Цитозин Частичный вес

Как легко видеть, качественное распределение зарядов при включении в расчет 0-электронов остается тем же, что и при рассмотрении ТОЛЬКО я-электронов (см. рис. 3.6). Так, например, можно сопоставить заряды на атомах С-5 и С-6 пиримидиновы.х оснований, рассчитанные только с учетом я-электронов и с учетом я- и а-электронов. В обоих случаях большая электронная плотность соответствует атому С-5. Далее оба расчета предсказывают, что на С-6 аденина и цитозина сосредоточены частичные положительные заряды и т. д. Возможно, что для предсказания химических особенностей оснований расчеты с учетом (т-электронов окажутся более подходящими, однако в настоящее время они малодоступны. [c.156]

Фотолиз замещенных цитозинов. Цитидин и цитидиловая кислота обратимо образуют фотогидрат при облучении как в воде, так и в буферных растворах. На фотохимическое поведение цитозина и его замещенных оказывают влияние неорганические ионы, в частности фосфатный и пирофосфатный. В присутствии этих ионов наряду с фотогидратом цитозина образуются частично другие фотопродукты, в настоящее время не идентифицированные 217. [c.667]

Время не установлена, изучен лишь ряд их свойств. Продукты, получающиеся при фотолизе цитозина и 1-метилцитозина в спирте, при нагревании частично регенерируют исходные соединения Водный раствор фотопродукта цитозина чувствителен к облучению при 313 ммк 22. [c.669]

Препараты ДНК бактерий характеризуются широким интервалом изменений содержания пар гуанин — цитозин (от 26 до 74%). Вместе с тем отдельные типы бактерий имеют достаточно гомогенную ДНК- Исследование ДНК целого ряда бактерий показывает, что температура перехода является линейной функцией от содержания пар гуанин — цитозин. Экстраполяция к случаю чистого ГЦ-сополимера при ионной силе раствора 0,15 дает температуру перехода 110°, а экстраполяция к случаю чистого АТ-сополимера — температуру 69°. Наблюдаемая температура перехода для АТ-сополимера равна 65°. Более высокую температуру перехода для образцов ДНК с высоким содержанием пар ГЦ можно, вероятно, объяснить (во всяком случае, частично) тем, что пара ГЦ связана тремя водородными связями, тогда как пара АТ — всего двумя. Каждая молекула имеет свою температуру перехода, зависящую от содержания пар ГЦ. Наличие корреляции между температурой перехода и содержанием пар ГЦ указывает, что никакие пары оснований не расположены подряд на сколько-нибудь значительном участке полинуклеотидной цепочки, а распределены таким образом, что температура перехода молекулы является функцией среднего содержания пар ГЦ во всей молекуле. [c.323]

Азотистые основания, обнаруженные в ДНК, представлены двумя основаниями пуринового ряда — аденином и гуанином —и двумя основаниями пиримидинового ряда — тимином и цитозином. В формулах, приведенных на рис. 24.4, звездочками отмечены атомы водорода, которые замещаются атомом углерода кольца сахара в ДНК двойные связи отвечают лишь одной из нескольких валентных структур для каждой молекулы. Такие молекулы имеют плоское строение, поскольку каждая из связей в пуриновом и пиримидиновом кольцах частично имеет характер двойной связи. [c.687]

Дальнейшее изучение спектрофотометрического кислотного титрования ДНК (из зобной железы теленка) показало, что изменения в ее спектрах до начала денатурации (т. е. до начала быстрого возрастания оптического поглощения), которые происходят при pH 2,59 и 0 и при pH 3,32 и 30°, обусловлены протонированием цитозиновых остатков 1273]. Был сделан вывод, что при 0°, когда каждый адениновый и цитозиновый остатки протонированы, структура стабильна, а поэтому титрование обратимо вплоть до этой точки но в том случае, когда протонируются гуаниновые остатки, происходит денатурация (что находится в соответствии с ранними наблюдениями). Контролируемые изменения pH или температуры, приводящие к частичной денатурации, указывают на гетерогенность ДНК [273]. Однако определение области значений pH, при которых происходит денатурация, и изучение изменений значений рН1/2 (pH, при которых денатурация происходит на 50%) для ДНК, содержащих различные количества гуанина и цитозина, указывали на то, что, хотя кислотная денатурация при высокой ионной силе происходит скачкообразно, ее все же нельзя отнести к процессам типа все или ничего . Гетерогенность по составу сама по себе еще не объясняет расширения области структурного перехода при кислотной денатурации [274]. Можно ожидать, что, для того чтобы вызвать денатурацию при более низких температурах, необходима более высокая степень протонирования, причем кривые должны быть смещены в сторону более низких значений pH. Так, при 30° рН1 2 равен 3,07 (для ДНК из зобной железы теленка, ц = 0,1 М), а при 0° это значение снижается до 2,25. Увеличение содержания гуанин-цитозиновых пар также понижает pH, при которых происходит денатурация, но это смещение относительно мало [274]. [c.594]

Азотистые основания, обнаруженные в ДНК, представлены двумя пуриновыми основаниями — (Зенынол и гуанином —-а. двумя пиримидиновыми основаниями — тимином и цитозином. В формулах, приведенных на рис. 15.20, звездочками отмечены атомы водорода, которые в ДНК замещаются атомом углерода кольца сахара расположение двойных связей отвечает лищь одной из нескольких возможных валентных структур для каждой молекулы. Такие молекулы имеют плоскую конфигурацию, так как каждая из связей в пуриновых и пиримидиновых кольцах имеет характер частично двойной связи. [c.455]

Коэффициенты парных взаимодействий для остальных изученных систем имеют сравнительно небольшие по абсолютной величине положительные и отрицательные значения (табл. 4.20), что исключает возможность ассоциации. В случае, когда существует линейная зависимость коэффициентов парных взаимодействий от энтальпии гидратации аминокислот к (А у Д)), можно говорить о наличии слабого взаимодействия между молекулами растворенного вещества, которое сопровождается их частичной дегидратацией [7, 8]. Такая зависимость коэффициентов парных взаимодействий аминокислот с нуклеиновыми основаниями от энтальпий гидратации АК обнаружена для взаимодействия с yt, Ade и af (рис. 4.20). Существование указанной зависимости говорит о том, что несмотря на значительную конкуренцию между процессами слабых взаимодействий и дегидратации, для указанных молекул влияние растворителя на процесс взаимодействия является управляющим фактором. Необходимо отметить, что зависимость (Ahyjfi) гораздо слабее для аденина и кофеина, чем для цитозина. Это говорит о большей конкуренции между вышеупомянутыми процессами для Ade и af, чем для yt и о том, что для изученных пуриновых НО растворитель оказывает меньшее влияние на процесс их взаимодействия с АК, нежели для цитозина. Таким образом, слабое взаимодействие цитозина, аденина и кофеина с АК в значительной степени зависит от гидратационного состояния аминокислот. [c.241]

Изучалось также влияние частичного дезаминирования полинуклеотидов на способность тРНК вступать в биохимические реакции а также на способность синтетических полинуклеотидов служить матрицей для ДНК-полимеразы или функционировать в бесклеточной системе биосинтеза белка Азотистая кислота является эффективным мутагеном. По современным представлениям (обзор — см. з), этот мутагенный эффект связан с дезаминированием остатков аденина и цитозина, так как продукты таких реакций — гипоксантин и урацил — способны образовывать комплементарные пары с цитозином и аденином. Дезаминирование же остатка гуанина приводит в основном к инактивации генетического материала. [c.421]

Насыщение двойной связи С-5—С-6, протекающее при галоидировании пиримидиновых производных (см. стр. 330), также приводит к соединениям, расщепляющимся с раскрытием цикла в щелочной среде 8 . Образующиеся при этом ациклические продукты охарактеризованы не были. Образование ациклических производных цитозина и частично тимина происходит, по-видимому, и при обработке ДНК иодом (pH 5,3 100 °С, 5 мин) с последующим действием 1 н. раствором NaOH (100 °С, 1 ч) [c.456]

Частичная апуринизация ДНК наблюдается уже при нагревании ее водных растворов в интервале pH 6,1—7,3 при 65— 100° С (в этих условиях происходит также частичное отщепление цитозина 55). [c.501]

Показано, что в этих условиях происходит также частичное отщепление цитозина и тимина Об использовании апуриновых ДНК для анализа частоты встречаемости различных полипиримидиновых последовательностей в ДНК см. стр, 575. [c.501]

Кислотный гидролиз РНК до пуриновых оснований и пиримидиновых нуклеотидов, очень широко применявшийся в более ранних исследованиях (особенно до развития современных методов хромотографического анализа, см. обзоры ), используется для анализа нуклеотидного состава РНК и в настоящее время. С этой целью РНК нагревают при 100° С с 1 н. соляной кислотой в течение 1 ч реже применяется гидролиз 0,4 н. серной кислотой при 100° С в течение 1 Побочными процессами, протекающими в этих условиях, являются расщепление гликозидной связи в производных дигидроурацила (см. гл. 8), частичное дезаминирование производных цитозина (на 2—4%) возможна также частичная деградация 1-метиладенина (см. стр. 442). [c.567]

Обычным методом кислотной деградации ДНК является нагревание ее 2%-ного раствора в 0,2 и. серной кислоте при 100° С в течение 35 мин 2 . При данном методе гидролиза эти условия являются оптимальными, так как они позволяют достичь достаточно полного расщепления фосфодиэфирных связей у дезоксирибозильных звеньев, образовавшихся в результате апуринизации ДНК (см. также стр. 500). Большая продолжительность реакции приводит к частичной апиримидипизации ДНК и расщеплению соответствующих фосфодиэфирных связей, как было показано при изучении кинетики кислотного гидролиза пиримидиновых олигонуклеотидов. При этом остаток цитозина отцепляется с большей скоростью, чем остаток тимина Так, при длительном нагревании динуклеотида р(1Тр(1С в 0,2 н. серной кислоте при 100° С протекает преимущественное отщепление цитозина и образование тимидин-3, 5 -дифосфата [c.574]

Щелочной гидролиз был применен также для расщепления ДНК после ее предварительного дезаминирования с последующим гид-роксиламинолизом (удаление остатков цитозина и большей части остатков гуанина, см. стр. 472) а также после предварительного окисления 0з04 (разрушение остатков тимина и частично остатков [c.580]

НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ. Высокомолекулярные органические соединения, входящие в состав сложных белков — нуклеопротеидов, играющих важную роль в моцессах жизнедеятельности всех живых существ. Построены из большого количества мононуклеотидов, в состав котш)ЫХ входят фосфорная кислота, углеводы (ри-боза или дезоксирибоза) и так называемые пуриновые и пиримидиновые основания. Различают дезоксирибонуклеиновую кислоту (ДНК) и рибонуклеиновую кислоту (РНК). РНК содержит углевод рибозу, а ДНК —частично восстановленную рибозу — дезоксирибозу. Они отличаются и составом оснований. В те и другие входят цитозин, аденин и гуанин, но в РНК содержится еще урацил, а в ДНК — тимин. ДНК сосредоточена преимущественно в ядрах всех клеток, в хромосомах, РНК находится главным образом в цитоплазме. ДНК имеет большое значение в передаче наследственных свойств организмов. РНК играет большую роль в синтезе белков. [c.203]

Хотя взаимодействия химически синтезированных полиадениловой н полиуридиловой кислот не наблюдали, частичное взаимодействие иолицитидиловой с полигуаниловой кислотой (обе со средней длиной примерно 10 нуклеотидов) было показано с помощью противоточного распределения, а также электрофореза на бумаге гомополимеров и их смеси (22J. Это взаимодействие (сопровождаемое небольшим уменьшением ультрафиолетового поглощения), ио-видимому, сходно с тем, которое наблюдается у высокомолекулярных ферментативно синтезированных полимеров 164]. Кроме того, обнаруженное затем ограниченное вращение вокруг межнуклеотидных связей в олигонуклеотидах также свидетельствует о том, что водородные связи между остатками гуанина и цитозина более прочные, чем между аденином и урацилом. Эти синтетические полимеры содержали как 2 — 5 -, так и 3 — 5 -связи, и трудно было ожидать их полного взаимодействия даже в случае исиользования препаратов с более длиииыми цепями, так как изменение межплоскостного взаимодействия могло бы значительно понизить эффективность образования водородных связей . Последующие работы [c.533]

Различные физические свойства РНК указывают на существование в нейтральном солевом растворе при низких температурах частично спирализованной структуры. Так как препараты являются одиоцепочечными и не содержат эквимолярных количеств комплементарных оснований, то был сделан вывод, что каждая полинук-леотидиая цепь состоит из ряда несовершенных двухспиральных участков (соединенных одним концом), по своему характеру сходных с двойной спиралью ДНК, причем эти участки соединяются гибкими фрагментами, лишенными какой бы то ни было определенной конформации [238]. Среди многих возможных пар оснований наиболее стабильными оказались пары, в которых аденин связан водородными связями с урацилом, а гуанин — с цитозином, и эти пары, по-видимому, единственные, которые могут обеспечить образование правильной спиральной структуры. Внутри таких структур все другие пары оснований либо разделены слишком большими расстояниями, либо структурно не соответствуют друг другу. В соответствии с этой точкой зрения была обнаружена линейная зависимость между температурой плавления данных РНК и содержанием в них гуанин-цитозиновых пар [3561. [c.626]

При выращивании бактерий и вирусов в присутствии 5-бромур ацила (аналог тимина) в условиях недостатка тимина или подавления его синтеза происходит частичная замена в нуклеозидах тимина на данное основание Тимин, как известно, спаривается в ДНК с аденином. 5-Бромурацил, в отличие от тимина, способен в большей мере образовывать кроме обычной кетоформы енольную форму, что обусловлено наличием в 5-положении молекулы электроноакценторного заместителя — брома. 5-Бромурацил в виде енола спаривается не с аденином, а с гуанином, аналогично цитозину [c.476]

Характер расщепления фрагментов ДНК в методе секвенирования путем химической деградации таков, что для чтения последовательности с радиоавтографа геля наиболее оптимальным вариантом является такой, когда при нанесении на гель одна дорожка (обычно первая) соответствует гуанину, вторая - пуринам, третья - пиримидинам и четвертая - цитозину (рис. 6.1). Таким образом, две средние дорожки содержат большее (кроме потенциально возможных частных случаев) число полос, чем крайние дорожки, поскольку в них видны фрагменты ДНК, ограниченные нуклеотидам и О, А и С, Т соответственно. Таким образом, эти две средние дорожки (О + А и С + Т) вместе содержат все полосы частичного расщепления меченой по одному из концов молекулы ДНК, Правильное прочтение полос, видимых на радиоавтографе геля, заключается, во-первых, в определении вертикальной позиции каждой конкретной полосы, соответствующей тому или иному нуклеотиду, относительно полос в соседних дорожках, относящихся к одному и тому же образцу ДНК, и, во-вторых, в выявлении типа нуклеотидов, к которому принадлежит данная полоса. Так, например, если полоса имеется только во второй дорожке - то это аденин, поскольку для другого пуринового основания - гуанина будет характерно наличие двух полос в первой О-дорожке и совпадающей с ней полосой во второй О + А-до-рожке. Аналогично проводится и чтение пиримидиновых оснований, где полоса только в третьей дорожке указывает, что это тимин, а если эта же полоса имеется и в четвертой дорожке, то тогда это цитозин. Что касается более редко используемых реакций, приводящих к выявлению полос ДНК по типу А > С, А > О, 6 > А, С > Т, то в таких случаях требуется более сложное сопоставление наличия или отсутствия полос в соседних треках. Анализируя таким образом полосы одну за другой и поднимаясь вверх по радиоавтографу, необходимо достигнуть места, где полосы в соседних дорожках расположены так близко друг к другу, что уже невозможно различить их вертикальную последовательность. После этого чтение нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК с данного радиоавтографа можно считать законченным. Если же этот образец был нанесен на гель дважды, то для ранее нанесенного препарата на радиоавтографе будут видны фрагменты ДНК большего размера. В таком случае надо найти перекрывающиеся участки (что гораздо легче сделать, если в секвенируемой последовательности ДНК содержатся какие-нибудь характерные участки как, например, ААААОСАААА или им подобные, хорошо заметные глазом) и продолжить чтение данного образца ДНК, пока позволяет достигну- [c.199]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология