Нуклеозиды по связи

Общее строение нуклеиновых кислот строго доказано. При гидролизе нуклеиновые кислоты распадаются на соответствующие нуклеотиды. Место связи рибозы с фосфорной кислотой установлено с помощью избирательного гидролиза. При этом в зависимости от природы фермента получают нуклеозид-5 -монофосфат, или нуклеозид-3, 5 -ди-фосфат, или нуклеозид-З -монофосфат, откуда следует, что остатки рибозы связаны в нуклеиновых кислотах фосфорной кислотой в положении 3,5. Природа оснований установлена путем их идентификации в продуктах гидролиза нуклеотидов. Наконец, нуклеиновые кислоты титруются как одноосновные кислоты. Это указывает на то, что две гидроксильные группы фосфорной кислоты связаны с двумя остатками рибозы. [c.361]

Рибонуклеаза. — Одна из рибонуклеаз была выделена в кристаллическом виде из бычьей поджелудочной железы Купит-цем (1940). Панкреатическая рибонуклеаза гидролизует рибонуклео-тидные связи, в которых пиримидиновый нуклеозид этерифицирован по З -положению сахара. Этот фермент содержит 124 остатка аминокислот и четыре дисульфидные связи. Установление первичной структуры этого фермента Муром и Штейном (1960) явилось важной вехой в химии белка. Последовательность частично была определена на окисленной рибонуклеазе, которая при энзиматическом расщеплении дает 24 пептида. Их размеры позволяют непосредственно определить последовательность химическими и ферментативными методами. Наконец, ферментативный гидролиз нативного белка, разделение содержащих цистин пептидов, окисление их до цистеиновых пептидов и аминокислотный анализ последних позволили выяснить, каким образом восемь по-луци1стинооых о статков связаны друг с другом (рис. 27, стр. 740). [c.739]

Строение нуклеиновых кислот. Химическое исследование показывает, что молекулы нуклеозидов связаны в дезоксирибонуклеиновой кислоте через остатки фосфорной кислоты, причем каждый подобный остаток этерифицирован группой ОН в положении 5 одной молекулы и группой ОН в положении 3 другой молекулы нуклеозида. При этом образуются линейные макромолекулярные цени приведенной ниже формы (где X и У представляют собой пиримидиновые или пуриновые остатки) (Браун и Тодд, 1952 г.) [c.776]

При образовании нуклеозидов связь между азотистым основанием и моносахаридом возникает за счет гликозидного гидроксила пентозы и водорода у атома азота в положении 9 пуринового основания или в положении 3 пиримидинового основания. Чаще всего азотистые основания имеют здесь кетонную форму. Соединение остатка фосфорной кислоты с нуклеозидом в нуклеотиде происходит при образовании сложного эфира, за счет гидроксила кислоты и гидроксила пентозы в положении 5 или 3. Приводим примеры строения нуклеозидов и нуклеотидов [c.531]

К он фигурация г л и к о з и д, н о г о центра. Наиболее сложным вопросом структурной химии нуклеозидов является выяснение конфигурации гликозидного центра. Как и любой Н-гликозид, нуклеозиды могут иметь одну из двух возможных конфигураций у гликозидного атома и относиться к а или 3-ряду. Возможность, что их строение соответствует структуре анила открытой альдегидной формы сахара, в данном случае 1 сключается, поскольку, как указывалось выше, во всех природных нуклеозидах связь гетероциклического ядра с мо осахаридом осуществляется через атом а.зота, стоящий в цикле другими словами, все нуклеозиды являются Ы-гликозидами вторичных аминов, для которых структуры типа шиффовых оснований невозможны. [c.195]

Заметим, что образование фосфодиэфирной связи нельзя сводить к простому взаимодействию хлорфосфата с 5 -гидроксилом нуклеозида. Этот метод редко используется для образования фосфодиэфирной связи, поскольку такие реакции протекают медленнее, а сама методика синтеза сравнительно сложна. Ниже будет обсуждаться более удобная реакция хлорфосфата одного нуклеозида со вторым нуклеозидом. Альтернативный подход заключается в образовании фосфодиэфирной связи путем активации in situ нуклеотидов копденспрующнм агентом. Некоторые из таких агентов описаны ниже. [c.174]

Расшифровка структуры нуклеозидов связана с решением следующих вопросов определение типа азотистого основания и моносахарида, места присоединения углеводного остатка, установление размеров углеводного цикла и конфигурации гликозидного центра. [c.340]

Следовательно, у пиримидиновых нуклеозидов связь углевод — гетероциклическое основание осуществляется через что подтверждено данными рентгеноструктурного анализа [c.341]

Соединение основания и пентозы называют нуклеозидом. Связь ((3-гликозид-ная) образована первым атомом углерода пентозы с первым атомом азота в пиримидиновых нуклеозидах и девятым атомом азота — в пуриновых нуклеозидах. [c.102]

О ДНК и РНК говорилось как о высокомолекулярных соединениях, состоящих из мономерных единиц — нуклеозидов, соединенных между собой фосфодиэфирным] связями. Такое описание может привести к представлению, будто бы это длинные [c.113]

Фосфорилирование нуклеозида хлорфосфатом аналогично образованию пептидной связи, происходящему при взаимодействии амина с ацилхлоридом. Вероятно, один из простейших таких примеров— реакция рибонуклеозида с хлороксидом фосфора. В соответствующих условиях (триметил- или триэтилфосфат в качестве растворителя, О С, а затем обработка смесью диоксан — пиридин, комнатная температура) происходит фосфорилирование в основном [c.171]

Рибонуклеиновые кислоты (сокращенно РНК) построены из рибо-нуклеозидов, связанных в положении 3,5 сложноэфирной связью с фосфорной кислотой. Дезоксирибонуклеиновые кислоты (которые сокращенно называют ДНК) построены из дезоксирибонуклеозидов, также связанных в положении 3,5 сложноэфирной связью с фосфорной кислотой. Вследствие этого нуклеиновые кислоты относятся к классу полиэфиров. [c.358]

Эфирные связи, образуемые фосфорной кислотой, соединяют атом С (3) углеводного остатка данного нуклеозида с атомом С (5) углеводного остатка последующего нуклеозида. [c.661]

Длина эфирной связи Р—О в фосфатной группе Н. (ок. 0,16 нм) меньше длины обычной простой связи (0,171 нм) т.е. вклад тс-связи близок к 35%. Вследствие sp -гибридиза-ции валентный угол при атоме кислорода в группировке Р—О—R увеличен до 118-120° и вращение вокруг связи С—О более заторможено, чем вокруг связи Р—О. Почти все торсионные углы в молекуле Н. коррелируют между собой. Обычно Н. конформационно менее подвижны, чем нуклеозиды, что не исключает наличия неск. конформаций в динамич. равновесии, но сказывается на их относит, заселен- [c.304]

Группой. Кроме того, место атаки у того или иного основания меняется для ферментов, выделенных из различных источников. Например, бычья панкреатическая РНаза атакует фосфоэфирные связи пиримидинового нуклеозида, присоединенного к остатку фосфорной кислоты З -связью. В то же время РНаза из бактерии В. 8иЫШ8 атакует фосфоэфирную связь пуринового нуклеозида, присоединенного З -связью. [c.127]

Нуклеозиды -- это двухкомпонентные системы, состоящие из углеводных остатков и азотистых оснований, связанных р-тликозидной связью, которая образуется между атомами С (1) углевода и N (9) в пуриновых или N (1) в пиримидиновых азотистых основаниях. [c.660]

Г., катализирующие гидролиз сложноэфирных связей (эстеразы), действуют на сложные эфиры карбоновых и тио-карбоновых к-т, моноэфиры фосфорной к-ты и др. К этому подклассу относятся, в частности, ферменты, играющие важную роль в метаболизме липидов, нуклеиновых к-т и нуклеозидов, напр, арилсульфатазы, ацетилхолинэстераза, дезоксирибонуклеазы, липазы, фосфатазы, фосфолипазы и эндодезоксирибонуклеазы. [c.561]

Нуклеозиды, являющиеся мономерными составляющими нуклеиновых кислот, связаны друг с другом фосфодиэфирными связями и образуют цепь полинуклеотида. Фосфодиэфирная группировка связывает между собой З -гидроксильную группу остатка одного нуклеозида с 5 -гидроксильной группой остатка соседнего нуклеозида. Таким образом, полинуклеотидная цепь нуклеиновых кислот представляет собой линейную структуру, в которой моно-нуклеозиды связаны между собой 3, 5 -фосфодиэфирными связями, причем мононуклеозиды расположены в цепи в строго определенной для данной нуклеиновой кислоты последовательности. Об- [c.26]

Отличие химического поведения псевдоуридина от поведения обычных пиримидиновых нуклеозидов связано с двумя особенностями его структуры наличием двух атомов азота, связанных с водородом, и присутствием С-гликозидной связи. Особенности реакций замещения в гетероциклическом ядре псевдоуридина уже рассматривались в гл. 5 здесь мы остановимся только на превращениях, обусловленных наличием С-гликозидной связи. К их числу относятся легкая изомеризация углеводного остатка в составе нуклеозида и необычное для других пиримидиновых нуклеозидов поведение при каталитическом гидрировании и окислении перйодатом. Все эти превращения удается хорошо объяснить, исходя из предположения о легком раскрытии фуранозного цикла в псевдоуриди-не V с образованием промежуточного продукта с сопряженными двойными связями (VI) или его катиона (VII) [c.607]

Наиболее важными классами природных соединений этого типа являются фосфатиды и нуклеиновые кислоты. В последнее время были достигнуты значительные успехи главным образом в изучении химии нуклеиновых кислот, что вполне понятно, если иметь в виду бурное развитие молекулярной биологии. Рибонуклеиновые и дезоксирибонуклеиновые кислоты состоят из цепей полинуклеотидов, в которых индивидуальные нуклеозиды связаны друг с другом фос-фодиэфирными связями. Различные нуклеозиды располагаются в соответствующих цепях в определенном порядке, который, как предполагают, представляет собой код наследственных признаков и свойств. Согласно другим представлениям, нуклеиновые кислоты в организмах непрерывно ресинтезируются в результате сложных [c.501]

Конечно, как и в случае образования пептидной связи, затрачивается определенная энергия, и поэтому необходима активация. Синтез фосфодпэфирной связи был бы невозможен при простом смешивании фосфорной кислоты с соответствующими защищенными нуклеозидами. Наконец (см. ниже), может потребоваться даже блокирование фосфатной группы. Хотя это не строго необходимо (и не применялось в первых нуклеотидных синтезах), такой метод имеет свои преимущества и в настоящее время наиболее распространен. [c.154]

После ацилирования аминогруппа становится химически неактивной, или ненуклеофильной. Тем не менее введение ацильной группы часто приходится осуществлять в две стадии полное ацилирование нуклеозида с последующим деаци-лироваиием сахара. Вдобавок гликозидная связь М-ацильных производных обычно менее устойчива к гидролизу. К типичным ацильным группам относятся аце-/ О / О / [c.155]

На основе сведений о различных защитных группах, пригодных для блокирования гидроксильных и аминогрупп, можно синтезировать защищенные нуклеозиды, в которых реакционноспособные группы образуют только 3, -фосфодиэфирную связь. Нежелательные продукты (3, 3 - или 5, 5 -фосфодиэфиры, фосф-амиды и т. п.), скорее всего не образуются. Показательный при- [c.166]

После завершения реакции защитные группы можно удалить в мягких условиях, не затрагивающих фосфодиэфирной связи. На этом основан фосфодиэфирный метод синтеза полинуклеотидов. Продукт реакции — фосфодиэфир со свободной, потенциально уязвимой для воздействия, отрицательно заряженной группой. Далее, с увеличением длины полинуклеотидной цепи число отрицательных зарядов в соединении также будет увеличиваться. Поэтому в зависимости от условий реакции эти потенциально нуклеофильные центры могут участвовать в нежелательных побочных реакциях. Кроме того, такое многозарядное соединение слищком полярно, чтобы можно было проводить его очистку обычными методами органической химии, например с помощью хроматографии на силикагеле. Вместо этого необходимо использовать хроматографию на ионообменных носителях, обладающих меньшей емкостью (например, на ДЭАЭ-целлюлозе). Фосфодиэфирный метод пригоден для получения веществ лишь в небольших количествах. Однако нейтрализация зарядов путем этерифи-кации подходящими защитными группами перед фосфорилирова-нием нуклеозидов устраняет проблемы, упомянутые выше. В этом случае продуктом реакции конденсации является фосфотриэфир. Фосфотриэфирный метод позволяет работать с большими количествами веществ. Ниже описаны некоторые защитные группы, используемые для блокирования фосфата. [c.167]

Именно защищенный фосфорилирующий агент и реягирует с нуклеозидами с образованием 3, 5 -фосфодиэфирной связи. После завершения реакции трихлор-этильная защитная группа может быть удалена несколькими способами классический— это обработка цинком, но можно использовать и фторид тетрабутил-аммония [c.168]

Представление о строении нуклеиновых кислот нуклеозиды и нуклеотиды. Гетероциклические основания, рибоза (дезоксирибоза) и фосфорная кислота как структурные единицы нуклеиновых кислот. Представление о строении РНК и ДНК. Биологические функции ДНК и РНК. Рибосомальные, информационные и транспортные РНК. Связь между строением и биологическими функциями нуклеиновых кислот. Двойная спираль как модель молекулы ДНК. Роль водородных связей аденин — тимин и гуанин — цитозин в образовании двойной спирали. Правило Ча )-гаффа. Проблема передачи наследственной информации. Вещество, энергия и информация — необходимые компоненты при синтезе белка. Гснетическин код как троичный неперекрывающийся вырожденный код. [c.249]

Перечисленные выше основания, соединяясь с ри-бозой или дезоксирибозой), образуют нуклеози-ды. Эти соединения были выделены при гидролизе нуклеиновых кислот. В нуклеозидах азотистое основание связано с остатком рибозы (или дезок-сирибозы) посредством С —К-связи, в формировании которой участвует полуацетальная гидроксигруппа моносахарида и водород группы — МН [c.422]

Каждое основание связагю с углеводной частью М-гликозидной связью и данный структурный фрагмент называется нуклеозидом. Этерификация нуклеозида фосфорной кислотой по пятому положению углеводного остатка приводит к мононуклеотиду. Мононуклеотиды соединяются между-собой фосфорной кислотой, т. е. между ними формируется фосфорнодиэфирная связь. Вторичная структура ДНК представляет собой двойную спираль, состоящую из двух переплетенных цепей ДНК. Основания обеих цепей обращены внутрь спирали и благодаря этому происходит спаривание оснований. Такое взаимодействие оснований одной цепи с основаниями другой цепи обеспечивает прочность двой-1ЮЙ спирали ДНК. Пары оснований, между которыми формируются водородные связи, называются комплементарными. [c.433]

Построение макромолекул ДНК и РНК осуществляется из нукле-озидов путем образования эфирной связи между фосфорной кислотой и молекулами нуклеозида. В образовании этой связи участвуют гидроксилы при С-3 и С-5. Примером ГуЮжет служить фрагмент молекулы ДНК с остатками аденина (А), цитозина (Ц) и гуанина (Г) [c.350]

В. Кон и сотр.), когда было установлено строение их мономеров — нуклеозидов и нуклеотидов, и доказано, что и в ДНК, и в РНК нуклеотидные остатки связаны только 3 —5 -фосфодиэфирной связью. К этому же времени с помощью бумажной хроматографии были выяснены основные закономерности нуклеотидного состава ДНК и РНК (Э. Чаргафф и сотр.). В частности, было показано, что в ДНК аденин и тимнн, гуанин и цитозин всегда содержатся в равных количествах это имело принципиальное значение при установлении ее макромолекулярной структуры. [c.6]

НЫ обрааовывать множество связанных водородны.ми связями пар другой структуры. Некоторые из эти.ч пар обнаруживаются экс-пери.ментально для производных нуклеозидов и нуклеотидов, а так-в ко.мплексах ряда синтетических полинуклеотидов. Однако квантово-механические расчеты показывают, что уотсон-криковские А-Т-(в случае РНК —А-1]-) и О-С-пары энергетически наиболее вьггодны. Происходит это потому, что в этих парах центры с повышенной и пониженной электронной плотностью оснований расположены оптимально друг относительно друга. Таки.м образом, комплементарные пары оснований в нуклеиновых кислотах стабилизированы преимущественно электростатнчески.ми взаимодействиями [c.25]

По мере разделения перекрученных qeneit исходной молекулы к их основаниям, ставшим теперь доступными, присоединяются комплементарные нуклеозид-5 -трифосфаты, но с противоположных концов двух цепей. При взаимодействии трифосфатов с З -оксигруппами предыдущих нуклеотидов в растущих цепях образуются новые 3, 5 -фосфодиэфирные связи и освобождаются молекулы неорганического фосфата. В результате каждая из двух родительских цепей дает начало двойной спирали с новой цепью, когда та становится достаточно длинной. Раньше принято было считать, что раскручивание исходных цепей может происходить только на концах двойной спирали. Сейчас установлено, что эти цепи расходятся в нескольких местах на протяжении всей спирали, а образовавшиеся в каждом месте полинуклео-тидные фрагменты соединяются в процессе еще одной реакции (она здесь не показана), давая законченные нити очень большой длины. ФФ — неорганический пирофосфат. [c.484]

К прир. N-Г. относятся нуклеозиды, нуклеотиды, нуклеиновые к-ты, гликопротеины, нек-рые смешанные биополимеры, в к-рых гликозидная связь соединяет углеводные и пептидные цепи через амидный атом N остатка аспарагина. Многие N-Г. и структурные аналоги нуклеозидов, являясь антиметаболитами нуклеозидов, обнаруживают высокую физиол. активность и используются в кач-ве лек. препаратов, напр, фторафур, цитарабин. [c.577]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология