Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Конформация обзор

    Желающих более подробно ознакомиться с конформацией производных циклогексана мы отсылаем к специальным монографиям и обзорам [ 1, 36, 39]. [c.29]

    Предложены и другие названия для конформаций (табл. 3). Так, скошенную конформацию иногда называют гош , трансоидную — транс или анти . Первое из этих названий по смыслу соответствует наглядному русскому обозначению скошенная и поэтому введение иностранного термина представляется неоправданным. Обозначения транс или анти неудобны, так как они употребляются в стереохимии в иных целях. О различных способах обозначения конформаций см. также в обзоре [3]. [c.31]


    Движущей силой, обеспечивающей переход циклобутана в неплоскую конформацию, является уменьшение напряжения заслонения (питцеровского напряжения). Обзоры о конформациях производных циклобутана, в частности циклобутанонов, — см. [20]. [c.327]

    Заместители, не имеющие цилиндрической симметрии, могут быть не только аксиальными или экваториальными, но, кроме того, еще иметь ту или иную конформацию по связи, соединяющей их с циклогексановым кольцом. В качестве примера можно привести карбоксильную группу [69]. В заключение укажем на некоторые обзоры [70], посвященные обсуждавшимся в данном разделе проблемам конформационного анализа. [c.358]

    Стоит упомянуть, что сам термин конформация появился впервые в связи с обсуждением пространственного строения сахаров. Обзор, посвященный конформации сахаров см. [2] большой материал есть также в книге [3]. [c.629]

    Свойства белков определяются не только аминокислотной последовательностью, но и пространственным строением белковой молекулы, в частности ее вторичной структурой — т к принято называть конформацию полимерной цепи белков (обзор см. [12]). [c.636]

    Компьютерный анализ участков, построенных по типу решетки алмаза, представляет собой очень удобный путь для изучения устойчивых конформаций карбоциклов, содержаш,их до 24 углеродных атомов [50]. Опубликован исчерпывающ,ий обзор по конформационному анализу средних и больших циклов в кристаллическом состоянии [44]. [c.94]

    Химики-Органики (и те, кто работает в области нуклеозидов, не составляют исключения) стали усиленно полагаться на физические методы. Тем не менее детальное рассмотрение этих методов не входит в задачу данного издания. По своему характеру исследования в этой области удобно разбить на три группы (а) теоретические исследования (б) спектроскопические методы, используемые для идентификации и анализа нуклеозидов, и (в) изучение конформаций молекул. В отведенном объеме можно лишь перечислить недавние обзоры и некоторые основополагающие работы по важнейшим из этих методов. [c.76]

    Далее, в силу возрастающего применения физических методов, особенно рентгеноструктурных исследований, ЯМР- и оптической (дисперсия оптического вращения, круговой дихроизм) спектроскопии, акценты были сдвинуты к проблемам топологии этих важных молекул и ее связи с их биологической функцией [114—116]. Другой, в равной мере важной причиной этого сдвига, была высокая степень жесткости циклопептидов по сравнению с их линейными аналогами, что снижало число связанных взаимопревращениями форм и в определенной мере облегчало анализ. Тем не менее эти пептиды все еще в какой-то мере сохраняют гибкость, и часто конформация в кристаллическом состоянии отличается от конформации в растворе. Подробное обсуждение конформаций выходит за рамки этого обзора, но приводятся узловые моменты, касающиеся химических или биологических свойств молекул. [c.313]


    Наряду с данными, приводимыми в следующем разделе (краткий обзор конформаций полипептидов с длинной цепью) в последующих разделах приведены заключения о конформациях боль- [c.428]

    Использование в ЯМР-спектроскопии более концентрированных растворов по сравнению с применяемыми в других спектральных методах может снижать правомочность сопоставления данных различных методов, поскольку в некоторых случаях [72] высокая концентрация вещества благоприятствует определенным конформациям (например, р-форме). Применение физических методов для конформационного анализа полипептидов рассмотрено в обзорах [73—75]. [c.443]

    За период около 10 лет теоретические исследования конформаций пептидов прошли развитие, начав с расчетов отдельных аминокислотных остатков, затем изучались аминокислотные остатки в составе олигопептидов, взаимодействующие как с ближними участками, так и с боковыми радикалами полипептидного скелета, и далее были исследованы олигопептиды, имеющие важные биологические функции. Некоторые аспекты этих исследований отражены в обзорах [83, 84]. [c.445]

    В современных обзорах, посвященных более детальному описанию конформации полисахаридов, приведены расчеты стереохимии полисахаридных цепей в зависимости от типа имеющихся в них химических связей [1], описаны методы предсказания параметров неупорядоченных форм молекул полисахаридов в растворах [2], рассмотрены вторичные и третичные структуры полисахаридов в растворах и гелях [3]. В более ранних обзорных работах рассмотрены основные принципы образования конформаций полисахаридов [4] формам молекул полисахаридов посвящен обзор [5]. [c.282]

    Таким образом, исследование ДОВ, АДОВ и КД эффективно при определении а-спиральности белков и полипептидов. С другой стороны, весьма перспективно изучение ИОА комплексов белков с красителями и ионами металлов, ИОА коферментов и простетических групп. Такие исследования дают сведения о конформациях и в сочетании с химией позволяют расшифровать события, протекающие в активном центре ферментов (см. гл. 6 и [135]). Изучению структуры белков методом КД посвящен обзор [272]. [c.319]

    Влияние изменений в длинах связей и несвязанных взаимодействиях наиболее заметно в замещенных кислородсодержащих гетероциклах. Рассмотрим, например, 2-метил-1,3-диоксан (13) ([18], обзоры см. [28, 29]). Конформация 13а с экваториальным расположением метильной группы более предпочтительна, чем для метилцикло- [c.64]

    Вопросы циклизации и конформаций углеводородных цепей рассматриваются в обзоре Winnik, hem. Rev., 81, 491—524 (1981). Стерические и электронные эффекты в гетеролитических реакциях замыкания цикла рассматриваются в обзоре Вальтере.— Усп. хим., 1982, 51, с. 1374— 1397. [c.299]

    Обзор, посвященный связи конформаций циклоалкилгало-генидов Сз—Сю с их ИК-спектрами, см. [44]. [c.343]

    При опенке предпочтительных конформаций замещенных циклогексенов пользуются представлением об аллилъном напряжении (обзор см. 61]). В структурах типа ХХУП проявляется А - -напряжение при этом имеют в виду невыгодность экваториальной ориентации заместителя К в аллильном положении из-за его сближенности с винильным заместителем К  [c.457]

    Исследование деталей строения амидной группы стимулировалось в первую очередь тем, что эта группировка является основой строеняя полипептидной цепи белковых веществ (см. гл. И, стр. 635). Однако, начиная с 60-х годов, появляется много работ по пространственному строению и более простых амидов. Решающую роль при изучении конформаций амидов играет метод ЯМР. Накопленный материал обобщен в обстоятельном обзоре [58]. [c.585]

    Величина барьера, выраженная в величинах АО, равна 67—80 кДж/моль. С ростом величины радикалов К и К барьер несколько падает-, по-видимому, это является результатом дестабилизации как 2-, так и Е-конформаций и большего значения, которое приобретают в этих условиях неплоские формы [89]. Изомерии соединений тиоамидного типа посвящен обзор [90]. [c.599]

    Спектрополяриметрический метод был использован для изучения изменений конформации, вызываемых введением дополнительных пептидных цепей в молекулу инсулина по трем его свободным аминогруппам [15]. Исходный инсулин спирален на 25%, модифицированный лизином — на 32—33%, модифицированный глутаминовой кислотой — на 3—16%. Если к растворам синтетической полиглутаминовой кислоты добавить некоторые красители (акридин оранжевый, псевдоизоцианин) и измерить дисперсию оптического вращения в области 560—360 нм, то при pH 5,5 кривая ДОВ имеет плавный характер (полимер в неупорядоченной конформации) при pH ниже 5,1, когда полимер приобретает спиральную конформацию, дисперсия оптического вращения становится аномальной, причем величина вращения резко возрастает. Это связано с адсорбцией красителя на спиральной полипептидной цепи, в результате чего полоса поглощения красителя становится оптически активной [16]. Дальнейшее развитие спектрополяриметрического метода позволило перейти к прямому измерению эффекта Коттона в области 185—240 нм, непосредственно связанного со спиральностью молекул белков и полипептидов (обзор см. [17]). [c.638]


    Предплавление и плавление. Процессы предплавления и плавления н-парафинов интенсивно исследовались в связи с изучением особенностей ориентационного и конформационного беспорядка подвижных и гибких длинноцепочечных молекул в ротационных кристаллах вблизи температуры плавления и в жидкой фазе. Предплавление и плавление веществ с гибкими молекулами, в том числе н-парафинов, рассмотрены в классической монографии А. Уб-белоде [137, глава 6] предплавление н-алканов — в современном (1994 г) обзоре Л. Манделькерна [298] плавление н-парафинов — в работах Д. Дорсета с соавт. [222], А. Н. Афанасьева с соавт. [6] и др. конформации парафиновых молекул в жидкой фазе — в работах Д. Дорсета с соавт [224], Г. Церби с соавт. [411] и др. молекулярные модели процессов предплавления в кристаллах н-парафинов и полиэтилена — в работах В. В. Гинзбурга и Н. Г. Рывкиной [35], [c.108]

    В таблице приведены далеко не все секреторные и несекреторные пептидные и белковые гормоны. При их последующем рассмотрении также нельзя охватить всех их представителей и остановиться на всех аспектах их химии и эндокринологии. Почти невозможно включение в обсуждение многочисленных синтетических аналогов различных пептидных гормонов, а также проблематики, связанной с обширными нсследованнямн конформаций пептидных молекул. Многие монографии и обзоры могут дать обширную информацию об интересной области науки, относящейся к пептидным и белк овь(м гормонам [581—590]. Уверенно идет установление структуры и изучение механизма действия новых природных соединений пептидной природы из головного мозга, внутренних органов, лимфоцитов, кожи амфибий и т. д., обладающих гормональным действием. [c.236]

    В обзоре [13] отмечается, что полифторалкоксифосфазены имеют лабильную структуру, зависящую от условий получения полимера и его термической предыстории. Главной причиной формирования мезоморфного состояния этих полимеров является специфическое взаимодействие основной полимерной цепи с боковыми цепями, содержащими большое число электроотрицательных атомов фтора. Особенно большое внимание уделялось исследованию поли[бис(трифтор-этокси)фосфазена]. Отмечается, что своеобразное строение мезофазы этого полимера обуславливает способность полимерного материала в мезоморфном состоянии течь подобно жидкости. Структура изотропного расплава полифосфазена сохраняет основные черты строения мезофазы, отличаясь свернутой конформацией макромолекул [212]. В области 453-493 К существенно изменяются реологические свойства и ряд структурных характеристик мезофазного расплава полимера, что сопровождается тепловым эффектом [213]. Предполагают, что в этой области температур происходит конформационное превращение макромолекул полимера с образованием структуры, промежуточной между одномерной слоевой и двумерной псевдогональной. Обнаружена высокая чувствительность мезофазы поли[бис-(фторэтокси)фосфазена] к приложенному давлению (до 400 МПа) повышение температуры перехода полимера (Г]) из кристаллического состояния в мезофазу, резкое расширение области существования мезофазы с ростом давления, а также ее упорядочение [211]. [c.352]

    Однако расчеты адсорбции полимерных молекул в тонких прослойках и пленках, в особенности в условиях их некоторого перекрытия, требуют одновременного учета очень многих факторов конформации иупругих свойств полимерных молекул, взаимодействия сегментов с поверхностями прослойки и с другими сегментами, принадлежащими как той же молекуле полимера, так и соседним. Нали-ч[ие активных центров на поверхностях, а также различных по активности г упп полимерных молекул, в том числе и ионогенных, значительно осложняет такие расчеты. Поэтому теория стерической составляющей расклинивающего давления использует по необходимости целый ряд упрощающих предположений. Рассмотрение теории и экспериментальных исследований стерической составляющей представляет собой самостоятельную задачу. Для ознакомления с ней мы отсылаем читателя к известным обзорам [8—И]. [c.116]

    Например, в кристаллах миоглобина и гемоглобина их от 5 до ю лизоцима - всего 5. Дж. Рапли, детально изучивший этот вопрос, в своем обзоре пишет "...кристалл глобулярного белка можно рассматривать как упорядоченный и открытый ансамбль компактных молекул, имеющих почти что минимальный контакт с областью, не занятой твердым веществом. Эта область составляет около половины объема кристалла-она непрерывна, заполнена растворителем, аналогичным основной массе жидкости, и состоит из каналов, способных вместить молекулы соединений с молекулярной массой более 4000 [354. С. 257]. Полностью исключить возможность отклонения структуры белка в кристалле от структуры в растворе тем не менее нельзя. Но несомненно и то, что в большинстве случаев изменения могут коснуться только положений некоторых боковых цепей в областях контактов на периферии глобулы. Вероятность, что конформационные нарушения произойдут, и произойдут именно в активном центре, невелика, конечно, в том случае, когда кристаллизация осуществляется в условиях, близких к тем, при которых фермент или другой белок проявляет активность. При идентичности структур фермента в кристалле и растворе различия в эффективности катализа могут быть обусловлены лишь разными условиями диффузии субстрата и продуктов реакции и стерическими затруднениями для конформационных перестроек активного центра. Дж. Рапли по этому поводу замечает "...кристаллический белок обладает ферментативной активностью, и, хотя его свойства несколько отличаются от свойств растворенного белка, сам факт каталитического действия кристаллического фермента служит достаточно убедительным аргументом против предположения о большом изменении конформации в процессе кристаллизации [354. С, 271]. Таким образом, можно заключить, что рентгеноструктурные данные почти всегда правильно отражают укладку основной цепи белка и, как правило, буквально воспроизводят биологически активную конформацию. Поэтому все, что говорится Меклером и Идлис о "жидком" и "твердом белке, по моему мнению, представляется глубоко ошибочным и выглядит не более, чем попыткой спасти идею стереохимического кода. Неудачно также отождествление жидкого" белка с "расплавленной глобулой". Трудно предположить, что короткоживущее промежуточное состояние, которое возникает на последней стадии свертывания полипептидной цепи и о котором пока имеется лишь туманное предствление, является активной формой белка, способной функционировать длительное время. [c.538]

    Такой порядок абсолютной величины АСобщ процесса свертывания был найден экспериментально для большого числа белков, содержащих около 150 остатков [413]. Для оценки АСобщ привлекались скорости водородного обмена в состояниях N и К [414— 416], калориметрические данные процесса деструктурирования цепн, данные, полученные из кривых денатурации (см. обзор в [413]), а также константы равновесия К между нативной и случайной конформациями, найденные при иммунологических исследованиях [418]. Поскольку величина АС дщ мала, любые энергетические расчеты, преследующие цель установления корреляции между ковалентной и геометрической структурами белка, должны быть исключительно точными, чтобы дать значимые результаты. Поскольку невалентные связывающие силы в белке поняты еще ие достаточно, достичь такую точность пока еще трудно (гл. 3). Нужно отметить также, что константа равновесия очень чувствительна к температурным изменениям. [c.180]

    Дополнительное биологическое приспособление для поддержания полисахаридных цепей в упорядоченной конформации имеется в полисахаридах с прерывающейся периодичностью строения (см. разд. 26.4.3.1). В таких структурах блоки периодичных последовательностей, имеющие склонность к конформационному упорядочению, прерываются модифицированными последовательностями, конформационно неупорядоченными и потому растворимыми. Тенденция упорядоченных сегментов уходить из раствора из-за легкости их агрегации или энтропийных факторов противостоит тенденции неупорядоченных сегментов оставаться в контакте с растворителем. Если упсрядоченное состояние образовано двумя или более полисахаридными тяжами, то возникает сетчатая структура, в которой также имеются топологические ограничения для агрегации упорядоченных сегментов. Некоторые типы конформационного упорядочения, которые, как было показано, ответственны за образование в этих последовательностях областей связывания, показаны на рис. 26.4.1. Более детальные сведения об упорядоченных конформациях полисахаридов, которые были описаны для растворов и гелей, приведены в обзорах [3, 5]. [c.298]

    В обзоре Р. Л. Авояна и др. (1960 г.) подробно описаны исследования пространственных затруднений и конформаций в ароматических молекулах. [c.372]

    Модель, изображенная на рис. 1.1, является грубой, но удобной. При более точном подходе, принимая во внимание все валентные углы, цепь пожно представить в виде последовательности звеньев. При этом следует учесть правильные статистические веса для транс- и гош-конформаций или их обобщений и даже статистические отклонения от идеальных транс- и гош-состояний. Полный обзор вычислений этого типа содержится во второй книге Флори [3]. [c.30]

    Пытаясь ответить на этот вопрос, мы должны признать, что размер циклической системы и общий вид молекулы — наиболее важные факторы, определяющие отличие свойств циклической системы от ациклической. Наличие циклической системы придает некоторую напряженность молекуле, которая может отсутствовать в ациклической модели. Чем больше эти напряжения, тем более вероятны различия в свойствах циклических и ациклических систем. П1бкие молекулы предпочтительно принимают конформации, при которых связывающие взаимодействия максимальны, а отталкивающие, несвязывающие взаимодействия сведены к минимуму. В этих конформациях существуют нормальные углы и длины связей, которые не меняются в значительной степени при переходе от одного соединения к другому, а также предпочтительное расположение заместителей, как, например, зигзагообразное расположение атомов водорода и алкильных групп у соседних атомОв углерода. Если наличие циклической системы заставляет молекулу принимать конформацию, при которой эти предпочтительные характеристики не достигаются, то молекулу следует считать напряженной (обзор см. [1)). Она будет все же стараться принять такую конформацию, при которой притягивающие (связывающие) взаимодействия будут максимальны, а отталкивающие — минимальны, но это потребует больших затрат энергии, чем в случае ациклической модели. [c.53]

    В книге сделан обзор работ по применению ЯМР-спектро-скопии высокого разреимения для изучения структуры синтетических и биологических полимеров. Кратко изложены основы метода ЯМР рассмотрена изомерия в полимерных цепях. Подробно описаны спектры синтетических полимеров и дана их интерпретация с целью определения структуры, стерео-химической конфигурации, конформации и механизма роста цепи. Обсуждаются спектры винильных полимеров, а также полидиенов, полимеров, получаемых при раскрытии циклов, и других типов полимеров. Большое внимание уделено природным полимерам (полипептидам, белкам, нуклеиновым кислотам) и малым молекулам — моделям рассматриваемых биополимеров. [c.4]


Смотреть страницы где упоминается термин Конформация обзор: [c.107]    [c.107]    [c.127]    [c.129]    [c.133]    [c.209]    [c.211]    [c.303]    [c.9]    [c.166]    [c.240]    [c.241]    [c.498]    [c.79]    [c.112]    [c.164]    [c.438]    [c.226]   
Водородная связь (1964) -- [ c.145 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Обзоры



© 2025 chem21.info Реклама на сайте