Рибонуклеиновые кислоты ферментативный

Ферментативная деградация рибонуклеиновой кислоты кристаллической рибонуклеазой [1503]. [c.294]

Нуклеаза стафилококка — фермент, который состоит из единственной полипептидной цепи, содержащей 149 аминокислотных остатков, и проявляет гидролитическую активность по отношению как к дезоксирибонуклеиновой кислоте (ДНК), так и к полимерам рибонуклеиновой кислоты (РНК) [294]. Особенно интересно, что ферментативная активность целиком зависит от присутствия ионов Са(И) в соизмеримых концентрациях при гидролизе РНК и ДНК. Ион Са(П) необходим также для присоединения ингибиторов к [c.114]

Нуклеозиды могут быть получены как ферментативным, так и химическим путем из любого встречающегося в природе нуклеотидного материала. Однако главным источником получения этих гли-козидов служат нуклеиновые кислоты, выделяемые из различных тканей и организмов. Расщепление рибонуклеиновой кислоты до смеси входящих в ее состав нуклеозидов может быть достигнуто различными способами, среди которых следует упомянуть гидролиз разбавленным раствором аммиака при повышенной температуре [2], кипячение в течение нескольких дней с водным пиридином [31 и гидролиз, катализируемый ионами различных металлов [4]. Предложенный недавно метод [51 основан на кипячении рибонуклеиновой кислоты (или мононуклеотида) с водным раствором форм-амида в течение нескольких часов при pH 4. Разделение и выделение нуклеозидов было в значительной степени улучшено благодаря использованию ионообменных методов [6]. [c.12]

Эти циклофосфаты сыграли важную роль в выяснении механизма миграции фосфатного остатка, а также механизма химического и ферментативного (рибонуклеаза) гидролиза рибонуклеиновой кислоты [69]. [c.133]

Помимо ряда вирусных нуклеиновых кислот, большинство выделенных полирибонуклеотидов, бесспорно, представляют собой сложные смеси, содержащие полимеры с различной длиной цепи, нуклеотидной последовательностью и составом оснований (присутствие или отсутствие минорных оснований). Существует ряд приемов для частичного фракционирования, однако, пока не разработаны удовлетворительные методы характеристики, трудно определить степень чистоты или гомогенности рибонуклеиновых кислот. В основу оценки чистоты транспортных РНК, этих сравнительно низкомолекулярных полирибонуклеотидов, может быть положена их ферментативная реакция с аминокислотами (через аминоациладенилаты), что, конечно, позволяет оценить и их биохимическую однородность. [c.365]

Левый конец каждой из помещенных выше схем нуклеиновых кислот обозначим как головное звено, а нуклеозидную компоненту справа — как хвостовое звено. Из рассмотрения описанных выше механизмов очевидно, что хотя при щелочном гидролизе цепь разрывается с образованием нуклеозид-2 - и нуклеозид-З -фосфатов, в случае нуклеиновой кислоты первого типа хвостовое звено появляется в виде свободного нуклеозида, второго типа — головное звено освобождается в виде нуклеозид-2, 5 - и нуклеозид-3, 5 -дифосфатов, а хвостовое звено — в виде нуклеозида, в то время как из нуклеиновой кислоты четвертого типа головное звено освобождается в виде нуклеозид-2, 5 - и нуклеозид-3, 5 -дифосфатов, но не образуется свободного нуклеозида. Нуклеиновая кислота третьего типа дает исключительно нуклеозид-2 - и нуклеозид-3 -фосфаты. Ферментативный гидролиз диэстеразой селезенки (специфичной для эфиров нуклеозид-З -фосфатов) привел бы к тем же результатам. Однако при применении диэстеразы змеиного яда (специфичной для эфиров нуклеозид-5 -фосфатов) можно получить дополнительную информацию. Так, в случае рибонуклеиновой кислоты первого типа из головного звена получается нуклеозид, а из остальной части цепи — нуклеозид-5 -фосфаты из нуклеиновой кислоты второго типа [c.388]

В свете современных представлений о метаболизме в растительной клетке местом действия физиологически активных веществ могут быть а) ферменты и ферментные системы б) белки, липиды, нуклеиновые кислоты, участвующие в молекулярной организации структур цитоплазмы и ядра в) информационные и транспортные рибонуклеиновые кислоты г) дезоксирибонуклеиновая кислота. Надо полагать, что эффект, или глубина , воздействия зависит от того, на что и в какой мере влияет то или иное физиологически активное вещество. В одних случаях это действие ограничивается лишь временным изменением интенсивности каких-либо ферментативных реакций, в других — [c.5]

РНК-полимераза, определяемая ранее по способности включать рибонуклеозидтрифосфаты в рибонуклеиновые кислоты в присутствии ДНК-матрицы, сейчас может рассматриваться как часть более сложного комплекса, участвующего в транскрипции. Исходная ферментативная активность-это лишь минимальный компонент того, что можно назвать РНК-полимеразой. Она лишь контролирует правильное спаривание рибонуклеотидов с ДНК и катализирует образование фосфодиэфирных связей между ними. [c.132]

За открытие ферментативной активности рибонуклеиновых кислот. За развитие теории и методологии органического синтеза. [c.628]

В 1959 г. был основан Институт молекулярной биологии АН СССР, нося-нщй имя академика В. А. Энгельгардта, открывшего (совместно с М. Н. Любимовой) ферментативные свойства белка мышц, изучившего новые пути распада углеводов и впервые высказавшего идею об окислительном с-форилировании. В. А. Энгельгардт был пионером в изучении биологических явлений на молекулярном уровне, и его работы по механохимии мышц, по существу, открыли эру молекулярной биологии. Основные проблемы этой новой науки находятся сейчас в центре внимания коллектива упомянутого института, добившегося существенных успехов в расшифровке структуры и механизма действия ферментов (А. Е. Браунштейн), строения и функций транспортных рибонуклеиновых кислот (А. А. Баев), регуляции активности генома, нуклеосомной организации хроматина и ряде других направлений. [c.12]

Для получения рибонуклеозид-5 -фосфатов используется ряд методов, в том числе химический и ферментативный гидролиз рибонуклеиновой кислоты, ферментативное фосфорилирование рибонуклеозидов, а также химические синтезы. Для препаративного получения рибонуклео-зид-5 -фосфатов пригодны только химические синтезы. [c.340]

Известно неск. типов РНК. Рибосомные рибонуклеиновые кислоты, связываясь с рибосомными белками, образуют рибосомы, в к-рых осуществляется синтез белка. Матричные рибонуклеиновые кислоты служат матрицами для синтеза белков (трансляции). тРНК осуществляют связывание соответствующей аминокислоты и ее перенос к рибосомам. Обнаружены т.наз. малые ядерные РНК, участвующие в превращ. первичных продуктов транскрипции в функционирующие молекулы т.наз. антисмысловые РНК участвуют в регуляции биосинтеза белка и репликации плазмидных ДНК. В виде РНК представлены геиомы мн. вирусов (РНК-содержащие вирусы), в к-рых матрицами для синтеза РНК служат вирусные РНК. Нек-рые РНК обладают ферментативной активностью, катализируя расщепление и образование фосфодиэфирных связей в своих собственных или др. молекулах РНК. [c.298]

При определенных условиях расщепления рибонуклеиновых кислот образуются циклические фосфаты, представляющие собой д -эфиры ортофосфорной кислоты с 2 - и З -гидроксильными группами рибозы. Они называются нуклеозид-2, З -циклофосфатами и обозначаются N > р (например, адеиозин-2, З -циклофосфат, или А> р). Циклофосфаты типа (а) N(1 , 5 ) > р не образуются при расщеплении нуклеиновых кислот. Некоторые из иих, иапример аденозин-3 , 5 -циклофосфат (см. с. 240), являются продуктами ферментативных реакций, протекающих в клетке, и играют важную биологическую роль. [c.301]

Из дезоксирибонуклеиновых кислот, значительно более устойчивых к действию щелочей, чем рибонуклеиновые кислоты, и требующих для гидролиза других ферментативных систем, можно с помощью мшеральных кислот отщепить пурины и получить тиминовые кислоты используя ферменты поджелудочной железы получают олигонуклеотиды . [c.436]

Гейл [643], обстоятельно изучавший процессы включения аминокислот и синтез белка у бактерий, сообшил, что включение аминокислот в фрагменты разрушенных клеток стафилококка ускоряется рибонуклеиновой кислотой. Далее он установил, что некоторые продукты ферментативного расщепления рибонуклеиновой кислоты также стимулируют включение аминокислот. По-видимому, в таких продуктах гидролиза содержится ряд активирующих веществ, химическая природа которых еще не установлена . [c.280]

Продукт полинуклеотидфосфорилазной реакции представляет собой линейный сополимер со случайной последовательностью рибонуклеотидных мономеров, связанных между собой 3, 5 -фосфодиэфирными связями (что было доказано путем химической и ферментативной деградации этого продукта). Таким образом, продукт полинуклеотидфосфорилазной реакции химически идентичен природным рибонуклеиновым кислотам. [c.512]

Первый нуклеотид, инозиновая кислота (по-гречески — мышечная ткань), был выделен Либихом [2] в 1847 г. из мясного экстракта отчасти как результат полелп1ки, поднятой Берцелиусом по поводу наличия креатина в сыром и вареном мясе). С тех пор было выделено большое число мононуклеотидов, как правило, 5 -фосфаты, хотя в яде тигровых змей и родственных видов был найден также аденозин-З -фосфат 13]. Эти соединения выделяют прямой экстракцией тканей или организмов 14—9], в которых они обычно присутствуют в небольших количествах в качестве промежуточных соеди-нени1 обмена. Однако основным источником мононуклеотидов являются их полимерные производные, нуклеиновые кислоты. При щелочном гидролизе в мягких условиях [10, 11] рибонуклеиновой кислоты образуется смесь 2 - и З -фосфатов нуклеозидов, которую можно легко разделить с помощью ионообменной хроматографии 112], Для выделения аналогичных 5 -эфиров требуется применение ферментативного гидролиза, как правило, с использованием фосфо-диэстеразы змеиного яда 113, 14]. Подобная ферментативная обработка дезоксирибонуклеиновой кислоты после предварительной обработки дезоксирибонуклеазой приводит к дезоксинуклеозид-5 -фосфатаы [15—17]. Очищенная диэстераза змеиного яда значи- [c.123]

Как и в случае адениновых нуклеотидов, широкое распространение имеют 5 -фосфаты, 5 -пирофосфаты и 5 -трифосфаты цитидина, гуанозина и уридина [13—16]. Они являются промежуточными соединениями при биосинтезе рибонуклеиновых кислот. Трифос-фаты участвуют также в биосинтезе ряда диэтерифицированных пирофосфатных производных кроме того, они заменяют АТФ в качестве фосфорилирующего агента или кофермента в некоторых ферментативных реакциях [17—21]. Полифосфаты дезоксинуклеозидов также выделены [22—25], и снова, помимо функции непосредственных предшественников дезоксинуклеиновой кислоты, второй нх главной функцией является, вероятно, участие в биосинтезе промежуточных соединений, таких, как тимидин-5 -пирофосфат-глюкоза и дезоксицитидин-5 -пирофосфатхолин. Строение всех этих нуклеозидполифосфатов установлено методами, аналогичными примененным для определения строения АТФ, и подтверждено синтезом. [c.189]

Описано несколько других систем, которые катализируют включение концевых рибонуклеотидов в РНК- Они, возможно, и не имеют отношения к специфическому синтезу РНК de novo, так как рибонуклеиновые кислоты, вероятно, образуются путем постепенного присоединения нуклеотидов и концевые фрагменты, по-видимому, должны быть более чувствительны к обратимому пирофосфоро-лизу, чем внутренние нуклеотиды. Однако важным фактором при включении в концевые группы может быть отсутствие подходящего рибонуклеозид-5 -трифосфата. В различных рибонуклеиновых кислотах было идентифицировано около тринадцати различных нуклеозидов при попытке вызвать ферментативную полимеризацию-четырех основных нуклеотидов встретились затруднения, препятствующие образованию полинуклеотида с достаточно высокой длиной цепи. Тем не менее существуют прямые доказательства синтеза полирибонуклеотидов из рибонуклеозид-5 -трифосфатов в животных системах. Например, экстракты из ядер зобной железы теленка после фракционирования дают ферментные препараты, которые катализируют образование полиадениловой кислоты (длиной 25—100 нуклеотидов) из аденозин-5 -трифосфатов. В присутствии затравочной РНК цитидин-5 -трифосфат превращается в по-лицитидиловую кислоту частично очищенным ферментом (в отличие от фермента, специфичного для АТФ) из того же самого источника. В случае других систем животных (ядра печени крысы) моно-нуклеотидный остаток цитидин-5 -трифосфата (а-Р ) включается во внутренние участки, а не в конец цепи. Включение заметно стимулируется АТФ, ГТФ и УТФ, в то время как рибонуклеаза и дезоксирибонуклеаза заметно понижают включение. [c.318]

Методы, используемые для экстракции рибонуклеиновых кислот, частично зависят от природы органа или организма. В одном из ранних методов, использованном Левиным 11], к густому тесту из дрожжей добавляли щелочь, смесь перемешивали с пикриновой кислотой, фильтровали и нуклеиновую кислоту осаждали из фильтрата добавлением соляной кислоты. Такая довольно жесткая обработка приводила к тому, что полученная нуклеиновая кислота значительно отличалась от нативной рибонуклеиновой кислоты. Для выделения рибонуклеиновых кислот, приближающихся по структуре к нуклеиновым кислотам живой клетки, необходимо избегать применения жестких условий (pH, тедтература) в то же время необходимо, насколько возможно, затормозить ферментативный распад. Широко применялась экстракция рибонуклеопротеидов изотоническим раствором хлористого натрия [2,3]. Белки от нуклеиновых кислот могут быть отщеплены различными методами, такими, как обработка смесями хлороформа с октиловым спиртом [4], додецилсульфатом натрия [5], нитратом стронция [6] или спиртом [7], а также расщепление белковой фракции трипсином [8]. И снова эффективность каждого метода определяется природой рибонуклеопротеида. Для инактивации ферментов в процессе экстракции полезно применение хлоргидрата гуанидина (денатурирующего агента) [9] для выделения рибонуклеиновых кислот и нативных рибонуклеопротеидов из дрожжей был применен метод. [c.364]

Хотя на данном этапе методы химического гидролиза не позволяют сделать выбора между 3 —5 - и 2 —5 -межнуклеотидными связями, доказательства, по-видимому, исключительного присутствия 3 —5 -структуры были получены на основании исследований ферментативного гидролиза рибонуклеиновых кислот и простых нуклеотидных производных. Из различных источников был выделен ряд нуклеаз, которые катализируют гидролиз нуклеиновых кислот на более мелкие фрагменты. Панкреатическая рибонуклеаза [93] — один из группы ферментов, обнаруживающих высокую специфичность к рибонуклеиновым кислотам,— была тщательно изучена и дано объяснение механизма ее действия. Ранние исследования показали, что фермент действует по пиримидиннуклеозидным звеньям, так как крупные педиализуемые остатки после ферментативного расщепления рибонуклеиновой кислоты значительно обогащены пуринами [94] кроме того, выделяются пиримидиновые мононуклеотиды, но не обнаружено свободных пуриновых мононуклеотидов [75, 95, 96]. Дальнейшие исследования кислотного или щелочного гидролиза продуктов, полученных в результате последовательной обработки рибонуклеиновой кислоты рибонуклеазой и фосфомоноэстеразой предстательной железы, привели к заключению, что специфичность рибонуклеазы такова, что нуклеиновые кислоты расщепляются ею с образованием смеси пиримидиновых мононуклеотидов и пуриновых олигонуклеотидов, содержащих в качестве концевой единицы пиримидиновый нуклео-зид-2 (или 3 )-фосфат [75, 97]. [c.377]

И З -фосфатов пуриновых нуклеозидов и З -фосфатов только пиримидиновых нуклеозидов. (Миграции моноэтерифицированного фосфата в щелочных условиях не происходит.) Специфическое действие рибонуклеазы, катализирующей образование пиримидиновых нуклеотидов из участков нуклеиновой кислоты с двумя или более соседними пиримидиновыми остатками и олигонуклеотидов из участков, где пуриновые нуклеотиды ограничены пиримидиновыми нуклеотидами, было показано в результате изучения ферментативного гидролиза простых эфиров мононуклеотидов. В то время как алкиловые (бензиловые, метиловые и этиловые) эфиры пиримидиновых нуклеозид-З -фосфатов легко превращаются в свободные З -нуклеотиды через нуклеозид-2, З -циклофосфаты, аналогичные эфиры пиримидиновых нуклеозид-2 -фосфатов (или пуриновых нуклеозид-2 - или нуклеозид-З -фосфатов) совершенно не затрагиваются. Следовательно, в рибонуклеиновой кислоте все остатки пиримидиновых нуклеотидов соединены скорее через З -фосфатную, чем через 2 -фосфатную группу [87]. Наконец, применение нуклеазы селезенки, которая расщепляет рибонуклеиновую кислоту как на пуриновые, так и на пиримидиновые нуклеотиды, этерифицированные по З -гидроксильной группе без промежуточного образования нуклеозид-2, З -цикло- [c.378]

Определения молекулярного веса рибонуклеиновых кислот часто приводили к противоречивым результатам, отчасти из-за того, что размер молекулы сильно зависит от предварительной обработки. Последнее может приводить не только к низким значениям молекулярного веса (в результате ферментативного или химического разрыва ковалентных связей), но также к обманчиво высокому молекулярному весу (в результате агрегации отдельных линейных цепей). Помимо изменения нуклеиновых кислот, связанного с экстракцией, внутри живой клетки, несомненно, наблюдаются значительные вариации длины цепей рибонуклеиновых кислот с различными биологическими функциями непосредственная экстракция дает поэтому сложную смесь. Молекулярный вес рибонуклеиновых кислот колеблется приблизительно от 15000 (соответствующего примерно 50 нуклеотидам) до 2,1 10 . Последнее значение отмечено для свежевыделенной рибонуклеиновой кислоты из вируса табачной мозаики и соответствует длине цепи приблизительно в 6000 нуклеотидов, так как нуклеиновая кислота существует, по-видимому, в виде одиночной свернутой цепи [106]. Большинство коммерческих препаратов рибопуклеиновой кислоты из дрожжей после очистки имеют среднюю длину цепи примерно 6 или 7 нуклеотидов. [c.379]

Из культуральной жидкости Ba illus subtilis выделена кристаллическая внеклеточная рибонуклеаза. Ее действие подобно действию панкреатической рибонуклеазы фермент катализирует специфический гидролиз эфирных связей в эфирах пуриновых рибо-нуклеозид-3 -фосфатов [177]. Из гороха [178, 179] и листьев табака [180] выделены другие рибонуклеазы, расщепляющие все межнуклеотидные связи в рибонуклеиновых кислотах с образованием нуклеозид-З -фосфатов (или 2, 3 -циклофосфатов). Абсолютной специфичности у этих ферментов не обнаружено одни связи расщепляются быстрее, чем другие. Ценное, по-видимому, свойство рибонуклеазы из райграсса заключается в значительном снижении скорости гидролиза с уменьшением размера полинуклеотидного субстрата, так что в ферментативном гидролизате накапливаются существенные количества разнообразных олигонуклеотидных промежуточных продуктов [181]. Фермент расщепляет олигонуклеотиды независимо от природы их концевых групп. [c.395]

После гидрогенолиза бензильной группы и обработки щелочью в очень мягких условиях образовалась смесь продуктов, из которой аденилил-2 5 -уридин (аденозин-2 -уридпп-5 -фосфат) выделяли с помощью ионообменной хроматографии. В противоположность щелочеустойчивому ди(нуклеозид-5 )-фосфату, который был описан выше, этот диэфир обнаружил многие свойства, характерные для рибонуклеиновых кислот. При щелочном гидролизе этого динуклеозидфосфата образуются уридин и смесь аденозин-2 -и аденозин-З -фосфатов ферментативный гидролиз диэстеразой змеиного яда приводит к аденозину и уридип-5 -фосфату а при окислении перйодатом с последующим выдерживанием при pH 10 получаются урацил и аденозин-2 -фосфат [8. [c.477]

При осторожном щелочном гидролизе рибонуклеиновых кислот или гидролизе с помощью ферментов (например, рибонуклеазой для рибонуклеиновых кислот, фосфодиэстеразой змеиного яда для дезоксирибонуклеиновых кислот) можно расщепить высокомолекулярные полинуклеотиды на простые нуклеотиды. В молекуле простого нуклеотида тот или иной из перечисленных выше гетероциклов связан с рибозой (в ДНК — с дезоксирибозой) и фосфорной кислотой, этерифицирующей сахарную часть нуклеотида. Это явствует из того, что среди продуктов гидролиза, проведенного в соответствующих условиях, можно найти свободный гетероцикл и изомерные фосфаты Д-рибозы (соответственно /)-2-дезоксири-бозы). С другой стороны, гидролиз нуклеиновых кислот или изолированных нуклеотидов можно (ферментативно или действием аммиака) довести и до соответствующих нуклеозидов, т. е. отщепить фосфорную кислоту, оставив связанными гетероцикл и сахар. Таким образом, нуклеотиды — мономеры , поликонденсацией которых (с отщеплением воды) образуются полинуклеотиды ( полимеры ), — представляют собой фосфорные вфиры нуклеозидов. Поскольку продукты гидролиза нуклеозидов — пириииди-новые и пуриновые гетероциклы (а также рибоза или дезоксирибова), идентифицируются сличением с известными образцами, остается установить место связи гетероцикла с сахаром, характер их циклизации, конфигурацию гликозидного центра и, наконец, место фосфорилирования сахарной части молекулы. [c.712]

С помощью различных химических и ферментативных методов им удалось удалить из экстракта белки, полисахариды и рибонуклеиновую кислоту, не нарушив способности к трансформации R-мутантов в дикий тип S. Наконец, после дальнейшей очистки экстракта Эйвери, Мак-Леод и Мак-Карти пришли к выводу, что трансформирующим началом служит ДНК даже в том случае, если чистую ДНК из экстракта S-клеток развести 6-10 частями воды и добавить такое незначительное количество к культуре R-клеток, трансформация R- S еще будет иметь место. Более того, ДНК, выделенная из культуры S-бактерий, являющихся потомками бактерии, которая ранее сама была трансформирована из R-клетки, [c.158]

США Олтмен С, Чек Т. Р. Открытие ферментативной активности рибонуклеиновых кислот [c.543]

Примером химического строения ферментов может служить рибонуклеаза. Первый ферментный белок, первичная структура которого была определена в 1960—1962 гг.,— рибонуклеаза — фермент, катализирующий расщепление рибонуклеиновой кислоты, В 1969 г. осуществлен его химический синтез. Молекулярная масса кристаллической рибонуклеазы равна 13 683. Поли-пептидиая цепь этого фермента состоит из 124 аминокислотных остатков и четырех дисульфидных мостиков, которые, по-видн-мому, связывают между собой отдельные участки. полипептидной цепи рибонуклеазы и поддерживают третичную структуру белка. Концевыми аминокислотами рибонуклеазы являются лизин и валин. Установлено, что каталитическая активность рибонуклеазы зависит главным образом от наличия В ней двух гистидиновых остатков, а молекула фермента свернута таким образом, что эти два аминокислотных остатка — один в начале, другой в конце полипептидной цепи — оказываются в непосредственной близости один от другого. Если блокировать свободную аминогруппу остатка лизина, то также происходит полная потеря каталитической активности фермента. Это свидетельствует о том, что ферментативные свойства рибонуклеазы, а также других ферментов зависят от структуры определенных участков полипептидной цепи и их взаимодействия, т. е. от структуры активного центра фермента. [c.76]

Понятие энзнмология в настоящее время расщирено в связи с двумя основными обстоятельствами. Во-первых, экспериментальным путем доказано, что ферментативными свойствами обладают не только белки, но и рибонуклеиновые кислоты (так называемые рибозимы). Во-вторых, среди белковых посредников биохимических процессов обнаружены не только ферменты (катализаторы биохимических реакций), но и клеточные компоненты, узнающие и транслоцирую-щие (компоненты систем таксиса, транспортных систем и т.д.), которые прямо не катализируют никаких химических реакций. Предметом энзимологии в настоящее время можно считать описание любых посредников биохимических процессов, а в ее задачу входит изучение физических и химических основ функционирования этих посредников и их физиологической роли в живом организме. [c.5]

Смотреть страницы где упоминается термин Рибонуклеиновые кислоты ферментативный: [c.777] [c.137] [c.233] [c.316] [c.367] [c.386] [c.393] [c.413] [c.414] [c.417] [c.427] [c.520] [c.36] [c.683] [c.674] [c.180] [c.26] [c.320] [c.423] [c.181]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология