Полипептиды кинетика

Такое поведение поли-у-бензил-1-глутамата связано с его конфигурационным полиморфизмом, вообще присущим а, -полипептидам. Принимая во внимание, что, в зависимости от характера растворителя, макромолекулы П 0ли-7-бензил-1-глутамата могут иметь и конформацию клубка, можно схематизировать различные структурные состояния этого и родственных полимеров циклической серией переходов (рис. 21). В отличие от первоначального варианта этой схемы, предложенной Флори [42], мы подчеркиваем то обстоятельство, что характер кристаллического состояния может зависеть от пути, который должны проделать различные части молекулярных цепей, так как кинетика кристал-,лизации гибких и жестких макромолекул совершенно различна. [c.75]

Кинетика достижения равновесной степени спиральности при переходе спираль — клубок интересна не только сама по себе, но и с точки зрения ее прямой связи со скоростями конформационных перестроек в белках, обусловливающих их ферментативную активность, и другими биологическими процессами. По индивидуальным сигналам от обеих форм (см. разд. 13.4.1), отстоящим друг от друга примерно на 100 Гц, можно оценить их время жизни, которое в данном случае не может быть меньше 10 с судя по остаточной мультиплетности протонных сигналов в спектрах некоторых полипептидов (например поли-Ь-аланине), минимальное время жизни конформационных состояний порядка 10 с. С другой стороны, методами температурного скачка [161], диэлектрической релаксации [162—164] и ультразвукового поглощения [165, 167] для этого характеристического времени получены величины порядка 10 с или даже меньше теоретическая оценка согласуется с данными этих методов [163, 168, 170]. Таким образом, данные метода ЯМР заметно противоречат результатам других методов и это противоречие нельзя устранить, даже предположив, что часть рассмотренных нами результатов ошибочна. [c.322]

Описан гидролиз полипептидов под действием кислот и щелочей [1140—1144]. Симха [1145] приводит данные о кинетике гидролиза пептидной связи. [c.160]

Изучена также кинетика гидролитического расщепления этого полипептида под влиянием трипсина, и полученные резуль- [c.217]

Как известно, существует много реакций, для которых детерминистическое описание не адекватно, и для них должны быть применимы стохастические модели. Самым известным примером являются реакции в системах, содержащих малое число реагирующих частиц, как это имеет место в биологических клетках. Укажем также на процессы, в которых активированные молекулы инициируют реакцию лавинного характера. Многие реакции в химии полимеров могут быть также описаны стохастически, в том числе распределение длин цепей, распределение сополимерных композиций, кинетика выделения реагентов из смеси, кинетика полимеризации биологических макромолекул в матрицах, контролируемые диффузией химические реакции, модели стерилизации, денатурация полипептидов или протеинов, хроматография, релаксация неравновесного распределения по колебательным степеням свободы в ударных волнах, теория гомогенной и гетерогенной нуклеации в парах, теория адсорбции газов на твердых поверхностях, деградация линейных цепных молекул, разделение молекулярных соединений с помощью противотока диализа, статистические процессы агрегации и полимеризации, изотопный обмен и т. д. [c.65]

Полипептиды. Часть 15. Инфракрасная спектроскопия и кинетика синтеза полипептидов. [c.341]

Изучение кинетики гидролиза грамицидина С показало, что сам антибиотик труднее гидролизуется, чем продукты его распада — нециклические полипептиды. [c.480]

Тесная связь между колебаниями металлокомплекса и полипептида может влиять на кинетику реакции двумя путями. Во-первых, комплементарные движения белка могут увеличивать или уменьшать энергию активации, необходимую для достижения переходного состояния. Во-вторых, всякое возрастание числа осцилляторов, которые могут перенести энергию на выделенный специфический осциллятор, участвующий в образовании или разрыве связи, должно приводить к росту предэкспоненциального множителя в выражении для скорости реакции и, следовательно, ускорять реакцию. [c.242]

Принимая во внимание, что кинетика полимеризации ангидридов Лейкса в русских изданиях не освещена, а роль а-полипептидов как биологических моделей огромна, мы дадим в 5 этой главы полный кинетический вывод соответствующего МВР. Этот вывод вообще характерен для любого ненарушенного процесса роста живых цепей и может служить иллюстрацией применяемых методов описания таких процессов. [c.172]

Другим количественным методом измерения числа пептидных групп, взаимосвязанных водородными связями, является изучение кинетики изотопного обмена имидного водорода белка или полипептида на водород воды. Хотя выше прием уже излагался вкратце, на нем необходимо остановиться более подробно. Сущность этого метода сводится к следующему. [c.106]

Кинетика этой реакции обладает рядом особенностей быстрая стадия инициирования сопровождается процессами роста цепи — сначала медленного (образование низкомолекулярного полипептида) и затем быстрого (превращение в высокомолекулярный полипептид). Согласно Доти, на первой стадии образуется клубок (Р пептид), а на второй — а-спираль, растущая гораздо быстрее. Если реакцию инициировать а-пептидом, то первой стадии вообще [c.156]

Метод исследования мономолекулярных слоев в применении к полимерам оказался полезным в таких разнообразных областях полимерной науки, как кинетика полимеризации, характеристика привитых сополимеров, определение скоростей реакций функциональных групп, установление преобладающей конформации для синтетических полипептидов, идентификация стереорегулярных полимеров и их смесей. Кроме того, этот метод оказывает существенную помощь в таком практически важном направлении, как проблемы адгезии. [c.554]

Поликонденсация имеет наибольшее значение, так как с ее помощью могут быть получены весьма разнообразные полиамиды. Этот путь весьма подробно исследован на примере использования многочисленных диаминов и дикарбоновых кислот и их производных. Не менее подробно исследована также реакция поликонденсации различных аминокислот, приводящая к получению многочисленного класса полиамидов, обычно называемых полипептидами. Изучена также кинетика и механизм реакции поликонденсации. Особенно подробно исследована реакция мочевины с формальдегидом, приводящая к образованию мочевино-формальде-гидных смол. [c.13]

Изучение кинетики гидролиза грамицидина С показало, что сам антибиотик труднее гидролизуется, чем продукты его распада — нециклические полипептиды из числа последних наиболее стойкими оказались ди-пептиды 288. [c.539]

Кинетика простой полимеризации NKA была описана и рассмотрена в разд. 2 и 3, где было показано, что простая , или нормальная , полимеризация N-замещенных и N-незамещенных NKA протекает по одинаковому механизму с растущим аминным концом. Рост полипептидов в присутствии апротонных оснований и подобных агентов отличается в кинетическом смысле от описанных ранее реакций, [c.573]

Интересное явление, которое было обнаружено при исследовании оптической активности, заключается в переходе растворенного поли-Ь-пролина из одной спиральной конформации в другую, имеющую противоположное направление. Кинетика этого впервые обнаруженного Курцем и др. [595] процесса была подробно изучена Штейнбергом и др. [328]. Правовращающая форма I ([а]с = +50°), полученная при полимеризации в эфирном растворе, в ледяной уксусной кислоте превращалась в сильно левовращающую форму II ([а]о = —540°) с полупериодом жизни, равным при 25° примерно 4 час. Обратный процесс можно изучать, разбавляя раствор формы II в уксусной кислоте большим количеством пропанола-1. Природа этих превращений уже рассматривалась (стр. 123) здесь же необходимо лишь отметить, что поли-Ь-пролин представляет хороший пример, показывающий важность получения данных об оптической активности в диапазоне проявления эффекта Коттона. Поли-Ь-пролин II характеризуется отрицательным эффектом Коттона, который, однако, сосредоточивается около 203 м х. [592] и отличается от эффекта Коттона, который проявляется при 225 м 1, оказывая определяющее влияние на вращательную дисперсию спиральной формы поли-у-бензил-Ь-глутамата и подобных полипептидов в близкой ультрафиолетовой области [589]. Известно, что эти два эффекта возникают вследствие разных электронных переходов, и они проявляют обратную корреляцию между знаком эффекта Коттона и направлением спирали. В результате этого спирали поли-Ь-пролина была приписана левая структура [592]. [c.202]

Некоторые из нерешенных задач, стоящих перед теорией, будут сформулированы ниже при рассмотрении особенностей кинетики сорбции органических ионов. Решение этих задач, по-видимому, могло бы дать в руки исследователей, работающих в области кинетики, более адекватный математический аппарат и тем самым придать теории более количественный характер. Это имело бы большое значение и для практики, так как в практически наиболее важных случаях сорбции больших органических ионов (ионообменное поглощение антибиотиков, алкалоидов, полипептидов, белков и т. п.) многие трудности вызываются очень медленной скоростью достижения ионообменного равновесия, а неполное значение закономерностей, управляющих кинетикой, не позволяет произвести теоретически обоснованный выбор оптимальных условий проведения процесса. [c.218]

Баллард, Бамфорд и Уэймут [363] исследовали кинетику полимеризации М-карбангидридов глицина, /-фенилаланина и й, /-фенилаланина в присутствии Ь1С1 и ЫаЛ и установили, что образуются циклические полипептиды и соответствующие производные гидантоин-З-уксусной кислоты. Образования 2,5-дике-топиперазинов не наблюдается. При концентрации ЫС1 больше 0,1 N реакция протекает по уравнению второго порядка (от концентрации катализатора). Кислоты являются ингибиторами полимеризации Ы-карбангидридов а-аминокислот. Реакция протекает путем обрыва протона от МН-группы. Если водород замещен алкильной группой, то разложения под действием ЫС1 не происходит. [c.100]

Для действия этого фермента необходимо присутствие свободной а-аминогруппы поэтому он отщепляет от пептидной цепи только N-концевую аминокислоту. Как и при действии реактива Эдмана, отщеп.тгение N-концевой аминокислоты приводит к демаскированию следующего N-концевого аминокислотного остатка. Изучение кинетики освобождения аминокислот ия полипептида дает информацию о последовательности аминокислот в цепи. В случае пептида, имеющего структуру HgN—A-B- -D и т. д., аминокислота А будет освобождаться быстрее, чем аминокислота В, а эта последняя в свою очередь быстрее, чем аминокислота С, и т. д. Лейцинаминопеп-тидаза, как явствует из ее названия, легче всего отщепляет N-концевые остатки лейцина однако она способна отщеплять также и другие аминокислотные остатки, хотя и значительно медленнее. Затруднения, встречающиеся при использовании этой методики, связаны большей частью именно с этими различиями в скорости отщепления. Если, например, в упомянутом выше гипотетическом пептиде аминокислота В является хорошим субстратом, а аминокислота А — плохим, то А и В будут отщепляться практически одновременно. [c.88]

В дополнение к материалам, изложенным в гл. VU, следует привести лишь некоторые данные по кинетике гидролиза грамицидина С. Выяснилось 1894 что сам антибиотик более устойчив к гидролизу, чем продукты его распада — нециклические полипептиды. Из последних наиболее устойчивыми являются дипептиды. [c.359]

Количественным методом измерения числа пептидных групп, связанных друг с другом водородными связями, служит изучение кинетики изотопного обмена полипептида, или белка с водой. Этот метод был развит с помощью техники дейтериевой метки Лиидерштрём-Лангом и с помощью тритиевой метки в нашей лаборатории. Речь идет о скорости обмена имидного водорода пептидной группы с растворителем. Известно, что в низкомолекулярных полипептидах этот атом водорода обменивается с водой неизмеримо быстро. Здесь он подобен подвижному водороду [c.47]

НОМ виде, как ни в одном из других случаев полимеризации. Это следствие огромных внутримолекулярных сил, приводящих к внутримолекулярной кристаллизации, сопровождающейся большими изменениями энергии. Первое, на чем следует остановить внимание, это на кинетике реакции синтеза полипептида (поли-у-бен-зилглютамата, поли-1-лейцина, поли-1-фенилаланина) в диоксане (нитробензоле) при инициировании первичным амином (гексил-амином). [c.56]

Подводя итоги, можно утверждать, что в синтезе полипептидов конфигурационная энергия, связанная с образованием а-спирали, играет большую роль. Она определяет собой кинетику образования всех витков после первых двух и заставляет растущий полимер отбирать из смеси стереоизомеров тот, который имеет естественную простанственную конфигурацию по отношению-к ра стущей спирали. [c.61]

Заведующий С. Е. Н. Bawn Направление научных исследований коллоидная химия электрохимия ядерная химия термохимия комплексы переходных металлов боразотные соединения кинетика и механизм реакций полимеризации и окисления металлорганические соединения строение высокомолекулярных соединений окисление углеводородов реакции переноса электронов в растворе гетерогенный катализ химические реакции, инициированные радиацией механизм образования полипептидов. [c.261]

Многими авторами исследован гидролиз полипептидов под действием кислот и щелочей [95—99]. Хейнс, Вальтер и Грютцмахер [100] исследовали кинетику кислого гидролиза ряда полипептидов полиглицина, поли-d,/-аланина, [c.58]

Большое влиянпо па кинетику процесса образования полипептидов оказывают примеси в исходных мономерах, наличие которых приводит к появлению индукционного периода. Ингибиторы реакции полимеризации — это такие вещества, которые способны связывать воду, как, на- [c.188]

Многими авторами исследован гидролиз полипептидов иод действием кислот и щелочей [33—37]. Симха [38] изучил кинетику гидролиза пептидной связи. Под каталитическим влиянием цианистого натрия в растворе диметилформамида легко деструктируются гомополимеры моноизоцианатов [22]. [c.263]

Хейнс, Вальтер и Грютцмахер [59] исследовали кинетику кислого гидролиза ряда полипептидов полиглицина, поли-й,/-аланина, поли-d, /-а-амииомасляиой кислоты, поли-d,/-фенилаланина, поли-й,/-порлейци-на, поли-с ,/-лейцина и поли-d,/-изолейцина. Для кинетических расчетов они применяли формулу [c.264]

Прямоугольные пластинки полиакриламидного геля имеют ряд преимуществ по сравнению с цилиндрическими гелями поэтому ниже приводится описание аппаратуры для электрофореза на пластинках, хотя из тех же самых растворов можно приготовить и цилиндрические гели. Электрофорез на одной пластинке удобнее всего для прямого сравнения нескольких образцов в совершенно одинаковых условиях (pH, температура, сила тока, градиент напряженности поля). Пример представлен на рис. 1 здесь изучалась кинетика синтеза белков, кодируемых бактериофагом Т4, в клетке Es heri hia oli. В данном случае особенно важна идентичность условий, так как спектр синтезируемых полипептидов быстро меняется и различия в величине молекулы между некоторыми синтезируемыми белками весьма незначительны. Другой пример показан на рис. 2 здесь удалось установить очень небольшие различия в величине молекул IgD-подобных иммуноглобулинов, секретируемых восьмью клонами одной линии лимфобластов человека. [c.101]

Измерение основано на изу<1ении включения меченой аминокислоты в растущие и завершенные полипептиды. Выбор метода принципиально определяется характером изменений удельной активности внутриклеточного фонда (пула) меченой аминокислоты и возможностью точного измерения 1м. Существуют также некоторые частные ограничения одни методы требуют исследования кинетики мечения на нестационарной стадии (1м 1с), другие — предполагают знание полной аминокислотной последовательности полипептида, его концевых фрагментов или концевых аминокислот. [c.278]

В некоторых случаях для определения относительных из1менений 1 нет необходимости в исследовании кинетики мечения растущих и завершенных полипептидов. Из уравнения (1) следует, что при двух различных состояниях белоксинтезирующей системы [c.280]

Рис. 29. Определение времени синтеза средней полипептидной цепи в нормальных условиях и при действии циклогексимида. Исследовали кинетику мечения растущих н завершенных полипептидов в клетках печени мыши после введения животным растворов 0,14 М Na l (а, I) или циклогексимида 0 5 мг/25 г массы тела i(a,2) и 5 мг/25 г массы тела i(6) io определяли ло уравнению 1(3)—а или по уравнению (4) —б.

Сборка оболочки вириона начинается с включения вирусного гликопротеина в плазматическую мембрану клетки. Гликопротеин VSV-Индиана претерпевает сложный путь созревания, включающий протеолитическое нарезание, присоединение и процессинг олигосахаридов, присоединение жирных кислот [51]. Эти модификации осуществляются одна за другой в ходе синтеза и последующего транспорта G-белка к поверхности клетки. Изучение кинетики этого процесса показало, что для достижения клеточной мембраны новосинтезированному G-белку требуется по меньшей мере 15 мин. В отличие от четырех других вирусных белков G-белок всегда связан с мембраной, а его мРНК обнаруживается в рибосомах, связанных с мембранами. N-конец G-белка содержит гидрофобную сигнальную последовательность, которая взаимодействует с мембраной эндоплазматического ретикулума (ЭР). Очевидно, именно эта область новосинтезированного полипептида инициирует связывание рибо- [c.436]