Дезоксирибонуклеозид и фосфаты

В результате последовательного действия разнообразных клеточных экзо- и эндонуклеаз нуклеиновые кислоты подвергаются распаду до стадии рибо- и дезоксирибонуклеозид-3 - и 5 -фосфатов. Дальнейший распад образовавшихся продуктов связан с ферментативными превращениями мононуклеотидов , нуклеозидов и далее свободных азотистых оснований. На [c.500]

Синтез дезоксирибонуклеозид- 5 -три-фосфатов, являющихся непосредственными предшественниками ДНК (гл. 28), [c.671]

В результате каталитического (в присутствии платины) окисления рибо- и дезоксирибонуклеозидов при pH 9 получаются соот-ветствуюш,ие 5 -карбоновые кислоты, причем окисление аденозина и гуанозина протекает несколько медленнее по сравнению с окислением уридина и тимидина. Таким же образом в кислой среде окисляется тимидин-3 -фосфат полученные данные позволяют исполь- [c.49]

Наличие взаимодействия, скорее всего образование водородной связи между цыс-гидроксильной группой и фосфорным остатком, ясно видно из сравнения соответствующих рибонуклеозид- и дезоксирибонуклеозид-3 -фосфатов. Из поведения их при хроматографировании на анионообменной смоле следует, что первые — значительно более сильные кислоты и что смеси таких нуклеотидов (например, цитидин-3 -фосфата и дезоксицитидин-3 -фосфата) могут быть легко разделены. В противоположность этому соответствующие рибонуклеозид- и дезоксирибонуклеозид-5 -фосфаты имеют близкие характеристики [67, 154]. [c.174]

Дезоксирибонуклеозид-5 -фосфаты и щелочные гидролизаты рибонуклеиновой кислоты из дрожжей анализировали методом двумерной хроматографии [58]. Чтобы удалить примеси из адсорбента, слои РЕ1-целлюлозы элюировали на расстояние 5 см 10 %-ным раствором хлорида натрия. Сейчас же вслед за этим помещали слои в растворитель — воду и элюировали дважды до самого верха. После сушки при комнатной температуре слои готовы для хроматографирования. Многостадийное хроматографирование предусматривает элюирование водой вплоть до начальной линии, затем 1 н. муравьиной кислотой (без промежуточной сушки) на расстояние 10 см и, наконец, элюирование 60 % -ным насыщенным раствором сульфата аммония во втором направлении на расстояние 8 см. Перед элюированием разделенных соединений со слоя адсорбента пластинку вымачивали в метаноле 15 мин, чтобы удалить избыточные соли, затем сушили и элюировали с нее разделенные соединения 60 %-ным насыщенным раствором сульфата аммония. [c.127]

При ферментативном расщеплении ДНК в зависимости от выбранного фермента получаются 3 - или 5 -фосфаты дезоксирибонуклеозидов. Так, действие панкреатической дезоксирибонуклеазы I, которая активируется или другими двухвалентными катионами, приводит к образованию 5 -фосфатов Гидролиз дезоксирибонуклеазой II из селезенки дает З -изомеры [c.363]

Большинство исследователей отдает предпочтение пути А вследствие достижения более высокого выхода, а также большей стабильности и доступности дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатов по сравнению с З -фос-фатами. [c.394]

Пиримидиновые нуклеозиды и нуклеотиды. При регулируемом гидролизе рибонуклеиновых кислот энзиматическими или химическими методами может образоваться каждый из четырех рибонуклеозидов—аденозин, гуанозин, цитидин и уридин,— их монофосфаты (по три от каждого) или, в случае уридина и цитидина, их 2, 5 - и 3, 5 -дифосфаты. При энзиматическом гидролизе дезоксирибонуклеиновых кислот получаются дезоксирибонуклеозиды и их -фосфаты,- являющиеся производными аденина, гуанина, тимина, цитозина, 5-ме-тилцитозина и 5-оксиметилцитозина 3, 5-дифосфаты пиримидиновых дезокси- [c.255]

ДНК-полимераза катализирует ковалентное связывание новых дезоксирибонуклеотидов, которое происходит благодаря присоединению их а-фосфатных групп к свободному З -гидроксильному концу пред существующей цепи ДНК следовательно, синтез цепи ДНК происходит в направлении 5 - У (рис. 28-7). Энергия, затрачиваемая на образование каждой новой фосфодиэфирной связи в остове ДНК, обеспечивается расщеплением пирофосфатной связи между а- и Р-фосфатными группами предшественников - дезоксирибонуклеозид-5 -трифос-фатов. Образующийся при этом пирофосфат разрушается затем до фосфата, который может сдвигать реакцию в сторону ее завершения. В процессе работы быЛо сделано очень важное наблюдение было отмечено, что ДНК-полимеразная реакция протекает только в том случае, если в системе уже находится некоторое количество предсуществующей двухцепочечной ДНК. [c.900]

NMP) +1 - удлиненный полинуклеотид, а Pj-отцепившийся фосфат. Ферменту необходимы 5 -дифосфаты рибонуклео-зидов с рибонуклеозид-5 -трифосфата-ми, с дезоксирибонуклеозид-5 -дифосфа- [c.922]

Диэстераза змеиного яда вызывает гидролиз РНК до нуклео-зид-5 -монофосфатов (фиг. 36), начиная от З -гидроксильного конца цепи. Она гидролизует также олигонуклеотиды, образующиеся в результате действия дезоксирибонуклеазы I на ДНК, при-водя к образованию дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатов (фиг. 38). Наличие концевых З -фосфорильпых групп придает субстрату устойчивость. [c.92]

Этот фермент гидролизует РНК до нуклеозид-5 -монофосфа-тов (фиг. 36), начиная с 5 -гидроксильного конца цепи. Он действует также на смесь олигонуклеотидов, образующихся в результате разрушения ДНК дезоксирибонуклеазой П селезенки, расщепляя олигонуклеотиды до дезоксирибонуклеозид-З -фосфатов (фиг. 39) [41, 53]. Фосфодиэстераза не вызывает распада олиго-нуклеотидов, содержащих 5 -фосфомоноэфирные концевые группы. [c.92]

Подобно экзонуклеазе I, экзонуклеаза II начинает разрушение иолидезоксирибонуклеотидной цепи с З -гидроксильного конца, освобождая последовательно дезоксирибонуклеозид-5-моно-фосфаты (фиг. 40). Однако в отличие от экзонуклеазы I этот фермент действует и на динуклеотиды. Так, экзонуклеаза II гидролизует олигонуклеотид фТфТфТфТфТ до 5фТ. Фермент этот быстрее действует на нативную (двухцепочечную) ДНК, чем на денатурированную (одноцепочечную) ДНК, и не разрушает олигонуклеотиды, содержащие З -фосфомоноэфирную группу не действует он и на РНК. [c.94]

Биологическая функция полинуклеотидфосфорилазы неизвестна. Маловероятно, чтобы этот фермент участвовал в синтезе различных типов клеточной РНК, так как, во-первых, при характерных для внутриклеточной реды концентрациях рибонуклеозиддифосфатов и неорганического фосфата положение равновесия реакции сдвинуто в сторону фосфоролиза, а не в сторону поликонденсации и, во-вторых, первичные структуры затравки и продукта различны. Последний аргумент особенно важен, так как специфичность нуклеотидных последовательностей раздичных типов клеточной РНК может быть обеспечена (как и в случае ДНК) только управляемым синтезом. Возможно, что полинуклеотидфосфорилаза функционирует как расщепляющий фермент, разрушая ненужную РНК и освобождая рибонуклеозид-дифосфаты, которые могут, например, использоваться как предшественники дезоксирибонуклеозидов (и, следовательно, ДНК). [c.512]

Имеющиеся косвенные доказательства существования водородной связи между карбонильной группой при С-2 пиримидинового кольца и водородом гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы можно разбить на две группы. Одна группа — это данные о различии физических свойств или химической реакционной способности для пиримидиновых нуклеозидов и их производных, в которых имеется гидроксильная группа при С-2 (например, уридин, уридин-З -фосфат, уридин-5 -фосфат) и производных, в которых эта гидроксильная группа отсутствует (например, 2 -дезоксиури-дин, уридин-2 -фосфат, алкилурацилы). Помимо уже упоминавшихся данных по УФ-спектрам производных уридина сюда относятся данные о различии констант ионизации для производных цитозина этих двух групп отличия в спектрах ЯМР пиримидиновых нуклеотидов 33, а также различие в скоростях протекания некоторых реакций рибо- и дезоксирибонуклеозидов (например, фотохимической гидратации производных цитидинакаталитического гидрирования и гидроксиламинолиза 9 производных уридина). [c.141]

Ацетилирование гидроксильной группы углеводного остатка в дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатах гладко протекает под действием уксусного ангидрида в водной среде при pH 7. В этих условиях гетероциклическое основание не ацилируется даже в случае производных цитидина. При аналогичном ацилировании рибонуклеозид-З -фосфатов за счет внутримолекулярного фосфорилиро-вания 2 -гидроксильной группы в смешанном ангидриде I в значительных количествах образуются циклические фосфаты. [c.513]

Кислотный гидролиз дезоксирибонуклеозид-3, 5 -циклофосфа-тов и пуриновых рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфатов приводит к выделению оснований (см. стр. 495), сопровождающему разрыв фосфодиэфирных связей . Так, при нагревании аденозин-3, 5 -циклофосфата с сульфокатионитом в Н+-форме образуется смесь рибозо-2 -, -3 - и -З -фосфатовв более жестких условиях — при нагревании с 1 и. соляной кислотой при 100° —продуктами реакции являются аденин, рибоза и ортофосфорная кислота При аналогичной обработке (1 н. НС1, 100 °С) уридин-3, 5 -циклофос-фат полностью расщепляется за 1 ч (время полупревращения 8 мин) при этом образуются урацил (67%), уридин-2 (3 )-фосфат (27%) и уридин-5 -фосфат (6%). Цитидин-3, 5 -циклофосфат разрушается полностью за 2 ч (время полупревращения 26 мин) при этом возникают цитозин (6%), цитидин-2 (3 )-фосфат (78%) и ци-тидин-5 -фосфат (13%) [c.552]

Название нуклеотид было введено в 1908 г. Левиным и Ман-делем 11] для соединений, выделенных из кислотных гидролизатов нуклеиновой кислоты зобной железы теленка. Еще до недавнего времени фосфаты нуклеозидов часто характеризовали по названию сырья так, например, для описания двух различных изомеров аденинового нуклеотида употребляли выражения дрожжевая адениловая кислота и мышечная адениловая кислота . В настоящее время эта терминология утратила в какой-то мере свое значение, и если известно положение фосфорного остатка, то его обозначают обычно, как в данном примере аденозин-2 -фосфат. Для Аюнофосфатов природных рибонуклеозидов вoз южнo существование трех изомеров (2 -, 3 - или 5 -фосфаты), а в ряду дезоксирибонуклеозидов вoз южны как З -фосфаты, так и 5 -фосфаты. Все они были выделены. [c.123]

Коффи и Ньюбург [45] изучали влияние изменения содержания сульфата кальция в качестве связующего в слоях ОЕАЕ-целлюлозы и обнаружили, что величины Rf (табл. 24.1) почти всех исследованных соединений сильно меняются, если в качестве растворителя используется соляная кислота. Наилучшее общее разделение рибонуклеотидов авторы работы [45] получили со смесью изомасляная кислота—раствор гидроксида амо-ния (уд. масса 0,90)—вода (33 1 16), однако лучшее разрешение зон 2 -фосфата и изомерного ему З -фосфата они достигли при элюировании пробы 0,005 н. соляной кислотой на слое ОЕАЕ-целлюлозы, закрепленной 10 % сульфата кальция. Поскольку гуаниловая кислота при рН<10 проявляет сильную тенденцию к образованию прожилок, монорибонуклеотиды растворяли в 0,1 н. растворе гидроксида аммония. Наилучшие условия для разделения дезоксирибонуклеотидов — сочетание ОЕАЕ-целлюлозы с 10 % сульфата кальция в качестве связующего и того же растворителя, что и для разделения рибонуклеотидов. Добавляя сульфат кальция к адсорбенту, удается отделить 2-дезоксицитидин-5 -фосфат от 2-дезоксиаденозин-5 -фос-фата при хроматографировании на слое без связующего зоны этих соединений перекрываются. Для разделения смесей, содержащих как рибо-, так и дезоксирибонуклеозиды, наилучшим оказалось сочетание разбавленной 0,005 н. соляной кислоты со слоями ОЕАЕ-целлюлозы без добавки связующего. При использовании связующего (сульфата кальция) величины Rf уридина и тимидина возрастали настолько, что их пятна перекрывались с пятнами цитидина и 2-дезоксицитидина. Нуклеозиды наносили на пластинку из раствора в нейтральном растворителе. Свободные основания в виде раствора в 0,1 н. соляной кислоте лучше всего разделялись растворителем Рандерата [42] на адсорбционных слоях ОЕАЕ-целлюлозы, не содержавших сульфата кальция. [c.123]

Несмотря на то что карбодиимидному методу синтеза нуклеотидо-(Р- ,К)-пептидов свойственны некоторые недостатки, главным из которых является образование большого количества побочных продуктов, значительно снижающих выход основного соединения, метод этот очень прост, не требует подготовительных синтезов и тщательного высушивания растворителей. Особенно следует отметить возможность использования незащищенных нуклеотидов. Все это позволяет считать карбодиимидный метод удобным общим способом получения моно- и олигонуклеотидил-(5 - Ы)-амино-кислот и -пептидов (структур типа I), а также нуклеозид-5 -полифосфо-(Р- М)-аминокислот (типа IV). Кроме того, его можно рекомендовать для синтеза аминокислотных производных дезоксирибонуклеозид-5 - и З -фосфатов. [c.353]

Пирофосфатным методом с выходом до 95% были получены [24, 25, 28—33] аминокислотные (пептидные) производные различных рибо- и дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатов, а также тимидин-З -фосфата (см. табл. 3). При синтезе соответствующих производных серина в реакцию вводился метиловый эфир серина [30]. Так как аминогруппа серина является более сильной нуклеофильной группой, чем оксигруппа, основным продуктом реакции является эфир нуклеотидо-(Р- К)-серина. Этим методом можно получать [30] также 0-нуклеотидилоксиаминокислоты. Для этого используется эфир Ы-кбз-оксиаминокислоты и к реакционной смеси добавляется трибутиламин,- увеличивающий нуклеофильность оксигруппы [c.356]

Синтез дезоксирибонуклеотидов путем восстановления рибонуклеотидов является основным направлением биосинтеза их в клетке. Однако не исключена возможность биосинтеза дезоксирибонуклеотидов по пути, независимому от биосинтеза рибонуклеотидов. Для микроорганизмов частично реализуется путь, основанный на переносе остатка дезоксирибозы с дезоксирибонуклеозида на свободное пуриновое или пиримидиновое основание с последующим фосфорилированием синтезированного дезоксирибонуклеозида. Так, в Е. соИ и животных тканях синтез осуществляется с использованием дезоксирибозо-5-фосфата, образующегося под действием специфической альдолазы из 3-фосфоглицеринового и уксусного альдегидов. Дезоксирибозо-5-фосфат изомеризуется в дезоксирибозо-1-фосфат, который конденсируется с пуриновыми или пиримидиновыми основаниями с образованием нуклеозидов, фосфорилируемых далее в нуклеотиды [c.440]

Фосфорилирование сахарного остатка дезоксирибонуклеозида возможно только по положениям С-3 и С-5, так как атомы С-1 и С-4 включены в фуранозное кольцо, а атом С-2 не имеет гидроксидной группы. Оба типа замещенных фосфатов найдены в дезок-сирибонуклеозидах, выделенных после гидролиза ДНК. Ниже показано строение дезокси-З -адениловой кислоты и дезокси-5 -аде-ниловой кислоты [c.211]

Дезоксирибонуклеиновые кислоты являются полинуклеотидами, в которых фосфатные остатки каждого нуклеотида служат мостиками при образовании фосфодиэфирных связей между остатками дезоксирибозы. Доказательство того, что межнуклеотидные связи находятся между атомами С-3 и С-5, получено при изучении ферментативных гидролизатов ДНК. Последовательный гидролиз ДНК панкреатической дезоксирибонуклеазой (ДНазой) и фосфоди-эстеразой змеиного яда дает смесь дезоксирибонуклеозид-5 -фосфа-тов. Комбинированное действие ДНазы и фосфодиэстеразы селезенки приводит к дезоксирибонуклеозид-З -фосфатам. Таким образом, ДНК является длинноцепочечным полимером с диэфирными межнуклеотидными связями между атомами С-3 и С-5, как показано на рис. 7.1 для фрагмента цепи ДНК. [c.214]

Дезоксирибонуклеазы II (дезоксирибонуклеинат-З -олигонуклеотидгидро-лазы) в качестве конечного продукта действия образуют олигодезоксирибону-клеотид-З -фосфаты со средней длиной молекул в 6 звеньев и небольшие количества дезоксирибонуклеозид-З -фосфатов. Молекулярная масса ДНКазы [c.225]

Как и в случае ДНКаз, существует большая группа (более десяти) экзорибо-нуклеаз, ускоряющих реакции отщепления рибонуклеотидов по концевым оста кам РНК, и олигорибонуклеотидов, возникающих при селективном гидролизе РНК под действием эндорибонуклеаз. Таким образом, в результате деятельности разнообразных нуклеаз нуклеиновые кислоты при распаде дают сложную смесь индивидуальных рибо- и дезоксирибонуклеозид-3 и 5 -фосфатов. [c.230]

Нуклеозиддифосфаты и нуклеозидтри-фосфаты превращаются друг в друга под действием нуклеозид-дифосфат — киназы, фермента с широкой специфичностью, в отличие от монофосфаткиназ. В следующих уравнениях X и Y могут быть любыми рибо- или дезоксирибонуклеозидами из большого набора этих соединений [c.264]

Смотреть страницы где упоминается термин Дезоксирибонуклеозид и фосфаты: [c.46] [c.207] [c.210] [c.900] [c.96] [c.204] [c.131] [c.136] [c.158] [c.312] [c.323] [c.488] [c.489] [c.493] [c.516] [c.416] [c.395] [c.225] [c.225] [c.103]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология