Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Тирозин связывание

    Окисление тирозина (%) Связывание фенолов (в. мкг/г печени) [c.388]

    Рнс. 7. Связывание глицил-/.-тирозина (строение его молекулы показано жирно) в активном центре карбоксипептидазы А (сравни с рис. 5) [15] [c.20]

    Бросается в глаза высокое содержание гидрофобных аминокислот лейцина, изолейцина, тирозина и наличие всего одного остатка пролина. Связывание углеводной части осуществляется, по всей вероятности, через N-гликозидную связь с остатком аспарагина-80 либо через О-гликозидную связь с остатками треонина или серина [c.431]


    Рис. е.И. Структура комплекса карбоксипептидазы с глицил-Ь-тирозином, Арг 145. Тир 248 и Глу 270 показаны до связывания субстрата (пунктир) и после него [c.378]

    Для пептидных гормонов характерно наличие двух сайтов, отвечающих за биологический эффект участка связывания с рецептором и участка, ответственного за формирование и передачу сигнала. Для окситоцина сайтом связывания с рецептором является аминокислотный остаток изолейцина в третьем положении. Участок формирования и передачи сигнала соответствует тирозину во втором положении. [c.150]

    При изучении эффекта Керра [119], а также при исследовании спектров флуоресценции 7-глобулина [1201 показано, что 90% ароматических остатков спрятаны внутри глобулы и находятся в гидрофобном окружении. При подробном изучении дифференциальных УФ-спектров 7-глобулина Окуловым и Троицким [1211 обнаружено, что примерно 17 остатков тирозина (из 56) и 3 остатка триптофана (из 22) расположены на поверхности нативной глобулы 7—8 тирозинов расположены в щелях глобулы и больше половины тирозинов (31—32) и подавляющая часть триптофанов находятся внутри глобулы. Авторами было замечено, что при pH 3 молекула 7-глобулина может набухать , что приводит к повышению доступности хромофоров без разрушения упорядоченных структур молекулы. Это, вероятно, связано с частичным разрушением глобулярной (третичной) структуры без нарушения вторичной. Если при этом частично или полностью разрушаются гидрофобные области, то естественно, что связывание углеводорода должно уменьшаться. Вероятно, такое поведение (существование частично развернутой формы белка) при изменении pH присуще всем глобулярным белкам. Однако для обнаружения этих форм недостаточно изучения только вязкости и оптической активности. Очень важную информацию может дать исследование связывания углеводородов. Дальнейшее увеличение заряда с изменением pH среды приводит белковую молекулу к состоянию, соответствующему полной дезорганизации глобулы, разрушению ее третичной и вторичной структуры, т. е, к состоянию клубка. [c.26]

    Водородные связи между боковой группой К и полипептидной цепью. Эти водородные связи также следует принимать во внимание при оценке структуры белка. В качестве примера на рис. 27.1 показано Н-связывание между гидроксигруппой фрагмента тирозина и карбонильной группой полипептидной цепи. [c.524]

    Образовавшиеся в кишечнике под действием бактерий ядовитые продукты распада тирозина - крезол и феиол — после всасывания обезвреживаются в печени, в которую оттекающая от кишечника кровь попадает через систему воротной вены. Обезвреживание фенола и крезола может происходить двояким путем либо посредством связывания их с серной кислотой, либо путем соединения их с глюкуроновой кислотой. [c.337]


Рис. 19. Специфическое взаимодействие при связывании глицил-Ь-тирозина с КПА по данным разностного синтеза Фурье. Рис. 19. <a href="/info/32737">Специфическое взаимодействие</a> при <a href="/info/696754">связывании глицил</a>-Ь-тирозина с КПА по данным <a href="/info/141160">разностного синтеза</a> Фурье.
    Несмотря на то что в растворе Си(П)-замещенный фермент связывает субстрат [85], этот аналог КПА не обладает ферментативной активностью. Однако методом рентгеноструктурного анализа при низком разрешении комплекса Си(П)КПА с глицил-ь-тирозином показано, что при связывании субстрата отсутствуют конформационные изменения глутамата-270 (рис. 19). Это наблюдение подтверждает, что при Си(П)-замещении изменяются стерические [c.87]

    На этом примере видны некоторые важнейшие черты, свойственные большому числу ферментов. Во-первых, катализатор имеет как бы два центра—связывающий (контактный) и собственно каталитический. Один из них, представленный в рассмотренном случае протонированной гуанидиновой группой и тремя гидрофобными радикалами, обеспечивает образование комплекса фермент — субстрат (связывание субстрата ферментом), в результате чего расщепляемая связь направляется на каталитический центр. Собственно каталитический центр представлен в рассмотренном случае ионом цинка и оксигруппой тирозина. [c.326]

    Сорбция субстрата в активном центре а-Х, обеспечивается гвдрофобной полостью. Ее размеры 1,0x0, 5x0,4 нм оптимальны для связывания боковых цепей остатков гвдрофобных аминокислот (триптофан, фенилаланин, лейцин, тирозин), а конфигурация допускает лишь определенную ориентацию субстрата. Механизм каталитич. гвдролиза включает стадию сорбции субстрата, расщепления пептвдной связи с образованием ацилфермента и послед, переноса ацильной фуппы на нуклеоф. акцептор. [c.263]

    Объяснение этого явления, как оказалось, совершенно не связанного с химическим механизмом, состоит в следующем [61]. Если заместитель гидрофилен (Х = СОМе, +КМез), (41) является нормальным субстратом. В случае же гидрофобного заместителя (Х = С1) ароматическое кольцо уходящей группы связывается в ароматическом центре связывания субстрата на ферменте лучше, чем остаток тирозина, что, безусловно, может привести к существенному изменению эффективности катализа. [c.496]

    Обнаружено, что существенная для связывания карбоксильная группа субстрата образует солевой мостик с гуанидиновой группой аргинина-145, тем самым, а также предпочтительными положениями связывания боковых радикалов, приводя подлежащую расщеплению амидную связь в контакт с атомом 2п. Теперь единственными другими функциональными группами, близкими к этой амидной связи, являются карбоксильная группа глутаминовой кислоты-270, которая (как и аргинин) сдвигается на 0,2 нм по сравнению со свободным ферментом, и фенольный гидроксил тирозина-248. Последняя группа не является одной из пяти групп, которые, как полагают, обычно участвуют в ферментативном катализе. Имеются также химические доказательства важности тирозина в карбоксипептидазе. Примечательно наблюдение, что эта группа не содержится вблизи цинка активного центра нативного фермента. Связывание глицил-тирозина, однако, вызывает весьма существенный конформационный сдвиг, в процессе которого фенольная группа тирозина-248 сдвигается не менее, чем на 1,2 нм с поверхности белка к новому положению вблизи пептидной связи субстрата. В результате этого движения происходит закрывание углубления, в котором находится активный центр, так что последний, по-видимому, не находится более в равновесии с растворителем. [c.502]

    Хотя выдвинутая Фишером гипотеза ключа и замка оказалась весьма плодотворной и объясняет многие общие закономерности субстратной специфичности, по мере накопления в последние годы детальной информации о взаимодействиях типа фермент-молекула ее недостатки становились все более очевидными. В буквальном смысле эта теория подразумевает наличие жесткого центра связывания. В то же время имеется большое число данных, как рентгеноструктурных, так и прямых спектрофотометрических и кинетических исследований ферментов в растворе, о конформационной мобильности белков. Мы видели, что тирозин-248 карбоксипептидазы при связывании глицилтирозина сдвигается не менее чем на 1,2 нм, явно меняя природу и форму как участка связывания, так и каталитического центра (см. разд. 24.1.3.4). Это, возможно, крайний случай, однако при наличии рентгеноструктурчых [c.515]

    Многочисленные белки связывают ионы металлов. Некоторые из них действуют как биологические хранилища металлов, в то время как другие служат для их транспорта. Ферритин запасает железо, главным образом в печени и селезенке, в виде оксигидро-ксифосфата Fe(HI) с приблизительным составом Fe(OOH)s, FeO, РО4Н2. Это соединение образует ядро диаметром 7 нм, окруженное 24 белковыми субъединицами, давая в результате сферическую молекулу общим диаметром около 12 нм. Трансферин, с другой стороны, является белком плазмы, переносящим ионы Fe + и Си +. Имеются данные, что в состав центра связывания металла входят тирозин и гистидин. Так, в спектре поглощения белка и-меется пик при 465 нм, соответствующий переносу заряда между фенолят- и Ре +-ионами. [c.561]


    Метод афинной модификации центров связывания IgG можно проиллюстрировать несколькими примерами. Ион ж-нитробензо-диазония, близкий по размерам к лг-динитробензолу, реагировал с антителами свиньи, выработанными против 2,4 динитрофениль-ного гаптена, присоединяясь к боковым радикалам Туг-33 Н-цепи и Туг-33 и Туг-313 L-цепи антитела. Л -Бромацетил-(л1-арсанилазо)-L-тирозин (16) реагировал с боковым радикалом Lys-59 Н-цепи [c.566]

    Пуромицин является структурным аналогом тирозинил-тРНК. Связываясь с аминоацильным центром рибосомы, он тормозит связывание новой аа-тРНК на стадии элонгации синтеза белка. [c.541]

    Этим функции белка как фермента или апофермента скорее всего не исчерпываются. Все рассмотренные ме-чанизмы предполагали достаточно статичное расположение функциональных групп белка в активном центре Это не совсем верно. Взаимодействие с субстратом нередко сопровождается изменением конформации белковой молекулы, и согласно теории, выдвинутой Кошландом, направленные конформационные изменения белка являются важным фак1чэром ферментативного превращения. В отдельных случаях такие изменения зарегистрированы с помощью рентгеноструктурного анализа. Например, карбоксипептидаза А была подвергнута рентгеноструктурному анализу как в отсутствие субстрата, так и в комплексе с глицил-1/-тирозином. Полость, в которой находится активный центр, существенно сужается при связывании этого субстрата, т.е, наблюдается отчет ливый конформационный переход. Кроме того, широко дискутируется и имеет в отдельных случаях убедительные подтверждения гипотеза, согласно которой фермент фиксирует субстрат в конс юрмации, существенно более близкой по своей геометрии к активированному комплексу реакции, чем конформация субстрата, преобладающая у несвязанных молекул. Это, естественно, должно приводить к снижению активационьюго барьера реакции и способствовать существенному ускорению превращения. [c.208]

    Молекулярный вес окситоцина равен 1007. В результате гидролиза получаются по 1 молю следующих аминокислот, относящихся к ряду L цистина, тирозина, изолейцина, глутамина, аспарагина, пролина, лейцина и гликоколя. Окситоцин представляет собой нонапептид (если считать цистин за два остатка цистеина). В результате расщепления окситоцина на более простые пептиды был установлен способ связывания этих аминокислот в молекуле они образуют единую пептидную цепь, обладающую одним цистеииовым остатком у одного конца и остат- [c.412]

    Для связывания белков наиболее часто используют такие группы молекулы белка, как N-концевая а-аминогруппа и s-ами-ногруппа лизина, а также С-концевая карбоксильная группа и карбоксильные группы глутаминовой и аспарагиновой кислот. Фенольные гидроксильные группы тирозина или SH-группы остатков цистеина могут также принимать участие в связывании. В углеводах и их производных чаще всего в связывании принимают участие гидроксильные и аминогруппы, в нуклеиновых кислотах — фосфатные группы, гидроксильные группы сахара и амино- или енольные группы оснований. Высокомолекулярные соединения, которые обладают большим числом групп, способных связываться, присоединяются несколькими участками. Вследствие этого значительно уменьшается риск отщепления связанной молекулы, однако многоточечное связывание может приводить к деформации нативной структуры иммобилизованной молекулы и таким образом изменять ее свойства. Иногда применяют методы более лабильного связывания, например через тиолсложноэфир- [c.231]

    Применение. В микроскопии для связывания SH-rpynn, выявления и блр кирования тирозина и в качестве реактива иа аминогруппу. [c.139]

    При таком движении атом железа увлекает за со1бой и гистидиновый остаток Р8 боковой цепи, и амплитуда этого движения составляет примерно 0,75 А. Смещение затем передается другим частям белковой цепи, в котЬрую вхОдит Р8, и, в частности, происходит большой сдвиг фенольной боковой депи, содержащей тирозин Н02. А это в свою очередь вызывает различные смещения атомов в соседних субъединицах, что оказывает влияние на способность к связыванию кисл орода гем-групп а ми в них. Так, движение атома железа и гем-группы в. одной субъединице гемоглобина действует как спусковой механизм , который запускает в движение существенные структурные изменения в других субъединицах. Один из вопросов, который еще остается нерешенным в этой про блеме связывания кислорода гемоглобином, касается строения группировки Ре— Ог. Три возможных типа структуры показаны на рис. 31.5. Наименее реально линейное строение, и таких структур еще не обнаруживалось. Боковое расположение Должно быть таким же, как в простых комплексах кислорода с другими метал- [c.643]

    Продукт присоединения X устойчив к нагреванию (100° С, 15 мин) и к действию кислот (6 н. соляная кислота), но расщепляется при обработке 0,1 н. раствором NaOH. 5-Цистеин включается при облучении в поли-U и РНК, в меньшей степени — в поли-С, поли-dT и ДНК. Включение резко уменьшается в случае двухспиральных полинуклеотидов. Урацил при облучении (253,7 ммк) способен также связываться с глицином, серином, фенилаланином, тирозином, триптофаном, цистином, метионином, гистидином, аргинином и лизином. Наибольший процент связывания обнаружен для цистеина, тирозина и фенилаланина Характер связи (за исключением цис. -еина) не установлен. [c.637]

    Во всех нормальных гемоглобинах и миоглобинах млекопитающих имеется дистальный гистидин, и первоначально предполагалось, что он играет существенную роль в обратимом связывании кислорода путем, например, образования водородной связи. Однако в настоящее время известны несколько мутантов, в которых гистидин Е7 замещен на другие аминокислоты, например на тирозин в а-цепях (НЬ М Boston) или -цепях (НЬ М Saskatoon) или аргинин (НЬ Zuri h) [8, 170]. Показано, что железо в аномальных цепях, по крайней мере во втором и третьем из названных мутантных белков, может связывать кислород, хотя для этих мутантов скорость [c.160]

    Конечно, прямой доступ к иону железа для лигандов закрыт аминокислотами, особенно дистальным гистидином. Как уже отмечалось, один из атомов азота имидазольного кольца гистидина обращен к железу, а другой фактически находится на поверхности, так что этот гетероцикл может работать как своего рода люк, перекрывающий лигандную полость. Поэтому связывание любого лиганда представляет собой сложный процесс, включающий промежуточные изменения конформации белка, например поворот гистидина Е7 вокруг его связи Са —Сз или небольшое искажение структуры спирали Е [161]. Тем не менее скорость связывания кислорода исключительно велика. Константа скорости реакции второго порядка при 20°С для различных миоглобинов находится в интервале 1,0-10 — 1,9-10 дм -моль с [определенные к настоящему времени значения свободной энергии активации для этих процессов составили в трех случаях 23,0, 23,0 и 29,3 кДж/моль (5,5, 5,5 и 7,0 ккал/моль) соответственно], а константы скорости для изолированных, но слегка модифицированных а- и 3-цепей составили 5-10 — 8-10 дм моль с , тогда как для мономерного гемоглобина hironomus получено более высокое значение 3-10 дм -моль 1-с [6]. Для гемоглобйнов кинетика реакции имеет сложный характер вследствие изменений четвертичной структуры, однако константы скорости и в этом случае попадают в интервал 10 — 10 дм моль с . Константы скорости отщепления кислорода составляют 10—70 с , а соответствующие энергии активации равны 80—88 кДж/моль (19—21 ккал/моль) для миоглобинов и 10— 15 с и 67—105 кДж/моль (16—25 ккал/моль) для большинства гемоглобйнов (эти значения сильно зависят от pH). Библиографию по этому вопросу см. в работе [8]. Даже если гистидин существенно уменьшает величину константы скорости, которая была в отсутствие белка, наблюдаемые скорости вполне достаточны для физиологических потребностей. Мутантные гемоглобины, в которых гистидин замещен на аргинин или тирозин, обнаруживают несколько более высокие скорости, особенно в реакциях с СО [8]. Некоторые гемоглобины с очень малыми константами скорости диссоциации ( 10 с 1), которые явно не могут функционировать как переносчики кислорода, встречаются у нематод [91]. [c.163]

    Иной подход к хроматографии пептидов на целлюлозных обменниках был предложен Янари с сотрудниками [8]. Еще в 1956 г. они описали фракционирование белков на целлюлозных ионитах системой Н2О—СО 2- Позже эта же идея была применена 1< хроматографии небольших синтетических пептидов. Используя небольшое различие в прочности связывания пептида целлюлозным анионитом в ОН-форме, элюцию проводят сначала просто водой, а затем водой, насыщенной СО2 (при 1 атм). В некоторых случаях этот прием позволяет получить хорошее разделение. Так, можно разделить глицин, диглицин и триглицин, отделить тирозин от 1-лейцил-1-тирозина и даже разделить стереоизомеры (1-лейцил- [c.185]


Смотреть страницы где упоминается термин Тирозин связывание: [c.260]    [c.398]    [c.322]    [c.445]    [c.264]    [c.46]    [c.559]    [c.566]    [c.708]    [c.171]    [c.171]    [c.579]    [c.190]    [c.191]    [c.145]    [c.152]    [c.553]    [c.449]    [c.232]    [c.77]    [c.944]    [c.431]    [c.161]   
Лабораторное руководство по хроматографическим и смежным методам Часть 2 (1982) -- [ c.0 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Связывание

Тирозин

Тирозин тирозин



© 2025 chem21.info Реклама на сайте