Поли АВР-рибоза

Рис. 16.5. л —формула О-рибозы Б — масс-спектр при электронной бомбардировке В- масс-спектр при ионизации полем. [c.326]

Рибонуклеиновые кислоты (РНК, т. е. содержащие рибозу) образованы одной поли нуклеотидной цепочкой, которая скручена так, что образуется значительное количество коротких спиральных участков (рис. 77) — это вторичная структура РНК. [c.181]

Гексаметилендиамин присоединен к АМР пурина в 6-положении перед привязкой к агарозе Гексаметилендиамин присоединен к АМР в С -поло-жении аденина перед привязкой к агарозе Периодатное окисление рибозы с последующим сшиванием гидразидом (используется дигидразид адипиновой кислоты в качестве пространственной группы) [c.146]

Метод ПМР — самый информативный из всех физических методов — особенно ценен для изучения углеводов — их различных стереоизомеров, таутомеров и конформеров. Сигналы аномерных протонов (т. е. находящихся у С(1, альдоз), как наименее экранированные по сравнению с другими протонами моносахаридов, лежат в области слабых полей — от 4,5 до 5,5 м. д. На рис. 63 представлены спектры равновесных растворов П-глюкозы и В-рибозы в окиси дейтерия (в качестве растворителей для снятия ПМР-спектров стараются использовать жидкости, не содержащие атомов водорода, чтобы не осложнять картину за счет протонов растворителей). В спектре О-глюкозы (рис. 63, а) видны два дублета с химическими сдвигами 5,32 и 4,74 м. д. [c.341]

Рассмотрим небольшое число ПМР-спектров. На рис. 15 представлена небольшая часть записи ПМР-спектра растворов I)-глюкозы (а) и Д-рибозы (б) в растворе окиси дейтерия (ОзО) эта часть относится к области низких напряжений. На рис. 15, а видны два дублета, характеризующиеся химическими сдвигами 5,32 и 4,74 м. д. Судя по положению в области 5 м. д., эти дублеты принадлежат аномерным протонам а- и р-форм глюкозы. Дублет 5,32 м. д. принадлежит экваториальному протону, как расположенному в области более слабого поля, т. е. а-форме. Дублет 4,74 м. д. относится к аксиальному протону, т. е. р-форме. Это же подтверждается константами расщепления J, которые на спектре равны соответственно 3,5 и 7,5 Гц. Наконец, расщепление каждого пика на дублет свидетельствует, что данный протон взаимодействует лишь с одним протоном у соседнего углеродного атома (у С-2) [c.91]

Каково происхождение гена tox и почему он переносите вирусом Паппенхеймер и Джил высказали предположение что этот ген каким-то образом образовался из гена эукариотической клетки, кодирующего функциональный белок. Этот ген внедрился в вирус и в ходе эволюции трансформировался в ген, детерминирующий синтез белкового токсина. Наличие в клеточном ядре поли (ADP-рибозы) (разд. И, 3) позволяет предложить одну из возможностей появления гена tox. NAD+ служит субстратом при синтезе этого ядерного полимера, а синтетаза катализирует разрыв рибозилникотинамидной связи с образованием новой гликозидной связи между 1-углеродом рибозы и 2-гидроксильной группой аденозина следующей мономерной единицы. Возможно, что именно ген синтетазы в результате модификации трансформировался в ген дифтерийного токсина. [c.306]

Как уже упоминалось, нуклеозндами называются соединения, полу-чающи бся при частичном гидролизе мононуклеотидов И содержащие гетероциклическое оонование и остаток моносахарида. Установление строения нуклеозидов и их синтез был первым этапом в познании нуклеиновых кислот и других нуклеотидов. В зависимости от того, содержат ли нуклеозиды в качестве углеводной компоненты рибозу или деэоксири-бозу их называют рибонуклеозидами и дезоксирибонуклеозидами. [c.190]

Существует три вида ферментов, разрушающих (деполимери-зующих) нуклеиновые кислоты (а) фосфотрансферазы — эти эндонуклеазы разрушают РНК с соучастием 2 -гидроксильной группы рибозы, которая атакует атом фосфора на стадии расщепления цепи, перенося таким образом фосфатную группу с 5 -гидрок-сильной группы соседнего нуклеотида на 2 -группу (б) фосфодиэстеразы— существует большое количество этих ферментов (которые могут быть эидо- или экзонуклеазами), различающихся по своей специфичности к основаниям и углеводным остаткам (в) фосфорилазы — ферменты этого класса расщепляют поли-нуклеотидную цепь по ортофосфату так, что обычно процесс развивается с одного конца цепи. [c.142]

С2-эндо, Сз-эндо, Сгэкзо, С з-экзо. Если атом Сг или Сз находится по ту же сторону от плоскости, что и атом С5, то такое смещение называют эн<9о-смещением. В противном случае говорят об экзо-смещении. С -эндо- и С з-эндо-конформации встречаются наиболее часто. С2-эн<9о-конформации рибозы фигурируют в В-форме и С-форме ДНК в Л-форме ДНК, в двуспиральной РНК и поли-А рибоза находится в Сг эн(9о-конформации. Смещение атомов Сг и Сз от плоскости, образованной другими атомами, не превышает 0,6 А. [c.491]

Джонс и сотр. [54] описали спектры ЯМР С 11 пиримидиновых и пуриновых нуклеозидов с природным содержанием этого изотопа углерода. Типичные спектры в с б-ДМСО показаны на рис. 15.10. Резонансные сигналы делятся на две группы сигналы в сильном поле относятся к углеродным атомам пентозы, а находящиеся в слабом поле — к С-атомам основания. Спектры в сильном поле очень похожи, но положение сигналов углеводного остатка несколько зависит от природы основания. Так, сигналы от атомов С-Г и С-4, которые всегда являются наименее экранированными в этой части спектра, могут менять положение друг относительно друга. В остатке дезоксирибозы наиболее экранирован атом С-2, сигнал которого лежит на 30 м. д. в более сильном поле по сравнению с его положением в спектре рибозы. Положение сигналов С-атомов оснований, отнесение которых было сделано на основании сравнения спектров друг с другом и со спектрами модельных соединений, не зависит от того, какой из сахаров (рибоза или дезоксирибоза) входит в нуклеозид (ср. спектры аденозина и дез-оксиаденозина на рис. 15.10). Установлено, что для большинства наблюдаемых химических сдвигов, так же как и в случае свободных оснований (см. разд. 15.3), выполняется достаточно хорошая [c.421]

Мак-Дональд и Филлипс с сотр. [79, 81, 85] установили, что спектры ПМР нефракционированной дрожжевой тРНК проявляют такую же температурную зависимость, как спектры поли-А (см. рис. 15.12), что указывает на плавление структуры. В частности, сигнал С-1 -протонов рибозы появляется в спектрах при более высоких температурах, чем сигналы протонов оснований. Однако Смит и сотр. [101] установили, что площади этих сигналов вероятно, отражают агрегацию, вызванную высокой концентрацией Na l (1,0 М), а не плавление вторичной структуры. Информацию о вторичной структуре можно получить из ширины пиков, но не было обнаружено различий в изменении ширины сигналов в областях (/) и II) (см. рис. 15.14). Поэтому вероятно, что по крайней мере в тРНК фрагменты сахаров и оснований в одинаковой степени принимают участие в образовании внутренней структуры. [c.431]

Углеводы. Лемье и др. [96] с успехом использовали метод ЯМР при изучении. структуры углеводов ниранозного типа. Эта работа была подробно рассмотрена ранее [124]. Нужно напомнить, что резонансная частота протона, связанного с циклической структурой, зависит от конформации и что спин-сииновое взаимодействие между соседними протонами отвечает последовательности а.е ее- Исходя ИЗ ЭТИХ двух обстоятельств, Лемье и др. смогли определить конфигурацию ряда аномерных пентаацетатов. Наиболее важным в этом исследовании явилось наблюдение, что а- и Р-апомеры можно идентифицировать но химическому сдвигу сигнала, появляющегося в самом слабом поле (ранее для такой идентификации приходилось пользоваться правилом изоротации Хадсона [80]). Аналогично удалось выяснить конфигурацию а- и Р-аномеров в ряду тетраацетатов, за исключением ацетилированных производных рибозы. [c.270]

Нативная ДНК. ткмуса теленка, адсорбированная на целлюлозе Гексаметилендиамин присоединен к аденозину в С -положении аденина перед привязкой к агарозе Гексаметилендиамин присоединен к 2, 5 -АВР в 6-положении пурина перед привязкой к агарозе Гексаметилендиамин присоединен к 3, 5 -АОР в 6-положении пурина перед привязкой к агарозе Периодатное окисление рибозы с последующим сшиванием гидразидом (используется гидразид адипиновой кислоть[ в качестве пространственной группы) Гексаметилендиамин присоединен к сАМР в С -поло-жении аденина перед привязкой к агарозе [c.145]

Еще более яркая картина получается при анализе ЯМР-спектра Ь-рибозы (рис. 63, б). В области слабых полей здесь имеются четыре дублета в области 5,42, 5,30, 4,99 и 4,91 м. д. По соображениям, аналогичным приведенным выше, эти пики принадлежат аномерным протонам а-О-рибофуранозы, Р-В-рибофуранозы, Р-В-ри-бопиранозы и а-В-рибопиранозы [c.342]

Это расщепление связано, по-видимому, с возможностью существования оксима рибозы в открытой таутомерной форме, в которой облегчена р-элиминация фосфатной группы из З -положения соответствующего углеводного остатка (см. стр. 583). В получающихся после реакции с гидроксиламином дезурацильных РНК остаток гидроксиламина, присоединенный к рибозофосфатной цепи, может быть удален гидролизом в слабокислой среде (pH 5) в присутствии циклогексанона В результате образуется поли- [c.471]

Образование комплекса поли-(А-1-У) показывает, что рибоз-ные цепочки, точно так же как дезоксирибозные, могут при условии специфического спаривания оснований образовывать [c.345]

Рибонуклеозиды, в состав которых входит рибоза. Поли-мер1ше рибонуклеозиды — это рибонуклеиновые кислоты (сокращенно РНК). [c.411]

Анализ параметров волн, приведенных в работе [254], позволяет установить некоторые тенденции их изменения для различных групп исследованных соединений. Так, в случае четырех три-О-ме-тильных производных пентоз и гексоз четко прослеживается тенденция повышения высоты волны при уменьшении абсолютного значения отрицательной величины потенциала полуволны этих соединений. Подобная же тенденция проявляется и у 2-дезоксипро-изводных моноз. В случае же неметилированных пентоз и гексоз (за исключением рибозы) высота волны намного ниже волн двух упомянутых классов соединений и, в отличие от них, предельный ток растет при увеличении абсолютной величины отрицательного значения Еч . Для волны рибозы наблюдается ненормально высокое значение г пр. Можно предположить, что в случае 0-триметильных и 2-дезоксипроизводных моноз, когда сокращается число гидрофильных гидроксильных групп и увеличивается гидрофобность молекул, а следовательно, повышается их адсорбируемость на поверхности электрода, решающую роль играет увеличение поверхностной концентрации электрохимически неактивной формы при снижении катодного потенциала, приводящее к возрастанию кинетического тока. Для неметилированных моноз, у которых (за исключением рибозы) вследствие очень высокой гидрофильности, обусловленной большим числом гидроксильных групп, по-видимому, поверхностная составляющая тока очень низка можно предположить, что в этом случае увеличение тока с ростом катодного потенциала обусловлено главным образом влиянием поля электрода, способствующим раскрытию цикла, при котором увеличивается полярность молекулы [260]. В случае же рибозы, вероятно, имеет место какое-то специфическое взаимодействие ее со ртутным электродом, приводящее к резкому увеличению ее адсорбируемости. Однако, как уже отмечалось, имеющихся экспериментальных данных недостаточно для окончательного установления природы наблкздаемых явлений. [c.202]

В результате более легкого освобождения фосфорного остатка из рибозо-2- или рибозо-З-фосфата (эфирная связь находится в а- или Р-поло-жении к альдегидной группе), чем из рибозо-5-фосфата, имеет место значительное дефосфорилированне производных пуриновых нуклеотидов, содержащих 2 - или З -фосфоэфирные связи (напрпмер, в РНК) в условиях, являющихся стандартными при определении кислотолабильного фосфора (полифосфатной природы). Это не всегда учитывается в исследоианиях. [c.175]

Хотя другие методы синтеза специфических соединений, возможно, лучше, чем метод с использованием этилполифосфата, многосторонность свойств этого реагента просто замечательна. Помимо синтеза нуклеотидов, нуклеозидов и полинуклеотидов, реагент используется в полипептидном синтезе и для получения линейных полисахаридов, включая поли-Р-(1 —> 4)-0-глюкозу и даже такие неустойчивые полисахариды, как поли-а-(1 — 5)-В-рибоза [42, 43, 48]. При этом присутствие в реакционной смеси небольших количеств воды не мешает полимеризации. Все эти реакции представляют несомненный интерес в связи с вопроса ш о происхождении жизни на Земле. [c.517]

На основании полученных данных можно сделать вывод, что выделенная нами фосфоамидаза специфически гидролизует фосфоамидную связь, образованную мононуклеотидом, содержащим фосфор в 5 -поло-жении рибозы, и аминокислотой. [c.378]

Укажите, какими из перечисленных параметров различаются типы РНК а) первичной стругаурой б) молекулярной массой в) вторичной струстурой г) способом соединения нуклеотидов в поли-нуклеотидной цепи д) наличием рибозы или дезоксирибозы. Объясните, почему в клетках число вариантов различных иРНК достигает нескольких десятков тысяч, а тРНК — около 60 вариантов. [c.297]

Уширение и сдвиги в сильное поле сигналов в спектрах ЯМР свидетельствуют о сильной аоооциацни поли-У не только с пурино-вым и полинуклеотидами, такими, как поли-А, но и со свободными пуриновыми основаниями [82, 86], а также об ассоциации поли-У и поли-Ц с нуклеозидами, 5 -нуклеотидами и нуклеозидтрифосфа-тами [84]. Особый интерес представляет наблюдение Чена и Крейчмена [86], которые установили, что пурин столь тесно связывается при внедрении в структуру поли-У, что при облучении резонансного сигнала протона при С-2 рибозы наблюдается положительный эффект Оверхаузера (см. разд. 1.18.2) для протонов пурина при С-6 и С-8, но для протона при С-2 этого эффекта не наблюдается. [c.428]

При интенсификации процессов эксцизионной репарации в ответ на повреждающие воздействия в клетках млекопитающих усиливается активность фермента поли(АОР-рибозил)-полимеразы. Этот фермент при участии кофермента NAD+ осуществляет реакцию АОР-рибозилирования белков хроматина. В основном происходит моно-АОР-рибозилирование, однако иногда имеет место присоединение гомополимерных цепочек (АОР-рибоза) . Функция поли(АОР-рибозил)-полимеразы или ее продукта—(АОР-рибоза)п—в процессе эксцизионной репарации не вполне ясна. Наблюдается корреляция во времени между интенсификацией [c.80]

При пигментной 19серодерме в клетках большинства (если не всех) комплементационных групп наблюдаются аномалии в скорости и интенсивности ответа поли(АОР-рибозил)-полимеразы на ультрафиолетовое облучение. В клетках по крайней мере одной комплементационной группы снижение активности фермента, по-видимому, связано с неспособностью разрезать цепь ДНК у поврежденного сайта. [c.81]

Картер и Краут показали, что весьма распространенная вытянутая конформация полипептидных цепей (р-складчатая структура по Полингу и Кори) соответствует стабильной правозакрученной двойной спирали, т. е. существует двойная полипептидная спираль. Ее шаг и радиус примерно такие же, как и у двойной спирали нуклеиновых кислот. Авторы весьма тщательно построили пространственные молекулярные модели и увидели, что полипептидная двойная спираль в точности комплементарна двойной спирали РНК, причем полипептидная двойная спираль точно входит в малую бороздку двойной спирали РНК. В результате образуются водородные связи между 2 -0Н Группами рибозы (что, по-видимому, и объясняет особые свойства РНК, у ДНК нет этого гидроксила) и кислородом карбонила пептидной связи. Авторы отмечают, что такую точную комплементарность ста- бильных конформаций РНК и полипептидов вряд ли можно считать простым совпадением. Они предположили, что обе эти двойные спирали взаимно катализировали сборку друг друга из активированных предшественников на ранних стадиях эволюции. В самом деле, комплементарное соответствие двух двойных спиралей представляется весьма важным, но оно обеспечивает ускорение синтеза лишь основных каркасов — полипептидного и полинуклеотидного, тогда как для преодоления обсуждаемого нами кризиса на начальной стадии биологической эволюции необходимо установление полного однозначного соответствия определенных аминокислотных и нуклеотидных радикалов. Для этого нужно, чтобы взаимная полимеразная активность поли- [c.59]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология