Модель комплексов включения

Одной из характерных особенностей ферментативного катализа является способность ферментов образовывать адсорбционные, обычно нековалентные комплексы. Идеальные модели ферментативных процессов должны включать взаимодействия данного типа. К такого рода ассоциатам могут приводить ионные и неполярные взаимодействия, а также образование водородных связей. К неполярным следует относить мицеллярные комплексы, я-комплексы и комплексы включения. [c.310]

Действие второго фактора (процесса) рассматривается после учета первого фактора, наиболее сильно влияющего на комплекс включенных в модель показателей. [c.12]

Возможно включение линейных двух- и трехатомных субстратов, таких, как СО, N0, О2 или N3- Ионы металла находятся внутри макроциклического лиганда, причем каждый из них связан с несколькими донорными группами N 2, а также с расположенным в центре макроцикла субстратом (4 молекулы в случае Поскольку некоторые металлопротеины используют двухъядерные металлические центры для осуществления каталитической функции, то данная модель имитирует медные пары третьего типа в медьсодержащих ферментах. В двухъядерном Си (II)-комплексе расстояние Си—Си оценивается в 0,52 нм. Интересно, что этот комплекс обнаруживает антиферромагнетизм и является диамагнитным при комнатной температуре. [c.380]

Исследования с использованием пространственных моделей показали, что аналогичный комплекс может быть образован актиномицином и с двухцепочечной ДНК. Обратите внимание на то, что в то время, как показанные на рисунке две аминогруппы гуаниновых колец образуют водородные связи с актиномицином, другие водородные атомы тех же аминогрупп, так же как и атомы водорода при N-1 и карбонильные группы гуанинового кольца, доступны для водородных связей, образующих ГЦ-пары. Таким образом, показанная на рисунке структура может быть легко превращена в часть двухцепочечной молекулы ДНК, в которой феноксазиновое кольцо актиномицина интеркалировано между двумя G -парами (рис. 2-21). Для того чтобы это произошло, ДНК должна развернуться на 18° в месте включения дополнительного кольца. [c.210]

Первое слагаемое характеризует вклад в образование донорно-акцепторной связи электростатических взаимодействий, второе - ковалентных. Уравнение (1.5) содержит четыре неизвестных параметра. Для их оценки в качестве стандартного акцептора выбрали молекулу иода. Для нее приняли равной = Сд = 1. Вычисление других параметров проводится, исходя из допущения, что д = а Хд Сд = йЛд, где Хд-дипольный момент донора, Лд- рефракция донора, а иЬ- коэффициенты. В результате подстановки доступных экспериментальных значений получают уравнение с двумя неизвестными. Рассматривая ряд комплексов, получают систему уравнений. Решение каждой пары уравнений дает значения а и й, которые затем усредняются. Исходя из этих средних величин рассчитывают параметры доноров д и Сд. Значения параметров модели Драго для ряда растворителей представлены в табл. 1.6. Для близких по строению комплексов можно, используя величины и С, рассчитать теплоты образования. Расхождения расчетных и экспериментальных величин связывают со стери-ческими эффектами, влиянием я-взаимодействий, перестройкой компонентов при комплексообразовании. Необходимо отметить, что в рассмотренном подходе не учитывается сольватационная составляющая, а все умозаключения проводятся без учета влияния растворителя, как, если бы реакция протекала в газовой фазе. Поэтому дальнейшая модификация уравнения привела к включению в состав рассматриваемых также и параметров неспецифической сольватации [18] [c.16]

Единая схема комплекса моделей текущего планирования на промышленном предприятии создается либо на основе существующей методологии разработки техпромфинплана и последующего включения в нее дополнительно требуемых эконо-мико-математических моделей, либо на базе предварительного создания единого комплекса ЭММ годового планирования с последующим включением в этот комплекс недостающих моделей расчетов. В обоих случаях на этой основе разрабатывается интегрированная схема расчета показателей техпромфинплана. [c.233]

Сравнение этих результатов со случаем эквивалентного по проницаемости гомогенного комплекса показало, что в последнем варианте влияние бокового растекания гораздо слабее, т.е. включение в модель одной лишь крупномасштабной анизотропии по проницаемости недостаточно для правдоподобной имитации этого процесса необходимо еще представление анизотропных фазовых проницаемостей на микроуровне. [c.460]

Пространственная модель комплекса должна учитывать раскручивание ДНК и его особенности. Лерман предложил модель интеркаляции, согласно которой молекулы АК прослаиваются между парами оснований ДНК, вступая с ними в вертикальное взаимодействие [142]. Для такой интеркаляции необходимо раскручивание сахаро-фосфатных остовов обеих цепей ДНК, что создает между парами оснований свободное пространство, достаточное для включения молекулы красителя. Ван-дер-ваальсова толщина этой молекулы составляет 3.4 А. Модель Лермана [c.528]

Действие йода в водных растворах в присутствии высокополимеров не только сохраняется, но в некоторых случаях даже повыщается, в то время как TOK nimo Tb препарата резко снижается. Это открывает щи-рокие возможности создания препаратов йода для энтерального и парентерального применения. С помощью метода дифракции рентгеновских лучей показано, что синяя окраска, наблюдаемая при взаимодействии йода с крахмалом, циклодекстринами, кумаринами и другими веществами, вызвана не нормальной диатомной формой йода, а расположением йода внутри каналов этих полимеров при образовании составов включений . На основании адсорбционных спектров водного раствора соединения йод-ПАВ высказано предположение о винтообразной модели комплекса. [c.396]

Согласно общепринятому в настоящее время мнению, образование комплекса амилоза-иод связано со спиральной конформацией цепи амилозы, в центре спирали которой образуется каналообразная полость с размерами, достаточными для размещения иода (рис. 120). Эта модель впервые была предложена Хейнсом [890] и Фройденбергом и др. [891] до открытия комплексов включения мочевины, построенных по аналогичному принципу. Предложенная модель была подтверждена в результате установления того факта, что комплекс крахмал-иод образует гексагональные кристаллы [892], наличие которых было бы трудно объяснить какой-либо другой геометрией цепей амилозы. В дальнейшем модель получила дополнительные подтверждения открытием дихроизма в потоке [893], в результате которого было доказано, что цепи иода распола- [c.319]

Эффективным средством идентификации параметров и автоматизированного построения моделей пористых сред являются вычислительные комплексы, оснащенные средствами автоматического анализа изображения (ААИ). Принципиальная схема одного из таких вычислительных комплексов показана на рис. 3.3. При помощи передающего телевизионного сканирующего устройства изображение объекта может быть введено в цветном или чернобелом варианте непосредственно с плоскости наблюдения во всех ее видах, т. е., например, с фокальной плоскости окуляра оптического микроскопа, с экрана электронного микроскопа, с экрана телевизора, а также фотографических репродукций и др. Соответственно в схему ААИ может быть включен оптический микроскоп, электронный микроскоп (просвечивающий, эмиссионный или растровый), приемное телевизионное устройство, эпидиаскоп и т. п. Скорость работы современных ААИ более чем на 5 порядков превышает скорость работы человеческого глаза при значительно более высокой чувствительности (свыше 200 точек на [c.125]

Эндоэдральные комплексы фуллеренов, таким образом, являются молекулярным топологическшч объектом типа атом внутри сферы . В идеальной трактовке топологической связи между атомом и оболочкой не должно быть никакого взаимодействия. Для реальных атомно-молекулярных, а не геометрических систем абсолютно все взаимодействия исключить не возможно. В данной модели остается электростатическое взаимодействие, которого, вероятно, нет, если включен атом инертного газа. [c.143]

На более крупных территориях и участках рек функционируют различные (промышленные, сельскохозяйственные и прочие) предприятия. В связи с этим комплекс водоохранных сооружений и мероприятий будет включать в себя разные группы сооружений со своими показателями. Потребуется агрегирование однотипных предприятий, ЗВ и т. д. Поэтому вместо оптимизации одной группы мероприятий (например, очистных сооружений) потребуется модификация задач для включения в состав моделей всего комплекса водоохранных мероприятий на водохозяйственных участках и значимых хозяйственных территориях. При анализе комплексных задач достаточно оперировать не каждым сооружением или мероприятием в отдельности, а некоторыми агрегированными сооружениями, обобш,ающими выбранные на меньших территориях и участках рек комплексы каждой группы мероприятий и сооружений по охране вод. Для такого агрегированного сооружения (мероприятия) сохраняется состав основных параметров, присущих описаниям сооружений или мероприятий соответствующей группы охраны вод по видам, а значения параметров усредняются. Кроме того, состояние самого водного объекта может основываться теперь на свойствах в целом определенных групп ингредиентов (металлы, нефтепродукты, нитраты и пр.), а не на детальном перечне концентраций ингредиентов загрязнений в отдельности. Таким образом, использование обобщающих понятий и проведение усреднений или агрегирований позволяет решать реальные задачи по выбору водоохранных мероприятий на территориях и участках рек среднего и крупного размера. [c.330]

И графитизированных нитей ясно, что графитизированные нити, которые подвергаются окислению, не являются графитом, а лишь частично графитизированным углеводородным материалом. С этой точки зрения графитизированные нити могут грубо рассматриваться как графит с присадкой водорода, который вносит нарушения в структуру всей нити. Тип 1 участков находится на этом углеводородном материале, тип 2 является графитовой решеткой, ненарушенной водородом или другими присадками. Эта точка зрения подкрепляется тем, что энергия активации и порядок реакции для окисления участков типа 2 одинаковы с теми, которые приводятся для окисления чистого графита Блайхолдером и Эйрин-гом [14]. Процесс 1 имеет нарушенную решетку, в которую включен водород в активированный комплекс для образования поверхностного окисла типа 1. Процесс 2, который состоит в образовании поверхностного окисла 2, включает в его активированный комплекс только графитовый углерод и кислород. Процессы 3 и 4 подобны, за исключением того, что в процессе 3 поверхностный окисел отрывается от углеводородного материала, в процессе 4 кислород должен унести углеродный атом из графитовой решетки без нарушения, за исключением нарушения поверхностного окисла. По-видимому, процесс 4 более трудный, чем процесс 3. Процесс 5 есть процесс графитизации, при котором водород покидает материал, а углеродные атомы организуются сами в графитовой структуре. Процесс 6 происходит вследствие наличия кислорода в поверхностном окисле типа 1, который покидает поверхность скорее с водородом, чем с углеродом, оставляя, таким образом, негидрогенизи-рованный углерод, который может образовать графитовую структуру типа 2. В частности, в гидрогенизирован-ной графитовой решетке будут участки и типа 2 и типа 1. Благодаря разложению окисла типа 1 решетка будет разрываться до такой степени, что участок типа 2, который зависит от устойчивости графитовой решетки, станет участком типа 1. Это является уже процессом 7. а в коэффициенте пропорциональности процесса 7 для этой модели является средним числом участков типа 1, которые должны быть удалены, для того чтобы превра- [c.180]

Для объяснения образования и свойств соединений включения амилозы с подом выдвинуто несколько теорий. Штейн и Рандль [84] предположили, что образование комплекса обеспечивается кумулятивными дипольными силами спирали амилозы, которые увеличиваются с удлинением спирали и поляризуют включенные, молекулы иода, тем самым вызывая электростатические взаимодействия между молекулами иода. Дополнительная стабилизация комплекса достигается, как предполагают авторы модели, тем, что иод в спирали находится в виде резонирующей полииодной цепи. Очень важно в этой теории, что ее предсказание увеличения устойчивости комплекса с увеличением длины спирали совпадает с экспериментальными данными. Однако теория применима лишь к случаю образования комплекса из сухой амилозы и парообразного иода. В водных растворах поляризация воды уменьшает электростатическое поле спирали амилозы кроме того, весьма существенным компонентом комплекса в растворе являются иодид-ионы. В действительности они могут принимать участие в образовании комплекса и в твердой фазе. Для приготовления комплекса из сухой амилозы и паров иода все же требуется небольшое количество воды. Поэтому в системе могут присутствовать иодид-ионы, которые образуются в результате взаимодействия иода с водой или восстановления его амилозой. [c.542]

Модели молекул Р- и у-циклодекстринов свидетельствуют о том, что внутренние диаметры полостей в этих молекулах составляют примерно 8 и 10 А соответственно. На основании этих моделей можно заключить, что три циклодекстрина будут по-разному образовывать соединения включения в зависимости от размера молекулы- гостя , что и подтвердилось экспериментально. По-видимому, более устойчивые комплексы образуются тогда, когда молекула- гость может принять такую ориентацию в циклодекстрипе, которая будет способствовать максимальному взаимодействию с группами, находящимися на внутренней стороне кольца. Поэтому, с одной стороны, у-циклодекстрины слишком велики [13], чтобы образовывать устойчивые комплексы с такими небольшими молекулами, с которыми а- и р-циклодекстрины легко их образуют, а, с другой стороны, а-циклодекстрин не будет образовывать соединений включения с большими молекулами. [c.548]

На образование соединения включения -циклодекстрина с ури-дин-5 -фосфатом такше указывает щелочность среды. Уф-Спектр включенного нуклеотида показывает,что растворы р-циклодекстрина, буферированные до pH = 7, имеют щелочную реакцию. Эти комплексы исследовали как модели адепозинтрифосфатных (АТФ) ферментных систем. Образование соединений включения может объяснить более сильное фосфорилирующее действие АТФ in vivo по сравнению с его слабой активностью in vitro. [c.555]

При рассмотрении возможности включения этих комплексов в стадию, определяющую скорость реакции, следует также учесть, что структура типичных комплексов АгН-галоген не представляет собой удачной модели для реакции ароматического замещения, как это показано с помощью метода дифракци н рентгеновских лучей (VI). К тому же энтальпии образования я-комплексов неизменно небольшие — ниже обычных энергий активации в реакциях замещения. Величины АН для комплексообра- [c.459]

На основании рентгенограмм соединения включения акрилонитрила в монтмориллоните построена схема (рис. 2) полимеризации, соответствующая образованию синдиотактического полимера. Молекулы акрилонитрила и образующегося полимера представлены в виде бриглебовских моделей. Все элементы схемы вычерчены в масштабе. При полимеризации должно происходить уменьшение расстояния между слоями монтмориллонита на 3,0 А. Это действительно имеет место, судя по рентгенограмме облученного комплекса. [c.80]

N-aцильнoe производное нуклеофильного звена или его модель) или геометрическую модель переходного комплекса. Тогда формируемая в процессе синтеза и миграции заместителей первичная структура будет настраиваться на минимум свободной энергии системы, соответствующий глобулам, в которые встроен промежуточный продукт каталитического превращения или модель переходного комплекса. Иными словами, конформационный переход произойдет при достижении такого внутримолекулярного распределения функциональных групп, в котором модель функционирующего активного центра уже учтена как элемент первичной структуры. Теперь нужно удалить включенный фрагмент из сформировавшейся глобулы и освободить активный центр. Если в результате этого не произойдет катастрофического разрушения третичной структуры (а ее, если понадобится, можно предварительно стабилизировать внутри- или межмолекулярным сшиванием), то система перейдет в более высокий энергетический минимум, запомнив ,, однако, энергетически предпочтительное состояние с занятыми активными центрами. Последнее эквивалентно возникновению некоторого напряжения, которое по крайней мере частично сохранится или даже усилится при сорбции соответствующего субстрата в зоне активного центра и которое будет подталкивать реагирующие частицы вдоль координаты реакции, т. е. в сторону образования промежуточного продукта или переходного комплекса, запрограммированного при самонастройке. Упомянутое напряжение окажется причиной снижения свободной энергии активации процесса. Термин напряжение взят в кавычки, ибо, вообще говоря, нет никакой необходимости (впрочем, равно как и противопоказаний) трактовать его как истинное напряжение третичной структуры. [c.296]

Следует учитывать, что существующие мощности не могут удовлетворить все увеличивающуюся потребность промышленности в наиритах. Кроме того, сейчас в зарубежной практике наметилась тенденция перевода производства неопренов на более безопасную технологию с использованием нового источника сырья — бутадиена. Поэтому в СССР намечено построить несколько новых заводов по выпуску хлоропреновых каучуков и латексов на базе бутадиена. В этих условиях значительный практический интерес представляет задача определения оптимальных размеров вновь строящихся предприятий по производству наиритов, которая была поставлена н решена во ВНИИполимер с помощью соответствующей экономикоматематической модели. Последняя разработана специально для включения в комплекс частных задач технико-экономической оптимизации, решаемых в ЕСТЭО-ХТС на этапе перспективного планп-рования. [c.129]

Белки встраиваются в мембрану разными способами (рис. 42.11) детали этого процесса во многих случаях еще не установлены. Для объяснения механизма встраивания предложены две модели сигнальная гипотеза и мембранная триггерная гипотеза. В сигнальной гипотезе предполагается, что белок включается в мембрану параллельно его трансляции на мРНК в полирибосомах это так называемое ко-трансляционное включение. Когда лидерная последовательность выходит из рибосомы, она выявляется некой сигнал-распознающей частицей (СРЧ), которая блокирует дальнейшую трансляцию на уровне примерно 70 аминокислот, 40 из которых остаются в большом рибосомном комплексе, а 30 экспонированы в среду (рис. 42.12). СРЧ содержит шесть белков, с ней ассоциирована 78-РНК, близко-родственная А1и-семейству последовательностей ДНК с большим числом повторов (см. гл. 38). Блокирование трансляции не снимается до тех пор, пока комплекс СРЧ-лидерная последовательность— рибосома не свяжется с так называемым отстригающим белком (рецептором для СРЧ) эндоплазматического ретикулума. В этот момент начинается котрансляционное встраивание белка в эндоплазматический ретикулум. В процессе элонгации оставшейся части белка он перемещается через липидный бислой, поскольку рибосома остается присоединенной к эндоплазматическому ретикулуму. Таким образом образуется шероховатый (усеянный рибосомами) эндоплазматический ретикулум. Рибосомы остаются прикрепленными к эндоплазматическому ретикулуму в течение всего времени синтеза мем- [c.136]

Включение равновесных физико-химических взаимодействий в аналитические модели миграции может базироваться на использовании простейших модификаций метода характеристик (см. разд. 7.1.8). Главным ограничением, снижаюпщм эффективность такого рода исследований, является пренебрежение в них рассеивающими эф ктами, обусловленными либо гидродинамической дисперсией, либо проявлением внутренней гетерогенности водоносных комплексов. [c.436]

Введенный в эксплуатацию сегмент соответствует централизованной модели глобального мониторинга влажности природного газа. Измерительный многоканальный комплекс КОНГ-Прима-4 включен в технологическую систему управления станцией осушки природного газа. Результаты работы анализатора поступают в технологический компьютер станции, визуально предоставляются оператору и направляются в единую систему мониторинга для накопления и анализа информации, диагностики работоспособности гигрометров. В пределах Степновской СПХГ информация перемещается по локальной сети и через сервер направляется по выделенной линии на почтовый сервер ВЦ Югтрансгаз , где расположена учетная запись электронной почты, с которой производится отправка данных по каналам Internet. Почтовая система ВЦ Югтрансгаз является каналом, предоставляющим доступ к информационным ресурсам анализатора КОНГ-Прима-4 . По электронной почте данные доставляются на сервер фирмы Вымпел , где они архивируются и обрабатываются. При круглосуточной работе всех составляющих системы мониторинга обеспечиваются высокая надежность передачи данных (при пере- [c.57]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология