Оценка частот генов по данным пар МР

Оценки частот генов Л1 и Лг в данной популяции соответственно равны [c.22]

ОЦЕНКА ЧАСТОТ ГЕНОВ ПО ДАННЫМ ПАР МР [c.30]

Нахождение матрицы, обратной данной, — это, как правило, трудоемкий процесс с многочисленными арифметическими выкладками. Существенно облегчает эту задачу использование быстродействующих компьютеров. Однако обращение матрицы 2X2, которой мы пользовались при оценке частот генов ABO,— простая и легко запоминающаяся процедура. Если [c.114]

Учитывая имеющуюся в настоящее время возможность разграничения различных типов ахондроплазии с помощью клинических и рентгенологических критериев, большой интерес представили бы результаты пересмотра специалистами частот возникновения мутаций в случае этой болезни и для некоторых ее доминантных гено-копий. Вместе с тем следует отметить, что три имеющиеся на сегодняшний день оценки, полученные из данных об ахондроплазии, удивительно близки по величине. [c.164]

Как можно получить общую оценку по данным для двух полов, если между ними нет различия по частоте гена [c.131]

Следовательно, если молекула донорной ДНК уже включена в клетку-реципиент, вероятность осуществления трансформации не будет зависеть ни от присутствия других чужеродных молекул ДНК в препарате, ни от состояния компетентности реципиентной клетки. Эти данные позволили провести более точную оценку эффективности процесса трансформации, чем в ранее проведенных определениях, основывавшихся на учете включения ДНК в культуру. Итак, чтобы определить вероятность трансформации на включенную молекулу ДНК, несущую Str -reH донора, следует постоянное количество Р-ДНК, включенное в расчете на одну трансформированную клетку, разделить на количество Р-ДНК, экстрагированной из клетки-донора. Полученное таким путем значение вероятности составило приблизительно 0,3. Следовательно, проникшая в реципиентную клетку молекула донорной ДНК, несущая определенный ген, способна вызывать трансформацию с достаточно высокой частотой. [c.167]

Вернемся теперь к вопросам, поставленным в начале этого раздела насколько отбор важнее, чем повторные мутации Обратите внимание на то, что для повышения частоты данного аллеля в результате мутирования при отсутствии отбора необходимо, чтобы данная мутация время от времени возникала вновь, т. е. повторялась. Рассмотрим мутирование в одном направлении от Л к а, происходящее с частотой и. Вообще обычно происходит также обратное мутирование от а к Л, уравновешивающее эффект первого процесса. Однако мы пренебрежем обратными мутациями и используем наиболее благоприятную систему для изменения частоты аллеля путем мутаций. Согласно оценке Холдейна, сделанной на основе наблюдений по дрозофиле и примуле, частота мутаций равна примерно 10 на один ген эта оценка была подтверждена в дальнейшем исследованиями, проводившимися на других организмах. Холдейн вычислил потенциальное воздействие мутаций следующим образом частота аллеля Л в первом поколении потомков (р1) равна (1 — и)ро (где ро — исходная частота Л), а во втором поколении потомков (рг) она равна (1 — )р1 или (1 — ) Ро и так далее. Записав эти формулы в общем виде, р(=(1 — ) ро, и разделив правую и левую части на ро, а затем прологарифмировав, получим [c.49]

Частоты возникновения мутаций в случае редких вариантов ферментов. Частоты редких вариантов ферментов будут обсуждаться в разд. 6.1.2. Учитывая, что на данный момент никаких новых мутаций, приводящих к появлению таких вариантов у людей, не подвергавшихся воздействию мутагенных агентов, не обнаружено, знание этих частот позволяет рассчитать верхний предел скорости мутирования он оказался равным [X = 2,24 х 10 на ген на поколение [1788]. Эта оценка свидетельствует, что частоты возникновения мутаций в соответствующих генах не выше частот мутаций в [c.170]

Оценка выявляемого генетического груза. Следующим пунктом в рассуждениях авторов был вывод, что те же самые гены могут оказывать неблагоприятное воздействие даже в гетерозиготном состоянии, т.е. что их доминантность к больше 0. Согласно формуле 6.15, вероятность элиминации данного мутанта в условиях естественной системы скрещивания равна приблизительно г у. 8, где г = Р - - д к (обозначения те же, что и выше). Можно показать, что число выявляемых летальных эквивалентов равно произведению общего числа летальных эквивалентов на гармоническую среднюю величин г для отдельных мутантов. Сведения, необходимые для определения № у человека отсутствовали, поэтому были использованы данные, полученные на дрозофиле. На их основе для 16 аутосомных леталей рассчитаны значения /г со средней, равной 0,04. Учитывая, что мутации с более вредным эффектом в природных популяциях должны встречаться реже, и предполагая, что в основном вредное влияние производится гетерозиготами (из-за их более высокой частоты), оценка гармонической средней 7 для всех вредных генов составляет 0,02. [c.352]

Эти рассуждения об отборе и изменчивости можно начать с прямо противоположного конца. Предположим, что в некой популяции проводится искусственный отбор и что этот отбор привел к изменению распределения фенотипов в популяции, которое передается по наследству. Из этого следует, что в данной популяции с самого начала имелось нетривиальное количество генотипической изменчивости по данному признаку. Можно даже утверждать, что в любом случае нас интересует только успех селекции и что оценка генотипической изменчивости несущественна, сколь скоро мы убедились в возможности селекции по данному признаку. При таком рассуждении упускается из виду то обстоятельство, что мы не можем предсказать, до каких пределов удастся вести отбор и характер изменения наследственности в процессе отбора, а поэтому для любой длительной программы улучшения животных и растений непременно потребуется информация о частотах аллелей и числе генов. [c.97]

Рассмотрим сначала простой случай без доминирования, когда все три генотипа самок различимы. Пусть наблюдаемые численности в выборке самцов для (гаплоидных) генотипов Л и а будут 01 и соответственно ( 1+ 1=Л/ 1). Аналогичным образом пусть наблюдаемые численности в выборке самок для генотипов АА, Аа, аа, будут соответственно />2, Яг и D2 -H2- -R2=N). Предположим, что эти две выборки независимы. Частоту аллеля а можно оценить отдельно из данных по самцов и N2 самок можно найти и одну суммарную оценку его частоты по объединенной выборке. В любом случае она основывается на простом подсчете генов (эквивалентном оценке методом максимального правдоподобия) [c.130]

Гетерозиготньж индивидуумов, нормальных по фенотипу, но обладающих рецессивным геном, который в гомозиготном состоянии может вызвать нарушение метаболизма, называют носителями. Вычисления с использованием уравнения Харди—Вайнберга, показывают, что частота носителей в популяции всегда выше, чем можно бьшо бы ожидать на основе оценок частоты фенотипического проявления данного дефекта. Это ясно видно из табл 27.1. [c.317]

Зная частоты четырех хромосом, мы можем оценить частоты разных аллелей. Однако обычно мы располагаем сведениями о частоте аллельных генов, а не о частоте хромосом (что в данном случае эквивалентно сведениям о частоте генотипов, поскольку Хи Х2, Хз, и Х представляют четыре возможных генотипа). Обычный способ оценки частоты генотипов на основании частот аллелей состоит в том, что частоту первого аллеля первого гена умножают на частоту первого аллеля второго гена, получая таким образом частоту первого генотипа и так далее, аллель за аллелем. При этом, однако, предполагается, что частоты аллелей в первом локусе независимы от частот аллелей во втором локусе. Представим себе, например, популяцию гамет, в которой гаметы, встречающиеся с частотой р, несут аллель Аь с частотой д — аллель Аг, с частотой 5 — аллель Вь а с частотой I — аллель Вг. Чтобы установить, какая доля гамет несет аллели А1В1, надо умножить р на 5. Это всегда будет верно при независимом распределении. Из этого непосредственно вытекает, что произведение частот хромосом Х Х минус произведение частот Х2Х3 должно быть равно нулю (Х]Х4= = р5-д1 Х2Хз = д8-р1). [c.106]

В последующих разделах будут описаны различные методы оценки частот мутаций на основе данных о редких наследственных болезнях. В большинстве случаев эти методы применяются в исследованиях, проводимых на уровне качественных менделирующих фенотипических признаков и предполагающих существование простого способа наследования нозологических форм при отсутствии сведений о специфических генных локусах. [c.158]

Оценка, полученная для множественных экзостозов (диафизарной аклазии) (13370), основана на данных о семи спорадических случаях, обнаруженных в относительно небольшой популяции. На пенетрантность, по-видимому, влияют гены-модификаторы, сцепленные с полом (см. разд. 3.1.7) приведенная оценка частоты мутаций не может быть очень точной. [c.166]

Доказательство наличия отбора. Как отмечалось, оценки притока генов, полученные для генов, испытывающих в африканских популящ1ях давление отбора, можцо использовать для определения того, изменились ли интенсивность и направление отбора в новом месте обитания африканских негров. В нескольких работах были получены более высокие оценки притока генов белых для трех генетических маркеров гена серповидноклеточности (Hb S), аллеля африканского варианта G6PD (GD ) и аллеля гаптоглобина НрЧ Как отмечалось в разд. 6.2, на аллели Hb S и Gd в Африке действует отбор, связанный с тропической малярией гаптоглобин является белком, участвующим в переносе гемоглобина. Определенные величины притока генов для этих аллелей были достоверно выше, чем соответствующие оценки, полученные на основе частот систем групп крови Dufiy и АВО они варьировали приблизительно от 0,49 (Gd , Сиэтл, северо-запад США) до 0,17 (GD , Мемфис, юг США). Эти результаты указывают на то, что в Соединенных Штатах-стране, где малярии нет,-против этих генов идет отбор. Из-за отсутствия необходимых данных интенсивность этого отбора не может быть точно определена. Для доказательства существования отбора в отношении генов, для которых [c.366]

Какие же выводы можно сделать из всех этих опытов с новыми мутациями Данные Фалька, Уоллеса и Мукаи по существу, если не статистически, отличаются друг от друга, а самые обширные и наиболее тщательно проанализированные эксперименты Уоллеса оставляют проблему открытой. Если существует оптимальный уровень гетерозиготности, то какой Действительно ли несколько мутаций, индуцированных Уоллесом и Мукаи, приблизили геном к этому уровню Если это так, то классическая школа реабилитирована, потому что даже в опытах Мукаи со спонтанными мутациями среднее число накапливающихся мутаций составляет 4—5 на хромосому, если использовать оценку 0,1411, данную Мукаи, как примерную частоту возникновения мутаций на хромосому за поколение для модификаторов жизнеспособности. Если между отдельными гомозиготами, образующими генотипический фон, и сверхдоминированием новых мутаций существуют особые эпистатические взаимодействия, то есть ли возможность оценить оптимальный уровень гетерозиготности Принимая во внимание огромные усилия, которых потребовали эти эксперименты, и неопределенность полученных результатов, вряд ли можно надеяться, что подобная работа будет повторена, так что ее значение для проблемы гетерозиготности навсегда останется хотя и важным, но довольно двусмысленным. [c.96]

Предположим, что табл. 2.7 представляет собой сводку данных по группам крови человека, где а обозначает наблюдаемые численности пар МР, а Иа = С соответствует общему числу пар МР (включающих 2 G индивидуумов с 4 G генами). Мы можем определить частоты генов, основываясь исключительно на данных о G матерях или только на данных о G детях, однако при таком подходе отбрасывается информация, поставляемая другими О индивидуумами. Применяя противоположный подход, модено определить частоты генов из данных по суммарным совокупностям матерей и детей, представленных в табл. 2.7. Однако здесь- возникают трудности, связанные с тем, что эти 2 О индивидуумов не являются независимыми друг от друга, и поэтому в нашей выборке нет 4 G независимых генов таким образом, в этом случае дисперсия оценок не равна pqjAG, как должно было бы следовать из формулы (2v). Поскольку каждый ребенок имеет общий ген со своей матерью, ясно. Что на одну пару МР приходится только три независимых гена (хотя полное число генов равно, очевидно, четырем). [c.30]

Он оценил частоты генов по данным, касающимся только матерей. Если мы проведем оценку частот, основываясь на данных по 1990 парам мать — ребенок с использованием приведенных в табл. 5.5 вероятностей образования этйх пар, то оценки максимального правдоподобия и их стандартные отклонения будут следующими (в качестве нулевого приближения взяты оценки Бормана) [c.103]

Из этих данных следует, что в любой группе непроанализированных мутантных форм, по всей вероятности, содержится, ломима настоящих генных мутантов, некоторое число редких рекомбинантов. Существующие оценки частоты спонтанных генных мутаций, особенно у высших растений и животных, могут оказаться поэтому слишком высоними, как уже отмечалось в гл. 5. Вполне возможно, что истинные генные мутации у высших организмов встречаются реже, чем это считается в настоящее время. [c.68]

Эффективным методом, позволяющим изучать изменчивость белков в природных популяциях и определять частоты генотипов и аллелей в популяциях, служит электрофорез в гелях (см. дополнение 22.1). Маса-тоши Ней предложил удобный способ оценки генетической дифференциации популяций по данным электрофореза (дополнение 26.1). При этом используются две величины 1) генетическое сходство I, оценивающее долю структурных генов, которые идентичны в обеих популяциях, и 2) генетическое расстояние (или дистанция) )-оценка среднего числа замен аллелей в каждом локусе, произошедших за время раздельной эволюции двух популяций. Замены аллелей имеют место тогда, когда в результате мутаций аллели в отдельных локусах замещаются другими аллелями или когда сразу замещается целый набор аллелей. Этот метод учитывает то обстоятельство, что замены аллелей могут быть неполными в какой-то части популяции новый аллель может вытеснить старый , который тем не менее с большей или меньшей частотой продолжает присутствовать в популяции. [c.214]

Сколько мутаций возникло бы спонтанно, если бы не было дополнительного облучения, обусловленного факторами современной цивилизации. Все полученные выше для точковых мутаций оценки являются относительными. Они представлены или в виде удваивающих доз или в виде числа новых мутаций на рентген и на локус. Чтобы перевести их в абсолютные оценки, необходимо знать число локусов, подвергающихся риску. Проблема общей частоты точковых мутаций в геноме человека обсуждалась в разд. 5.1.4.2 при рассмотрении частот спонтанных мутаций для отдельных генов. Из этого обсуждения видно, что экстраполяция частот отдельных мутаций на весь геном человека зависит от предположений о числе локусов, подвергающихся риску, числе мутаций внутри одного локуса, приводяшлх к идентифицируемому фенотипу и об эффектах, если они есть, мутаций в последовательности ДНК, не кодирующих полипептидных цепей. На все эти вопросы так трудно ответить, что мы просто не в состоянии прямо оценить, насколько может увеличиться частота возникновения точковых мутаций после воздействия данной дозы радиации. [c.254]

Скрининг многих ферментов, проведенный аналогичными методами, позволяет получить несмещенную оценку доли полиморфных локусов. Такая оценка была получена Харрисом и Хопкинсоном в 1972 г. Эти авторы объединили данные электрофоретических исследований населения Европы примерно по 70 различным локусам, кодирующим ферменты. Число исследованных ферментов было меньше, поскольку один фермент может состоять более чем из одной полипептидной цепи и, следовательно, кодироваться более чем одним геном. Считается, что ген полиморфен, если частота [c.283]

