Рекомбинационное расстояние

Некоторые экспериментальные факты говорят в пользу рекомбинационной теории. Так, непосредственно наблюдалось наличие избыточного количества растворенного в железе водорода в опытах, в которых электролиз проводился с железным электродом, погруженным в раствор НаЗО . В этих опытах благодаря большой скорости диффузии водорода его присутствие в количествах, превышающих равновесную растворимость, обнаруживалось в глубине железа на некотором расстоянии от поверхности электрода. [c.399]

Для размера мутона из генетики известны цифры 0,01—0,02%. Если воспользоваться оценкой физических размеров рекомбинационной единицы, равной 250 парам нуклеотидов, то для минимальной области генетического вещества, затрагиваемой мутацией, получается от 2 до 5 пар нуклеотидов (в двойной спирали Крика— Уотсона). Такие цифры вполне соответствуют ожидаемому кодовому числу. Они неплохо согласуются также с другими, сделанными ранее оценками. Однако существуют мутанты, способные к рекомбинации и находящиеся на расстоянии меньше 0,01%. Они образуют так называемые виды и связаны с реконом, к вопросу [c.381]

Существенная зависимость коэффициента разделения от потенциала наводит на мысль об изменении с потенциалом расстояния перескока протона, т. е. изменении расстояния между донором (аммонийным ионом) и электродом. Этот эффект должен играть существенную роль, если медленной стадией является перенос протона от донора к электроду. Если же принять рекомбинационный механизм (3671, при котором ион замещенного аммония ВН+ нейтрализуется с образованием радикала ВН и затем два радикала рекомбинируют, давая 2В и Н2, то изотопный эффект не должен зависеть от потенциала. Последнее связано с тем, что для механизма разряд—рекомбинация изотопный эффект определяется лишь стадией разряда [250], которая включает в себя только внутримолекулярное изменение координаты протона при превращении ВН+ в ВН. На вероятность такого перехода параметры двойного слоя не должны влиять. [c.204]

Теперь можно сравнить генетическое сцепление, выведенное на основании вышеупомянутого рекомбинационного анализа, с временными расстояниями, ранее установленными на основании кинетики переноса, приведенной на фиг. 110. В частности, можно видеть, что два локуса, la и риг, с одной стороны, отделимы кроссинговером с вероятностью, составляющей 22%, и, с другой стороны, разница во времени переноса их составляет 1 мин. Следовательно, 22"o сцепленной передачи соответствует 1 мин переноса. Так как для переноса всей хромосомы требуется примерно 100 мин и так как геном Е. соН представлен кольцевой молекулой ДНК, содержащей 3-10 нуклеотидных пар, можно рассчитать, что вероятность кроссинговера на пару нуклеотидных оснований составляет 22" х X 100(1-З-10 ) = 0,007%. [c.243]

Высокая разрешающая способность этого подхода, благодаря селективной методике, позволяет количественно оценить даже самые редкие рекомбинационные события, а это дает возможность измерять расстояние по карте для любой пары мутаций. (Единственным ограничением этого метода является частота обратных мутаций, или реверсий , к дикому типу. Эта частота составляет примерно 0,0001%. Таким образом, чтобы достичь минимального уровня измерений, превышающего в 10 раз фон спонтанных мутаций, можно измерять только рекомбинационные частоты выше 0,001%.) [c.17]

Рис. 3.10. Рекомбинационная карта гена триптофан-синтазы соответствует аминокислотной последовательности этого белка. Вертикальными черточками показаны мутационные сайты, определенные по аминокислотным заменам в белке и по картированию мутаций в гене. Расстояние между черточками указывает на расстояние между мутациями на карте (выраженное в процентах рекомбинации).

В первом эксперименте сравнивали расстояние между мутационными сайтами с расстоянием между аминокислотными заменами в белке. Расстояния на генетической карте измеряли в единицах рекомбинации, а расстояния на белке-по числу аминокислот, разделяющих аминокислотные сайты. На рис. 3.10 показано, что порядок семи мутационных сайтов соответствует порядку семи аминокислотных замен. Расстояние на рекомбинационной карте между мутациями относительно совпадало (как это не удивительно) с действительным расстоянием между аминокислотными заменами в молекуле белка. [c.51]

Мутации, приводящие к нарушениям синтеза цитохрома Ь, при картировании могут быть объединены в ряд кластеров. Каждый кластер занимает небольшой по длине участок, порядка 1% рекомбинационной карты. Расстояния между кластерами довольно велики и составляют 2-9% рекомбинационной карты. Каждый кластер обозначается как box с соответствующим номером. Кластеры распадаются на три класса. [c.258]

Расстояние между компонентами канонической последовательности почти точно соответствует одному или двум виткам двойной спирали. Эта особенность может отражать тот факт, что некоторые геометрические соотношения используются в рекомбинационных реакциях. Например, рекомбинационный белок или белки) может присоединиться к одной стороне ДНК, что напоминает взаимодействие с другими сигнальными элементами генома, такими, как промоторы и операторы (гл. 11 и 14). [c.510]

Анализ частоты рекомбинаций может дать ответы на два вопроса. Первый вопрос состоит в том, принадлежат ли оба гена одной хромосоме. Если наблюдаемая частота рекомбинаций между аллелями каких-либо двух генов меньше 50%, то на этот вопрос можно ответить положительно. Для генов, расположенных в одной хромосоме очень близко друг к другу, наблюдается обычно очень низкая частота рекомбинаций. По мере увеличения расстояния между генами частота рекомбинаций также увеличивается. Более того, кроссинговер между генами, находящимися в одной хромосоме, но сильно удаленными друг от друга, может происходить настолько часто, что наблюдаемая частота рекомбинаций будет близка к 50%, т. е. к значению, соответствующему независимому расщеплению. В таких случаях для определения принадлежности генов одной хромосоме требуется статистический анализ. Иногда хромосомы бывают настолько длинными, что гены, расположенные на разных концах, всегда расходятся независимо. Такие случаи можно выявить, лишь ответив на второй вопрос каково взаимное расположение сцепленных генов в хромосоме Рекомбинационный анализ дает ответ и на этот вопрос. [c.133]

Пермиссивные условия Псевдоаллель Расстояние на карте Рекомбинационный тест [c.185]

Основы рекомбинационно-диффузионной модели радиолиза рассмотрены в [229, 230]. Решение кинетической модели ищут на единичной трековой форме выбранного типа (например, шпора или трек), а затем распространяют на все трековые формы выбранного типа в единице объема. Концентрация частиц -го типа с (г, 1) — есть функция распределения данных промежуточных частиц в момент времени ( на расстоянии г от центра шпоры (сферическая симметрия) или от оси трека (цилиндрическая симметрия). Для каждой промежуточной частицы записывают нелинейное дифференциальное уравнение в частных производных (3.217), показывающее изменение концентрации этой частицы во времени. Уравнение включает диффузионный член для выбранной -й частицы, генерированной излучением, и члены, учитывающие появление /-й частицы по реакциям первого и второго порядков и гибель -й частицы по реакции первого порядка,, по реакциям рекомбинации между собой и с другими промежуточными частицами и при реакциях захвата акцепторами, при- [c.197]

Соотношение (9.5) использовалось для измерения концентрации атомов азота на расстоянии Az — 4—6 см от разряда вниз по потоку. При скоростях газа 40—90 см/с время его прохождения от разряда до места измерения составляло 40—200 мс. Исследование механизма возбуждения N2 (5 П , v) (см. гл. V, 4) показало, что при таких временах заселение обусловлено только рекомбинацией атомов. Спектр излучения также имел вид, характерный для рекомбинационного послесвечения, и не менялся при изменении [c.219]

Интенсивность излучения первой положительной системы в разряде на два-три порядка величины превышает регистрируемую интенсивность рекомбинационного спектра, что потребовало разработки специальных конструкций трубок (рис. 9.2) и делает измерения этим методом в разряде и на более близких расстояниях невозможными. Вклад рассеянного излучения разряда определялся по виду регистрируемого спектра. [c.220]

Справедливость этого вывода была подтверждена сначала данными рекомбинационного анализа стабильные мутации (делеции), введенные в скрещивание, сокращали генетические расстояния между фланкирующими мутациями, т. е. расположенными справа и слева от делеций. В дальнейшем выпадение участка ДНК продемонстрировали на гетеродуплексах, полученных путем гибридизации ДНК из фага дикого типа и из делеционного мутанта. При этом в участке, соответствующем делеции rll, образовывалась однонитевая петля за счет лишней ДНК из дикого типа, хорошо различимая в электронный микроскоп. [c.376]

Необычной особенностью репликации ДНК фага Ми является то, что, во-первых, все вновь синтезированные копии фагового генома оказываются в состоянии профага (т. е. включены в клеточную хромосому) и, во-вторых, фагоспецифическая последовательность нуклеотидов, которая послужила матрицей для образования дочерних геномов, остается в клеточной хромосоме на том же месте, где она находилась до репликации. Другими словами, репликация идет без выщепления резидентного профага и, по существу, представляет собой репликативную транспозицию. Вероятная схема этого процесса представлена на рис. 152. Фагоспецифические белки обеспечивают сближение концов профага, интегрированного в клеточную хромосому (аналогично тому, как они это делают с проникшей в клетку молекулой ДНК фага). Участок хромосомы, в котором сближены концы прсфага, контактирует с другим участком этой же хромосомы или с какой-либо другой находящейся в клетке молекулой ДНК. В этом свежем участке появляется ступенчатый разрыв (два однонитевых разрыва на расстоянии 5 п. н.) возникают однонитевые разрывы и по обеим границам резидентного профага. Выступающие 5 -концы клеточной ДНК соединяются с З -концами вирус-специфических последовательностей, а З -концы клеточной ДНК выполняют роль затравки. Таким образом, инициация раунда репликации представляет собой в этом случае вариант рекомбинационной инициации- В результате Полуконсервативной репликации и последующих процессов репарации в клеточной хромосоме оказывается две копии профага в каждой из них одна чз цепей пронсходнт из резидентного профага, а вторая синтезирована заново. При повторении этого процесса Количество профагов в клеточной хромосоме может достигать сотни. [c.287]

Присутствие в пламени солей металлов оказывает существенное влияние на скорость рекомбинационных процессов. Ньюстабб [156] показал, что свинец в водородном пламени фактически ионизирован, но тогда очевидно, что он должен обладать такой же способностью образовывать электрон, как и натрий в ацетиленовом пламени. Он объясняет этот экспериментальный факт двояко во-первых, собственная ионизация в зоне реакции ацетиленовых пламен, безусловно, много больше, чем при горении смеси водорода с кислородом во-вторых, возможен процесс, в котором свинец непосредственно передает свой электрон положительному иону, возникающему в пламени. Такой процесс эффективнее, чем тримолекулярная рекомбинация электрона с атомом свинца, поэтому ионы свинца можно наблюдать на некотором расстоянии от зоны реакции. [c.260]

Произошло поглощение света, образовались ионизованные центры люминесценции и накопились свободные электроны в зоне проводимости (а так как зонная теория предполагает все процессы симметричными между электронами и дырками, то все, что рассматривается по отношению к электронам, происходит и с дырками). Скорость движения электронов в зоне проводимости чрезвычайно велика и составляет 10 —10 см1сек. Отсюда следует, что даже в том случае, если концентрация локальных уровней чрезвычайно мала, т. е. они находятся на значительном расстоянии друг от друга, происходит очень быстрое распределение электронов по уровням локализации (переходы 2- 3 2- 3 2— 4 ). Если уровнем локализации является возбужденный уровень активатора, то, как рассмотрено выше, произойдет рекомбинация. Иначе обстоит дело с электронами, попавшими в ловушки. На уровне ловушек они могут оставаться значительный период времени, пока не будут освобождены тепловым или оптическим путем. Очевидно, что именно за счет процессов локализации рекомбинационное излучение затянуто во времени. Необходимо также помнить, что электроны, перешедшие из ловушек в зону проводимости, имеют достаточно большую вероятность повторной (и большей) локализации. Электрон, находясь в ловушке, не является неподвижным, но находится в колебательном состоянии, однако амплитуда его такова, что он не может выйти в зону проводимости. Получив определенное количество энергии за счет теплоты, что равносильно уменьшению глубины первоначальной ловушки, электрон может покинуть ее и перейти в зону проводимости (переход 3- 2) и в конце концов локализоваться на активаторе (переход 2— 4 ). Разумеется, что чем меньше глубина ловушки, тем больше вероятность выхода из нее, т. е. тем меньше время пребывания электрона в заданной ловушке. Скорость освобождения [c.63]

Поскольку изучение кроссинговера на молекулярном уровне не дало пока почти ничего, попробуем взяться за эту проблему с другого конца. Частота рекомбинаций между двумя генами составляет обычно около 50% или ниже. Эта цифра 50% отражает всем знакомое менделевское соотношение (расщепление 1 1) и означает, что два данных гена могут свободно перекомбинироваться между собой — это всегда тот случай, когда гены находятся на двух разных хромосомах. Вероятность того, что обе эти хромосомы после мейоза окажутся вместе в одном ядре, равна 50% (ср. рис. 43). Если гены лежат в одной и той же хромосоме, то образуется 0% рекомбинантов при условии, что сцепление не было нарушено. Все значения между О и 50% характеризуют частоту нарушения сцепления, т. е. частоту рекомбинаций иначе говоря, они служат мерой относительного расстояния между двумя данными генами. Сейчас получены значения вплоть до 0,02%. Если теперь, исходя из измеряемых длин хромосом, попробовать вычислить абсолютные расстояния между генами — нет надобности повторять здесь применяемые с этой целью довольно сложные расчеты, — то мы получим величины порядка нескольких ангстрем (А), иногда даже долей ангстрема. Но тогда, следовательно, генетический анализ позволяет различать на хромосоме и соответственно на ДНК точки , удаленные друг от друга всего на несколько ангстрем. Итак, рекомбинационный анализ позволяет проникнуть непосредственно в область молекулярных размеров. [c.134]

Последняя величина измеряется независимо в той же серии экспериментов путем отбора рекомбинантов по двум признакам Ad+Sm . С помош,ью этой величины мы и производим нормировку вероятности. Поделив на нее измеренную вероятность сложного события, получаем искомую величину — вероятность рекомбинации между точками z и Ad. Таким способом мы избавляемся одним ударом от всех трудноизмеримых величин — от вероятности конъюгации а и вероятности пропикновепия локуса в зиготу w х). Все эти параметры автоматически исключаются, когда мы делим вероятность сложной рекомбинации на T Ad-sm- На рпс. 110 нанесены расстояния в рекомбинационных единицах, а в табл. 18 приведены результаты генетических экспериментов (многократных рекомбинаций), на основании которых эти расстояния вычислены. [c.331]

Доля двухзарядных ионов в суммарном токе масс-спектра изменялась случайным образом. Интенсивность трех- и четырех зарядных ионов обычно не превышает 0,5%, и, следовательно, ими можно пренебречь. Отношение интенсивности однозарядных ионов к деухзарядным, рассчитанное по данным фотомет-рирования без введения поправочных коэффициентов, составляет /+//2+ 5—16, а с учетом зависимости почернения фотоэмульсии Ильфорд 02 на заряд иона это соотношение составляет величину /(/+// + 84-30, где /С — коэффициент, указывающий, во сколько раз чувствительность фотоэмульсии к двухзарядным ионам превышает соответствующую чувствительность к однозарядным ионам. Относительно значения К в литературе имеются противоречивые сведения [1, 9]. Поэтому значение К было определено следующим образом. На двух фотопластинках были зарегистрированы масс-спектры железа при максимальном (до 20 мм) и минимальном (до 3 мм) расстояниях электродов искрового разряда от входной щели масс-спектрометра. Вследствие различия рекомбинационных процессов в первом случае содержание двухзарядных ионов снизилось до 2—5%, а 1ВО втором —достигало 20—30%. [c.135]

Такие сайты разделяют одну и ту же несимметричную последовательность из 8 пар оснований. В присутствии родственных последовательностей стимулирующий эффект утрачивается следовательно, любая замена основания в такой последовательности приводит к потере ею способности выступать в качестве горячей точки . Последовательность hi встречается обычно в ДНК Е. oli примерно один раз на каждые 10 тысяч пар оснований. Ее присутствие в ДНК фага лямбда дикого типа, а также в других генетических элементах свидетельствует, что она не существенна для Re A-зависимости рекомбинации. Последовательность hi способна стимулировать рекомбинацию в соседних областях, находящихся от нее на расстоянии до 10 тысяч пар оснований. Мы не знаем, какую именно роль она играет в рекомбинации, но возможно, что /ii-последовательность необходима для инициации или разрещения рекомбинационных интермедиатов. [c.452]

Мутации гП дают возможность оценить предельную разрешающую способность рекомбинационного анализа. Как уже упоминалось выще, посев фага на Е. соИ К (А.) дает возможность выявить единственный рекомбинант дикого типа гП из 10 г//-фаговых частиц. Следовательно, в соответствии с уравнением (6.1) теоретически минимальное расстояние между двумя соседними различимыми мутациями гП должно составлять 0,0002 (2 10 /10 = 2 10 " ). Однако минимальное наблюдаемое на карте расстояние между соседними г//-мутациями составляет около 0,02 единиц (см. рис. 6.4). Меньшие расстояния не обнаружены, несмотря на высокую чувствительность системы. Эта оценка минимально возможного наблюдаемого расстояния между мутациями на карте хорошо соответствует получаемой из предположения, что минимальной единицей рекомбинации служит пара нуклеотидов. Хромосома фага Т4 содержит 1,8-10 нуклеотидных пар и имеет длину 1500 единиц. Таким образом, величина 0,02 единицы соответствует приблизительно двум парам нуклеотидов. Поскольку это лишь грубая оценка, то естественно предположить, что к рекомбинации способны мутации, локализованные в соседних парах нуклеотидов. Это было убедительно подтверждено при исследовании карты тонкой структуры гена trpA. Следовательно, точечные мутации, не дающие при скрещивании рекомбинантов дикого типа, вернее всего представляют собой независимые изменения одной и той же пары нуклеотидов. [c.175]

Метод прерванной конъюгации удобен при физическом картировании генов, довольно удаленных друг от друга, но не может использоваться при картировании маркеров, находящихся на близком расстоянии. Такие локусы картируют посредством рекомбинационного анализа, основанного на тех же принципах, которые были использованы при постановке трехфакторных скреидиваний (гл. 5 и 7). [c.246]

Рис. 8.14. Генетическое картирование посредством рекомбинационного анализа мерозигот, возникающих в результате конъюгации. Отбирается дистальный маркер С. Расстояние на генетической карте между В к С определяется как умноженное на 100 отношение числа рекомбинантов ЬС к числу рекомбинантов С. Поскольку

Первые неожиданности такого рода были выявлены после определения нуклеотидной последовательности генома фага фХ174, генетическая структура которого была рассмотрена в гл. 7. Полная нуклеотидная последовательность одноцепочечной ДНК фХ174, а также соответствующие аминокислотные последовательности кодируемых белков приведены на рис. 12.6. Показаны также сайты узнавания для ряда рестриктаз, использованных при определении последовательности ДНК. В целом наблюдается хорошая корреляция между нуклеотидной последовательностью (рис. 12.6) и генетической картой (рис. 7.5) фага. Однако можно отметить и три случая отклонения от такой корреляции. Во-первых, имеет место расхождение между рекомбинационными частотами и физическими расстояниями, особенно в области гена А. Во-вторых, [c.83]

Сравнение физической карты Е. oli, построенной в опытах по прерыванию конъюгации, и рекомбинационной карты показывает, что 1 мин соответствует 20 единицам рекомбинации. Поскольку вся хромосома передается за 100 мин, ее общая рекомбинационная длина составляет 2000 единиц, а с учетом общего количества ДНК в хромосоме (4- 10 п. н.) единица рекомбинации соответствует ок. 2 тыс. п. н. Расчеты показывают, что рекомбинационное картирование разумно применять на расстояниях не более 3 мин, поскольку на больших расстояниях маркеры будут наследоваться независимо. При использовании конъюгационного метода трудно ставить реципрокные скрещивания. В связи с этим картирование на коротких участках обычно проводят с использованием трансдукции при помощи умеренного фага Р1. [c.215]

Синаптонемальный комплекс обеспечивает структурную основу, необходимую для рекомбинационных событий, но сам он, вероятно, непосредственно в них не участвует. Как полагают, важную роль в этих событиях играют рекомбинационные узелки, которые представляют собой очень крупные белковые комплексы с диаметром около 90 нм (для сравнения заметим, что крупная молекула глобулярного белка массой 400000 далътон имеет диаметр порядка 10 нм). Рекомбинационные узелки сидят на некоторых расстояниях друг от друга на лестнице синаптонемального комплекса, между двумя гомологичными хроматидами (см. рис. 15-14). Предполагается, что это место расположения крупных мультиферментных рекомбинационных аппаратов , которые подтягивают друг к другу локальные участки ДНК материнской и отцовской хроматид через область синаптонемального комплекса шириной 100 нм. [c.19]

Смотреть страницы где упоминается термин Рекомбинационное расстояние: [c.422] [c.404] [c.446] [c.460] [c.24] [c.47] [c.42] [c.376] [c.37] [c.110] [c.79] [c.16] [c.249] [c.249] [c.19] [c.122] [c.192] [c.122] [c.138] [c.159] [c.301]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология