Определение стартовой точки

В ПИА на стадии ввода пробы реализуется так называемый прямоугольный ввод, обеспечивающий определенную стартовую точку начальной концетрации [c.252]

Определение минимума целевой функции для разных стартовых точек [c.394]

Почти повсеместно встречается определенная последовательность из 7 П.Н., отделенная от стартовой точки расстоянием от 19 до 27 п.н. Эта семичленная последовательность была обнаружена у млекопитающих, птиц, амфибий и насекомых. Во всех изученных случаях (независимо от источника) среднестатистическая последовательность имеет следующий вид [c.149]

Из этого определения становится ясно, что мы не вправе исследовать структуру промотора, просто делетируя отдельные его участки. При этом промотор может инактивироваться в результате изменения расстояний между его определенными областями, даже если сами делетированные последовательности и не играют никакой роли. Поэтому необходимо создавать маленькие делеции, на место которых помещались бы другие последовательности таких же размеров. С помощью такого подхода можно определить те последовательности ДНК вокруг стартовой точки, которые необходимы для инициации транскрипции. [c.154]

Фазирование нуклеосом может осуществляться одним из двух способов. Один из них заключается в том, что каждая нуклеосома располагается специфически на определенной последовательности ДНК. Это несколько противоречит представлению о том, что нуклеосомная субъединица может образоваться в результате соединения любой последовательности ДНК с гистоновым октамером. Второй возможный способ связан с существованием некой специфической последовательности, которая предпочтительно участвует в образовании первой нуклеосомы на данном участке, а затем начинается последующее образование нуклеосом с определенным размером нуклеосомного повтора. (Если в конструкции нуклеосом существует некоторое разнообразие-например, если длина линкерного участка может варьировать, скажем, на 10 п. н.,-место специфической локализации будет постоянно смещаться по мере удаления от первой фиксированной нуклеосомы.) Стартовую точку образования нуклеосом можно определить путем связывания негистоновых белков со специфическим сайтом ДНК. [c.378]

При расчетах потенциальных поверхностей надо еще иметь в виду, что, в принципе, отсутствуют математические способы, которые дали бы возможность провести пусть грубый, но быстрый обзор значительной части потенциальной поверхности. Все реальные расчеты выполняются численно точка за точкой. Поэтому каждый раз можно судить о свойствах поверхности лишь в небольшой области в окрестности данной точки. Получить достаточно полное представление о форме поверхности даже в пределах одной потенциальной ямы, особенно когда она имеет более или менее сложную форму, как правило, не удается из-за громадного обьема вычислений. Поэтому на практике ограничиваются лишь определением формы потенциальных кривых вдоль определенных сечений многомерной поверхности (см.рис. 4.3). Распространенным, например, является построение потенциальных кривых для внутренних вращений в молекулах и характеристик параболических потенциалов силовых постоянных), которыми можно довольно хорошо аппроксимировать потенциальные поверхности в окрестности того или иного минимума. Сам минимум определяется итерационным путем с помощью пошагового спуска от некоторого начального положения системы на многомерной потенциальной поверхности. Такая математическая процедура всегда приведет к одному из минимумов, но совершенно не позволяет ответить на вопрос о том, имеется ли где-нибудь рядом другой минимум и каков он. Для решения этого вопроса (и то не со стопроцентной вероятностью) надо многократно проделывать процедуру спуска к минимуму, начиная с разных стартовых точек. Если процесс всегда сходится к одной точке, то возникает значительная доля уверенности в существовании только одного минимума в широком диапазоне вариаций геометрических параметров. [c.162]

ДНК-зависимая РНК-полимераза — это фермент, полимеризующий рибонуклеотиды в последовательность, комплементарную кодирующей цепи гена (рис. 39.2). Фермент связывается с определенным участком кодирующей цепи, называемым промотором. Затем в стартовой точке инициируется синтез [c.82]

Определение ионов никеля. Полоску бумаги, подготовленную, как указано выше, размечают графитовым карандашом. На расстоянии 5 мм от одного из концов бумаги проводят линию, перпендикулярную волокнам бумаги. Это линия погружения проявляющего раствора. Таким образом, проявляющий раствор будет двигаться вдоль волокон бумаги. Далее на расстоянии 15—20 мм от первой линии проводят вторую — стартовую линию, параллельную первой. На стартовой линии на расстоянии 10—15 мм точками размечают центры пятен. [c.343]

Ход определения. Наносят на стартовую линию пластинки Силуфола 0,01 мл полученного спиртового экстракта и проводят разделение, как описано в предыдущей методике. Синие пятна обводят карандашом. Кальку накладывают на пластинку и обводят карандашом контур пятна. Обведенное пятно вырезают и взвешивают на аналитических весах с точностью до 0,0002 г. Одновременно из той же кальки (вырезают 1 см и взвешивают с той же точностью. Отношение массы пятна кальки к массе 1 см кальки дает значение площади в квадратных сантиметрах. [c.70]

При проведении самого определения на стартовую линию наносят каплю раствора фенолов, выделенных из анализируемой пробы (см. метод А ), и капли смесей стандартных растворов различных фенолов. Находят пятна от стандартных растворов, близкие по интенсивности к пятнам, полученным при хроматографировании анализируемой смеси, и рассчитывают содержание отдельных фенолов по той же формуле (см. метод А ), [c.237]

Гораздо меньшие затраты на аппаратуру требуются для гель-хроматографии в тонком слое (см. гл. П). В этом случае в конце опыта вместо объема выхода необходимо измерить расстояние от стартовой линии до пятна вещества — длину пробега ]56]. При стандартизации результатов хроматографии на бумаге длину пробега относят к пути, пройденному растворителями (определяют величину / /) в тонкослойной гель-хроматографии длину пробега исследуемого вещества относят к пути, пройденному хорошо идентифицированным веществом [72]. Для белков (а только для них тонкослойная гель-хроматография и применялась до настоящего времени) удается таким образом определять молекулярный вес, имея в распоряжении всего несколько микрограммов вещества [56, 72, 73]. В качестве стандартов здесь также используются белки, приведенные в табл. 22. Из фиг..36 видно, что отношение длины пробега ряда белков к пути, пройденному цитохромом с, является линейной функцией от логарифма молекулярного веса. Как показывает опыт, эту калибровочную линию нельзя считать достаточно универсальной, поскольку ее наклон довольно сильно изменяется от одной серии экспериментов к другой. Результаты определения молекулярного веса становятся более точными, если соответствующие стандартные белки наносят на каждую пластинку. Это вполне возможно, так как на пластинку шириной 20 см свободно можно одновременно нанести по меньшей мере 10 образцов. Благодаря несложному оборудованию и небольшим затратам вещества точность определения молекулярного веса этим методом можно повысить. [c.167]

Основной принцип метода можно изложить следующим образом если фазы, приписанные стартовому набору отражений, неверны, то процедуру фазового определения необходимо полностью повторить. Следовательно, вместо того чтобы пытаться [c.258]

Факторы, от которых зависит отделение завершенной полипептидной цепи от полисомы, изучены слабо. Согласно одной из предложенных моделей, это отделение происходит после того, как через участок поликонденсации пройдет кодон, соответствуюш ий С-концевому аминокислотному остатку полипептида одновременно от полисомы отделяется и рибосома, на которой произошло это событие. Для полицнстронных матриц эта простая модель, очевидно, не подходит. В этом случае должен, по-видимому, существовать какой-то сигнал, который вынуждал бы готовую полипептидную цепь отделяться от рибосомы, а рибосому — приступать к трансляции следующего цистрона с определенной стартовой точки, или же это должен быть сигнал для одновременного отделения готовой полипептидной цепи и рибосомы (несмотря на то что считана еще не вся т-РНК). В последнем случае необходим, очевидно, еще один сигнал в начале следующего цистрона, который служил бы указанием другой, присоединяющейся рибосоме, с какого места [c.531]

Методика. Пластинки с силикагелем Г готовят, применяя приспособление для намазывания слоев фирмы Desaga (толщина слоя 250 ц), и сушат при 120°. Для обеспечения определенной влажности слоя силикагеля Г дают подняться хлороформу.до высоты 12 см и сушат сначала на воздухе, а затем 20 мин в вакуумном эксикаторе. Далее изображенным на рис. 143 способом наносят 3 пробы исследуемого вещества и 2 пробы трехкомпонентной эталонной смеси (условия разделения на стр. 35). Стартовые точки выделены на рис. 143. Осуществляют разделение 1 (растворитель—хлороформ) и разделение 2 (растворитель — бензол) и снимают двумерную хроматограмму. Одновременно для большей надежности количественного определения проводят хроматографическое разделение эталонной смеси. Длина пути для растворителя 1 (хлороформ) составляет 10 см после этого сушат на воздухе, повертывают пластинку на 90° и помещают в растворитель 2 (бензол). В этом случае длина пути также составляет 10 iJii. [c.353]

В том случае, если при определении микропримесей макрокомпонент продвигается первым вслед за фронтом растворителя, иногда используют метод повторной хроматографии или метод с размыванием хроматографического пятна в поперечном направлении, которое достигается применением слоя сорбента в виде треугольника с вершиной в стартовой точке. При движении по такому слою поток подвижной фазы направлен под углом к направлению движения разделяемых компонентов, что приводит к образованию узких поперечных зон и к их резкому разграничению в области широкой части слоя. Такой способ проведения хроматографиро- [c.18]

РНК-полимераза кишечной палочки в настоящее время получена в высокоочищен-ном виде, многие ее структурные и функциональные особенности изучены. Холофер-мент с мол. массой 500 ООО в определенных условиях диссоциирует на несколько субъединиц. Две из них получили название а-цепей, каждая с мол. массой 39 ООО, одна — Р-цепи (мол. масса 155 ООО), одна — Р -цепи (мол. масса 165 ООО) и одна — о -фактора (мол. масса 95 ООО). Холофермент без а-фактора называется кор -ферментом. а-Фактор инициирует синтез РНК- Холофермент без а-фактора может катализировать синтез РНК на матрице ДНК тогда, когда используется гетерологичная ДНК. Добавление же а-фактора в систему с гомологичной ДНК восстанавливает синтез. С началом синтеза РНК а-фактор высвобождается с транскрипционного комплекса и может быть снова использован для активации кор -фермента. а-Фактор узнает гены, с которых должна транскрибироваться РНК. В отсутствие ст-фактора кор -фермент начинает транскрипцию РНК с произвольных генов ДНК, а при наличии его — со специфической стартовой точки. [c.80]

После того как РНК-полимераза начала рост цепи РНК, о-субъеди-ница высвобождается из ферментного комплекса и рост цепи РНК продолжается в ее отсутствие. В настоящее время кажется вероятным, что в РНК-полимеразе Е. oli имеется лищь по одному типу а- и Р-субъединиц, которые вместе служат не только для транскрипции всех бактериальных генов, но и для транскрипции любой фаговой ДНК, которая может заразить эту бактерию. Однако представляется столь же вероятным, что в клетках Е. ali существует несколько разных типов ff-субъединиц, каждый из которых способен узнавать уникальную структуру разных стартовых точек, придавая, таким образом, индивидуальным молекулам РНК-полимеразы определенную степень дифференциации их специфичности в отношении инициации . В настоящее время кажется еще более [c.404]

Разрывы, образующиеся под действием эндонуклеаз в далеко отстоящих друг от друга точках одной цепи, выполняют две функции они снимают механические напряжения, возникающие при раскручивании цепей, и благодаря им появляются свободные З -ОН-группы — стартовые точки, откуда начинают свое действие полимеразы. И в самом деле, было показано, что вблизи каждого из таких разрывов может присоединиться молекула полимеразы. Поскольку разрыв происходит только в одной цепи, целостность двухцепочечной молекулы ДНК сохраняется она нарущается только в том случае, когда обе цепи разрываются в одном месте. В каких именно точках происходят разрывы —пока неясно, но было высказано предположение, что их появление определяется присутствием какой-то определенной химической группы. Например, отмечалось [2702], что ДНК содержит небольшое количество 6Н-метиладенина и 5-ме-тилцитозина (приблизительно по одному основанию на тысячу нуклеотидов) и что если метильные группы удалить, ДНК те- [c.18]

Продукты транскрипции представляют собой дискретные молекулы, имеющие предопределенные 5 -и З -концы. Из этого следует, что инициирование и терминирование транскрипции должны происходить в определенных сайтах ДНК. Инициация предполагает образование комплекса между РНК-полимеразой и ДНК в участке, расположенном вблизи нуклеотида, с которого начинается транскрипция. Последовательность ДНК, необходимая для образования этого комплекса, называется промотором. Промотор может включать в себя как последовательности, непосредственно связывающиеся с инициирующим комплексом, так и те, которые прилегают к этому участку. (Распознавание этих последовательностей необходимо для инициации, но они не являются частью стабильного сайта связывания.) То место, с которого начинается включение первого нуклеотида в синтезирующийся транскрипт, называется стартовой точкой. [c.132]

Какова точная локализация оператора по отношению к промотору Определение размеров /асО-локуса по длине ДНК, защищаемой репрессором in vitro от действия нуклеаз, показало, что он представляет собой область размером около 26 пар нуклеотидов. Она простирается от положения — 5 сразу же слева от стартовой точки мРНК до положения -I- 21 в пределах транскрипционной единицы. Следовательно, область оператора может перекрываться с концом промотора, начинающимся от блока Прибнова и кончающимся в пределах транскрипционной единицы. [c.182]

В целом следует отметить определенное сходство между организацией промотора у эукариот и у бактерий. У эукариот наиболее важными элементами промотора являются ТАТА-блок и часто СААТ-блок, расположенные на расстоянии —25 и —40 --100 п. н. от стартовой точки. [c.65]

Раствор образца следует наносить маленькими порциями (0,25 мкл) так, чтобы стартовая точка была как можно более компактной. Каждая порция раствора быстро высушивается с помощью фена или вентилятора. На пластинку наносят также несущие заряд окрашенные соединения, они мигрируют на определенное расстояние и служат для визуальной оценки процесса. Для электрофореза применяют буферы, содержащие пиридин, уксусную кислоту, воду, иногда бутанол [26, 60] (табл. 7.1). Для получения различных разделяющих систем можно варьиро- [c.233]

Практическое применение обобщенного последовательного метода отношения вероятностей для определения наиболее вероятного механизма реакции этинилирования ацетона в среде жидкого аммиака для условий дискриминирующих экспериментов показало, что в целом он приводит к тем же конечным результатам, как и энтропийный метод Бокса—Хилла. Причем по методу Бокса—Хилла оказалось достаточным поставить шесть контрольных опытов, чтобы модель 6 (механизм Тедеши) прошла испытания. В то же время но обобщенному методу отношения вероятностей модель 6 прошла испытания после четырех контрольных опытов. Такая ситуация на практике встречается достаточно часто, так как обобщенный метод отношения вероятностей использует в процедуре принятия решений всю имеющуюся экспериментальную информацию, в том числе и результаты стартовых опытов. Последнее позволяет делать достаточно надежные выводы о наилучшей математической модели. [c.197]

В этом варианте в колонку или па стартовую линию хроматографической пластинки наносят определенную порцию раствора исходной смеси веществ, а затем ведут элюцию раствором вещества, обладающего заведомо большим сродством к неподвижной фазе хроматографической системы, чем любой из компонентов смеси. Происходит вытеснение их пз неподвижной фазы, причем в первую очередь тех, которые обладают меньшнм сродством к сорбенту, а затем и всех остальных. Элюеит выталкивает все компоненты смеси впереди себя наподобие поршня. Так как они выходят в подвижную фазу концентрированными, то между ними также идет конкуренция за связь с неподвижной фазой. Компоненты, уступающие другим в силе сродства к этой фазе, оттесняются еще вперед, где сорбируются, но только до тех пор, пока их опять не вытеснят компоненты, обладающие большим сродством к сорбенту. В результате такого чередования сорбции и вытеснения компоненты смеси будут выходить из колонки один за другим в порядке возрастания силы их связи с неподвижной фазой. Ясно, что при этом зоны соседних компонентов будут соприкасаться или даже немного перекрываться друг с другом. Для аналитического фракционирования метод непригоден, но хорош для препаративного или полупромышленного разделения веществ, поскольку емкость колонки здесь используется очень эффективно. [c.12]

Если на ППЭ имеется несколько достаточно глубоких локальных минимумов и начальная температура среды невысока (в упомянутом выше смысле), то, в зависимости от стартовых условий, может образоваться несколько продуктов реакции согласно схеме А+В С,, А+В Сз и т д Поскольку хфодукты С , Сз и др по определению имеют один и тот же атомный состав, то можно сказать, что в результате реакции образуется несколько топологических изомеров При подходящих воздействиях извне могут совершаться и переходы С1 -> Сз, те идти мономшекуляр-ные реакции. Этот случай показан на рис 7 1,6 [c.318]

За пределами 30—40 остатков, примыкающих к С-концу, N-концевая часть растущего пептида оказывается свешенной с рибосомы вХ кружающую среду. Здесь уже действуют все те факторы, которые определяют спонтанное сворачивание пептида в конформацию, даясттемую" условиям среды. Однако необходимо учитывать три обстоятельства, делающих ситуацию отличной от таковой, наблюдаемой при спонтанной ренатурации развернутого белка в опытах in vitro. Во-первых, если рибосома обеспечивала и поддерживала какую-то определенную универсальную конформацию растущего пептида внутри себя, например а-спираль, то сворачивание белка может начинаться не из вытянутого или беспорядочного состояния цепи, а из данной стартовой конформации. Во-вторых, поиск путей сворачивания начинается не с любых и не с разных участков полипептидной цепи, а идет последовательно с N-концевой части цепи. В-третьих, в процессе сворачивания С-конец фиксирован на частице большой молекулярной массы (т. е. подвижность его резко ограничена), что должно приводить к больщей стабильности промежуточных структур по сравнению с аналогичными структурами свободной полипептидной цепи. [c.273]

Посторонние примеси. Проводят определение, как описано в разделе Тонкослойная хроматография (т. 1, с. 92), используя в качестве адсорбента силикагель Р4, а в качестве подвижной фазы смесь 5 объемов 1-бутанола Р, 4 объемов воды и 1 объема уксусной кислоты ( 300 г/л) ИР. Наносят отдельно на пластинку по 5 мкл каждого из трех растворов в метаноле Р, содержащих (А) 40 мг испытуемого вещества в 1 мл, (Б) 0,40 мг испытуемого вещества в 1 мл и (В) 0,40 мг бефения оксинафтоата СО в 1 мл. Вынимают пластинку из хроматографической камеры, дают ей высохнуть на воздухе и оценивают хроматограмму в ультрафиолетовом свете (254 и 365 нм). При 254 нм видны два основных пятна на хроматограммах растворов А, Б и В, в то время как при 365 нм флуоресцируют только пятна, близкие к фронту растворителя. Любое дополнительное пятно, видимое на хроматограмме, полученной с раствором А, кроме двух основных пятен, не должно быть более интенсивным при рассмотрении при двух длинах волн, чем пятно, расположенное ближе к стартовой линии при хроматографировании раствора Б. [c.56]

Возникающий процесс диффузии проявителя, т. е. его движения по капиллярам листа бумаги, приводит к сольватации молекул анализируемого вещества проявителем и движенодо этих молекул перпендикулярно стартовой линии по плоскости листа бумаги. Различные молекулы органических соединений в зависимости от природы проявителя движутся от стартовой линии с различной скоростью. Через несколько часов (или суток) проявитель дЪходит до верха листа, а анализируемые вещества остаются на бумаге в виде пятен, прошедших определенное расстояние. Если анализируемые вещества бесцветны, то можно сделать их видимьши, проведя цветную аналитическую реакцию. [c.97]

Одним из практических аспектов качественного и количественного определения с помощью ТСХ является прямая связь между диаметром стартового пятна и эффективностью разделения, а также конечными результатами. Практический интерес представляет величина пижнего предела разности между двумя значениями Rf соседних веществ, при котором ошибки системы становятся ощутимыми. С точки зрения экономики важным фактором [c.34]

При определенных условиях (низкие температуры, большие скорости разрушения) тепловые флуктуации не играют существенной роли, и разрыв хрупких тел идет по атермическому механизму. В этом случае только при напряжениях выше критического (ок) растут микротрещииы и твердое тело разрушается. Если пренебречь механическими потерями, то стартовая скорость микротрещин при переходе напряжения через значение 0к сразу стано вится большой, приблизительно равной скорости распространения поперечных упругих колебаний в твердом теле. Если же учесть рассеяние упругой энергии, зависящее от скорости роста трещины, то предельная критическая [c.95]

Для определения МВР полимеров, в особенности узкодисперсных, с помощью ТСХ необходимо исключить хроматографическое размывание из распределения полимера по пластинке. Для этого был разработан метод, основанный на двумерном хроматографировании полимера в одной системе растворителей [35, 55], в результате чего хроматографическое пятно полимера располагается по диагонали пластинки (рис. 20). Если параллельно с образцом (1) прохроматографировать другой образец (2) одномерно, то распределение на пластинке образца 2 в направлении В можно рассматривать, как стартовую зону образца 1 при хроматографировании в направлении Б. При денситометрии обоих пятен в этом направлении можпо получить дисперсию хроматографического размывания (а р) образца (1) в направлении Б как разность дисперсий распределения концентрации в денситограммах образцов 1 и 2 [c.156]

В этом методе для инициирования процесса определения фаз некоторым отражениям стартового набора приписывают конкретные численные значения. Эта идея реализована в рассматриваемом здесь комплексе программ MULTAN [61], В нецентросимметричном случае отражению общего типа приписывают значение в том или ином квадранте, т, е, л/4 и Зл/4, Определение значений отражений внутри квадрантов дает удовлетворительные результаты, при этом максимальная ошибка составляет 45°, Все комбинации фаз вводят в тангенс-формулу. Таким образом, если для стартового набора используют три главных отражения, то должно получиться 64 варианта наборов фаз. [c.259]

При более высоких темп-рах и практически всех конечных длительностях нагружения хрупкое разрушение происходит в две стадии (область II на рис. 2). На первой, медленной стадии осуществляется термофлук-туационный механизм роста микротрещины разрыв связей наступает, когда энергия тепловых флуктуаций в нек-ром микрообъеме со превышает определенное значение U, к-рое можно рассматривать как энергию активации разрушения. При нек-ром малом (безопасном) напряжении Сд вероятности разрыва и восстановления связей одинаковы, и трещина практически не растет. При сг>(То микротрещина начинает расти со стартовой скоростью vs=khs, где ts — время, характеризующее элементарный акт термофлуктуационного разрыва связи. Я, — путь, на к-рый продвигается участок микротрещины при каждом разрыве (расстояние между соседними рвущимися цепями). Напряжение в областях, непосредственно примыкающих к вершине трещины, значительно превышает среднее по образцу и составляет ро, где Р — т. наз. коэфф. перенапряжения. В момент времени, когда перенапряжение достигает критич. значения ро , наступает вторая стадия разрушения дальнейший рост трещины происходит по атер-мич. механизму с критич. скоростью v , близкой к скорости распространения поперечных упругих волн в твердом теле (порядка 1000 м сек), вплоть до полного разрушения образца. Существование двух стадий хрупкого разрушения подтверждается наличием двух зон на поверхности разрыва — зеркальной, соответствующей медленной стадии, и шероховатой. [c.114]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология