Другие фаги

Различия между вирусными геномами касаются не только формы молекул ДНК- У некоторых вирусов — пока это известно только для вирусов прокариот, т. е. для фагов,— в состав ДНК входят необычные и модифицированные основания. Классический пример ДНК Т-четных фагов вместо цитозина содержит 5-оксиметилцитозин (ОМЦ), причем к оксигруппе этого основания могут быть присоединены один или два остатка глюкозы (с образованием соответственно гликозил-ОМЦ и гентибиозил-ОМЦ). Геномы некоторых других фагов также содержат необычные основания. В большинстве случаев модифицированным оказывается пиримидин (тимин или цитозин). Ни одна из указанных модификаций не нарушает способности оснований вступать в стандартные уотсон-криковские взаимодействия. [c.262]

Исследование физических и химических свойств фагов fl и I2 показало, что это два совершенно новых типа бактериофагов, до тех пор неизвестных молекулярным генетикам. Однако вскоре после открытия в Нью-Йорке фагов fl и f2 из всех частей света начали поступать сообщения об открытии других фагов, специфичных к мужским штаммам большинство из них напоминало либо fl, либо f2. Так, одна группа новых фагов — fd, М13 и F12 — была родственной фагу fl, а вторая группа —MS2, fr и R27 — фагу f2. В дальнейшем мы будем обозначать эти два семейства бактериофагов групповыми символами fl и f2, поэтому следует помнить, что многое из того, что будет сказано ниже о свойствах фагов fl и f2, в действительности основано на экспериментах, проведенных с другими членами этих двух групп. Лишь фаг QP, интересный в историческом отношении,. [c.466]

Бактериофаг X оказался настоящей сокровищницей систем генетической регуляции, изучение которых позволило заметно расширить и углубить наши представления о механизмах генетической регуляции у прокариот. В процессе литического развития гены фага X (см. гл. 7) регулируются таким образом, чтобы обеспечивать контролируемую репликацию ДНК, рекомбинацию, синтез структурных белков и сборку частиц потомства фага. В то же время лизогенам по фагу X присущ иной способ экспрессии генов. В лизогенных бактериях репрессированы все гены профага, используемые при литическом развитии, и экспрессируется только один ген, обозначаемый с1, который контролирует репрессию генов профага. Экспрессия гена с1 в лизогенах обеспечивает также иммунитет клетки к повторной инфекции другим фагом X. [c.183]

Использование всего комплекса методов сравнения, как простейших, так и относительно более сложных, имеет своей целью отнести фаг к той или иной известной семье фагов, а затем осуществить сравнение с другими фагами в пределах этой семьи. Такое сравнение дает ответ, является ли данный фаг мутантом одного из уже известных фагов или вновь выделенным представителем этой семьи. Отнесение фага, выделенного в условиях производства, к определенной семье имеет принципиальное значение и для выбора способов получения устойчивых форм бактерий, и для оценки способов профилактики фаголизисов этими фагами, и для оценки вероятности повторных фаголизисов на производстве, вызванных фагами данной семьи. [c.194]

Количество адсорбционных рецепторов для каждой из семей фагов ограничено. Поэтому изучение адсорбционных свойств фага, выделенного на производстве, с использованием (заранее созданного) набора фагоустойчивых мутантов, отобранных в отношении других фагов, может показать возможности дальнейшего отбора устойчивых бактериальных мутантов с блокадой адсорбции. [c.200]

Т 2, Т4 и Тб) вместо цитозина входит оксиметилцитозин, большин-ст во остатков которого к тому же еще глюкозилированы. ДНК, мо-ди фицированную подобным образом, не разрезают почти все известные рестриктазы. Такой способ борьбы с рестрикцией могут позволить себе лишь крупные фаги, поскольку для этого фаг должен кодировать фактически новый метаболический путь синтеза необычных нуклеотидов, а также новые ферменты синтеза ДНК, адаптированные к необычным свойствам фаговой матрицы и к использованию необычного субстрата. Зато столь радикальная модификация ДН К позволяет фагам, использующим эту тактику, не только защищаться от хозяйских рестриктаз, но и пойти дальше они коди-р уют нуклеазы, деградирующие немодифицированную ДНК хозяина, но не действующие на фаговую ДНК. Другие фаги используют еще ряд способов борьбы с системой рестрикции хозяина. [c.133]

Дальнейшие события разберем на примере фага фХ174 (рис. 1Й1) у некоторых других фагов этой группы репликация генома имеет особенности, которые, впрочем, не изменяют обш,ую схему, фагоспецифический белок — продукт гена А — вносит одноцепо-чфчный разрыв в уникальное место родительской цепи в молекуле репликативной формы одновременно он соединяется ковалентна (при помощи фосфодиэфирной связи) с генерируемым при разрыве б -концевым нуклеотидом этой цепи. Возникающий в месте разрыва нефосфорилированный З -концевой нуклеотид представляет собой затравку. Впрочем, эта затравка может быть использована клеточной ДНК-полимеразой И для элонгации З -конца родительской (т. е. (-г)) цепи только при условии, что предсуществующий З -конец этой цепи будет вытеснен из дуплекса и тем самым обнажится однонитевая (—) матрица. Такое вытеснение осуществляется одной из клеточных хеликаз — продуктом гена гер. [c.273]

Недостаточно обоснованные выводы о встречаемости нуклеозидов могут оказаться некорректными. Так, помимо восьми основных нуклеозидов (1) — (8), большинство классов нуклеиновых кислот, столь сильно различающихся между собой, содержат, как было показано, в большем или меньшем процентном отношении модифицированные нуклеозиды. Длительное время было известно, что 5-метилдезоксицитидин образуется в гидролизатах ДНК растений и животных [7] полагают, что каждая система ферментов рестрикции бактерий содержит метилазу, которая метилирует специфические остатки оснований ДНК хозяина в последовательности, узнаваемой рестрикционной эндонуклеазой [7], давая таким образом появление модифицированных нуклеозидов из бактериальной ДНК. Фаговые ДНК часто содержат большие количества модифицированных нуклеозидов и очень возможно, что нас еще ожидает много неожиданностей по мере определения состава нуклеи новых кислот других фагов [7]. [c.70]

В заключение раздела, посвящеииого анализу последовательности нуклеиновых кислот, следует отметить, что новые методы обеспечили возможность полностью расшифровать строение ряда простейших геномов, к которым относятся бактериофаги < Х174 (5255 звеньев), С-4 (5577 звеньев), Т7 (39 936п.о.),>. (4 592 п. о.), некоторых других фагов и вируса обезьян 8У-40 (5226 л. о.), больших участков генома бактерий, животных, растений и т. п. Эта результаты заставили по-новому взглянуть на структуру и функцию генома и на его эволюцию. И тем не менее сегодня в середине 80-х годов расшифрована еще только очень незначительная часть генетической информации. Общая длина расшифрованных последовательностей составляет всего лишь несколько миллионов нуклеотидных звеньев, а это — только 0,001 длины генома человека. [c.330]

В том смысле, что инициатор, продуцируемый каким-либо одним ренликоном, например репликоном фага, узнает репликатор именно этого фага, но не репликаторы других фагов или бактериальной хромосомы. [c.198]

Закономерности кольцевого строения ДНК — прослеживающаяся во многих свойствах связь двухцепочечных вирусных ДНК с образованием кольцевой формы молекул. Примером могут служить суперспиральные ( рмы ДНК, выделенные из клеток, зараженных фагами ФХ174 и %, которые в ходе репликации становятся кольцевгыми. Макромолекулярное строение ДНК других фагов становится более понятным, если допустить, что какая-то стадия их биосинтеза проходит через образование кольцевой формы. Репликация кольцевой ДНК может сопровождаться образованием длинных непрерывных молекул, построенных из повторяющихся фрагментов, которые являются предшественниками молекул с липкими концами, молекул с начальными и концевыми повторяющимися последовательностями и молекул с циклическими перестройками. [c.53]

Так как в силу условий устойчивости ( > О [3]) матрицы операторов Са являются невыроаденными, уравнение (7) устанавливает взаимнооднозначное соответствие между изменениями составов фаз и при изменении состояния гетерогенной системы. Действительно, заданным изменения давления, температуры и состава одной из фаз будет соответствовать вполне определенюе (уравнением (7)) изменение состава другой, фагы. [c.49]

Что представляет собой мишень иммунитетного репрессора фага Я В ранних работах Кайзера и Жакоба было показано, что мишенью для репрессора является один или несколько генов, относящихся к так называемой области иммунности на генетической карте эта область располагается между выявленными позднее генами N и О и включает в себя ген с1 (фиг. 242). Такой вывод был сделан на основании изучения умеренного фага 434. Фаги 434 и Я гетероиммунны в отношении друг друга, так как каждый из них нормально растет на бактериях, лизогенных по второму профагу. Иными словами, каждый из них нечувствителен к действию репрессора другого фага. Кайзер и Жакоб установили, что гибридные фаги, образующиеся при рекомбинации между фагами Я и 434, оказываются нечувствительными к репрессору Яс1, если они не содержат области N- I-O родительского фага Я, даже в случае, если вся остальная часть генома была получена от этого родителя. После того как Пташне выделил репрес- [c.492]

В последние годы были проведены обширные исследования по изучению процесса сборки крупных фагов и фагов среднего размера, и особенно генетических основ формирования разнообразных фаговых компонентов. Для этих исследований в основном были использованы два типа мутантов фага Т4 и другие фаги тегдпературочув-ствительные мутанты (ts), которые размножаются при 25° С, но не могут размножаться при 42° С, и мутанты, специфичные по хозяину (am) (см. гл. IX, разд. В), которые размножаются в клетках Е. oli R 63, но не способны размножаться в клетках Е. oli В [110, 111, 238, 267,545, [c.260]

Как и у других фагов, в случае фага лямбда для экспрессии поздних генов, кодирующих компоненты фаговой частицы, необходимы дополнительные регуляторные механизмы. Такой контроль осуществляется геном Q, относящимся к задержанно ранним генам. Продукт этого гена pQ является еще одним белком-антитерминатором, позволяющим РНК-полимеразе, инициирующей транскрипцию на позднем промоторе Pr, преодолевать терминатор, располагающийся между этим промотором и поздними генами. Так, наличие белков-антитерминаторов с различной специфичностью позволяет осуществить последовательную экспрессию фаговых генов. [c.169]

Участок ДНК, узнаваемый белком pN, называется nut (N utilization). Участки, ответственные за антитерминацию при левосторонней и правосторонней транскрипции, обозначаются соответственно как nutL и nutR. Нам известно, что эти участки должны находиться между Pl и iLi в одной транскрипционной единице и между Pr и IRj-B другой. Где же точно они расположены Их можно картировать с помощью гибридов фага лямбда с другими фагами, у которых имеются замены в определенных участках генома, либо с помощью делеций в ДНК фага лямбда, предотвращающих антитерминацию, а также путем вьщеления точковых мутаций nut , блокирующих антитерминацию. [c.170]

Является ли способность белка pN узнавать короткую последовательность в транскрипционной единице примером более широко используемого механизма антитерминации Существуют другие фаги, родственные лямбда, которые имеют различные гены N и различную анти-терминаторную специфичность. Область фагового генома, в которой находятся сайты nut, имеет различную последовательность у разных фагов, и, вероятно, каждый фаг обладает только ему свойственными сайтами nut, которые специфически узнаются собственным белком pN. Каждый из этих белков pN должен обладать одинаковой способностью взаимодействовать с транскрипционным аппаратом, осуществляя антитерминаторную функцию, но при этом иметь различную специфичность по отношению к последовательности ДНК, активирующей этот процесс. [c.171]

Область, включающая левый и правый операторы, ген с1, кодирующий репрессор, и ген его, кодирующий другой регуляторный белок, определяет иммунитет фага. Это значит, что любой фаг, обладающий такой областью, проявляет тот же тип иммунитета, так как эта область определяет репрессорный белок и сайты, на которые действует репрессор. Поэтому она получила название области иммунности. Если мы говорим, что лизогенизирую-щий фаг вызывает иммунитет к любому другому фагу того же типа, мы имеем в виду, что иммунитет проявляется к любому другому фагу, имеющему ту же область иммунности (безотносительно от различий в других областях). [c.213]

Для некоторых лямбдоидных фагов (один из которых лямбда) была также определена нуклеотидная последовательность участков начала репликации. Оказалось, что они родственны между собой, однако отличаются от со-ответствуюшей области бактериальной ДНК. Теоретически фаговые области начала репликации способны образовывать клеверные листы (с более тесно расположенными ответвлениями). Как показано на рис. 31.8, консервативная последовательность находится справа от потенциального места этой структуры. Такая последовательность присутствует в ДНК Е. соИ, лямбда и другого фага, G4. Если допустить, что именно консервативные последовательности выполняют функции участков начала репликации, то следует отметить их вторичную структуру, которая скорее всего узнается именно благодаря своей структуре, а не нуклеотидной последовательности. [c.399]

ИММУНИТЕТ ПРИ ЛИЗОГЕНИИ, Способность профага предотвращать развитие в бактерии другого фага того же типа. [c.521]

Специфическая трансдукция облегчает генетические исследования у бактерий, касающиеся, в частности, расположения и регуляции генов. Для Е. соИ существует множество фагов, подобно фагу Я включающихся в хромосому бактерии в разных местах и позволяющих осуществлять специфическую трансдукцию хромосомных маркеров. Очень важно при этом, какой используется донор-хозяин. Например, штамм 2 (табл. 14.1) имеет делецию в месте нормальной интеграции профага Я в этом случае фаг Я включается с низкой частотой в другие, несвойственные для него места, разбросанные по всей хромосоме. Индукция таких лизогенных бактерий приводит к формированию трансдуцирующих фагов, несущих почти любой желаемый ген [35]. Этот подход может быть использован и для других фагов Е. oli, осуществляющих специфическую трансдукцию, а также для фагов, размножающихся в других видах бактерий. Многие из методов, позволяющих реализовать эти подходы и другие возможности использования фагов, способных к специфической трансдукции, описаны Миллером [2]. [c.90]

Стрептомицеты, устойчивые к одному фагу, часто приобретают устойчивость и к другим фагам. Вместе с тем фаги, лизирующие S. griseus, обладают литической активностью и в отношении других видов стрептомицетов. [c.491]

Структура частицвирионовразных бактериофагов различна (рис. 9.1). В отличие от вирусов эукариотов бактериофаги часто обладают специализированным органом прикрепления к поверхности бактериальной клетки, или хвостовым отростком, устроенным с разной степенью сложности, но некоторые фаги не имеют хвостового отростка. Капсид содержит генетический материал фага, его геном. Генетический материал разных фагов может быть представлен разными нуклеиновыми кислотами. Некоторые фаги содержат ДНК в качестве генетического материала, другие — РНК. Геном у больншнства фагов — двупитевые ДНК, а геном некоторых относительно редких фагов — одноните-вые ДНК. На концах молекул ДНК некоторых фагов присутствуют липкие участки (однонитевые комплементарные последовательности нуклеотидов), у других фагов липкие участки отсутствуют. У некоторых фагов последовательности генов в молекулах ДНК уникальны, тогда как у других фагов выявлены пср-мутации генов. У одних фагов ДНК линейная, у других замкнутая в кольцо. У некоторых фагов на концах молекулы ДНК имеются концевые повторы нескольких генов, у других фагов такая концевая избыточность обеспечивается присутствием относительно коротких повторов. Наконец, у некоторых фагов геном представлен набором из нескольких фрагментов нуклеиновой кислоты. [c.168]

I, Р2, Р22, Mul), профаги других фагов присутствуют в клетке в виде самостоятельных репликонов — плазмид (иапример, профаг Р1 Е. соИ). Такие фаги иногда называют фазмидами, подчеркивая их сходство с типичными фагами и с типичными плазмидами. Состояние профага может переходить в состояние лити-ческого развития после индукции. Индукция является следствием инактивации ренрессора. При этом появляется возможность экспрессии генов, ответственных за осуществление литического [c.171]

На заключительном этапе внутриклеточного развития фага включаются часы лизиса , т. е. функции фага, ответственные за разрушение бактериальных покровов и освобожде1ше зрелого фага. У разных фагов механизмы часов лизиса функционируют по-разному, у фагов, освобождающихся из клетки секрецией , такого механизма нет вообще. Обычно фаги (Т-четпые, Я) контролируют образование двух разных литических фермет ов, один из них разрушает клеточную мембрану, а другой — ригидный мукополимерный слой клеточной оболочки. У фагов Я, i 22 соответствующие гены расположены рядом в геноме и входят в состав одной и той же единицы транскрипции. У других фагов, например Т4, гены, контролирующие ферменты лизиса, регулируются, по-видимому, независимо, но согласованно. Обязательное условие лизиса — прекращение фосфорилирования и реакций, ведущих к укреплению мембраны инфицированных бактерий. Детальные механизмы включения часов лизиса все еще ие выяснены. Хотя лизис большинства клеток в одномоментно инфицированной культуре бактерий наступает в пределах достаточно узкого интервала времени, тем не менее отдельные клетки могут лизироваться с большим запозданием. Некоторые мутации фагов ускоряют наступление лизиса. [c.176]

Длительность эклипсного и латентного периодов является обычно довольно устойчивым признаком того или иного фага. Следовательно, при условии стандартных опытов и соответствующих контролей, например сравнения с каким-то хорошо изученным фагом, активным в отношении данных бактерий, этот признак можно использовать в ходе предварительной идентификации фага на производстве. На длительности латентного периода обычно не сказывается эффективность функционирования морфогенетических генов. Другой признак, оцениваемый по результатам опыта ОЦР, — величина урожая не может быть использована в идентификации, кроме, разумеется, особых случаев, где он столь характерен, что полностью отличает данный фаг от других фагов. Время лизиса, как и величина урожая, не слишком надежный признак даже при первичной идентификации. На него могут влиять многие факторы внешней среды, возраст бактерий и т. д. [c.186]

Следствием осуществления фагом циклов гюследовательных инфекций бактерий, растущих па поверхности твердой среды или в полужидком агаре (газон), является образование негативной колонии (НК), называемой также иногда стерильным пятном, бляшкой. Вид НК — признак, чрезвычайно специфичщлй для данного фага, иногда для группы родственных фагов. Признаки, которые, позволяют отличить НК одного фага от НК другого фага, разнообразны наличие и размер зоны центрального лизиса наличие, степень и характер роста в этой зоне устойчивых бактерий определяют степень мутности центра НК наличие и размер ореола (часто зависит от выделения клетками литических ферментов) характер края (ровный или рваный, четкий или постепенно переходящий в газон). Иногда — и это специфический признак определенных фагов — НК обладают опалесценцией (голубоватый оттенок в отраженном свете), опалесценция возникает за счет рассеяния света большим количеством фаговых частиц в НК- Специфичен вид НК у умеренных фагов (в их центре обычно растут лизогенные бактерии). Отбор и испытание клеток из центра НК часто позволяет определить, что фаг действительно является умеренным. Следует, однако, заметить, что не у всех умеренных фагов бактериальный рост в центре НК бывает хороню [c.186]

Чем же обусловлено такое разнообразие в способности разных фагов одной семьи использовать разные рецепторы Оказалось, что в генах — аналогах гена 37 встречаются гомологичные участки, разбросанные по длине гена. Такой мозаичный характер распределения участков гомологии/негомологии позволяет предположить, что конкретная структура гена 37 фагов этой семьи возникает как следствие рекомбинации субмодулей в пределах гепа. У одного из Т-чет1П51х фагов в пределах гена 37 было очень мало областей, гомологичных соответствующим областям генов тина 37 других фагов, в том числе и в той части гена, которая кодирует распознавание хвостовыми фибриллами соответствующего рецептора — белка Отр А. Таким образом, разные родственные фаги могут использовать разные участки одного и того же белка в качестве рецепторов для адсорбции. Возможно, что СТ0Л11 выраженная для Т-четных фагов способность использовать разные по природе бактериальные рецепторы является особым приобретением, типичным именно для вирулентных фагов, причем именно для фагов с высоким уровнем автономности. [c.202]

Смотреть страницы где упоминается термин Другие фаги: [c.133] [c.145] [c.273] [c.145] [c.251] [c.159] [c.222] [c.204] [c.38] [c.53] [c.305] [c.372] [c.473] [c.30] [c.208] [c.220] [c.209] [c.287] [c.118] [c.176] [c.199] [c.202]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология