидрокси-5-иоибориеи-2,3-дакарбоксиимида, было изучено влияние различных растворителей при конденсациях фрагментов. Результаты этого исследования показали, что системы ДМФ — ДМСО (1 1), N-метилпирролидон (НМП) — пиридин и ДМФ — HjO (7 3) не подходят для фрагментной конденсации. Предпочтительной по сравнению с другими растворителями оказалась система ДМФ — НМП (1 1). [c.177]

Для реакций конденсации могут с успехом применяться также полимерно связанный карбодиимид [482, 483], полимерно связанный трифенилфос-фин/2,2 -дипиридилсульфид [4841 и поли-(1-этоксикарбонил-2-этокси-1,2-дигидрохинолин) (III). Последний может быть получен из 6-изопро-пенилхинолнна, стирола н дивинилбензола с последующим взаимодействием с этиловым эфиром хдормуравьиной кислоты и этанолом в присутствии триэтиламина [485]. С III можно проводить конденсацию фрагментов без рацемизации. [c.200]

В лаборатории Иванова в Институте биооргаиической химии им. М. В. Шемякина классическим методом, с использованием принципа максимальной защиты, осуществлен синтез а-бунгаротоксина — токсина нз яда тайваньской змеи Bungarus ти- ti in tus, состоящего нз 74 аминокислот и имеющего 5 дисульфидных мостиков. Полностью защищенный пептид был получен конденсацией фрагментов (1—19, 20—37, 38—53, 54—74) исключительно по остаткам глицина и пролина (рис. 2-52). [c.316]

При планировании синтеза пептидов значительного размера нужно уделить особое внимание как разработке общего или стратегического плана, так и тактике, с помощью которой этот план может быть эффективно выполнен [110]. Основной стратегический замысел состоит в способе, которым может быть достигнуто построение определенной последовательности остатков аминокислот, т. е. либо ступенчатым способом по одному остатку за одну ступень, начиная с концевой амино- или карбоксигруппы, либо путем объединения нескольких частей с определенной последовательностью (конденсация фрагментов), проводя синтез либо в растворе, либо твердофазным способом и т. д. Тактические соображения включают выбор подходящего сочетания защитных групп для концевых амино- и карбоксильных групп для различных боковых радикалов аминокислот. Некоторые из этих защитных групп постоянны , т. е. сохраняются до конца синтеза, другие — временны , т. е. подлежат отщеплению на промежуточных стадиях синтеза, что дает возможность создания определенного типа пептидной связи или это производится для того, чтобы нужным образом изменить растворимость и т. д. Условия для снятия защитных групп должны быть выбраны с учетом аминокислотного состава пептида. Другую часть тактики составляет выбор методики создат ния пептидной связи, выбор растворителя, особенно в связи с опас ностью рацемизации. [c.408]

Метод конденсации фрагментов участок (в) на схеме (55) имеет преимущество в меньшем количестве конденсаций, что в принципе может обеспечить более высокую суммарную эффективность. Успех такого подхода может критическим образом зависеть от выбора мест сшивки в системе целевого полипептида. Предпочтительными остатками такого рода будут остатки глицина, поскольку конденсация фрагментов с С-концевым глицином исключает возмол<ность рацемизации. Подобным же образом часто используют пептидный фрагмент с С-концевым пролином, поскольку образование оксазолона с вторичными аминокислотами не может протекать. И, наоборот, остатки глутамина или бензилглутамата не должны располагаться на концевой аминогруппе пептидного фрагмента, поскольку при этом существует риск протекающей параллельно циклизации в производные пирролидонкарбонильного или пироглутамильного типа схема (56) . [c.410]

Его аминокислотный, состав включает два остатка метионина (что ограничивает использование гидрогенолиза в процессе синтеза), два остатка чувствительного к кислотной обработке триптофана и щесть остатков кислых аминокислот. Карбоксильная концевая группа закрыта остатком первичного амида, а концевая аминогруппа — пироглутамильным остатком (циклической глутаминовой кислотой). Первоначальный план синтеза включал как ступенчатое наращивание, так и конденсацию фрагментов, и вся цепь была разделена по пептидным связям 5,6 и 13,14. Глициновый остаток в положении 13 служил обычной точкой сшивки, поскольку он представляет собой нерацемизующийся остаток на С-конце одного пептидного фрагмента. Сшивка в точке 5 была выбрана потому, что наличие в этом месте остатка метионина не дает возможности проводить гидрогенолиз в процессе построения нужной последовательности остатков в центре молекулы. [c.412]

Позднее был предложен другой синтез [116, 117] схема (60) , включавший конденсацию фрагментов 2 + 2, что также приводит к амиду цвиттерионного тетрапептида. Последующее открытие отщепления о-нитрофенилсульфенильной группы в некислой среде простым образом разрешило эту проблему, и тиолиз тетрапептид-ного производного (118) проложил путь к синтезу амида тетрапептида с защищенным боковым радикалом [117] схема (61) Несмотря на наличие трудносинтезируемой последовательности Trp-Met, присутствие в Л -терминальном фрагменте остатков глицина и пролина обеспечивает значительную гибкость в синтетическом подходе. Первый синтез [116] включал непосредственную [c.415]

Другими продуктами реакции является хинолин, этиловый спирт и углекислый газ, которые легко югут быть удалены. Выход пептидов достаточно высок. При использовании ЭЭДХ для конденсации фрагментов имеет место рацемизация. [c.26]

В пептидном синтезе существукуг два типа защитных групп — постоянные и временные. Постоянными иазывак>т группировки, используемые для защиты боковых функциональных групп и удаляемые на заключительном этапе синтеза пептида. Временными являются защитные группы для Ы -концевой аминогруппы и С-концевого карбоксила, снимаемые соответственно перед каждой стадией удлинения цепи или конденсации фрагментов. [c.128]

Аминокислоты и их неактивироваиные производные заметно рацемизуются в сильнокислой или щелочной среде, особенно при нагревании. Активированные производные аминокислот более подвержены рацемизации как в процессе их получения, так и в ходе амниолнза. Особенно легко рацемизуются производные пептидов, что осложняет проведение конденсации фрагментов. Следует отметить, что уретановые N-зaщитныe группировки аминокислот (в том числе наиболее популярные Ъ- и Вос-группы) обладают низкой склонностью к образованию оксазолонов. Поэтому ступенчатый синтез с использованием этих групп — один из наиболее надежных путей избежать рацемизации при синтезе пептидов. [c.145]

Конденсацию фрагментов (D 3—6) и (D 7—10) осуществляли с помощью N, N -дициклогексилкарбодиимида. Полученный таким образом защищенный октапептид (Е 3—10) очищали противоточным распределением (54 переноса) и далее декарбобензоксилировали обработкой бромистым водородом в ледяной уксусной кислоте (100 мин). Из образовавшегося бромгидрата действием водного раствора карбоната калия удалось выделить свободный эфир октапептида (F 3—10) в достаточно чистом состоянии для использования в дальнейшем синтезе. При конденсации эфира октапептида (F 3—10) с bo-Asp(NH2)-Arg(N02)-0H (F 1—2).применяли карбодиимидный метод. Защищенный декапептид (G 1—10) очищали противоточным распределением. Гидрогенолиз пептида (G 1—10) в смеси метанола с 1,4 н. соляной кислотой при 35° и последующий гидролиз образовавшегося эфира декапептида (И 1—10) (без отделения получающегося в качестве побочного продукта хлористого аммония) действием 37%-ной соляной кислоты в течение 90 мин при 40° привели после обработки основной ионообменной смолой к смеси двух декапептидов (К 1—10) и соответствующего А5р(ЫН2-Р) -производного (I 1—10), которые удалось разделить противоточным распределением К —0,8 и 2,5 соответственно). Содержание этих двух веществ в смеси отвечает соотношению 1 1 оба они выделены в виде моноацетатов. Изоэлектрические точки декапёптндов (К 1—10) и (I 1—10) различны (7,4 и 7,9). При щелочном гидролизе в основном образуется декапептид (I 1—10) и лишь немного пептида с двумя свободными карбоксильными группами (К 1—10). [c.55]

Конденсация фрагментов (G 1—4) и (G 5—11) и последующее удаление грег-бутилоксикарбонильной группы у образовавшегося ундекапептида (Н 1—И) обработкой трифторуксусной кислотой (2 час, комнатная температура) привели к свободному пептиду (I 1—11), очищенному противоточным распределением. [c.188]

Синтез С-концевого пентапептида (G 7—II) был осуществлен взаимодействием BO -Phe-Tyr-Gly-OH (Е 7—9) с H-Leu-Met-NH2 (Е 10—11) и последующим удалением N-защитной группы хлористым водородом в ледяной уксусной кислоте. Конденсация фрагментов (G 1—6) и (G 7—11) карбодиимидным методом привела к защищенному ундекапептиду, блокирующие группы которого снимали обработкой трифторуксусной кислотой. Трифторацетат амида свободного пептида обладал растворимостью, достаточной для очистки противоточным распределением. [c.220]

Разработанная Андерсоном и сотр. [53в, 53г] схема синтеза гастрина приведена на рис. 46г. В этом случае план синтеза предусматривает конденсацию фрагментов с С-концевыми остатками метионина (положение 5) и глицина (положение 13). [c.221]

Конденсация фрагментов (I 1—5) и (I 6—13) привела к защищенному N-концевому тридекапептиду (К 1—13), который далее путем омыления превращали в соответствующую кислоту (L 1—13). Взаимодействием последней с амидом тетрапептида (L 14—17) и последующим удалением защитных групп у остатков глутаминовой кислоты был получен синтетический гастрин, активность которого составляла 110% активности природного гормона. Поведение синтетического пептида по отношению к протеолитнческим ферментам не отличалось от поведения гастрина I. [c.224]

Синтез цепи А инсулина. Мейенхофер и сотр. [1527а] (ср. [26286]) синтезировали защищенную цепь А конденсацией фрагментов 1—9 и 10—21 методом смешанных ангидридов (ср. [c.477]

Конденсация фрагмента [Н (1 —2 )-6—8] с ранее описанным пентапептидом (Н 1—5) с помощью карбодиимидного метода привела с выходом 40% к разветвленному декапептиду [I (1 — 2 )-1—8], охарактеризованному количественным аминокислотным анализом и УФ-спектром. Формильную группу отщепляли действием 4 н. метанольного раствора НС1 в трифторуксусной кислоте или диметилсульфоксиде в течение 20 час при 20 [К ( —2 )-1—8] [2392]. Освободившуюся аминогруппу вновь количественно идентифицировали колориметрическим нингидриновым методом. Последующее омыление сложного эфира проводили обработкой 1,5-кратным избытком 1 н. едкого натра в диметилсульфоксиде в течение 20 час [L(l —2 )-1—8] образовавшуюся свободную карбоксильную группу определяли микротитрованием. Циклизацию синтезированного разветвленного декапептида осуществляли путем перемешивания при 20° раствора декапептида с 300-кратным избытком N, N -дициклогексилкарбодиимида в условиях высокого разбавления, причем выход неочищенного продукта реакции составил 20%. Защитные группы отщепляли действием натрия в жидком аммиаке. Полученный циклический пептид был очищен путем противоточного распределения (400 переносов вго/7-бутанол/0,1 н. соляная кислота) и хроматографирования на целлюлозном порошке (н-бутанол/ пиридин/ледяная уксусная кислота/вода, 30 20 6 24 м-бута-нол, содержащий 15% уксусной кислоты) с последующим обессоливанием на амберлите ШС-50 (ХЕ-64) в Н+-форме. [c.566]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология