Олигомеры а-аминокислот

Зависимость скорости полимеризации от конформации молекулярной цепи синтетических полимеров впервые была показана на примере полимеризации Ы-карбоксиангидридов аминокислот с образованием полипептидов (см. с. 379). При этом экспериментально установлено, что реакция протекает в две стадии, различающиеся по скорости. Первая стадия протекает относительно медленно до тех пор, пока не образуется олигомер, способный свернуться в спираль, затем реакция идет [c.92]

В этой связи необходимо учитывать различное действие лигносульфонатов сульфитного щелока и сульфитно-дрожжевой бражки. Оно вызвано взаимодействием лигносульфонатов в процессе концентрирования при температуре выше 100 °С с присутствующими в сульфитно-дрожжевой бражке аминокислотами и олигомерами белковой природы. Образующиеся продукты конденсации остаются растворимыми и обладают повышенной поверхностной активностью. [c.241]

Установление вкладов, вносимых в термодинамические характеристики удерживания отдельными звеньями и функциональными группами молекул и олигомеров, весьма важно, поскольку они, как уже отмечалось выше, должны составить экспериментальную основу развития полу-эмпирической теории удерживания в жидкостной хроматографии. Отметим, что определение таких вкладов в случае белковых аминокислот позволило предсказывать времена удерживания (при определенных pH) ряда пептидов. [c.305]

Олигопептид - олигомер, в молекуле которого пептидными связями соединены фрагменты от трех до десяти а-аминокислот. [c.529]

Спектры олигомеров а-аминокислот с открытой цепью более сложны, чем опектры полипептидов, так как протоны всех аминокислотных остатков дают индивидуальные сигналы, положение ко- [c.324]

Мономолекулярные олигоамиды типа Н— [КН—(СНг)5С0] —ОН, где п = 2—25, получены аналогичным образом с использованием смешанных ангидридов К-замещенных аминокислот и диэфиров фосфорной кислоты, которые реагируют с аминогруппой олигомера, связанного с полимером-носителем [c.274]

Зависимость скорости полимеризации от конформации молекулярной цепи синтетических полимеров впервые была показана на примере полимеризации Ы-карбоксиангидридов аминокислот с образованием полипептидов (см. стр. 451). При этом экспериментально установлено, что реакция протекает в две стадии, различающиеся по скорости. Первая стадия протекает относительно медленно до тех пор, пока не образуется олигомер, способный свернуться в спираль, затем реакция идет с высокой скоростью с образованием высокомолекулярного полипептида. Присутствие в реакционной смеси изомерных аминокислот резко снижает скорость полимеризации. [c.104]

На рис. 14.18 приведено разделение соответствующих пар изомеров алкилбензолов и полиметилбензолов. Из рисунка видно, что селективность а для этих пар соединений непрерывно возрастает (главным образом, за счет возрастания специфического межмолекулярного взаимодействия адсорбат — элюент в ряду полиметилбензолов). Из измерений А (ДО) в этом ряду оценен вклад одной группы СНг в увеличение специфического взаимодействия адсорбат — элюент. Установление вкладов, вносимых в термодинамические характеристики удерживания отдельными звеньями и функциональными группами молекул и олигомеров, весьма важно, поскольку они, как уже отмечалось выше, должны составить экспериментальную основу развития полуэмпирической теории удерживания в жидкостной хроматографии. Отметим, что определение таких вкладов в случае белковых аминокислот позволило предсказывать времена удерживания (при определенных оН) ряда пептидов. [c.244]

Важным направлением является разработка катионных пленкообразователей, способных к электроосаждению из нейтральных или слабощелочных сред, что в известной мере может решить проблему коррозии оборудования. Их получают прививкой вторичных аминов, аминоспиртов и аминокислот к фенолам и фенолоальдегидным олигомерам в присутствии форм- [c.73]

Каждый домен способен выполнять свою функцию независимо от другого. С-концевой протеолитический фрагмент способен образовывать олигомеры. N-концевой фрагмент способен связаться с операторами, хотя и с более низкой эффективностью, чем интактный репрессор. Таким образом, информация для специфически контактирующей ДНК содержится в пределах N-концевого домена, но (так же как в случае с /ас-репрессором) эффективность процесса повышается при присоединении С-конце-вого домена. Вероятно, это происходит из-за способности интактного репрессора димеризоваться, что обеспечивает одновременное связывание с ДНК его двух N-концевых доменов. Выделенная N-концевая область осуществляет те же контакты с ДНК, как и интактный репрессор. Однако при удалении последних трех N-концевых аминокислот способность к некоторым из контактов утрачивается. На основе этого наблюдения была предложена модель, показанная на рис. 16.9, согласно которой основная часть N-концевой области осуществляет контакты на одной стороне ДНК, тогда как три последние N-концевые аминокислоты образуют контакты на противоположной стороне ДНК. [c.214]

Аминокислоты в белках связаны между собой прочными ковалентными пептидными связями, возникающими в результате химического взаимодействия между карбоксильной группой одной аминокислоты и аминогруппой следующей аминокислоты (рис. 10.14). Образующийся в результате такого взаимодействия двух или нескольких аминокислот олигомер называется пептидом. Дипептид состоит из двух аминокислот, трипептид-из трех и т.д. Аминокислоты, входящие в состав пептида, часто называют аминокислотными остатками. Структурную основу любого пептида составляет зигзагообразный остов, образованный атомами углерода и азота (рис. 10.15). Направленные вовне по отношению к остову боковые К-группы любых соседних аминокислотных остатков [c.21]

Анализ пептидов методом ВЭЖХ выглядел бы значительно (Проще, если бы относительное время удерживания пептида можно было предсказать исходя из его структуры. Решению этой задачи посвящена работа 1[161], автор которой, установил, что даремя удерживания олигомеров аминокислот практически ли- [c.62]

Циановодород может также превращаться в цианацетилен и циановую кислоту — предшествеииики пиримидинов. Эти реакции были воспроизведены в лабораторных условиях. Ведь уже в 1828 г. Велер получил из циановой кислоты II аммиака мочевину — первую животную субстанцию , синтезированную из неорганических соединений. Весьма вероятно, что все подобные процессы первоначально проходили в водной среде, причем ионы Н+ и ОН выступали в роли кислотного или основного катализатора. Замечательно, что три основных класса азотсодержащих биомолекул — пурины, пиримидины и аминокислоты — образуются прн гидролизе олигомеров, которые непосредственпо получены в разбавленных водных растворах H N. Синтез всех этих биомолекул на первобытной Земле мог бы быть следствием постоянного образования H N под действием электрических разрядов и ультрафиолетового излучения, H N, возможно, растворялся в каплях дождя и переносился ими на поверхность Земли, где могла происходить олигомеризация H N с последующим медленным гидролизом образую- [c.184]

Другим важнейшим направлением исследований является синтез производных аминокислот В частности нами разработан метод синтеза полифторалкилпроизводных и фосфорилированных производных е-аминокапроновой кислоты и ее олигомеров как матрицы для введения фармакофорных групп. [c.45]

Ряд олигомеров а-аминокислот играет значительную роль в жизнедеятельности организма и некоторые из них применяют в медицинской практике. Так, метиловый эфир дипептида L-аспарагил-Ь-фенилаланина (аспартат, аспартам) используют при диабете как малокалорийный заменитель сахара (в 150 раз слаще глюкозы). Его производят синтетическим или микробиологическим путем конденсацией аспарагина и метилата фенилаланина [c.38]

Малые строительные блоки, мономеры, в клетке соединяются в гигантские макромолекулы, или полимеры, в которых мономерные звенья связаны прочными ковалентными связями. Одни полимеры состоят всего лишь из нескольких мономерных звеньев (олигомер), другие из сотен, тысяч и даже миллионов. Типичный белок содержит от 100 до нескольких сотен аминокислот, молекула ДНК Е. oli состоит из 4-10 пар нуклеотидов, а сильно разветвленная молекула крахмала содержит свыше миллиона сахарных звеньев. Одни молекулы биополимеров представляют собой линейные цепочки, другие — разветвленные.. Иногда цепи полимера скручиваются с образованием жесткой цилинд-рической спирали, стабилизированной большим числом слабых вторичных связей. Но, как правило, такие структуры имеют значительно более сложную и нерегулярную конформацию. Довольно часто цепи полимера прилегают одна к другой, образуя сетчатые структуры, волокна,, мембраны. В отдельных случаях (например, в коллагене соединительной ткани) молекулы белка прошиты в поперечном направлении сильными ковалентными связями. Однако обычно макромолекулы в клетках связаны друг с другом более слабыми электростатическими и вандерваальсовыми силами. [c.67]

Аминокислоту плавят прямо в пробирке, которую помещают в масляную или металлическую баню при 220 °С. Температуру быстро повышают до 260 X и поддерживают в течение 15 мин. Если в процессе поликоиденсации вода все-таки конденсируется в приборе, ее выдувают горячим воздухом, а затем расплав охлаждают в токе азота. Полиамид извлекают из пробирки, хлоркальцие-вую трубку взвешивают для определения количества выделившейся воды. Опыт повторяют дважды, увеличив время реакции до 30—60 мин. Определите вязкость трех образцов полиамида в конц. Н2504 при 30 °С (С=10 г/л) в вискозиметре Оствальда (диаметр капилляра 0,6 мм). Возрастание т]уд/С с увеличением продолжительности реакции является мерой степени поликоиденсации. Полученный найлон 6 имеет температуру плавления, равную 215°С из его расплава можно тянуть нити. Полиамид содержит примеси линейных и циклических олигомеров, которые можно экстрагировать из хорошо растертого образца метанолом в аппарате Сокслета (12 ч). Экстракт содержит циклические и линейные олигомеры вплоть до пентамера, количество которых можно определить после удаления метанола в вакууме. е-Капролактам удаляют промыванием остатка безводным эфиром. Остаток вновь растворяют в метаноле (17о-ный раствор) и пропускают раствор через катионит [14], промытый метанолом линейные олигомеры задерживаются в колонке. Количество циклических олигомеров определяют [c.204]

Последовательность аминокислотных остатков в полипептид-,ной цепи называется ее первичной структурой. Определение пер.-вичной структуры производится путем частичного гидролиза белка с помощью специфических протеаз, катализирующих расщепление пептидной связи лишь между определенными остатками. Так, трипсин атакует лишь те пептидные связи, которые образованы СО-группами остатков основных аминокислот — Apr или Лиз. В результате образуется смесь коротких полипептидных цепей, олигомеров. Такие короткие цепи называются пептидами. Их исследование производится посредством химических и физико-химических методов (хроматография, масс-спектроскопия). Воздействуя другим ферментом, можно разрезать белок по другим связям, получить смесь других пептидов. N- и С-конце-вые остатки белка (см. стр. 68) определяются в результате их химической модификации, предшествующей частичному гидролизу. Зная строение пептидов, полученных при специфическом расщеплении различными ферментами, можно установить первичную структуру белка. Допустим, что белковая цепь имеет структуру [c.73]

Но есть среди ВМС и такие вещества, которые построены из большого числа сравнительно простых, но многократно повторяющихся звеньев. Звенья могут быть как одинаковые, так и разные, но набор их всегда невелик. Звенья образуются из небольших относительно простых молекул, которые называются мономерами. Соединения, состоящие из небольшого числа звеньев, называются олигомерами (от греч. oligos - малый), а если число звеньев составляет несколько тысяч или еще больше, то соединения такого типа называются полимерами. Из уже рассмотренных выше органических соединений к высокомолекулярным относятся зтлеводы крахмал и клетчатка, построенные из одинаковых звеньев (см. разд. 33.6), и белки, построенные из ограниченного набора аминокислот (см. разд. 34.2). [c.435]

Книга написана коллективом авторов - известных японских специалистов - под общей редакцией профессора Д Исии, который является ос-иовотложииком микромасштабной высокоэффективной жидкостной хроматографии Рассмотрены теоретические аспекты аппаратурное оформление метода включая конструкции микроколонок и узлов жидкостного хроматографа и системы детектирования Приведены примеры определения желчных кислот аминокислот олигомеров антиоксидантов в бензине лекарств Для химиков-аналитиков физикохимиков а также для студентов и аспирантов специализирующихся в. области хооматогоафии [c.4]

Путем поликонденсации с другими гидроксикислотами или аминокислотами можно изменить растворимость олигомера, сделав его пригодным для использования в среде более полярных разбавителей и все еще обеспечивая наличие единственной концевой карбоксильной группы [88 ]. Поли(гидроксикислоты) легко превращаются в привитые сополимеры путем этерификации концевой карбоксильной группы глицидилметакрилатом и последующей сополимеризации полученного макромономера с акриловыми или виниль-ными мономерами, образующими якорный компонент стабилизатора. [c.115]

Как уже отмечалось, иониты на основе целлюлозы и декстрана не обладают необходимыми механическими и ионообменными свойствами и вследствие этого их редко используют для хроматографического разделения аминокислот. Карбоксиметилцеллюлозу применяли для отделения лизина от его олигомеров и полимеров [26]. Известны попытки модификации DEAE-и QAE-сефадексов путем введения дополнительных поперечных связей и применения их для разделения цистеина и глутатиона [27]. Использование дауэкса 1-Х8 и сефадекса G-10 означает переход от ионообменной хроматографии к гелевой [28]. [c.334]

Разработаны варианты капиллярной флюидной хроматографии, флюидной хромато-масс-спектрометрии, флюидной хроматографии с программированием давления и потока, а также препаративной флюидной хроматографии. Используют пламенно-ионизационный, термоионный, пламенно-фотометрический, рефрактометрический, инфракрасный и ультрафиолетовый детекторы. Объектами исследования служили нефтяные остатки, олигомеры и полимеры, полиароматические углеводороды и их нитропроизводные, полиглицериды, полисахариды, красители, оптические изомеры производных аминокислот, металлоорганические соединения и т. д. [27—29]. [c.77]

Собраны сведения о разделении фосфорорганическпх пестицидов, инсектицидов, стероидов, гиббереллинов, пигментов, сложных эфиров, пуринов, сахаров, мономеров и олигомеров в найлоне, тирнмидинов, фенолов, ароматических кислот, спиртов, алкалоидов, аминокислот, карбоновых кислот, смол, карбонильных соединений, амидов, пищевых консервантов, органических галогенпроизвод-ных, иодотирозинов и триглицеридов. Описано также разделение [68, 69] протеинов, ферментов, нуклеиновых кислот, углеводов, пептидов, липидов, гуминовых кислот, сырой нефти, полимеров, например полиэтилена, полибутадиена и ацетата целлюлозы. Гель-хроматография может быть применена для обессоливания растворов, для выделения лития из солевых рассолов [82], а также для удаления низкомолекулярных соединений из растворов высокомолекулярных веществ. [c.550]

Реакция теломеризации получила широкое распространение, так как позволяет синтезировать различные олигомерные вещества, являющиеся как целевыми продуктами, так и исходным сырьем для синтеза других соединений. В качестве примеров продуктов радикальной теломеризации, нашедших применение в некоторых отраслях промышленности, можно привести олигомеры этилена с четыреххлористым углеродом — а,(о,(й,(й-тетрахлоралканы со степенью полимеризации 3—10 и более, используемые в качестве сырья для получения со-аминокислот, циклических соединений и др. олигомеры на основе тетрафторэтилена и трифторхлорэтилена, применяемые в качестве высококипящих масел, стойких теплоносителей, жидкостей для гидроприводов, пластификаторов для высокополимеров, смазочных масел и т. д. > олигомеры эфиров акриловой кислоты (бутилакрилат, 2-этплгексилакрилат, лаурилакрилат), аллил-ацетата и аллил хлорида, предложенные как пластификаторы для поливинилхлорида олигоэтиленовые воска — продукты ради- [c.256]

Удельная теплоемкость лизоцима в разбавленном растворе больше теплоемкости сухого белка. Последнюю можно вычислить, предполагая наличие аддитивности, из теплоемкостей олигомеров глицина и для некоторых аминокислот в кристаллическом состоянии, как это сделано в работе [16]. Удельную теплоемкость белка в растворе можно вычислить аналогичным образом из теплоемкостей разбавленных растворов олигомеров глицина и аминокислот, используя оценки, которые основаны на кристаллографическом изучении показателя, характеризующего контакты основной цепи и элементов боковых цепей в нативном белке с растворителем [17]. Результаты расчетов такого рода для сухого белка и для разбавленного раствора приведены в табл. 6.3. Согласие с экспериментом хорошее. В таблице приведены также результаты вычислений, основанных на наборах аддитивных параметров, которые для различных атомов и групп даны в работе [18] для твердого состояния и в работе [19] для раствора. И в этом случае согласие с экспериментом можно считать хорошим. Следует отметить тот факт, что теплоемкость белка в твердом и растворенно. г со- [c.119]

Скорость образования некоторых структур высшего порядка, по-видимому, строго регулируется. В то время как вторичная структура определяется в основном, если не исключительно, последовательностью аминокислот в самой цепи, третичная и четвертичная структуры, по крайней мере отчасти, находятся под контролем других молекул. Например, агрегация субъединиц в активный голофермент (образование четвертичной струк-" туры) может зависеть от их фосфорилирования, катализируе-мого другим ферментом, а этот процесс может в свою очередь регулироваться гормонами. На равновесие между неактивными субъединицами и активным олигомером часто влияют субстраты и кофакторы данной реакции. Таким образом, эпигенетический, контроль ферментативных функций на уровне образования тре- х ичной и четвертичной структур может играть существенную роль в метаболической регуляции. [c.17]

Газовая хроматография при невысоких давлениях слабо адсорбирующихся (практически не адсорбирующихся) газов-носителей используется для разделения и анализа достаточно летучих веществ (с давлением пара при температуре колонны не менее 0,13 Па). Однако многие вещества, хроматографический анализ которых имеет важное практическое значение, во-первых, недостаточно летучи и, во-вторых, очень сильно адсорбируются даже при высоких температурах колонны или претерпевают термодеструк-цию. Это прежде всего соединения с большой молекулярной массой (полимеры), соединения со средней молекулярной массой (олигомеры), сильно полярные соединения, в частности аминокислоты, лекарственные вещества, белки, а также очень сильно адсорбирующиеся даже на слабоспецифических адсорбентах труднолетучие неорганические соединения. [c.137]

Следует также ожидать влияния взаимодействия между функциональными группами, рассмотренного в предыдущем разделе, и на термодинамическое равновесие реакций других типов. Эти влияния рассматривались, в частности, для случая термодинамической устойчивости пептидной связи в макромолекуле белка [38]. Если гидролиз пептидной связи приводит к отщеплению отрезков макромолекулы и сопровождается разрывом ряда водородных связей, кажущаяся константа равновесия гидролиза должна уменьшаться вдвое при разрыве одной водородной связи [39]. Экснериментальные данные о равновесии такого типа были получены для фибриногена — белка, участвующего в образовании тромбов крови. В первой стадии процесса образования тромбов происходит гидролиз определенных пептидных связей и образуются короткие фрагменты макромолекулы. Этот процесс можно сделать обратимым и определить положение равновесия. Было показано [39], что равновесная концентрация пептидных олигомеров определяется устойчивостью наиболее легко гидролизуемых пептидных связей, скорость гидролиза которых на четыре порядка выше, чем нормальных пептидных связей. Однако, по-видимому, фактическая устойчивость этих связей весьма близка к нормальной, и низкое значение кажущейся константы равновесия реакции объясняется очень высокой степенью ассоциации олигомерных фрагментов, образующихся из макромолекулы исходного белка. Это указывает на то, что разрушение водородных связей не является необходимым для со.ль-волиза пептидной связи, и оно происходит лишь после расщепления пептидных связей. Аналогичные выводы могут быть сделаны на основании экспериментов с рибонуклеазой. Этот фермент также можно, гидролизуя н птидные связи определенного типа, расщепить на сегменты, состоящие из звеньев двадцати аминокислот [40]. Однако и в этом случае образующиеся олигомеры связаны между собой крайне прочно (константа диссоциации меньше 10 ) преимущественно водородными связями и разнообразными вторичными связями, которые при гидролизе пептидной связи не разрываются. [c.22]