Альтернативный подход к оценке среднего числа рецессивных генов у человека. Расширение программ скрининга наследственных метаболических заболеваний позволило определить частоту гетерозигот по этим болезням (1рд) непосредственно из частоты гомозигот (д ). В работе Харриса (1975) [93] эта оценка получена путем анализа данных скрининга населения Массачусетса [1806]. Сведения, приведенные в табл. 6.25 позволяют сделать вывод, что в среднем 11% родительской популяции могут быть гетерозиготными по одному из 14 скрини-руемых в этой популяции заболеваний. Представляется заманчивым обобщить такой вывод. [c.361]

Прямой метод выражает опасность ожидаемого числа генетических повреждений на одну гамету в расчете на единицу дозы излучения. Он состоит в использовании экспериментальных данных по частоте радиационно-индуцированных мутаций у мышей и их умножении на соответствующие значения для генома человека в целях определения вероятной для него частоты мутаций. Но, поскольку нет способа точного определения числа генных локусов в геноме человека, результаты, полученные таким образом, остаются спорными. Например, используя прямой метод, НКДАР в 1977 г. сделал следующую оценку опасности возникновения доминантных мутаций у человека. [c.105]

Знание того, что популяция в целом высокогетерозиготна, ничего не скажет нам о том, с какой скоростью происходит естественный отбор или как далеко он может зайти в смысле изменения данного признака, и не позволит сделать никаких выводов ни о прошлом популяций и географических рас, ни о генетических процессах при видообразовании. Ответы на эти последние вопросы, которые заключают в себе цель, стоящую перед генети-ками-эволюционистами, требуют оценки величин, которые возникли в теории популяционной генетики они требуют характеристики генных частот. Если нельзя определить частоту альтернативных аллелей в разных локусах, в разных популяциях и в разные периоды истории данной популяции, то вся теория популяционной генетики остается абстрактным упражнением. Мы не можем пройти мимо того факта, что теория эволюционной генетики — это теория исторических изменений частот генотипов. А в таком случае частоты генотипов и их изменения в пространстве и времени также должны входить в сферу интересов эволюционной генетики. [c.105]

Неоклассическая гипотеза использует в своей аргументации разнообразные теоретические данные по генетическому грузу при замещении генов (Холдейн, 1957) и при сбалансированном полиморфизме (Кроу, 1958), величине гетерозиготности, которая поддерживается благодаря мутационному процессу в конечной популяции (Кимура и Кроу, 1964), вероятности закрепления благоприятных (Холдейн, 1927) и нейтральных мутаций (Кимура, 1962), равновесной частоте, при которой новые мутации закрепляются в популяциях (Кимура, 1968), внося в эти теоретические результаты современные оценки средней частоты возникновения мутаций, средней величины генома, гетерозиготности на локус и величины популяции наряду с расчетами частоты замещения аминокислот у ряда хорошо изученных полипептидов в процессе эволюции (Кинг и Джукс, 1969). Кимура и Ота собрали эти разнообразные данные в ряде публикаций, две из которых (1971Ь, с), а также их превосходная книга (1971а) содержат все вычисления и доказательства. Однако полного и последовательного изложения всей аргументации нигде опубликовано не было. [c.204]

В ряде случаев признак может вообще не выражаться фенотипически, несмотря на генотипическую предопределенность. Частота фенотипического проявления данного гена среди его носителей называется пенетрантностью и выражается в процентах. Пенетрантность бывает полной, если признак проявляется у всех носителей данного гена (100%), и неполной, если признак проявляется только у части носителей. В случае неполной пенетрантности иногда при передаче признака одно поколение пропускается, хотя лишенный его индивид, судя по родословной, должен быть гетерозиготным. Пенетрантность — это статистическое понятие. Оценка ее величины часто зависит от применяемых методов обследования. [c.114]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология