Аденин спектры

С помощью рентгеновских спектров было установлено, что дезокси-нуклеиновые кислоты, ио-видимому, представляют собой двойные молекулы , состоящие из двух цепей, одна из которых винтообразно обвивает другую. Основания, входящие в состав одной цепи, связываются водородной связью с основаниями другой (например, гуанин с цитозином, аденин с тиминам). Дезоксинуклеиновые кислоты, вероятно, составляют основу или существенную часть генов. Они всегда содержатся в хромосомах, но отсутствуют в других частях клеток. [c.1049]

Рис. 15.3. Спектры ПМР (100 МГц) 5%-ных растворов пурина (а), аденина (б) и гуанина (в) в ОаО при 25 °С [8].

Еще в начале нашего века, когда из клеточных ядер выделили нуклеиновую кислоту (ее и назвали от слова нуклеус — ядро), обратили внимание на то, что она поглощает ультрафиолетовые лучи, не очень далекие от видимых. Впоследствии выяснилось, что за это поглощение ответственны азотистые основания — те самые ура-цил, цитозин, аденин, которые уже упоминались. А теперь допустим, что наш химик синтезирует как раз производные урацила. Берет он для начала сам урацил, растворяет точно отвешенные 1—2 миллиграмма в измеренном количестве воды и записывает УФ-спектр. Оказывается, что урацилу присуща сильная полоса поглощения, причем сильнее всего поглощается свет с длиной волны 256 нм (эта величина называется максимум поглощения). [c.151]

Впрочем, иной раз даже и не зная точного происхождения полос, можно исследовать с их помощью явления чрезвычайно важные. Так, известно, что двойная спираль ДНК удерживается за счет образования связей между парами оснований аденин—тимин и гуанин — цитозин. Первоначально доказать это удалось с великим трудом. Между тем есть возможность подтвердить это очень простым и наглядным экспериментом. Дело в том, что эти пары соединений настолько удачно стыкуются друг с другом, что немедленно образуют комплексы даже при простом смешении их растворов. Поэтому в ИК-спектре смеси гуанина с цитозином появляются полосы 3300 и 3488 см , которых нет в спектре ни одного из оснований. Если же изучить, как зависят высоты этих полос от отношения концентраций взятых веществ, оказывается, что по мере добавления, скажем, цитозина к гуанину они вначале растут, а потом остаются постоянными. Причем достигается этот максимальный уровень именно тогда, когда концентрации оснований равны. Итак, полосы сообщают интересные сведе- [c.157]

Выше (см. стр. 240) уже отмечалось, что изомерные динуклеозидфосфаты различаются по дисперсии оптического вращения и круговому дихроизму. Спектры ЯМР дают основания полагать что в ApU остаток урацила перекрывается с шестичленным циклом остатка аденина, тогда как в UpA такое перекрывание происходит с пятичленным циклом остатка аденина. Этот вывод согласуется с данными по титрованию указанных изомеров кислотами и щелочами 8. Определенные в этом случае константы ассоциации для UpA и ApU оказались равными соответственно 0,05 и [c.244]

Спектры денатурации РНК позволяют также приближенно оценить содержание пар гуанин цитозин и аденин урацил в двухспиральных участках, если пренебречь малым вкладом, вносимым в спектры односпиральными участками [c.289]

Из экспериментов со смешанными спиралями сополимера АУ и полимеров поли-У и поли-А получены новые данные, касающиеся спаривания оснований. Одноцепочечный сополимер АУ представляет собой цепочку, составленную из аденина и урацила, соединенных в случайной последовательности. Были получены образцы сополимера АУ с различными отношениями А У. Во всех случаях при образовании смешанной спирали с поли-А или поли-У минимум поглощения в ультрафиолетовой области спектра наблюдался при одинаковом числе комплементарных оснований в сополимере и гомополимере, но не при равном количестве молекул того и другого компонентов. Таким образом, имеет место соотношение 1 1 между комплементарными основаниями двух полимеров, а не между их молярными содержаниями. Аналогичные результаты были получены для трехцепочечной спирали (АУ-ЬУ-ЬУ). В этом случае число остатков урацила в гомополимере в 2 раза больше числа остатков аденина в сополимере. Очевидно, остающиеся без пары основания (например, урацил в сополимере АУ в последнем примере) должны образовывать петли, выходящие из структуры двух- или трехцепочечной опирали. Анализ модели показывает, что выходящая из спирали петля может быть образована даже всего лишь одним основанием. Считают, что такие петли играют важную роль в структуре РНК. Благодаря им может также сохраняться двойная спиральная структура ДНК при выпадении или включении оснований в одной из цепей. [c.348]

Этен-номенклатурное название С2Н4 его тривиальное название-этилен.) Соединения с циклическим расположением атомов, имеющие делокализованные, бензолоподобные кратные связи, называют ароматическими. Дакрон, нафталин, ДДТ, аденин и рибофлавин (см. рис. 21-1 и 21-3) содержат ароматические группы. На примере аденина и рибофлавина видно также, что углерод способен образовывать двойные связи с азотом и что азот может принимать участие в образовании ароматических циклов с делокализованными кратными связями. Многие разделы органической химии связаны с особыми свойствами систем, включающих ароматические циклы. Ароматические молекулы и комплексные соединения переходных металлов являются двумя важнейшими классами соединений, в которых энергия, необходимая для возбуждения электрона, приходится на видимую часть спектра. Поэтому практически все красители представляют собой такие соединения и принимают участие в механизмах захвата и переноса энергии фотонов. [c.270]

Его эмпирическая формула J-H2lN409P температура плавления 215° С [а] )=-Н44,5° (в соляной кислоте). В воде растворим в 200 раз более, чем рибофлавин. Его спектр поглощения (в воде) имеет максимумы при длине волны 442 372 268 222 нм. Применяется для внутривенной инъекции в медицинской практике [24]. Синтез РМФ см. стр. 132. Из наиболее сложных флавиновых коферментов следует отметить рибофлавинадениннуклео-тид, представляющий собой соединение пирофосфатной связью фосс юрного эфира рибофлавина и фосфорного эфира аденин-М-рибозида (адениловой кислоты). Он входит в состав желтого окислительного фермента, диафора-зы II. Строение кофермента доказано синтезом его из аденозин-5-фосфата [c.109]

В ФМН группой R является водород, в ФАД — нуклеотид аденин. Флавиновые коферменты окрашены, они имеют желтооранжевый цвет, так как рибофлавин, содержащий сопряженную трехкольцевую систему, поглощает свет в видимой области спектра. [c.96]

Раств-сть р. HjO. Циклонуклеотиды более уст. к кисл., чем нециклические монофосфаты. В 1 М HQ при 100 °С время выделения 50% аденина для циклофосфата 30 мии и для адено-зин-2 (3 - илн 5 )-фосфата 2-4 мин. 0,2 М Ва(ОН)2 при 1(Ю°С за 30 мин полн. гидрол. циклофосфат до смеси З -АМР и 5 -АМР (5 1). Синтезируется аденилатцшслазой в ответ на некоторые гормональные стимуляторы действует как второй посредник при клеточном гормональном контроле путем стимуляции протеинкиназ. Спектр pH [c.74]

Бел. гигр. порошок запах меркаптанов. рК 4,0 (NHj аденина) 6,4 (РО4) 9,6 (SH). Раств-сть р. HjO н. р. ац., эф., EtOH. Спектр при pH 2,5 11,0 259,5 им, с 16 800. Хранить в сухом виде при —20°С свободная кисл. мо жет разл. на 5% за 6 мес. Li-соль заметного разл. пе наблюдается. Очищенное в-во может содержать некоторые смешанные дисульфиды, особ, i глу 1 атионом. Раств. неусг. при pH > 7 за 24 ч при pH 8 и 25 С теряется -II" активности. Отн. ) ст. при pH 2 — 6 хранить замороженными. Легко окисл возд. до неактивного дисульфида тиольная гр. может быть регенерирована добавлением избытка тиолсодер-жащих соединений. [c.106]

Весьма подробно изучены ультрафиолетовые спектры пуринов [2—5]. Наиболее точные данные можно найти в статье [6], которая содержит сводку ранних работ с библиографией. Сопоставление данных ультрафиолетовых спектров пурина, аденина, 6-метоксипурина, 6-хлорпурина, 9-метилгипоксан-тина, 9-этилгуанина и 2,6-диаминопурина позволяет предположить, что электронное состояние простейших замещенных пуринов подобно таковому для бензола. Классификация спектральных полос основана на экспериментальных данных о влиянии изменения поляризации и pH среды на ультрафиолетовые спектры. [c.208]

Химические сдвиги пуринов, не содержащих аминогрупп, измеренные в трифторуксусной кислоте, коррелируются с с коэффициентом корреляции, равным 0,995. Значения разности химических сдвигов протонов у 2 и Сз использованы [12] для установления расположения заместителей в положении 3 у различных N-замещенных аденинов. Подробно исследовано влияние концентрации растворов на спектры ЯМР пурина и 6-метилпурина [13]. Установлено, что концентрационная зависимость ЯМР-спектров является функцией температуры и природы растворителя. На основании этих данных предположено, что в концентрированных растворах этих соединений имеет место частичная ассоциация молекул с образованием слоев из колец в вертикальном направлении. [c.209]

Для пуринов подробно изучены и обсуждены инфракрасные спектры [8, 16—21], которые подтверждают, что оксипурины в твердом состоянии в основном существуют в амидной форме [2], а меркаптопурины — в тионной 12, 18]. На основании данных ИК-спектров можно сделать вывод, что у гуанина в твердом состоянии преобладает кетоаминная структура, а у аденина — аминная [20]. [c.209]

В 1894 г. Крюгер [1], изучая алкилирование аденина хлористым бензилом в присутствии едкого кали, получил монобензиладенин неизвестного строения. В отсутствие щелочи было выделено в виде хлорида дибензильное производное. В настоящее время строение этих бензиладенинов установлено с помощью встречного синтеза [2—4]. Дибензильное производное охарактеризовано ультрафиолетовым спектром [2]. Крюгер [1] также нашел, что свинцовая соль аденина дает с иодистым метилом монометильное производное, однако строение его он также не установил. Метилированием гипоксантина им был получен диметилгипоксантин, которому была приписана структура I. Эта старая работа никем не была проверена. [c.288]

Вследствие большого значения природных и синтетических веществ этого типа ИК-спектры пуринов (399) широко изучались. В том числе исследовались пурин [20, 947], 6-аминопроизводные (аденины) [20], хлорпурины [617], 2- и 6-аминопроизводные [618, 947], тиоалкильные производные [44], аДенозинфосфаты [153, 555], полиадениловая кислота [623]. [c.604]

Наиболее важное свойство определенных коферментов заключается в их способности к обратимому восстановлению. Варбург установил, что при этом происходит восстановление никотинамидного кольца никотинамид-аденин-динуклеотида. Восстановление НАД и НАДФ приводит к заметным изменениям в спектре поглощения этих веществ (см. фиг. 50). Эти изменения впервые наблюдал Варбург. Аналогичные спектральные изменения происходят, когда НАД участвует в реакциях присоединения. Так, цианид реагирует с НАД, образуя соединение с максимумом спектра поглощения при 327 ммк, который можно сравнить с максимумом восстановленного НАД при 340 ммк. Диоксиацетон реагирует с НАД, образуя соединение с максимумом спектра поглощения при 340 ммк. Никотинамидное кольцо может существовать как резонансная система с положитель- [c.61]

Восстановление пиридиннуклеотидов можно легко проследить по увеличению оптической плотности при 340 ммк. На фиг. 50 приведены спектры поглощения окисленного и восстановленного НАД. Окисленный и восстановленный НАДФ имеет такие же спектры поглощения. Большой пик при 260 ммк у окисленной формы обусловлен главным образом аденином, хотя в поглощении при этой длине волны участвует и окисленное никотинамидное [c.207]

Реагенты, способные реагировать со свободными аминогруппами. В качестве такого реагента в химии нуклеиновых кислот часто используется формальдегид он реагирует со свободными аминогруппами цитозина, гуанина и аденина, образуя соответствующие оксиметильные производные (или — после дегидратации — шиффовы основания). Эта реакция сопровождается изменением спектра поглощения (смещением максимума в сторону длинных волн и усилением поглощения в области максимума) поэтому ее можно прослеживать спектрофотометрически. Все основания двухцепочечной ДНК в ее нативной конформации, а также больший или меньший процент оснований в других упорядоченных полинуклеотидах защищены от этой реакции, т. е. не реагируют с формальдегидом, если соблюдаются определенные меры предосторожности (нейтральное значение pH, низкая температура, низкая концентрация), сводящие к минимуму конформационные изменения, которые могут происходить даже в условиях, когда новые ковалентные связи не образуются. [c.145]

Доводы в пользу существования других протонированных форм аденина как основания, отличающихся от упомянутой выше основной формы (протонирование по N-1), были недавно приведены 8 на основании изучения спектров флуоресценции метилированных производных аденина при pH 2. Был сделан вывод, что в данном случае протонирование по N-1, хотя и имеет место, однако не объясняет явления флуоресценции, поскольку l-N-мeтилaдeнин, [c.181]

Тот же вывод, но с еще большей очевидностью следует и из спектров ЯМР смесей нуклеозидов и их аналогов в различных растворителях . Так, если гуанозин с цитидином сильно взаимодействуют в диметилсульфоксиде, то взаимодействие между 9-этиладенином и 1-циклогексилурацилом удается наблюдать лишь в малополярных растворителях, например в дейтерохлороформе . Тем не менее и в этом случае специфичность взаимодействия сохраняется. Следует отметить, что при высоких концентрациях наблюдается также незначительная гомоассоциация производных аденина и гуанина. [c.221]

Легко видеть, что при 255 и 270 ммк вклад в изменение спектра от разрушения пар аденин-урацил и гуанин - цитозин при денатурации одинаков, в результате чего при денатурации изменение оптической плотности тРНК в этих точках не должно зависеть от нуклеотидного состава РНК-Гипохромный эффект при 255 ммк, вызванный разрушением пар оснований, может быть оценен по данным плавления двухспиральных комплексов (поли-А)-(поли-и) и (поли-С) (поли-С). Процентная [c.288]

Оценка количества спаренных оснований в молекуле 5S РНК проведена несколькими способами. Исходя из различий гипохромии при 255 ммк 306 нативной и обработанной формальдегидом 5S РНК из Е. соН (см. стр. 288), было сделано заключение о том, что в двухспиральные участки входит от 63% до 67—72% от общего числа нуклеотидов молекулы. Оценка относительного содержания комплементарных пар оснований аденин урацил и гуанин-цитозин з , проведенная по спектрам денатурации (см. стр. 288), дает величину 60—70% пар гуанин цитозин. При окислении адениновых ядер молекулы 5S РНК из Е. соИ моноперфталевой кислотой при 20° С реакционноспособными оказываются только 43,7% оснований, т. е. 23 адениновых звена, что согласуется с количеством пар аденин урацил, оцениваемым на основании спектров денатурации 3 . Таким образом, для 5S РНК, как и для тРНК, наблюдается высокая степень спирализации молекулы. [c.299]

Спектры ЭПР других облученных оснований (аденина, гуанина, урацила, цитозина) представляют собой синглеты, иногда с очень слабо разрешенной СТС [216] (рис. VI, 19, б—д). В облученных ну-клеозидах и нуклеотидах спектры ЭПР радикалов идентичны спектрам облученных оснований. Радиационный выход радикалов при облучении азотистых оснований лежит в пределах 0,1—1,5 1216], при облучении /)-рибозы при 300° К он равен 4 -f- 6, при 100° К G (R) = 2 -ь 4 (табл. VI.4). [c.311]

Точно так же, как высокая поляризуемость симметричных водородных связей с двумя минимумами вызывает непрерывное поглощение в ИК-спектрах растворов, меньшая поляризуемость несимметричной водородной связи с перегибом на потенциальной кривой или с двумя минимумами является причиной ушире-ния полос. Иногда такое уширение наблюдается, например, для валентных колебаний ЫН, образующих водородную связь. Фол-дес и Сандорфи [237], рассматривая ангармоничность колебаний связи МН" -М, пришли к заключению, что потенциальная кривая имеет именно такой вид. Шульман [238] считает, что в полинуклеотидах несимметричная потенциальная кривая имеет место для водородной связи между атомами N(3) тимина и N(1) аденина (см. также разд. V. 17). Сильное уширение в действительности наблюдается для полос валентных колебаний ЫН-группы, образующей указанную водородную связь, так же как [c.299]

Ультрафиолетовые спектры поглощения ксантозина отличны от спектров 7-метилксантина (а также от спектров 1- или З-метил-ксантина) и они довольно близки к спектрам 9-метилзамещенных ксантина. Аналогично ультрафиолетовые спектры поглощения аденозина, инозина и гуанозина очень близки к спектрам 9-метил-аденина, 9-метилгипоксантина и 9-метилгуанина соответственно, но не похожи на спектры 7-метилпроизводных [30—32]. Эти результаты ясно показывают, что пуриновые нуклеозиды представляют собой 9-рибозилпурины это справедливо также для дезоксиаденозина и дезоксигуанозина, так как ультрафиолетовые спектры этих веществ почти идентичны со спектрами аденозина и гуанозина. Подтверждением того, что в пуриновых нуклеозидах сахар находится в положении 9, служит однозначный синтез 9-0-манно-пиранозиладенина, проведенный Тоддом с сотрудниками [33]. При периодатном окислении этого нуклеозида образуется диальдегид, идентичный диальдегиду, полученному из аденозина. [c.18]

Исследования дисперсии оптического вращения указывают на то, что в водном растворе полифосфатная цепь аденозин-5 -трифосфата может изгибаться с образованием связи между р- и уфосфатными группами и аминогруппой аденина [26]. Хотя ионы кальция и магния при pH 7 не влияют на оптическую симметрию молекулы, под действием ионов цинка, по-видимому, образуется конформация, стабилизированная 2п-хелатными связями между концевой фосфатной группой и заместителем в положении 6 пуриновых или пиримидиновых пирофосфатов и трифосфатов, но не 5 -монофос-фатов [27]. Кривые спектрального титрования в присутствии или в отсутствие ионов магния показывают, что в растворе нуклеозид-5 -трифосфаты существуют, вероятно, в свернутой конформации, в которой ион Mg координационно связывает пирофосфатную структуру с гетероциклическим основанием. Небольшие сдвиги в сторону более низких значений рКкажущ в присутствии ионов (приблизительно на 0,3 единицы) найдены для трифосфатов, но не обнаружены для нуклеозидов [28]. Однако на основании спектров ядерного магнитного резонанса можно предположить, что хелатная конформация маловероятна и что комплекс металл — АТФ в растворе имеет вытянутую форму [29]. Полученные данные указывают также, что в образовании комплексов с магнием и кальцием принимают участие Р- и у-фосфатные группы [30]. [c.189]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология