Рибонуклеозид фосфаты

Рибонуклеозид-5 -фосфаты можно отделить от соответствующих 2 -или З -фосфатов благодаря чувствительности первых к окислению перйодатом, обусловленной наличием двух г мс-гидроксиль-ных групп. [c.24]

Однако этим способом нельзя отделить друг от друга дезокси-рибонуклеозид-3 - и дезоксирибонуклеотид-5 -фосфаты, поскольку в этом случае отсутствуют гидроксильные группы при С-2. [c.24]

Возможность образования такой водородной связи может быть легко продемонстрирована на молекулярных моделях нуклеозидов с анга-конформацией. Впервые предположение о таком взаимодействии было выдвинуто для объяснения различия УФ-спектров в сильнощелочной среде уридина и уридин-З -фосфата, с одной стороны, и уридин-2 -фосфата, с другой стороны Прямых доказательств образования такого рода водородной связи до сих пор не получено. Расстояние между атомами кислорода 2-экзо-О и 2 -экзо-0 в кристаллах пиримидиновых рибонуклеозидов и рибонуклеотидов , полученное на основании данных рентгенографии, превышает расстояние, требуемое для образования водородной связи. Однако это не удивительно, так как в кристаллической решетке и тот и другой атомы кислорода находятся в непосредственной близости с функциональными группами соседних молекул нуклеотида такие межмолекулярные взаимодействия могут преобладать в данном случае над внутримолекулярными взаимодействиями, существующими в разбавленных растворах. [c.141]

Ионы двухвалентного свинца дефосфорилируют рибонуклеозид-2 (3 )-фосфаты за 2—4 ч при pH 6 и 100°С . [c.545]

Наличие цис-гликольной группировки в рибонуклеозид-5 -фосфатах резко понижает хроматографическую подвижность в основных системах, содержащих бораты. Подвижность рибо-и дезоксирибонуклеотидов в большинстве систем очень близка и различить эти группы соединений бумажной хроматографией чрезвычайно трудно. [c.326]

РИБОНУКЛЕОЗИД-2 - И РИБОНУКЛЕОЗИД-З -ФОСФАТЫ [c.147]

Наличие взаимодействия, скорее всего образование водородной связи между цыс-гидроксильной группой и фосфорным остатком, ясно видно из сравнения соответствующих рибонуклеозид- и дезоксирибонуклеозид-3 -фосфатов. Из поведения их при хроматографировании на анионообменной смоле следует, что первые — значительно более сильные кислоты и что смеси таких нуклеотидов (например, цитидин-3 -фосфата и дезоксицитидин-3 -фосфата) могут быть легко разделены. В противоположность этому соответствующие рибонуклеозид- и дезоксирибонуклеозид-5 -фосфаты имеют близкие характеристики [67, 154]. [c.174]

При определении структуры индивидуальных нуклеотидов часто используют химический или ферментативный гидролиз, а также дефосфорилирование до соединений известной структуры. Исторически сложилось так, что гетероциклические основания и углеводные составляющие основных нуклеотидов были уже известны и нерешенным оставался лишь вопрос о положении фосфориль-ного остатка в углеводной части молекулы [14]. Эта проблема была решена сравнительно легко для 5 -нуклеотидов и для дез-оксинуклеозид-З -фосфатов. Однако быстрое взаимопревращение рибонуклеозид-2 - и -З -фосфатов оказалось серьезной проблемой для исследователей, начинавших работы в этой области. Применение ионообменной хроматографии для разделения компонентов гидролизата дрожжевой РНК позволило однозначно определить положение фосфорильных остатков в этих нуклеотидах. Для всех четырех основных нуклеотидов были получены пары изомеров (а) и (Ь). Осторожный гидролиз адениловых кислот (а) и [Ь) дал соответственно рибозо-2- и -3-фосфат, которые были идентифици- [c.137]

Катализируемый основаниями гидролиз полирибонуклеотидов или рибонуклеозид-2 (3 )-фосфодиэфиров может проходить через интермедиаты, подобные (23). В процессе частичного гидролиза не наблюдается изомеризации нуклеозид-З -фосфодиэфиров в -2 -фосфодизфиры. Возможно, это происходит в силу того, что псевдовращению пентаковалентного интермедиата препятствует присутствие отрицательно заряженного лиганда Р—0 , а не Р—ОН. Энергетически неблагоприятно помещение отрицательно заряженного лиганда в апикальное положение в процессе псевдовращения следовательно, в качестве продуктов катализируемого основаниями гидролиза РНК преобладают З -фосфаты. Альтернативно, эту реакцию можно отнести к простому Sn 2(Р)-замещению по механизму типа in-line (в линию) схема (6) . [c.141]

Фермент полинуклеотидфосфорилаза широко использовался для присоединения рибонуклеозид-5 -пирофосфата к З -гидроксильной группе динуклеозидфосфата или к акцептору большего размера. Недостатком используемого метода является образование в ходе реакции неорганического фосфата, который ускоряет обратный процесс, т. е. частичный фосфоролиз З -концевого остатка. Это затруднение было преодолено удалением фосфата из реакционной смеси по мере его образования [15]. [c.187]

Однобуквенные символы рибонуклеозидов используются в сокращенных обозначениях монорибонуклеотидов, например 2 -UMP для уридин-2 -фосфата. Первая буква обозначает нуклеозид, вторая — количество фосфатных групп (М — моно, D — ди, Т — три), а третья буква Р означает фосфат (phosphate). Дезоксири-бопуклеотиды записываются аналогичным способом с добавлением впереди буквы d , например [c.359]

Пиримидиновые нуклеозиды и нуклеотиды. При регулируемом гидролизе рибонуклеиновых кислот энзиматическими или химическими методами может образоваться каждый из четырех рибонуклеозидов—аденозин, гуанозин, цитидин и уридин,— их монофосфаты (по три от каждого) или, в случае уридина и цитидина, их 2, 5 - и 3, 5 -дифосфаты. При энзиматическом гидролизе дезоксирибонуклеиновых кислот получаются дезоксирибонуклеозиды и их -фосфаты,- являющиеся производными аденина, гуанина, тимина, цитозина, 5-ме-тилцитозина и 5-оксиметилцитозина 3, 5-дифосфаты пиримидиновых дезокси- [c.255]

Для большинства рибонуклеозидов и нуклеотидов найдена транс-гош-кон-формация связей Сг —О2 и Сз —Оз, т. е. транс-расположтш связи О—Н относительно связи Сг —Сз и гош-от-носительно связи Сг —С/. Однако в аденозин-5- -фосфате гидроксильная группа находится в ориентации гош-гош. В молекуле цитозин-З-фосфата связь Оз —Р находится в транс-ориен-тации относительно связи Сг —С з и гош — относительно С4 —Сз. Возможно, существование такой конформации связи Сз —Оз обязано наличию водородных связей между гидроксильной группой Ог—Нг и атомами кислорода фосфатной группы. [c.172]

Все известные РНК-азы растений могут полностью гидролизовать РНК до образования рибонуклеозид-2, 3 -циклофосфатов. Ферменты растений отличаются от РНК-аз животных тем, что они катализируют расщепление связей между любыми различными нуклеотидами. Однако имеются данные, что РНК-аза растений с большей скоростью гидролизует связи, образованные гуанози-ном. РНК-аза из райграсса и очищенная РНК-аза из шпината катализировали также гидролиз и пиримидиновых, и пуриновых нуклеозидциклофосфатов с образованием соответствующих нуклео-3 ид-3 -фосфатов. РНК-аза из табака и гороха медленно расщепляла циклические фосфаты пуриновых нуклеозидов и не проявляла никакой активности по отношению к циклическим фосфатам пиримидиновых нуклеозидов. [c.481]

NMP) +1 - удлиненный полинуклеотид, а Pj-отцепившийся фосфат. Ферменту необходимы 5 -дифосфаты рибонуклео-зидов с рибонуклеозид-5 -трифосфата-ми, с дезоксирибонуклеозид-5 -дифосфа- [c.922]

Рибонуклеозид-2 - и рибонуклеозид-З -фосфаты получают, подвергая РНК щелочному гидролизу и разделяя образующиеся нуклеотиды при помощи ионообхмепной хроматографии. Гидролиз РНК под действием диэстеразы змеиного яда (стр. 92) приводит к образованию нуклеотид-5 -фосфатов, которые могут быть разделены хроматографически с использованием вспомогательной шкалы. Нуклеозид-5 -фосфаты можно выделить также из кислоторастворимой фракции животных тканей. В большинстве тканей содержание нуклеотидов аденина значительно выше, чем нуклеотидов других оснований. [c.26]

Возможно существование и другого пути биосинтеза пиримидинов, проходящего через карбомоил- -аланин, соответствующие рибонуклеозид и рибонуклеотид и затем дигидроуридин-5 -фосфат [59] в этом случае оротовая кислота не принимает участия в образовании пиримидинового кольца. [c.179]

Нуклеотидами "называются фосфорные эфиры нуклеозидов, в которых, сахар связан с фосфатной группой через атом кислорода. Их можно получить при химическом или ферментативном гидролизе нуклеиновых кислот, если проводить гидролиз в мягких условиях. В случае рибонуклеотидоВ гидролизат может содержать смесь 2 -, 3 - и 5 -мононуклеотидов (т. е. рибо-яуклеозид-2 -, рибонуклеозид-3 - или рибонуклеозид-5 -фосфатов цифра со-штрихом указывает положение, в котором произошла этерификация сахара) в случае дезоксирибонуклеотидов в гидро лизате могут присутствовать только [c.126]

Биологическая функция полинуклеотидфосфорилазы неизвестна. Маловероятно, чтобы этот фермент участвовал в синтезе различных типов клеточной РНК, так как, во-первых, при характерных для внутриклеточной реды концентрациях рибонуклеозиддифосфатов и неорганического фосфата положение равновесия реакции сдвинуто в сторону фосфоролиза, а не в сторону поликонденсации и, во-вторых, первичные структуры затравки и продукта различны. Последний аргумент особенно важен, так как специфичность нуклеотидных последовательностей раздичных типов клеточной РНК может быть обеспечена (как и в случае ДНК) только управляемым синтезом. Возможно, что полинуклеотидфосфорилаза функционирует как расщепляющий фермент, разрушая ненужную РНК и освобождая рибонуклеозид-дифосфаты, которые могут, например, использоваться как предшественники дезоксирибонуклеозидов (и, следовательно, ДНК). [c.512]

Выше уже рассматривалось (см. стр. 69) расщепление поли-и олигорибонуклеотидов под действием рибонуклеаз. Первая стадия реакции — превращение фосфодиэфира рибонуклеозида в циклофосфат— в значительной степени обратима, и в определенных условиях при обработке циклического фосфата моно- или олигонуклеотида (нуклеотидный компонент) избытком нуклеозида или нуклеозид-З -фосфата (нуклеозидный компонент) удается достигнуть образования 3 - 5 -фосфодиэфирной связи [c.96]

Ацетилирование гидроксильной группы углеводного остатка в дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатах гладко протекает под действием уксусного ангидрида в водной среде при pH 7. В этих условиях гетероциклическое основание не ацилируется даже в случае производных цитидина. При аналогичном ацилировании рибонуклеозид-З -фосфатов за счет внутримолекулярного фосфорилиро-вания 2 -гидроксильной группы в смешанном ангидриде I в значительных количествах образуются циклические фосфаты. [c.513]

Общим методом химического гидролиза рибонуклеозидмоно-фосфатов до рибонуклеозидов является обработка при pH 4 (обычно в аммонийформиатном буфере) и высокой температуре (100° С и выше)Такие условия, как было показано для простых алкилфосфатов, являются оптимальными для расщепления фосфомоноэфирных связей [c.542]

Рибонуклеозид-2, 3 -цилкофосфаты. Рибонуклеозид-2, З -циклофосфаты являются промежуточными продуктами гидролиза РНК и полирибонуклеотидов под действием рибонуклеаз 8, при химическом гидролизе РНК, катализируемом кислотами и основаниями (стр. 553 сл.) и при изомеризации (взаимопревращении) рибонуклеозид-2 - и рибонуклеозид-З -фосфатов (см. стр. 563). Фосфодиэфирная связь в рибонуклеозид-2, 3 -циклофосфатах расщепляется в щелочной и кислой средах. При этом образуется смесь рибонуклеозид-2 - и -З -фосфатов, если реакция проводится в воде, или соответствующих моноалкилфосфатоз, если средой являются безводные спирты [c.547]

Нуклеозид-3, 5 -циклофосфаты. Рибонуклеозид-3, 5 - и дез-оксирибонуклеозид-3, 5 -циклофосфаты (об их синтезе см. ) под действием кислот и оснований претерпевают расщепление фосфодиэфирной связи, которое во многих случаях, в зависимости от условий реакции и природы основания и углеводного остатка, сопровождается гидролизом N-гликозидной связи (стр. 495, 504). Первый из указанных процессов приводит к образованию смеси нуклеозид-3 - и -5 -фосфатов (с преобладанием З -изомеров) , второй— к смеси рибозо- (или дезоксирибозо-) фосфатов, дефосфо-рилирующихся в более жестких условиях [c.551]

Кислотный гидролиз дезоксирибонуклеозид-3, 5 -циклофосфа-тов и пуриновых рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфатов приводит к выделению оснований (см. стр. 495), сопровождающему разрыв фосфодиэфирных связей . Так, при нагревании аденозин-3, 5 -циклофосфата с сульфокатионитом в Н+-форме образуется смесь рибозо-2 -, -3 - и -З -фосфатовв более жестких условиях — при нагревании с 1 и. соляной кислотой при 100° —продуктами реакции являются аденин, рибоза и ортофосфорная кислота При аналогичной обработке (1 н. НС1, 100 °С) уридин-3, 5 -циклофос-фат полностью расщепляется за 1 ч (время полупревращения 8 мин) при этом образуются урацил (67%), уридин-2 (3 )-фосфат (27%) и уридин-5 -фосфат (6%). Цитидин-3, 5 -циклофосфат разрушается полностью за 2 ч (время полупревращения 26 мин) при этом возникают цитозин (6%), цитидин-2 (3 )-фосфат (78%) и ци-тидин-5 -фосфат (13%) [c.552]

При щелочном гидролизе нуклеозид-3, 5 -циклофосфатов состав продуктов реакции зависит от применяемого реагента. При нагревании в 1 н. растворе NaOH при 100° С аденозин-3, 5 -циклофосфат отщепляет 0 3,44 аденин (см. стр. 504), а уридин-3, З -циклофосфат — урацил, хотя основным продуктом реакции является уридин-З -фосфат ( 70%) . В то же время тимидин-3, 5 -циклофос-фат в этих условиях количественно превращается в смесь мононуклеотидов (время полупревращения 24 ч) — тимидин-З -фосфат (80%) и тимидин-З -фосфат (20%) - Значительно более эффективна в качестве гидролизующего агента гидроокись бария, в 0,2— 0,4 н. растворах которой при 100° С гидролиз фосфодиэфирных связей в рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфатах проходит количественно за 30 мин и практически не сопровождается отщеплением оснований При этом 3 - и 5 -нуклеотиды образуются в соотнощении примерно 5 1 (табл. 10.6). [c.553]

Майкальсоном осуществлен неизбирательный синтез полинуклеотидов путем полимеризации циклических рибонуклеозид-2,3-фосфатов в присутствии дифенилхлорфосфата или тетрафенилпирофосфата, а также Хараном путем поликонденсации нуклеотидов. [c.445]

Сообщения в литературе, описывающие избирательное фосфорили-рование З -гидроксильной группы в рибонуклеозидах, защищенных в положении 5, не являются абсолютно правильными с точки зрения последних достижений в химии нуклеотггдов. Действительно, весьма вероятно, что при условиях, устраняющих образование циклического фосфата и миграцию фосфатной группы, фосфорилирование будет протекать по 2 -гидроксильной группе, по крайней мере при действии мягких реагентов. Ср. тритилирова-ние и тозилирование (миграция маловероятна) с ацетилированием (перенос и миграция, приводящие к образованию более устойчивого эфира, установленные во многих случаях). Известно, что 2 -гидроксильная группа в рибонуклеозидах является более кислой , чем гидроксил в положении 3. [c.36]

Устойчивость гликозидной связи в кислой среде широко варьирует в зависимости от природы как основания (и его заместителей), так и сахара (и его заместителей). Так, напрпмер, дезоксинуклеозиды менее устойчивы, чем рибонуклеозиды, тогда как в пределах каждого класса устойчивость изменяется в следующем порядке урацил-(или тимин-) > цитозин- > аденин- > гуаниннуклеозид. На скорость кислотного расщепления гликозидной связи может оказывать значительное влияние наличие ацильного остатка в гетероцикле 100, 101], хотя имеется и другая точка зрения [102]. Этерификация гидроксильных групп сахара также влияет на устойчивость гликозидной связи, как, например, в случае 0-ацетил-2 -дезоксигуанозина [79], фосфатов тимидина [103] и 2 -0-/1-толуолсульфониладенозина [78] ]4а это указывает также удивительная устойчивость 2, 3, 5 -трн- [c.37]

Название нуклеотид было введено в 1908 г. Левиным и Ман-делем 11] для соединений, выделенных из кислотных гидролизатов нуклеиновой кислоты зобной железы теленка. Еще до недавнего времени фосфаты нуклеозидов часто характеризовали по названию сырья так, например, для описания двух различных изомеров аденинового нуклеотида употребляли выражения дрожжевая адениловая кислота и мышечная адениловая кислота . В настоящее время эта терминология утратила в какой-то мере свое значение, и если известно положение фосфорного остатка, то его обозначают обычно, как в данном примере аденозин-2 -фосфат. Для Аюнофосфатов природных рибонуклеозидов вoз южнo существование трех изомеров (2 -, 3 - или 5 -фосфаты), а в ряду дезоксирибонуклеозидов вoз южны как З -фосфаты, так и 5 -фосфаты. Все они были выделены. [c.123]

Наличие шестичленного фосфатного цикла стабилизирует пурин-гликозидные связи к действию кислых агентов. В этих условиях особенно неустойчивой оказывается гликозидная связь в уридин-3, 5 -циклофосфате и в соответствующем производном тимидина (но не в цнтидин-3, 5 -циклофосфате). При щелочном гидролизе едким натром рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфатов происходит сильное общее разложение, включая и разрыв гликозидной связи. Это особенно характерно для пуриновых производных, но с тимидин-3, 5 -циклофосфатом и, вероятно, с другими 2 -дезоксипроиз-водными этого не происходит. При действии гидроокиси бария образуются нуклеозид-3 - и нуклеозид-5 -фосфаты в отношении 5 1. При гидролизе пиримидиновых рибо- и дезоксирибонуклео-зид-3, 5 -циклофосфатов, катализируемом ионами бария, полу- [c.136]

Превращение нуклеозид-5 -трифосфата под действием водной гидроокиси бария — сложный процесс, в результате которого образуется ряд продуктов [144], в том числе и нуклеозид-3, 5 -циклофосфат [76]. Как рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфаты, так и аналогичные дезоксппроизБодные можно получать непосредственно нагреванием три-н-бутиламмониевой солн нуклеозид-5 -фосфата и ди-циклогексилкарбодинмида в пиридине [76—78]. [c.150]

При фосфорилировании соответствующих замещенных 9-P-D-глюкопиранозиладенина были получены его 2 -, 3 -, 4 - и б -фосфаты (а также 4, 6 -циклофосфат) [205]. 2 -, 3 - и 4 -Фосфаты не изоме-ризовались в тех условиях, которые вызывают взаимопревращения 2 -и З -фосфатов рибонуклеозидов. (Здесь интересно отметить, что из листьев хлопчатника был выделен глюкозиладенинфосфат [206], но структура его пока не установлена.) [c.171]

Несмотря на то что нуклеозид-5 -фосфаты и их эфиры не проявляют тенденции к изомеризации, рибонуклеозид-2 - и рибонуклео-зид-3 -фосфаты легко превращаются в равновесную смесь в кислой среде. Эта катализируемая кислотами миграция протекает через стадию промежуточного образования 2, 3 -циклофосфата [47] и аналогична превращению глицеро-а- и глицеро- -фосфатов в равновесную смесь [227—229]. [c.176]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология