Величины R нуклеотидов

Определению белка данным методом мешает присутствие нуклеиновых кислот и нуклеотидов. Измеряя оптическую плотность раствора при 260 нм (для учета поглощения соединений нуклеотидной природы) и 280 нм, содержание белка рассчитывают с помощью номограммы (рис. 6) экспериментально полученные величины оптической плотности при 260 и 280 нм находят в соответствующих столбцах номограммы и соединяют их прямой линией точка пересечения этой прямой со шкалой, на которой дана концентрация белка, определяет содержание белка в исследуемом растворе. [c.83]

Нетрудно предвидеть, что при увеличении числа повторяющихся аминокислотных остатков в белковой молекуле число возможных изомеров возрастает до астрономических величин. Ясно, что природа не может позволить случайных сочетаний аминокислотных последовательностей и для каждого вида характерен свой специфический набор белков, определяемый, как теперь известно, наследственной информацией, закодированной в молекуле ДНК живых организмов. Именно информация, содержащаяся в линейной последовательности нуклеотидов ДНК, определяет линейную последовательность остатков аминокислот в полипептидной цепи синтезируемого белка. Образовавшаяся линейная полипептидная цепь сама теперь оказывается наделенной функциональной информацией, в соответствии с которой она самопроизвольно преобразуется в определенную стабильную трехмерную структуру. Таким образом, лабильная полипептидная цепь складывается, скручивается в пространственную структуру белковой молекулы, причем не хаотично, а в строгом соответствии с информацией, содержащейся в последовательности аминокислотных остатков. Учитывая ведущую роль белков в живой природе и тот факт, что белки, составляя почти половину сухой массы живого организма, наделены удивительным разнообразием функций, изучение курса биохимии в медицинских высших учебных заведениях обычно начинают с этого класса органических веществ. [c.20]

Формальдегид является раскручивающим реагентом. Экспериментальные кривые 0(/) прекрасно согласуются с теоретическими. Их исследование позволило показать, что ультрафиолетовое облучение ДНК приводит к повыщению концентрации дефектов, и найти ее значения. Определены величины к (порядка 2 мин- ). Минимальная концентрация дефектов, обнаруживаемая КФМ, составляет один дефект на 10" пар нуклеотидов — метод очень чувствителен [106]. [c.526]

В среднем по всем трем нуклеотидам имеем 870 кал/моль, что существенное меньше величины 1280 кал моль для случайного замещения аминокислот. [c.591]

Чтобы определить относительную молекулярную массу разделенных фрагментов, одновременно проводят электрофорез маркерных макромолекул с известными молекулярными массами. Набор маркеров должен охватывать весь диапазон молекулярных масс в данной системе. Образец маркерных молекул вносят в отдельную лунку, расположенную вблизи одного из краев пластинки (или в две лунки у двух разных краев). Логарифм относительной молекулярной массы маркера линейно связан с его электрофоретической подвижностью Rf — величиной, равной отношению расстояний, пройденных маркерной молекулой и красителем (фронтом растворителя). Построив график зависимости логарифма относительных молекулярных масс маркеров от Кр можно найти относительную молекулярную массу каждого компонента образца. Относительная мол. масса белков измеряется в Дальтонах, двухцепочечных нуклеиновых кислот — в числе пар нуклеотидов, одноцепочечных — в числе нуклеотидов. [c.54]

Величина энергетического заряда теоретически может колебаться от 1 (в клетке все адениловые нуклеотиды только в виде АТФ) до О (в клетке содержится только АМФ). В растущей культуре величина энергетического заряда клетки равна примерно 0,8. Уменьшение его свидетельствует об ухудшении энергообеспечения организма. Когда эта величина становится ниже 0,5, клетки погибают. [c.124]

Помимо адениловых нуклеотидов в регулировании энергетических процессов активную роль играют система НАД(Ф)" / /НАД(Ф) Н2-коферментов и величина трансмембранного электрохимического градиента ионов водорода в виде обоих его составляющих и АрН). Преобладание аллостерического взаимодействия восстановленной или окисленной форм НАД(Ф) с ферментами катаболического пути приводит соответственно к понижению или повышению их активности. Достижение определенного порогового значения Арн+ на энергопреобразующей мембране служит определенным сигналом, тормозящим поступление ионов водорода против градиента. [c.124]

После образования праймера в направлении 5 3 образуется фрагмент ДНК. На отстающей цепи таких фрагментов синтезируется большое количество, и они называются фрагментами Оказаки. Их величина у прокариот составляет около 1000 нуклеотидов, у эукариот — в три раза меньше. [c.452]

Пусть концентрация скрепок такова, что в среднем одна скрепка приходится на п звеньев, причем для простоты предположим, что первая скрепка расположена на паре нуклеотидов, соответствующих первому звену, вторая — на паре, соответствующей (ге + + 1)-му звену, третья — на паре, соответствующей (2ге 1)-му звену и т. д. Обозначим через Р разность свободных энергий разомкнутой и связанной пар в условиях, когда соседние пары замкнуты До—величину, на которую следует уменьшить Р, если за связанной парой следует разомкнутая А —величину, на которую следует увеличить Р, если на паре нуклеотидов находится скрепка. Введем следующие символы состояний пар нуклеотидов [c.95]

Титрование до pH 4,3 протонирует основания и препятствует образованию осевого взаимодействия между основаниями, что также увеличивает объем клубка. Но дальнейшее титрование и понижение pH до 3,5 и ниже приводит к притяжению атомов водорода фосфатной группой и, как след-.ствие этого, уплотнению полинуклеотида 1[112]. В то же время титрование щелочью ионизирует енольные гидроксильные группы и препятствует образованию спиральной структуры увеличение при этом числа анионных групп вызывает максимальное растяжение цепи полинуклеотида (110, 112]. Объем статистического клубка полинуклеотида может меняться в значительных пределах. Для 1 миллиона нуклеотидов изменение между двумя экстремальными объемами может достигнуть 20-кратной величины, для 10 миллионов — 70-кратной (113]. [c.202]

На помощь пришла простая физическая методика, называемая электрофорезом. Молекула ДНК несет на себе отрицательный заряд, причем величина заряда пропорциональна длине цепочки, о следствие обычной электролитической диссоциации дезоксирибонуклеиновой кислоты, которая, как и любая кислота, распадается на анион и ион водорода. Только происходит это в каждом мономерном звене поликислоты. Диссоциирует водород фосфатной группы, которая расположена слева иа рис. 9. Второго водорода у фосфатной группы, входящей в состав ДНК, нет, так как он отщепляется от нуклеотида при образовании полимерной цепи. При этом соседний нуклеотид теряет группу ОН сахара (см. нижнюю часть химической юрмулы, приведенной на рис. 9), так что при присоединении нуклеотида к концу полимерной цепи ДНК выделяется молекула воды. [c.65]

Затем производят дополнительную идентификацию по кривой спектра поглощения, по Rf, по величине отношения поглощения 275 Eim (это отношение для адениловых нуклеотидов равно 0,4, для гуаниловых — 0,75, для уридиловых — 0,6, для цитидиловых — 1). [c.50]

Молекулярные веса A-j-T-nap и Г + Ц-пар нуклеотидов очень близки. В среднем они составляют 654. Как видно, нуклеотидный состав существенного влияния на величину молекулярного, веса ДНК не оказывает. При вычислении молеку- [c.107]

Расщепление нуклеиновых кислот под влклнием специфических ферментов — эндо- и экзонуклеаз — сопровождается разрывом фосфо-диэфирной связи и образованием продуктов различной величины, которые могут быть разделены методами электрофореза и хроматографии. Это широко используется при анализе последовательности нуклеотидов в молекулах РНК и ДНК., Особое значение при развитии генной инженерии получило расщепление ДНК специфическими эндонуклеазами (рестриктазами), позволяющее получать отрезки ДНК определенной длины и нуклеотидного состава. > [c.175]

В живых организмах АТФ, АДФ и АМФ присутствуют в связанном с белками состоянии и в виде комплексов с ионами Mg и Са . Скелетные мышцы млекопитающих содержат АТФ до 4 г/кг. У человека скорость обмена АТФ составляет ок. 50 кг в сут. Такая интенсивность обмена объясняется тем, что этот нуклеотид занимает центр, место в энергетике живых организмов. Сокращение мышц, биосинтез белков и нуклеиновых к-т, многие др. процессы, идущие с увеличением своб. энергии, сопряжены с гидролизом АТФ. Часть из них проходит с отщеплением от АТФ НэРО , другая-Н4Р2О,. В живой клетке ЛС гидролиза АТФ составляет — 50 кДж/моль. Сравнительно высокая абс. величина ДС" гидролиза двух ангидридных связей [c.33]

Обычно для характеристики эффективности О.ф. используют величины Н /2е или /2е, указывающие сколько протонов (либо электрич. зарядов) переносится через мембрану при транспорте пары электронов через данный участок дыхат. цепи, а также отношение Н /АТФ, показывающее, сколько протонов нужно перенести снаружи внутрь митохондрий через АТФ-синтетазу для синтеза 1 молекулы АТФ. Величина q 2й составляет для г нктов сопряжения 1, 2 и 3 соотв. 3-4, 2 и 4. Величина Н /АТФ при синтезе АТФ внутри митохондрий равна 2 одиако еще один Н может тратиться на вынос синтезированного АТФ из матрикса в цитоплазму переносчиком адениновых нуклеотидов в обмен на АДФ Поэтому кажущаяся величина /АТФ ру,и равна 3. [c.339]

Проведение каталитических реакций несложно. Поскольку катализ металлами весьма эффективен и сопровождается лишь небольшой деструкцией, этот метод пригоден для синтеза большого числа меченых соединений различных типов, причем часто можно достигнуть больших величин удельных активностей, чем в методе Вильцбаха [84]. Обменной реакцией с окисью трития на платиновом катализаторе были синтезированы меченые стероиды, пурины, пиримидины и нуклеотиды. [c.685]

Эта техника имеет преимущества перед распределительной и адсорбционной хроматографией, когда она используется для фракционирования больших количеств материала, растворенного в воде. Очевидно, что основное использование ионообменной хроматографии состоит в выделении и фракционировании полинуклеотидов и нуклеотидов, но величины рКа гетероциклических оснований таковы, что в интервале pH 4—10 некоторые нуклеозиды могут нести по меньшей мере частичный заряд и, следовательно, могут быть разделены этим методом. Для ионообменника используют два основных типа подложки либо полистирол, либо целлюлозу, и оба типа широко использовались для разделения нуклеозидов. В ероятно, наиболее широко используется метод. [c.73]

В последних столбцах левой и правой сторон таблицы приведены числа п водородных связей между нуклеотидами ху кодона и комплементарными нуклеотидами х у антикодона. Значения п (можно назвать эту величину степенью комплементар-ности) в первом октете равны 6 и 5, во втором 5 и 4. Можно думать, что при га = 6 взаимодействие 2 — 2 кодона и антикодона не имеет существенного значения, так как связь ху — х у достаточно прочна и обеспечивает необходимую комплементарность. Поэтому кодоны первого октета безразличны к г, В этом случае возможны 16 сочетаний кодон — антикодон, при которых одна и та же аминокислота включается в белковую цепь и отвечает любым 2 и 2 при фиксированных ху и, следовательно, х у. Если в первом октете га = 5, то возможно, что взаимодействие 2 —2 уже играет некоторую роль в обеспечении комплементарности, и число допустимых сочетаний кодон — антикодон может оказаться меньше 16, но больше 4. Из сказанного, конечно, не следует, что все мыслимые сочетания встречаются в природе. Было бы интересно экспериментально определить число различных антикодонов, т. е. различных тРИК, отвечающих данной аминокислоте, и, конечно, число соответствующих кодонов. Возможно, что опыт действительно покажет наличие большего числа антикодонов и кодонов для тех аминокислот первого октета, для которых га = 6, и меньшего их числа для га = 5. Мутационные замещения 2 в кодонах мРИК могут заметно отличаться по эффективности для га — 6 и га = 5, [c.593]

Прямой связи между сантирэями и числом пар нуклеотидов не существует. Можно лишь сказать, что чем выше доза в радах, тем меньше физическое расстояние для конкретной величины в сантирэях. Например, расстояния в [c.462]

Спехтрофотомгтричесхие методы применимы в тех случаях, когда детектируемые вещества обладают характерным спектром поглощения в видимой или ультрафиолетовой области. В табл. 7.2 приведшы характерные максимумы поглощения для компонентов нуклеиновых кислот (максимальные поглощения для компонентов ДНК и РНК близки), для аминокислот, поглощающих в Сидней УФ-области спектра, и некоторых упоминавшихся в тексте низкомолекулярных соединений. Приведенные значения молярных экстинкций для аминокислот и нуклеотидов дают представление о порядке величин молярных экстинкций биополимеров, поскольку эти значения варьируют в составе биополимеров в не очень широких пределах. При применении спектрофотом ического метода Дйи детекции биополимеров по ходу фракционирования следует иметь в виду, что в используемых водных растворах практически всегда присутствуют различные низкомолекулярные соединения, в первую очередь вспомогательные электролиты, вводимые для создания н жных значений pH и ионной силы. Эти соединения должны быть прозрачны в области поглощения, используемой для деггасции выделяемых биополимеров, тем более что концентрация вспомогательных веществ нередко на несколько порядков превышает концентрацию биополимеров. [c.248]

Мононуклеотиды и нуклеотидполифосфаты разделяют на слоях эктеола методом ионообменной хроматографии в качестве растворителя пригоден разбавленный водный раствор хлорида натрия (табл. 115 и 117). Как правило, удовлетворительного разделения достигают за 15 мин. Величины Rf нуклеотидов являются функцией концентрации хлорида в растворителе скорость движения нуклеиновых оснований и нуклеозидов не зависит от концентрации хлорида. Это отчетливо видно из рис. 178, который заимствован из работы Рандерата [69]. [c.448]

Неплоские деформации фуранозного кольца, по-видимому, сказываются в некоторой (хотя и очень небольшой) степени на длинах связей и валентных углах. Так, в среднем длина кольцевых связей С—С равна 1,523 А, а связь 4—С5 еще короче— 1,516 А. Эти величины значительно меньше нормальной одинарной связи С—С — 1,533 А [18]. У всех анализируемых соединений связь С/—О/ обычно длиннее связи С/—01/ в среднем на 0,02 А. Интересно, что длина внекольцевой связи С—О, если С выходит из плоскости кольца, в среднем около 1,40 А, за исключением молекулы дезо ксиаденозина в то же время, если атом С лежит в плоскости углевода, то средняя длина этой связи 1,43 А, что согласуется с нормальным расстоянием С—О 1,429 А [19]. Длина связи С5 —О5 зависит от того, связан ли атом Р с О5. В нуклеотид-5 -фосфатах длина связи С5 —О5 —1,47 А —значительно больше обычно принятой величины. На величину же связи Сз —О3 практически не влияет связь Р—О3, возможно, здесь сказывается, что Сз является атомом кольца. [c.170]

Величина гликозидной связи в нуклеозидах и нуклеотидах в среднем хорошо согласуется с величиной 1,47 А, обычно принимаемой для связи С—N. Связь С—NH2, как правило, укорочена, что видно из табл. 3. Сделанные нами оценки средиих [c.174]

Анализ длин связей Р—О в нуклеотидах показывает, чтО эти величины значительно меньше 1,71 А, вычисленных на основании эмпирического правила Шомэйкера и Стивенсона [40]. В среднем длина колеблется между 1,5—-1,6 А. Такое уменьшение длин связи вызывает взаимное отталкивание связей Р—О и приводит к увеличению угла О—Р—О до ПО— 116°. На длины связей Р—О влияет присутствие заместителей [c.175]

Величина изменения энтропии растворения (А5 = = -Ь28 энтр. ед./моль) была взята авторами из работы Козмана [96], изучавшего растворение бензола в воде. Изменение конфигурационной энтропии рассчитывалось по формуле А5 = = —RlnZ, где Е—статистическая сумма, и составляет по разным подсчетам —4,6 энтр. ед. или —13,1 энтр. ед., в зависимости от числа устойчивых конформационных состояний при вращении вокруг одинарных связей в нуклеотиде. Учитывая, что две составляющие энтропии имеют противоположные знаки, Де Во и Тиноко сделали вывод об относительно [c.184]

Идентификацию нуклеотидов осуществляют по следующим локазателям 1) по положению пика на кривой элюции и по величине отношения 260 275 2) по подвижности при электрофорезе в 0,05 М цитратном буфере, pH 3,8 в течение 1,5—2 часов при напряжении 40—50 в на I см в ССЦ 3) по хроматографической подвижности оснований (нисходящая хроматография на бумаге), полученных после гидролиза нуклеотидов концентрированной H IO4 при 100° в течение 1 часа в следующих системах изопропанол —НС1 —вода (170 41 39) метанол — НС1 — вода (70 20 10). [c.50]

Смотреть страницы где упоминается термин Величины R нуклеотидов: [c.171] [c.309] [c.459] [c.508] [c.252] [c.144] [c.309] [c.514] [c.158] [c.250] [c.253] [c.539] [c.446] [c.161] [c.221] [c.370] [c.76] [c.176] [c.179] [c.192] [c.88] [c.90] [c.208] [c.546]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология