Сродство гидролиза АТФ

Во второй и третьей частях, посвященных реакционной способности веществ, главное внимание уделено их химическому сродству. Разумеется, вопросы кинетики не менее (а зачастую даже более) важны, чем вопросы статики процессов. Однако, если принять во внимание специфичность и большое разнообразие скоростных факторов и также огромную сложность учета их влияния на реакционную способность веществ, изменение представлений о механизме протекания процессов по мере углубления знаний и, наконец, то обстоятельство, что большинство подлежащих рассмотрению вопросов связано со статикой различных процессов, то этот выбор вряд ли можно счесть спорным. Действительно, и закон действующих масс, и принцип Ле Шателье, и многие свойства растворов (в их числе растворимость, температуры отвердевания и кипения, давление пара), и процессы в них (диссоциация, нейтрализация, сольватация, комплексообразование, гидролиз и т.д.)—это прежде всего проблемы равновесия. Вместе с тем надо отчетливо показать, что вопросы статики и кинетики это проблемы возможности и действительности и что значение энергетического (термодинамического) и кинетического факторов неодинаково для различных типов процессов для реакций в растворах электролитов (например, при нейтрализации), для высокотемпературных реакций и других быстрых процессов кинетические соотношения не существенны наоборот, для медленных реакций и таких, продукты которых гораздо устойчивее исходных веществ (например, при горении), не играют ощутимой роли равновесные соотношения. [c.4]

Общее свойство гликозидаз — довольно высокое сродство их активных центров к отщепляемому моносахаридному остатку. Как правило, величина константы ингибирования для моносахаридов — ПродуКТОВ ферментативного гидролиза — близка к величине константы Михаэлиса для соответствующего субстрата. Аналоги или некоторые производные таких моносахаридов являются, по-видимому, наиболее эффективными конкурентными ингибиторами гликозидаз, известными к настоящему времени. В качестве приме- [c.28]

Таким образом, последовательно варьируя пары субстратов (различающиеся по длине на один мономерный остаток) и регистрируя все возможные меченые продукты гидролиза, можно определить сродство всех сайтов активного центра, за исключением двух, прилегающих слева и справа к каталитическому участку, Аг и Л,+ . [c.45]

Суммарное сродство сайтов 4 и 5, прилегающих к активному центру, было вычислено е помощью кинетических данных по ферментативному гидролизу мальтозы (см. табл. 6). Используя формулу (18) и полагая feo=l,2-10 мин а также применяя известное термодинамическое соотношение [c.51]

Полагая, по своей обычной методике, что гидролитический коэффициент ко для расщепления субстрата, связанного с ферментом продуктивно (т. е. с участием каталитического центра), не зависит от степени полимеризации субстрата и степени заполнения сайтов активного центра, Хироми принял, что величина соответствует плато, достигаемому каталитическими константами скоростей гидролиза при последовательном возрастании степени полимеризации субстрата (/го=Ь10 мин ) [8]. Далее, используя выражения (13) и (19) и численное значение константы скорости второго порядка гидролиза мальтозы, продуктивное связывание которой должно происходить с участием сайтов 6 и 7, прилегающих с двух сторон к каталитическому участку, Хироми рассчитал суммарное сродство этих сайтов, равное —3,1 ккал/моль. [c.52]

Так как мальтоза практически не гидролизуется под действием 3-амилазы, сродство сайта не могло быть определено из сравнения соответствующих констант скоростей второго порядка. Однако Хироми с сотр. [17] рассчитали его с помощью констант скоростей Кат. Кт для гидролиза мальтотриозы и определенных предварительно показателей сродства Л4 и Л5, При расчете были [c.55]

В связи с этим основная ценность картирования активных центров заключается не в нахождении абсолютных значений показателей сродства Аг, гидролитических коэффициентов ко или инкрементов свободной энергии активации ферментативной реакции при переходе от сайта к сайту АСа, а, по-видимому, в практической демонстрации следующего положения количественный состав продуктов ферментативной реакции в любой момент времени в ходе гидролиза, а также зависимость скорости реакции от степени полимеризации субстрата могут определяться небольшим числом параметров активного центра (числом сайтов, положением каталитического участка) и эффективностью взаимодействия мономерных остатков субстрата с отдельными участками активного центра. [c.75]

Для анализа экспериментальных данных (распределение продуктов ферментативной деструкции полимера в зависимости от степени полимеризации, или средняя степень полимеризации продуктов гидролиза) используют теоретические модели ферментативной деструкции полимеров — обычно весьма детализированные, но, как правило, содержащие сильные (и неочевидные) допущения, лишающие смысла всю детализацию. К ним относятся допущения об аддитивности показателей сродства индивидуальных сайтов, о постоянстве гидролитического коэффициента независимо от способа связывания субстрата и степени его полимеризации, о постоянстве инкремента свободной энергии активации действия фермента при последовательном заполнении его сайтов и т. д. Несоответствие теоретических данных, рассчитанных с помощью подобных упрощенных моделей, с экспериментальными нередко трактуется как доказательство в пользу существования таких неординарных механизмов, как множественная атака. При этом в работах, как правило, отсутствует критический анализ ограничений модели, и в частности анализ альтернативных механизмов действия фермента без априорного привлечения неординарных механизмов. [c.103]

Группу VIA составляют О, S, Se, Те и Ро. На внешнем энергетическом уровне атомов этих элементов находится шесть электронов s p. Из них непарные только два р-электрона, что и объясняет их окислительное число —2 в нормальном состоянии. Элементы S — Ро, атомы которых содержат энергетический -подуровень, могут быть и четырех- и шестивалентными. Размеры атомов О — Ро соответственно меньше, чем в группе N — Bi. Поэтому атомы О — Ро не теряют электронов и не превращаются в элементарные катионы. Сродство же к электрону высоко и высока склонность к присоединению электронов. Однако ионы установлены только у простых соединений этих элементов с активными металлами в кристаллическом состоянии и в расплавах. В водных же растворах ионы Э неустойчивы и подвергаются гидролизу [c.226]

У металлов побочной подгруппы II группы наблюдается склонность к образованию комплексных соединений. Соли цинка, кадмия и ртути заметно гидролизованы в растворах. Сродство к кислороду у цинка, кадмия и ртути больше, чем у металлов побочной подгруппы I группы. [c.205]

Перхлорэтилен менее подвержен гидролизу, чем трихлорэтилен, поэтому с ним безопасно применять мыла и моющие сродства, содержащие влагу. [c.16]

На основании данных экспериментов определяют изменения в эффективных величинах максимальной скорости гидролиза и константы сродства фермента к субстрату при активации фосфодиэстеразы комплексом КМ—Са +. [c.382]

Наряду с сродством к фтору бор обладает также очень сильным сродством к кислороду (см. получение элементов из их оксидов алюмотермией в разд. 36.2). Соединения бора с кислородом обычно можно получить путем окисления бора кислородом воздуха. Гидролиз галогенидов бора (ВС1з и др.), в которых [c.573]

Во второй и третьей частях главное внимание уделено химическому сродству. Разумеется, вопросы кинетики не менее (а зачастую даже более) важны, чем вопросы статики процессов. Однако если принять во внимание специфику и большое разнообразие кинетических факторов, а также огромную сложность учета их влияния на реакционную способность веществ, изменение представлений о механизме протекания процессов по мере углубления наших знаний и, наконец, то обстоятельство, что бол1 шинство подлежащих рассмотрению вопросов связано со статикой различных процессов, то этот выбор вряд ли можно счесть спорным. Действительно, и закон действующих масс, и принцип Ле Ша-телье, и многие свойства растворов (в их числе растворимость, температуры отвердевания и кипения, давление пара), и процессы в них (диссоциация, нейтрализация, сольватация, комплексообразование, гидролиз и т. д.) — это прежде всего проблемы равновесия. Вместе с тем надо отчетливо показать, что вопросы статики и кинетики — это проблемы возможности и действительности и что значение энергетиче- [c.4]

Ясно, что необходимым условием использования данного подхода яв./ яется подчинение кинетики ферментативного гидролиза уравнению Михаэлиса- Ментен. Отклонения от этого уравнения, вызванные такими эффектами, как трансглюкозилирование, ингибирование или активация субстратом, различная pH- или температурная зависимость скоростей гидролиза используемых пар субстратов будут искажать левую часть соотношения (20) п, следовательно, приведут к неверным показателям сродства сайтов активного центра к мономерным остаткам субстрата. [c.43]

В качество примера расчета приведем определение сродства для сайта Л,+2, т, с. второго после каталитического участка (ио нагфавлению к восстанавливающему концу субстрата). Его можно определить, сопоставляя константы скоростей второго порядка и рас[1ределение продуктов для гидролиза тримерного и тетра-мерного субстратов (см. рпс. 6, а). Из выражения (24) находим [c.47]

Использование тех же субстратов, но для другого способа расщепления связей (см. рис. 6,6) дает величину Л, . Рассмотрение кинетики гидролиза тетрамера и пентамера дает величины Л,.+з и Д.-2 н т, д. Как легко видеть, использование тримера в качестве субстрата минимальной длины не позволяет определять сродство участков А,- и Л,+ . Тем не менее использование онисанного приема (см. выражения 26 и 27) позволило Хироми и сотр. вычислить [c.47]

Наконец, расчет показателя сродства сайта Л был проведен следующим образом. Сначала было вычислено суммарное сродство всех сайтов А —Л , которое оказалось равно 6,4 ккал/моль (см. табл. 7). Затем, исходя из представлений о характере связывания мальтогексаозы с активным центром (см. рнс. 8), было найдено суммарное сродство сайтов Лг—Л (6,1 ккал/моль), для чего использовали величину. кцат1Кт для гидролиза мальтогексаозы (табл. 6), а также формулы (18), (29) и (30). Разность показателей сродства Л(—Л7 и Л2—Л7 дало величину Л,= = 0,3 ккал/моль. [c.51]

Наконец, для определения сродства остальных сайтов были использованы величины констант скоростей второго порядка (ккат/Кт) для гидролиза мальтоолигосахаридов со степенью полимеризации от трех до восьми. Определив отношения (к ,ах1Кт)п к (йкат/Л т)2 И связав ИХ функциональными зависимостями с величинами сродства индивидуальных сайтов, получили систему нелинейных уравнений (шесть уравнений для шести сайтов), которая была решена итеративным методом [8]. В итоге были найде- [c.52]

Работа [19] по картированию активного центра эндоксиланазы представляет особый интерес и в том отношении, что в ней была предпринята попытка независимого определения показателя сродства одного из сайтов активного центра, что дает возможность сопоставить эти величины и, таким образом, хотя и косвенно, оценить применимость допущений в теоретической части подхода Хироми. Используя меченные С и ксилозу и ксилобиозу как акцепторы в реакциях трансгликозилирования при гидролизе (соль-волизе) ксилотриозы и экспериментально определяя начальные скорости переноса ксилозы 1 и ксилобиозы Уг на олигосахарид-ный остаток в активном центре фермента, авторы [19] независимо определили показатель сродства второго (от каталитического участка) сайта по направлению к восстанавливающему концу [c.61]

Используя сайт 9 как внутренний стандарт, для которого срод-ство было принято равным нулю, Тома и сотр. определили относительные частоты расщепления связей для ферментативного гидролиза а-метнлмальтоолигосахаридов ( = 3—12), меченных по -метилглюкозильиой группе, и построили энергетическую карту сродства сайтов активного центра (в ккал/моль) [c.68]

Особенностями химии щелочноземельных металлов являются большое сродство к азоту, способность образовывать пероксиды, щелочной характер гидроксидов. Для химии магния характерна большое сродство к кислороду и растворимость его сульфата (в отличие от сульфатов щелочноземельных металлов). Все элементы ПА группы дают нерастворимые в воде фториды. Металлический бериллий и многие его соединения похожи на магний (оксид, карбонат, сульфат и некоторые другие). Он проявляет свойства диагонального с ним элемента — алюминия. Его гидроксид амфс-терен, растворимые соли гидролизуются с образованием основных солей (BeS нацело разлагается водой). [c.486]

Радиусы атомов элементов VIA-группы соответственно меньше, чем атомов VA-группы. Поэтому халькогены не огдают электроны и не превращаются в элементарные катионы, но они присоединяют электроны, так как сродство к электрону у них высокое, и образуют Э -. Правда, такие ионы существуют только в бинарных соединениях халькогенов с активными металлами в кристаллическом состоянии и расплавах. В водных растворах они гидролизуются (переходят в более устойчивые ионы), например [c.240]

На кинетику гидролиза значительное влияние оказывает и изменяющаяся степень сродства продуктов гидролиза к ферменту. Например, гидролиз глюкоамилазой плесневых грибов замедляется на коротких цепях. Гидролиз олигосахаридов происходит либо по многоцеиочечному, либо по комбинированному способу с уменьшением степени множественной атаки до единицы по мере укорочения цепей субстрата. Таким образом, гидролиз глюкоамнлазой в присутствии а-амилазы ускоряется только в начальных стадиях процесса. [c.179]

На этой простой схеме видно, что многоатомная цепочка из атомов бора должна обладать высокой степенью электронного сродства, другими словами—злектрофильностью (известные бороводороды легко окисляются, гидролизуются и т.д.). В свою очередь, полиатомная цепочка из атомов азота отличается высокой степенью нуклео-фильности и термической нестабильностью за счет электростатического дестабилизирующего взаимодействия непо-деленных электронных пар соединения [c.15]

Витамин Вт (карнитин). По своему химическому содержанию — это у-ами-но-р-гидроксикарбоновая кислота бета-иноаой структуры, которая присутствует в тканях животных, растений, в микроорганизмах. Для некоторых насекомых карнитин является собственно витамином. Высшие животные синтезируют его из 1-лизина и далее используют в качестве кофермента, участвуюш,его в переносе остатков жирных кислот через мембраны из цитоплазмы в митохондрии. Карнитин, взаимодействия с коферментно связанной жирной кислотой, образует бифильное производное жирной кислоты, имеюш,ее высокое сродство к липидному слою клеточных мембран. Это свойство и обеспечивает ему легкость внедрения в мембрану и транспорт через нее. Жирная кислота высвобождается после транспорта реакцией гидролиза (схема 10.2.13). [c.281]

Связывающие белки подошли бы на роль подвижных переносчиков в процессе облегченной диффузии, однако большая часть выделенных белков принадлежит, по-видимому, к системам активного транспорта, и их функция в процессах переноса до сих пор окончательно не установлена. Согласно одному из предположений, связывающий белок обладает сильным сродством к транспортируемому веществу (субстрату) и прочно связывается с ним на наружной поверхности летки. Образовавшийся комплекс белок—субстрат далее диффундирует к внутренней i TopOHe мембраны. Здесь в результате процесса, сопряженного с самопроизвольно протекающей экзергонической реакцией, например с гидролизом АТР, конформация бел1ка меняется таким образом, что его сродство к субстрату уменьшается. В результате транспортируемое вещество переходит в клетку, а связывающий белок диффундирует обратно к наружной поверхности. Там его конформация возвращается к исходной, вероятно, под влиянием химических воздействий. [c.359]

Для идентификации белковых компонентов 50S субчастицы, формирующих факторсвязьшающий участок, были использованы, в частности, антитела против различных рибосомных белков. Оказалось, что только антитела против белка L7 / L12 ингибировали связьшание EF-G, в то время как антитела против большого разнообразия других белков не влияли на эту функцию. Первоначально из этих опытов был сделан вьшод, что местом присоединения EF-G является белок L7 / L12. Действительно, избирательное удаление белка L7 / L12 то 50S субчастицы (с помощью диссоциации 0,5 М NH4 I с этанолом) приводило к значительному падению связьшания EF-G с рибосомой. Однако сродство не исчезало совсем, а лишь уменьшалось. Было показано, что даже при полном отсутствии белков L7 / L12 на рибосоме EF-G способен, хотя и гораздо менее эффективно, не только связываться, но и осуществлять свои функции в гидролизе ГТФ и в транслокации. Следовательно, белок L7 / L12 лишь помогает связьшанию EF-G, а основным связьшающим компонентом, ввиду отсутствия других причастных белков, должна быть рибосомная РНК. В прямых экспериментах это было подтверждено было найдено специфическое сродство определенного района 23S РНК к EF-G. [c.145]

Результатом гидролиза ГТФ является исчезновение или резкое уменьшение сродства EF-Тц к аминоацил-тРНК и к рибосоме. Считается, что это обусловлено какой-то конформационной перестройкой EF-Tu, когда он оказьшается связан с ГДФ вместо ГТФ. [c.180]

Смотреть страницы где упоминается термин Сродство гидролиза АТФ: [c.64] [c.68] [c.74] [c.110] [c.132] [c.603] [c.321] [c.40] [c.52] [c.378] [c.392] [c.553] [c.299] [c.49] [c.163] [c.164] [c.164] [c.165] [c.166] [c.166] [c.176] [c.180]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология