Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Полинуклеотиды строение

    Каково строение структурного звена полинуклеотида  [c.665]

Рис. 7.13. Схема строения полинуклеотида в области перехода сцираль — клубок Рис. 7.13. <a href="/info/325342">Схема строения</a> полинуклеотида в <a href="/info/120366">области перехода</a> сцираль — клубок

    Нуклеозиды и нуклеотиды. Для изучения пространственного строения нуклеиновых кислот широко используется метод рентгеноструктурного анализа моно-, олиго- и полинуклеотидов, который дает точные геометрические параметры молекул биополимеров и их компонентов в кристаллическом или твердом состоянии. Определение конформаций в растворах в настоящее время в основном про- [c.332]

    Описывать строение мономерного звена полинуклеотидов. [c.465]

    Термин макромолекулы обычно применяется к молекулам с молекулярными весами более 10 000. Такие макромолекулы, как белки, полинуклеотиды и полисахариды, необходимы для жизни, их структуры осуществляют сложные функции. Макромолекулы типа синтетических высокополимеров являются основой многих синтетических волокон, пластиков и синтетического каучука. Соотнощение между физическими свойствами этих материалов и их молекулярным строением имеет огромнейшее значение. В этой главе будут рассмотрены белки и синтетические высокополимеры. Изучая такие свойства, как вязкость, ультрацентрифугирование, диффузия осмотическое давление и рассеяние света, можно получить информацию об их молекулярном весе, о распределении и форме распределения молекулярных весов. [c.601]

    Тот же самый принцип активации карбоксильной группы используется н в синтезе белков in vivo. Карбоксильная группа аминокислоты активируется, реагируя с АТР с промежуточным образованием ангидрида. Однако следующая стадия не сводится просто к атаке такого ангидрида второй аминокислотой, поскольку синтез белков включает строго определенное последовательное присоединение многих (до нескольких сотен) аминокислот. Матрица, или организующая поверхность , должна участвовать в этом процессе для того, чтобы обеспечить правильную последовательность белковой молекулы. Макромолекулой, выполняющей функцию такой матрицы, является полинуклеотидтранс-портная рибонуклеиновая кислота (тРНК) строение полинуклеотидов описано в следующей главе. [c.56]

    Конечно, после образования пептидной связи необходимо удалить защитные группы в условиях, при которых продукт реакции не разрушается. Следовательно, защитные группы должны легко присоединяться к реагирующим соединениям и удаляться из конечного продукта в мягких условиях и достаточно полно. С учетом этих требований легко себе представить, что химия защитных групп — важный раздел органической химии. Это замечание справедливо не только для синтеза пептидов, но вообще для синтеза любых сложных органических молекул, например синтеза полинуклеотидов (разд. 3.6), строение которых предполагает возможность протекания побочных реакций по нескольким реакционноспособным центрам. [c.68]


    Исключительное биологическое значение полинуклеотидов, известных обычно под именем нуклеиновых кислот, уже было отмечено во введении к этому разделу книги. Вполне естественно поэтому стремление выяснить максимально полно строение этих высокомолекулярных веществ, являющихся, наряду с белками и полисахаридами, важнейшим типом биогенных полимеров. [c.246]

    При доказательстве химического строения нуклеозидов, нуклеотидов и полинуклеотидов определяются тип гетероциклического основания, природа углеводного компонента и место присоединения его к основанию, конфигурация гликозидного центра устанавливаются также число и место присоединения остатков фосфорной кислоты. [c.306]

    Хроматографические методы, позволившие разделить продукты химического или ферментативного гидролиза нуклеиновых кислот, сделали возможным в последние годы объяснение строения последних [14, 15, 44, 91]. Эти методы служат также для анализа мононуклеотидов [91, 92], олигонуклеотидов и смесей полинуклеотидов, получающихся при химическом синтезе [36, 44, 45, 90] или под действием ферментов [50, 65, 66). [c.451]

    Подобно белкам и углеводам, нуклеиновые кислоты представляют собой специфическую группу органических полимеров. Нуклеиновые кислоты являются полинуклеотидами. Чтобы понять, как построены эти полимеры, рассмотрим строение индивидуального нуклеотида. [c.533]

    На самом деле сомнительно, чтобы однотяжевый полинуклеотид имел точно такое же строение, что и одна комплементарная цепь в двойной спирали ДНК. Для одиночной нуклеотидной цепи такое расположение оснований, вероятно, менее выгодно, поскольку нерегулярная цепь не может иметь регулярного скелета. [c.190]

    В органической химии сегодня можно выделить три особо важных направления исследований. Первое направление — это выделение, характеризация и установление строения природных соединений. На сегодняшний день выделено и идентифицировано много новых природных соединений — алкалоидов и терпенов из растений, антибиотиков из микроорганизмов и грибов, пептидов и полинуклеотидов из организмов животных и человека. Хроматография позволяет [c.153]

    Химическая обзорная литература по нуклеиновым кислотам посвящена почти исключительно синтезу, в особенности синтетической химии мономеров (нуклеозидов и нуклеотидов), и в меньшей степени синтезу полинуклеотидов. Между тем имеется еще один важнейший аспект химии нуклеиновых кислот, который находится пока еще в процессе становления. Речь идет об изучении реакционной способности макромолекул нуклеиновых кислот и их компонентов, что важно как для выяснения вопросов, касающихся строения этих важнейших биополимеров, так и для правильного понимания их биологических функций. В последние годы подобные исследования начали очень быстро расширяться. Однако до сих пор данная сторона химии нуклеиновых кислот, по существу, не нашла должного отражения в обзорной литературе, за исключением нескольких обзоров по более или менее частным вопросам. [c.10]

    Существенно иного подхода требуют химические методы, используемые для функциональных (биологических) исследований нуклеиновых кислот. Во-первых, при функциональных исследованиях допустима, как правило, модификация лишь очень малого количества мономерных звеньев полимера, поэтому для корреляции химических и функциональных изменений необходимо располагать сведениями о механизме и кинетике основных и побочных реакций, строении и свойствах (включая функциональные свойства) не только конечных, но и промежуточных продуктов реакции. Во-вторых, поскольку модификации подвергается незначительное количество звеньев, важно знать не только их количество, но и распределение по цепи. В-третьих, модифицированные звенья разного строения могут иметь различные функциональные свойства, так что побочные реакции, даже если их скорость на порядки ниже скорости основной, могут вносить существенный вклад в изменение функциональных свойств полинуклеотида, затрудняя, а иногда и делая невозможной рациональную трактовку результатов. Последнее обстоятельство особенно важно учитывать при функциональных исследованиях генетических нуклеиновых кислот (ДНК, вирусных РНК). Применяемые методы детектирования позволяют обнаружить в этом случае изменения отдельных молекул полимера, которые могут содержаться в анализируемой смеси в незначительных количествах. При модификации же негенетических нуклеиновых кислот (например, транспортной РНК) удается наблюдать лишь суммарное изменение функциональных свойств, причем вклад кал<дого из модифицированных компонентов пропорционален его содержанию в смеси. [c.19]

    Как видно из материала предыдущего раздела, задача установления первичной структуры нуклеиновых кислот является весьма сложной и разрешена пока лишь в некоторых простейших случаях. В связи с этим большое значение для исследований связи структуры и реакционной способности, а также биологической активности приобретают модельные олиго- и полинуклеотиды определенного строения. Некоторые полинуклеотиды такого типа (см. стр. 64) получены из природных объектов, однако систематическое использование модельных полинуклеотидов для решения физико-химических и биологических проблем стало возможным только после разработки методов препаративного получения подобных соединений с помощью химического или ферментативного синтеза. Химические методы синтеза имеют значение для получения олигонуклеотидных соединений для получения же полинуклеотидов применяются ферментативные и химико-ферментативные методы. [c.83]


    По принципу строения различают два типа полинуклеотидов дезоксири-бозы или дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК) с молекулярным весом до 10 миллионов и рибозы или рибонуклеиновые кислоты (РНК) с молекулярным весом до 300 ООО. [c.436]

    Разработаны методы синтеза полинуклеотидов — простейших моделей нуклеиновых кислот. Эти методы послужили основой для синтеза олигонуклеотидов с заданной последовательностью нуклеотидов. Использование химических и биохимических методов синтеза дали возможность Каране получить полинуклеотид, соответствуюший активному фрагменту дезоксирибонуклеиновой кислоты. Все эти достижения в области исследования строения, функций и синтеза биополимеров позволили на другом, новом—молекулярном уровне подойти к изучению жизненных процессов. Есть все основания предполагать, что в ближайшее время нас ждут большие и интересные открытия в мире познания самых сложных и тонких областей жизнедеятельности организма (деятельности нервной системы, межклеточного взаимодействия, явлений иммунитета и т. д.). [c.54]

    Естественно, в смешанных полимерах, в том числе и в синтетической РНК , помимо наличия 2 -5 -связи, отсутствующей в природном полимере, порядок связи мономерных единиц совершенно случаен и не может соответствовать строго определенному порядку этих связей в природных РНК- Это наиболее важное отличие характерно для всех синтетических гетеропол-имеров, так как существующие методы полимеризации еще не позволяют осуществить направленный синтез гетерополимера с любым заданным чередованием очень близких по химическому строению, но все же различных мономерных единиц. Поэтому метод получения полинуклеотидов, предложенный Майклсоном, нельзя использовать для получения полинуклеотидов специфического строения, и он может быть назван лишь методом неизбнрательной полимеризации. Пока еще нельзя предложить путь получения специфических полимерных нуклеотидов чисто химическими методами. [c.251]

    Химия нуклеотидов в настоящее время только подходит к решению важнейшего вопроса об установлении строения полинуклеотидов в органохимическом смысле этого слова, которое мы в дальнейшем будем называть тонким строением полинуклеотидов. [c.251]

    Как всегда при выяснении строения сложного органического соединения, в том числе и специфического полимера, можно идти и синтетическим Путем, т. е. получать соединения с заранее заданным строением, и, сравнивая их с веществами природного происхождения, выносить суждение о строении последних. При определении строения полинуклеотидов речь должна идти о синтезе специфических олигонуклеотидов, т. е. таких, в которых имеется совершенно определенная заданная последовательность мононуклеотидных звеньев. Рассмотренный выше метод неспецифической полимеризации мононуклеотидов (стр. 251) для этой цели непригоден, так как необходимо иметь метод, который позволил бы создать цепь постепенно, наращивая мононуклеотидные звенья в нужном порядке. [c.254]

    Однако такие опыты еще не дают полной расшифровки кода. Остается неизвестным, какой из трех кодонов АУУ, УАУ или УУА кодирует Тир и т. п. В последующ1 х опытах Ниренберг применил уже не полинуклеотиды, а тринуклеотиды известного строения. В системах образуются комплексы тринуклеотид — тРНК — аминокислота (аминоацил). Синтез полипептида при этом ие идет, но, поскольку тринуклеотид имитирует кодон, образование комплекса позволяет его прочесть. Для этого нужно изучить все тРНК, которые последовательно связываются с ме- [c.277]

    С. Фокс, охлаждая растворенные в воде протеиноды, получил микроскопические частицы, названные им микросферами, которые обладали определенной внутренней организацией и рядом интересных, с биологической точки зрения, свойств. Смешивание раствора гуммиарабика и желатины приводит к формированию другого вида микроскопических структур, названных коацер-ватными каплями. Позднее было показано, что коацерваты возникают в результате объединения различных полимеров, например полипептидов и полинуклеотидов, при этом для получения коацерватов основное значение имеет не специфичность внутримолекулярного строения образующих их компонентов, а степень их полимеризации. Такие пространственно обособленные открытые системы, построенные из полимеров, были названы протоклеткам и . [c.194]

    Специфичность к вторичной структуре используется также для анализа пространственного строения полинуклеотидов. Так, обработка тРНК бисульфитом приводит к модификации только цитози-новых оснований, находящихся в петлях. [c.385]

    В отличие от протеидов других классов простетические группы нуклеопротеидов— нуклеиновые кислоты, или полинуклеотиды, — являются макромолекулярными соединениями. Они имеют сложное строение и дают в результате гидролиза фосфорную кислоту, пентозу и пиримидиновые и пуриновые основания. Строение нуклеиновых кислот будет описано ниже (см. Нуклеиновые кислоты ). В плазме клетки (цитоплазме) было обнаружено также очень большое число шарообразных частиц, называемых микросомами, с молекулярными весами порядка нескольких миллионов, также состоящих из нуклеиновых кислот (рибонуклеиновой кислоты) и белков, В этих микросомах происходит синтез белков. Нуклеиновые кислоты микросомов действуют как матрицы или клише (гены), служащие для синтеза специфичных белков и для своего собственного воспроизведения (Н. Е, Паладе, 1955 г,), В этом синтезе участвуют также и ферменты, связывающие аминокислоты с аденозиимонофосфорпой кислотой (М, Хогланд, 1956 г.). [c.455]

    При нагревании растворов природной рибосомной РНК или РНК некоторых вирусов, например вируса табачной мозаики (ВТМ) (стр. 152), наблюдаются такие же, хотя и менее четко выраженные, изменения. Это говорит о том, что в некоторых местах цепь РНК сгибается на себя таким образом, что пары оснований сближаются и соединяются водородными связями, образующимися между аденином и урацилом и между гуанином и цитозином (фиг. 20). Поскольку сегменты цепи, сближающиеся таким путем, могут оказаться не точно комплементарными, образование пар облегчается тем, что некоплементарные участки образуют выступающие петли (буква X на фиг. 20). Как показал рентгеноструктурный анализ, те участки молекулы, в которых цепь РНК сгибается на себя, имеют спиральное строение. Таким образом, молекула РНК представляет собой, по-видимому, полинуклеотид-ную цепь, некоторые участки которой имеют форму коротких и неполных спиралей. Б этих участках образуются пары оснований [c.56]

    Будучи экзонуклеазой, фермент вызывает последовательное разрушение З -гидроксильного конца цепи ДНК с освобождением мононуклеотидов (фиг. 41). Фермент этот гидролизует только двухцепочечную ДНК, вызывая распад 35—45% исходного количества полинуклеотида. Если фермент начинает свое разрушительное действие с двух З -гидроксильных групп па противоположных концах двухцепочечной молекулы (фиг. 42), то после распада примерно половины исходного количества остается кислотонерастворимая ДНК. Последняя имеет одноцепочечное строение и не подвергается дальнейшему гидролизу, хотя она и чувствительна к действию экзонуклеазы I. [c.96]

    В ряде опытов был изучен фосфоролиз, т. е. обращение реакции полимеризации [158, 166, 168]. Для этого используемый полинуклеотид инкубировали с ферментом в присутствии избытка неорганического фосфата, что приводило к образованию нуклеозиддифосфатов в результате последовательного отщепления моно-нуклеотидных единиц. Оказалось, что легко фосфоролизируются не только полимеры, полученные путем биосинтеза, но и обладающие затравочной активностью олигонуклеотиды. Динуклеотиды же и динуклеозидмонофосфаты, как и следовало ожидать, не поддаются фосфоролизу. РНК вируса табачной мозаики и высокополимерная РНК дрожжей могут легко подвергнуться фосфоролизу, но если дрон<жевую РНК предварительно обрабатывают щелочью, то фосфоролиз протекает медленно. Медленно протекает и фосфоролиз многочисленных тяжей, образованных, например, из поли-А и поли-У. Неполностью (па 20—30%) протекает фосфоролиз транспортной РНК клеточной цитоплазмы, что можно объяснить особенностями вторичного строения s-PHK. По-видимому, фосфоролиз затрагивает преимущественно концевые группы. [c.256]

    Строение рибонуклеиновых кислот РНК. Данные о строении рибонуклеиновых кислот,, более лабильных, обладающих меньшими молекулярными массами (от 20 ООО до 15 ООО ООО), чем дезоксирибонуклеиновые кислоты, являются менее полными. Как уже говорилось, в состав РНК в отличие от ДНК входит О-рибоза вместо 0-2-дезоксирибозы и урацил вместо тими-на. Молекула РНК обычно состоит из одной полинуклеотид-ной цепи, которая приблизительно наполовину имеет спиральное строение остальная часть может существовать в виде беспорядочно расположенной в пространстве одиночной цепи или клубка с некоторым числом двуспиральных фрагментов. [c.624]

    Реакционная способность нуклеотидных звеньев, механизм и кинетика реакций, а также строение и свойства модифицированных звеньев в первом приближении могут быть изучены на мономерных соединениях обычными методами органической и физической химии. Однако для учета взаимодействий, сказывающихся на реакционной способности отдельных нуклеотидных звеньев в составе полимера, необходимо исследовать модельные полимерные соединения— олигонуклеотиды, монотонные одно- и двухспиральные полинуклеотиды и, наконец, гетерополинуклеотиды. Полученных в ходе подобных исследований данных в большинстве случаев бывает достаточно для рационального использования реакции при изучении структуры и функций нуклеиновых кислот. [c.15]

    Задача установления нуклеотидной последовательности является весьма сложной практически она успешно решена пока лишь в случае относительно низкомолекулярных РНК, таких, как тРНК и 5S РНК. Имеющие в настоящее время практическое значение методы установления последовательности нуклеотидов в полинуклеотидной цепи основаны на частичном расщеплении полинуклеотидов. Поэтому перед рассмотрением основных принципов, с помощью которых производится установление строения полинуклеотидов, и применением этих принципов к различным типам природных нуклеиновых кислот целесообразно коротко остановиться на используемых методах избирательного расщепления полинуклеотидной цепи. [c.64]

    Единственный подход, который позволил в настоящее время установить полную структуру ряда РНК, — так называемый блочный метод — основан на реконструкции структуры полинуклеотида на основании данных о структуре фрагментов, полученных при его частичном расщеплении. При этом проводят расщепление, по крайней мере, двумя разными методами, различающимися по своей специфичности. Обычно для РНК применяют гидролиз пири-мндил- и гуанил-РНК-азамн. После разделения полученных коротких олигонуклеотидных фрагментов (обзоры — см. их строение устанавливают с помощью рассмотренных ниже методов. [c.73]

    Для тринуклеотидов строение однозначно вытекает из определения концевых нуклеотидных остатков (см. стр. 44). Строение полинуклеотидов большей длины может быть в некоторых случаях установлено однозначно перекрестным расщеплением эндонуклеазой другой специфичности, как это показано ниже для одного из тетрануклеотидов, выделенного при расщеплении аланиновой тРНК пиримидил-РНК-азой  [c.73]

    S РНК. Задача установления строения 5S РНК является более сложной, чем в случае гРНК. Во-первых, этот полинуклеотид имеет несколько большую длину цепи (120 остатков нуклеотидов) и, во-вторых, в его составе отсутствуют редкие компоненты, что уменьшает число опорных точек и делает необходимым получение перекрывания последовательности выделенных фрагментов на большем протяжении. Однако и в данном случае задачу можно решить на основании анализа структур продуктов частичного гидролиза полинуклеотида гуанил-РНК-азой приходится только выделять и идентифицировать значительно большее число таких фрагментов. [c.77]

    При полимеризации смеси нуклеозиддифосфатов под действием полинуклеотидфосфорилазы образуются полинуклеотиды, в которых распределение различных мономерных единиц близко к статистическому. Задача получения полирибонуклеотидов известного строения со специфической нуклеотидной последовательностью пока не решена, хотя возможность получения таких соединений с помощью РНК-полимеразной реакции с использованием в качестве матрицы соответствующих полидезоксирибонуклеотидов не вызывает сомнений. [c.106]

    Отличительной чертой двухспиральной РНК является независимость конформации от содержания воды в кристалле что наблюдается также для синтетических двухспиральных полирибонуклеотидов. По-видимому, эти отличительные особенности связаны не с тем фактом, что в РНК содержится урацил вместо тимина (в ДНК), поскольку ДНК фага РВ52, которая содержит урацил вместо тимина, обладает обычной для ДНК конформацией 4. Следовательно, можно предположить, что либо тип спаривания оснований в молекуле двухспиральной РНК отличается от того, который имеет место в двухспиральной ДНК, либо каким-то образом на конформацию полинуклеотида влияет остаток сахара, различный в этих двух типах полинуклеотидов. Первое из этих предположений следует исключить, поскольку рентгеноструктурный анализ двухспиральных молекул, получаемых при взаимодействии синтетических полирибонуклеотидов, показывает, что дифракционную картину, близкую к наблюдаемой для двухспиральных РНК, дают лищь те двойные спирали, которые образованы комплементарными полинуклеотидами Таким образом, отличие конформации двухспиральной РНК от двухспиральной ДНК связано, по-видимому, с различиями в строении углеводного остатка в этих двух макромолекулах. [c.262]

    И ЦИТИДИН в то же время уридин и тимидин быстро превращаются в этих условиях в соответствующие З-Ы-(р-оксипропил)-производные несколько медленнее реагирует гуанозин, образуя продукт неустановленного строения. Очень легко вступает в реакцию инозин строение получающегося продукта также не было доказано. Окись пропилена была использована для модификации ряда полинуклеотидов 268  [c.373]

    При переходе от нуклеозидов и нуклеотидов к олиго- и полинуклеотидам основные закономерности, связывающие лабильность N-гликозидных связей по отношению к кислотному гидролизу со строением нуклеозидных звеньев, сохраняются (о влиянии фосфо-рилирования гидроксильных групп остатков сахаров см. стр. 495 и 499). Однако кислотный гидролиз N-гликозидных связей в полинуклеотидах сопровождается расщеплением фосфодиэфирных связей , причем в полнрибонуклеотидах эти два процесса могут протекать независимо, а в полидезоксирибонуклеотидах расщепление фосфодиэфирных связей под действием кислот протекает после отщепления основания от соответствующего нуклеотидного звена (подробнее — см. стр. 572). [c.500]


Смотреть страницы где упоминается термин Полинуклеотиды строение: [c.507]    [c.222]    [c.288]    [c.288]    [c.53]    [c.584]    [c.457]    [c.327]    [c.103]    [c.379]    [c.486]   
Кристаллизация полимеров (1966) -- [ c.134 , c.135 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.384 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Полинуклеотиды



© 2024 chem21.info Реклама на сайте