Рибоза ПМР-спектр

Рис. 16.5. л —формула О-рибозы Б — масс-спектр при электронной бомбардировке В- масс-спектр при ионизации полем. [c.326]

Светлые кружки — суммарная интенсивность сигналов протонов при С-2 и С-б. темные — удвоенная экспериментальная интенсивность сигнала протона при С-1 в рибозе. Интенсивности выражены в процентах от суммы интенсивностей сигналов протонов при С-2 и С-8, наблюдаемых в спектре при 035 0. [c.427]

Следует заметить, что терм ин плавление может быть и неподходящим, поскольку очевидно, что структура не является кооперативной [76, 92]. При понижении температуры интенсивность сигнала протона при С-1 рибозы падает быстрее, чем интенсивность сигналов протонов оснований. При 10°С этот сигнал практически не наблюдается в спектре. Сигналы протонов при С-8 и С-2 также уширяются по-разному, что не находит разумного объяснения. Эти наблюдения наводят на мысль, что кольца рибозы участвуют в образовании более стабильной структуры, чем структура, образуемая фрагментами оснований. При низких pH интенсивность сигналов уменьшается еще больше, возможно, вследствие начала образования двойной спирали [93, 94]. [c.428]

Метод ПМР — самый информативный из всех физических методов — особенно ценен для изучения углеводов — их различных стереоизомеров, таутомеров и конформеров. Сигналы аномерных протонов (т. е. находящихся у С(1, альдоз), как наименее экранированные по сравнению с другими протонами моносахаридов, лежат в области слабых полей — от 4,5 до 5,5 м. д. На рис. 63 представлены спектры равновесных растворов П-глюкозы и В-рибозы в окиси дейтерия (в качестве растворителей для снятия ПМР-спектров стараются использовать жидкости, не содержащие атомов водорода, чтобы не осложнять картину за счет протонов растворителей). В спектре О-глюкозы (рис. 63, а) видны два дублета с химическими сдвигами 5,32 и 4,74 м. д. [c.341]

Чистые нуклеиновые кис,лоты содержат около 15% ааота и 10% фосфора. В их состав входят гетероциклические основания, которые обусловливают сильное поглощение в ультрафиолетовой области спектра с максимумом вблизи 260 ммк (см. ниже). На 1 г-атом фосфора в нуклеиновой кислоте приходится 1 моль сахара в рибонуклеиновой кислоте (РНК) это D-рибоза, а в дезоксирибонуклеиновой кислоте (ДНК) — 2-дезокси-В-рибоза. Сахара можно идентифицировать и их содержание определить количественно [c.121]

Для идентификации У. к. наряду с химич. реакциями (см. Урацил, Рибоза) можно воспользоваться изменением абсорбционного спектра поглощения [c.182]

Рис. 15. Часть ПМР-спектра (100 мГв) равновесных растворов О-глю-козы (о) и )-рибозы (б) в растворе окиси дейтерия при 35°С (химические сдвиги даны в м.д. от тетраметилсилана)

Рассмотрим небольшое число ПМР-спектров. На рис. 15 представлена небольшая часть записи ПМР-спектра растворов I)-глюкозы (а) и Д-рибозы (б) в растворе окиси дейтерия (ОзО) эта часть относится к области низких напряжений. На рис. 15, а видны два дублета, характеризующиеся химическими сдвигами 5,32 и 4,74 м. д. Судя по положению в области 5 м. д., эти дублеты принадлежат аномерным протонам а- и р-форм глюкозы. Дублет 5,32 м. д. принадлежит экваториальному протону, как расположенному в области более слабого поля, т. е. а-форме. Дублет 4,74 м. д. относится к аксиальному протону, т. е. р-форме. Это же подтверждается константами расщепления J, которые на спектре равны соответственно 3,5 и 7,5 Гц. Наконец, расщепление каждого пика на дублет свидетельствует, что данный протон взаимодействует лишь с одним протоном у соседнего углеродного атома (у С-2) [c.91]

Мессбауэровский спектр комплекса рибозы с трехвалентными ионами железа является комбинацией двух упомянутых выше дублетных спектров, что свидетельствует о частичном восстановлении железа до двухвалентного состояния. Полученные результаты показывают существенное влияние сахара на характер мессбауэровских спектров, а следовательно, и на электронное состояние железа в изученных комплексах с компонентами нуклеиновых кислот. [c.433]

Выход, однако, есть. Надо искусственно внести асимметрию в молекулу. Для этого вместо боргидрида натрия на стадии восстановления применяют его изотопный аналог — тетрадейтероборгидрид. Тогда у углеродного атома бывшей карбонильной группы, т. е. при С-1, появляется один атом дейтерия вместо одного атома протия. В результате ацетат полиола 31 из 2-дезокси-Б-рибозы дает в масс-спектре тот же характеристический пик, но сдвинутый на единицу массы (разница масс дейтерия и протия), т. е. пик иона с м/е 160 вместо 159. А ион, возникаю- [c.71]

Методы количественного определения нуклеиновых кислот основаны на определении содержания составляющих их компонентов азотистых оснований (как правило, спектрофотометрически благодаря поглощению в ультрафиолетовой области спектра) пентоз (с помощью химических реакций, позволяющих отдельно определять рибозу и дез-оксирибозу) и фосфора нуклеиновых кислот. [c.161]

Из продуктов полного распада ДПН ясно, что фрагмент, связанный с пирофосфатной системой, содержит никотинамид и одну молекулу рибозы. Ультрафиолетовый спектр продукта ферментативного гидролиза (XVI) ясно указывает на то, что последний является четвертичной пи-ридиниевой солью, а его распад под действием кислот на никотинамид. рибозу и фосфорную кислоту свидетельствует о том, что он является N-гликoзидoм. Отсюда следует, что этот фрагмент представляет собой фосфат (-3-кар боксамидопиридил) рибозида. Место связи остатка фосфорной кислоты в (XVI) было доказано наличием в нем свободной (1-гликольной системы, чем полностью подтверждалось строение (XVI), а тем самым и ДФПН, которому на основе этих данных может соответствовать только формула (XV). Единственный оставшийся невыясненным вопрос о конфигурации гликозидного центра в рибозном остатке, связанном с никотинамидом, был решен прямым синтезом (XVI) (см. ниже). [c.236]

Наличие гуанина в моче человека показано Вейссманом, Бромбергом и Гутманом [207, 208]. Сообщается о выделении из сапропеля аналога витамина Bi2, который содержит гуанин и рибозу [209, 210]. На основании данных ультрафиолетового спектра предположено, что рибоза присоединена к седьмому атому пуринового ядра. По своему строению этот аналог близок витамину Bi2, только вместо бензимидазольного заместителя в нем содержится гуаниновый остаток. Сходный гуанинсодержащий аналог витамина В12 выделен из ферментативной жидкости No ardia [211]. Нуклеотид, в состав которого входят гуанин и фукоза, выделен из овечьего молока [212]. Гуанин обнаружен также в нуклеотидном ферменте (гуанозиндифосфат маннозы), который содержится в дрожжах [213—215]. [c.137]

Джонс и сотр. [54] описали спектры ЯМР С 11 пиримидиновых и пуриновых нуклеозидов с природным содержанием этого изотопа углерода. Типичные спектры в с б-ДМСО показаны на рис. 15.10. Резонансные сигналы делятся на две группы сигналы в сильном поле относятся к углеродным атомам пентозы, а находящиеся в слабом поле — к С-атомам основания. Спектры в сильном поле очень похожи, но положение сигналов углеводного остатка несколько зависит от природы основания. Так, сигналы от атомов С-Г и С-4, которые всегда являются наименее экранированными в этой части спектра, могут менять положение друг относительно друга. В остатке дезоксирибозы наиболее экранирован атом С-2, сигнал которого лежит на 30 м. д. в более сильном поле по сравнению с его положением в спектре рибозы. Положение сигналов С-атомов оснований, отнесение которых было сделано на основании сравнения спектров друг с другом и со спектрами модельных соединений, не зависит от того, какой из сахаров (рибоза или дезоксирибоза) входит в нуклеозид (ср. спектры аденозина и дез-оксиаденозина на рис. 15.10). Установлено, что для большинства наблюдаемых химических сдвигов, так же как и в случае свободных оснований (см. разд. 15.3), выполняется достаточно хорошая [c.421]

Мак-Дональд и Филлипс с сотр. [79, 81, 85] установили, что спектры ПМР нефракционированной дрожжевой тРНК проявляют такую же температурную зависимость, как спектры поли-А (см. рис. 15.12), что указывает на плавление структуры. В частности, сигнал С-1 -протонов рибозы появляется в спектрах при более высоких температурах, чем сигналы протонов оснований. Однако Смит и сотр. [101] установили, что площади этих сигналов вероятно, отражают агрегацию, вызванную высокой концентрацией Na l (1,0 М), а не плавление вторичной структуры. Информацию о вторичной структуре можно получить из ширины пиков, но не было обнаружено различий в изменении ширины сигналов в областях (/) и II) (см. рис. 15.14). Поэтому вероятно, что по крайней мере в тРНК фрагменты сахаров и оснований в одинаковой степени принимают участие в образовании внутренней структуры. [c.431]

Теперь стало очевидным, что конформация рибозы не зависит от того, является ли основание в нуклеотиде или нуклео-зиде пурином или пиримидином. Это опровергает выводы работы [11], в которой из анализа спектров ЯМР утверждалось, что во всех пуриновых нуклеозидах конформация сахара Сг — эндо, а в пиримидиновых — Сз — эндо. [c.170]

Еще более яркая картина получается при анализе ЯМР-спектра Ь-рибозы (рис. 63, б). В области слабых полей здесь имеются четыре дублета в области 5,42, 5,30, 4,99 и 4,91 м. д. По соображениям, аналогичным приведенным выше, эти пики принадлежат аномерным протонам а-О-рибофуранозы, Р-В-рибофуранозы, Р-В-ри-бопиранозы и а-В-рибопиранозы [c.342]

Имеющиеся косвенные доказательства существования водородной связи между карбонильной группой при С-2 пиримидинового кольца и водородом гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы можно разбить на две группы. Одна группа — это данные о различии физических свойств или химической реакционной способности для пиримидиновых нуклеозидов и их производных, в которых имеется гидроксильная группа при С-2 (например, уридин, уридин-З -фосфат, уридин-5 -фосфат) и производных, в которых эта гидроксильная группа отсутствует (например, 2 -дезоксиури-дин, уридин-2 -фосфат, алкилурацилы). Помимо уже упоминавшихся данных по УФ-спектрам производных уридина сюда относятся данные о различии констант ионизации для производных цитозина этих двух групп отличия в спектрах ЯМР пиримидиновых нуклеотидов 33, а также различие в скоростях протекания некоторых реакций рибо- и дезоксирибонуклеозидов (например, фотохимической гидратации производных цитидинакаталитического гидрирования и гидроксиламинолиза 9 производных уридина). [c.141]

В литературе имеются также данные, которые можно рассматривать как косвенные указания на возможность внутримолекулярного образования водородных связей и в пуриновых нуклеозидах с участием N-3 гетероциклического ядра и гидроксила при С-2 рибозы. К их числу относятся некоторые различия в УФ-спектрах и спектрах ЯМР пуриновых рибо- и 2 -дезоксйрибонуклео-зидов. [c.142]

Спектры ЭПР других облученных оснований (аденина, гуанина, урацила, цитозина) представляют собой синглеты, иногда с очень слабо разрешенной СТС [216] (рис. VI, 19, б—д). В облученных ну-клеозидах и нуклеотидах спектры ЭПР радикалов идентичны спектрам облученных оснований. Радиационный выход радикалов при облучении азотистых оснований лежит в пределах 0,1—1,5 1216], при облучении /)-рибозы при 300° К он равен 4 -f- 6, при 100° К G (R) = 2 -ь 4 (табл. VI.4). [c.311]

Спектры ЯМР дают интересную информацию о таутомерном равновесии сахаров в растворах [57]. Показано, что d-рибоза и 2-деокси7С -рибоза в DgO представляют собой таутомерные смеси пиранозных и фуранозных структур, тогда как у d-ксилозы, d-ликсозы, d-арбинозы и других фуранозных циклов не обнаружено. [c.298]

Из смеси продуктов, полученных при кислотном гидролизе НАД в мягких условиях, был выделен рибозо-5-фосфат с выходом, достаточным для того, чтобы показать, что обе пентозы представляют собой В-рибозу [52]. Дезаминирование адениновой части молекулы азотистой кислотой дает соответствующие производные гипоксантина [53] без дальнейшего изменения молекулы полное дезаминирование НАД до динуклеотида гипоксантина и никотиновой кислоты (а никотинамиднуклеотида — до производного никотиновой кислоты) легко осуществляется при действии азотистого ангидрида [54]. Обработка НАД щелочью приводит к выделению никотинамида и аденозин-5 -пирофосфата [55], по-видимому, в результате элиминирования фосфата из АДФ-рибозы (или продукта расщепления). Хотя коферменты неустойчивы по отношению к щелочи и относительно устойчивы к кислотам, дигидропроизводные (легко получаемые восстановлением с помощью гипосульфита натрия) относительно устойчивы в щелочах, но совершенно неустойчивы по отношению к кислотам. При каталитическом гидрировании НАД и НАДФ получаются гексагидроироизводные, которые в отличие от дигидропроизводных не подвергаются окислению под действием флавопротеида. Изменения в ультрафиолетовых спектрах поглощения, которые сопровождают обратимое восстановление [c.193]

В водных растворах фуранозы присутствуют в небольших концентрациях (табл. 5), однако в водных растворах некоторых свободных сахаров они содержатся в довольно значительных количествах. В ЯМР-спектре рибозы, мутаротирующей в ВаО, Ленц и Хишен [18] обнаружили сигнал о 3,44 м. д., который был отнесен к протонам экзо-циклнческой оксиметиленовой группы — С-5, т. е. свидетельствовал [c.68]

В работе [60] были исследованы мессбауэровские спектры комплексов Ре " с гаунином, гуанозином и рибозой. Все изученные комплексы были при-готовлены лиофильной сушкой водных растворов этих компонент нуклеиновых кислот, содержащих железо в количестве одного атома на молекулу органического вещества. Комплексы были получены из кислых растворов при [c.432]

И. к. имеют максимум поглощения в УФ-свете при 249—250 ммк (в кислой среде) спектры ИМФ, ИДФ и ИТФ в УФ-свете близки между собой. Коэфф. молярной экстинкции И. к при pH 2 и 250 ммк равен 10 900. И. к. дают цветные качественные реакции на гипоксантин, рибозу и органически связанный фосфат. Количественные определения И. к. основаны на тех же цветных реакциях, а также на измерении поглощения И. к. в УФ-свете. Для качественных и количественных определений пользуются также методами хроматографии и ионофореза. И. к. содержатся в животных и растительных организмах. Являясь макроэргич. соединениями, ИТФ и ИДФ принимают участие в таких ферментативных процессах, как, папр., нуклеотидфосфокипазные реакции и декарбоксилиро-вание щавелевоуксусной к-ты до фосфоенолпировиноградной к-ты. [c.136]

Смотреть страницы где упоминается термин Рибоза ПМР-спектр: [c.327] [c.124] [c.394] [c.138] [c.310] [c.187] [c.394] [c.419] [c.424] [c.428] [c.431] [c.208] [c.341] [c.481] [c.73] [c.440] [c.136] [c.22] [c.60] [c.68] [c.433] [c.255] [c.506]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология