Пептидная активированием аминогрупп

Существует большое число методов образования пептидной связи между замещенными аминокислотами или пептидами. Обычно их разделяют на методы, при которых активируется карбоксильная группа, и методы, связанные с активированием аминогруппы. [c.386]

Образование пептидной связи активированием аминогруппы также проходит через приобретение положительного заряда атомом углерода карбоксильной группы, так как первой стадией процесса является присоединение карбоксильной группы к активируемой части молекулы. В этом случае течению реакции способствуют также стерические факторы. [c.24]

Известно несколько случаев, когда пептидный синтез на основе активирования карбоксильной группы приводил к низким выходам продуктов реакции, тогда как использование в этих случаях метода активирования аминогруппы позволяло получить хорошие результаты [296, 493]. [c.181]

Эта группа используется для защиты аминогруппы, причем алкилирование идет по 3ы1-механизму. Тритильная группа весьма кислотолабильна. Тогда как ацильные и сульфогруппы защищают аминогруппу, уменьшая нуклеофильность атома азота, тритильная группа не влияет на его нуклеофильность (основность) она блокирует аминогруппу, создавая стерические затруднения. На практике это может оказаться недостатком, поскольку объемистая тритильная группа способна также затруднять образование пептидной связи (активированной) карбоксильной группой. [c.74]

Активированные эфиры. — Метиловые и этиловые эфиры N-замещенных аминокислот реагируют со свободной аминогруппой другого компонента очень медленно. Сильная электроноакцепторная группа, такая, как п-нитрофенил, ускоряет нуклеофильную атаку сложного эфира по аминогруппе и делает возможным пептидный синтез [c.683]

Этапы пептидилтрансферазной реакции. Азот аминогруппы присоединяющейся аминокислоты осуществляет нуклеофильную атаку активированной карбоксильной группы растущей цепи, в результате чего образуется новая пептидная связь. [c.146]

Реакционноспособным промежуточно образующимся соединением при активировании аминогруппы с помощью фосфорного ангидрида [691, 996, 1959] является, по-видимому, этиловый эфир моноамида фосфорной кислоты [1959]. Вероятно, он образуется в результате взаимодействия фосфорного ангидрида с диэтилфосфитом, используемым в качестве растворителя очевидно, промежуточным продуктом этой реакции является этиловый эфир метафосфорной кислоты. При проведении пептидного синтеза смесь пятиокиси фосфора, карбоксильного и аминокомпонентов в диэтилфосфите нагревают в течение 3 час при 100° в присутствии третичного основания [691, 1959] можно также вначале осуществить только реакцию активации аминокомпонента и затем добавить карбоксильный компонент [1959]. Рацемизацию можно ожидать в том случае, когда карбоксильный компонент представляет собой N-защищенный пептид [691]. [c.190]

Применение находят два подхода. Первый заключается в переводе аминокислоты с блокированной аминогруппой в активированную форму и проведении реакции с аминогруппой второй аминокислоты. Напомним, что на образование пептидной связи затрачивается работа, поэтому необходима активация. Второй — взаимодействие двух аминокислот (одной с блокированной амино-, а другой — с карбоксигруппой) в присутствии конденсирующего реагента, активирующего карбоксил in situ. Остановимся сначала на первом. [c.79]

Полипептиды, Понятие о пептидной связи. Проблема синтеза пептидной связи. Защита аминогруппы, методы удаления защитных групп. Определение концевых групп. Активирование карбоксильной группы для образования пептидной связи. Синтез пептидов на твердых носителях (Меррифильд). Аминокислотные анализаторы. [c.248]

В биосинтетических реакциях ацильные группы часто переносятся от амидов или сложных эфиров к различным акцепторам. Например, конечной стадией в образовании пептидных связей в процессе синтеза белка на рибосомах является перенос пептидильной группы, присоединенной при помощи эфирной связи к молекуле тРНК, к аминогруппе активированной аминокислоты (гл. 11, разд. Д,1). [c.116]

Растворимая ферментная система, ответственная за синтез этого антибиотика, состоит из крупного белка с мол. весом 280 000, который активирует аминокислоты в виде аминоациладенилатов и переносит их на тиоловые группы молекул 4 -фосфопантетеина, ковалентно связанные с ферментом [26, 27]. Таким образом, обеспечивается связывание четырех аминокислот, а именно пролина, валина, орнитина (орнитин см. на рис. 14-2) и лейцина. Активацию фенилаланина обеспечивает другой фермент (мол. вес. 100 000). Формирование полимера инициируется, вероятно, активированным фенилаланином ) и осуществляется аналогично тому, как это имеет место в процессе удлинения цепи жирных кислот (разд. Г,6). Инициация происходит в то время, когда аминогруппа активированного фенилаланина (на втором ферменте) атакует ацильную группу аминоацилтиоэфира, при помощи которой удерживается активированный пролин. Затем свободная иминогруппа пролина атакует активированный валин и т. д., в результате чего образуется пентапептид. После этого две молекулы пентапептида связываются друг с другом, и процесс образования антибиотика завершается замыканием цикла. Последовательность аминокислот в антибиотике строго специфична, и замечательным является тот факт, что эта сравнительно небольшая ферментная система оказывается способной осуществлять все стадии процесса в требуемой последовательности. Аналогичным путем синтезируются также и некоторые другие пептидные антибиотики — тироциди-ны и полимиксины. [c.491]

Соединение представляет собой дипептид, образуюшийся в результате взаимодействия карбоксильной группы фенилаланина с аминогруппой валина. Чтобы осушествить целенаправленное образование этой пептидной связи (амидная связь), аминокислота, используемая в качестве кислотного компонента, должна быть блокирована по аминогруппе (Р-17г) и активирована по карбоксильной группе (Р-17д). В аминокислоте, используемой в качестве аминного компонента, карбоксильная группа должна быть блокированной, а аминогруппа - свободной и активированной (ср. Р-236) [656]. [c.561]

Bot почему хлорангидриды кислот в пептидном синтезе вообще не используются (ср. Р-236). Вместо этого часто применяют азиды кислот и активирование карбоксильной группы путем взаимодействия с дицик-логексилкарбодиимидом (ДЦК). Для защиты аминогруппы можно использовать среди прочих /)б г-бутоксикарбонильную (Р-17г) и бензил-оксикарбонильную группы (ср. с. 434 и сл.). [c.562]

Вторая аминокислота Б (аминокомпонент) атакует активированный карбоксильный компонент аминогруппой с образованием пептидной связи. Незащищенная аминофункция карбоксильного компонента А тоже может реагировать, что приводит (рис. 2-4) к нежелательным побочным продуктам — линейным и циклическим пептидам. Из этого следует вывод, что для однозначного течения пептидного синтеза следует временно блокировать все функциональные группы, не участвующие в образовании пептидной связи. [c.95]

Для того чтобы обеспечить возможность образования только одного дипептида, необходимо предотвратить образование трех остальных. Очевидно, для того чтобы получить дипептид NH2 HRi (0)-МНСЖгСОО, необходимо исключить участие в процессе аминогруппы первой аминокислоты и активированной карбоксильной группы второй. В пептидной химии это достигается использованием защитных групп Z на тех функциональных группах, которые не должны вступать в реакцию. Реакция [c.286]

Метод активированных эфиров. Если карбоксильная группа может быть легко переведена в сложноэфирную, способную легко взаимодействовать со свободной аминогруппой, то образование пептидной связи проходит в мягких условиях и с высокими выходами. Были исследованы многие эфиры, в том числе /г-нитрофенильный и тиофенильный, однако наиболее удоб-.ным оказался пентахлорфенильный эфир. [c.332]

Синтез гомодетного циклического пептида заключается в создании амидной связи между карбоксильной и аминогруппами одного и того же линейного пептида. Необходимое для осуществления этой реакции активирование концевых групп в принципе не отличается от соответствующего активирования при синтезе линейных пептидов. Основное различие между синтезом линейного и циклического пептида состоит в том, что во втором случае создание пептидной связи (циклизацию) нужно проводить в условиях высокого разбавления только таким образом можно свести к минимуму конкурирующую реакцию поликонденсации и создать благоприятные условия для замыкания внутримолекулярной пептидной связи. Буассона и Шуманн [302] предприняли попытку вычислить минимально необходимое разбавление (см. табл. 13, стр. 353) на практике обычно применяют концентрацию пептида от 100 до 10 ммоль1л. Конечно, в этих расчетах не учтены силы меж- и внутримолекулярного взаимодействия, а также подвижность молекул. Все же даже в условиях высокого разбавления выходы циклических пептидов в большинстве случаев много ниже -50%. Исключение составляют лишь циклические дипептиды (дикетопиперазины), которые получаются с практически количественным выходом даже при очень высоких концентрациях. Причина этого состоит в образовании энергетически выгодного шестичленного цикла. Шрамм и Тумм [1958] изучали циклообразование в пептидах при чрезвычайно высоких концентрациях. [c.346]

Шрамм и Виссман осуществили синтез пептидов с участием пятиокиси фосфора в среде диэтилфосфита в присутствии третичных оснований. Активация аминогруппы достигается взаимодействием эфира аминокислоты с соединением I, образовавшимся при реакцирт пятиокиси фосфора с диэтилфосфитом. Полученное производное II, активированное по аминогруппе, конденсируется с ацилированной аминокислотой или пептидом, образуя новую пептидную спязт.. В ходе реакции выделяется моноэтило-ВТ.ТЙ фир ортофосфорноИ кислоты. [c.119]

Твердофазный синтез правильнее всего рассматривать как особый случай ступенчатого синтеза пептидов с С-конца (т. е. с карбоксильного конца пептида). Соединение С-концевой аминокислоты с полимером в действительности является замещенным бензиловым эфиром, а химические процессы твердофазного пептидного синтеза по существу такие же, как в случае проведения ступенчатого синтеза бензилового эфира пептида в растворе, за исключением того, что пептиды с полимера невозможно удалить путем восстановления эфира водородом. Другая важная отличительная особенность твердофазного синтеза состоит в том, что для получения однородного продукта необходимо, чтобы все реакции протекали со 100%-ным выходом, так как в ходе синтеза очистка промежуточных веществ не проводится. На практике это означает, что по сравнению с обычным методом необходимо использовать более энергичные реагенты и более длительное время реакции для полного деблокирования аминогруппы, а также брать несколько молей каждой новой активированной аминокислоты для обеспечения полного включения этого аминокислотного остатка в пептидную цепь. При этом неизбежно некоторое увеличение расхода аминокислот, особенно при использовании карбодиимидного метода конденсации, так как в этом случае избыток аминокислоты нельзя регенерировать (активное промежуточное производное аминокислоты переходит в стабильную ацилмоче-вину и теряется как побочный продукт). Однако значительно более высокая скорость работы, достигаемая при твердофазном синтезе, и общие выходы, которые обычно очень высоки, в целом компенсируют этот недостаток. Теоретически в случае использования активированных эфиров на стадии конденсации производные аминокислот можно регенерировать. [c.19]

Полагают, что фрагменты 1—65 и 66—104 цитохрома с сердца лошади, полученные расщеплением бромоцианом в водной среде, способны к самосборке с реконструкцией пептидной связи [34]. Аналогичным образом самопроизвольно происходит конденсация фрагментов (1—52 и 53—58) панкреатического ингибитора трипсина [41]. Иными словами, циклическая структура С-концевого гомосеринлактона находится в достаточно активированном состоянии, чтобы в мягких условиях вступать в реакцию аминолиза с а-аминогруппой N-концевой аминокислоты. Благодаря этому удается осуществить синтез цитохрома с и трипсинового ингибитора из соответствующих фрагмен- [c.100]

Другой разновидностью этого способа является метод с использованием N-оксисукцинимида. На первой стадии карбоксильная группа гаптеиа активируется дициклогексилкарбодиимидом в органическом растворителе и взаимодействует с N-oк и yкцинимидoм с образованием сукцинимидного эфира. На второй стадии активированный эфир реагирует с аминогруппами носителя с образованием пептидной связи [c.179]

В условиях пептидного синтеза а-аминоизомасляная кислота обладает сравнительно низкой реакционной способностью. Установлено, что ацилирование аминогруппы а-аминоизомасляной кислоты в большой мере тормозится стерическими факторами [29, 30, 51,. 59, 63]. Благоприятными М-защитными группами являются бензи-локсикарбонил [27, 30, 51, 63], п-толуолсульфонил [63]. Для С-за-щиты рекомендованы грет-бутиловые эфиры [51], а также метиловые [63] и бензиловые [70]. В синтезе пептидов, содержащих остатки а,а-диалкиламинокислот, использованы методы ОСС [51], смешанных ангидридов [63, 70], активированных (п-нитрофенило-вых) эфиров [70], азидов [27, 70] и хлорангидридов [30]. С-ПМР-спектры для большого числа N- и С-защищенных а-амино-изомасляных кислот, пептидов А1Ь-А1а, А1а-А1Ь, А1Ь-А1а-А1Ь и А Ь-А1а-А1Ь-А1а-А1Ь приведены в [62, 77]. [c.60]

Активация белков в результате протеолитического расщепления одной или нескольких пептидных связей-широко распространенный механизм регуляции в биологических системах. Если белок в активированной форме является ферментом, то его неактивный предшественник называется проферментом (или зимогеном). Наиболее изученный процесс активации профермента - это превращение химотрипсиногена в химотрипсин, происходящее следующим путем. Под действием трипсина пептидная связь между остатками 15 и 16 в молекуле химотрипсиногена разрывается и в результате образуется химотрипсин. Возникшая при этом новая концевая аминогруппа изолейцина-16 загибается внутрь молекулы белка, где электростатически связывается с аспартатом-194. Это взаимодействие служит пусковым механизмом для ряда локальных изменений конформации, конечный результат которых - формирование кармана для связывания ароматических (либо больших неполярньгк) боковых цепей субстрата. Кроме того, формируется полость оксианиона, стабилизирующая переходное состояние. [c.176]