Основные u-аминокислоты белков

Однако для белков такое соотношение не обязательно выполняется, поскольку они могут связывать и другие, помимо протонов, ионы, которые вносят вклад в общий баланс зарядов (при условии нейтральности молекулы белка). Можно ожидать, что белки в изоэлектрической точке обладают меньшей растворимостью, чем при меньших или больших значениях pH, и это действительно имеет место. Поскольку в изоэлектрической точке молекула белка не обладает избыточным зарядом, в этих условиях белок легче агрегирует и осаждается. Далее, поскольку аминокислотный состав разных белков различен, для каждого белка существует характеристическое значение р/е. Это свойство является основой метода очистки белков путем изоэлектрического осаждения (осаждения в изоэлектрических условиях) pH смеси белков доводится до значения, равного значению р/ искомого белка, так что последний осаждается из смеси. Значение р/г аминокислот с нейтральной боковой цепью равно 5,6 0,5 для аминокислот, содержащих кислые группы, р/ ниже, а для аминокислот с основными группами в боковых цепях — выше. В то же время для белков р/ может меняться от О до И. Вывод формул для расчета р/ аминокислот имеется в большинстве учебников биохимии. [c.32]

Подобно протеолитическим ферментам поджелудочной железы, пепсин синтезируется в форме предшественника пепсиногена (обш,ее название всех подобных предшественников — зимоген). Пепсиноген — белок, полученный в кристаллическом виде,— содержится в слизистой желудка его молекулярный вес равен приблизительно 42 ООО, а изоэлектрическая точка лежит при pH 3,7. Превращение пепсиногена в пепсин катализируется ионами водорода поэтому можно полагать, что оно осуществляется после перехода пепсиногена в сильно кислый желудочный сок. Роль катализатора в этой реакции играет, по-видимому, сам пепсин. Реакция активации является, таким образом, аутокаталитической. Поскольку молекулярный вес пепсина равен 35 ООО, превращение пепсиноген-> пепсин связано со значительным укорочением полипептидной цепи. Оно происходит за счет отщепления N-концевого участка пепсиногена, в котором сосредоточены все основные аминокислоты. Среди продуктов отщепления обнаруживается ингибитор пепсина с молекулярным весом 3242 и пять более мелких фрагментов, в сумме отвечающих молекулярному весу около 4000. Связи, но которым атакует пепсин, показаны на фиг. 122. [c.424]

Флуоресценция мембранных систем наблюдается главным образом потому, что один из их основных компонентов — белок, как правило, обладает собственной флуоресценцией. Это обусловлено наличием в белковых молекулах ароматических аминокислот — триптофана, тирозина и фенилаланина. Основной вклад во флуоресценцию вносит триптофан. Весьма существенно, что интенсивность флуоресценции триптофана и положение ее максимума зависят от гидрофобности окружения этой аминокислоты и от свойств растворителя. [c.118]

Как и для аминокислот, значение pH, при котором белок в неких экспериментальных условиях имеет суммарный нулевой заряд, называется изоэлектрической точкой. В этой точке белок не обладает подвижностью в электрическом поле. Чем выше в белке количественное соотношение [кислые аминокислоты] / [основные аминокислоты], тем ниже его изоэлектрическая точка. У кислых белков р/< 7, у нейтральных р/около 7, а у основных р/ 7. Значения изоэлектрических точек некоторых белков представлены в табл. 1.4. [c.73]

Методика получения пептидных карт или отпечатков пальцев очень полезна при определении идентичности полипептидных цепей. Согласно этой методике, белок обрабатывают трипсином, который избирательно гидролизует пептидные связи, образованные карбоксильными группами основных аминокислот, аргинина и лизина. Образующаяся смесь пептидов разделяется с помощью хроматографии и электрофореза. Эквивалентный вес полипептидной цепи рассчитывают по количеству аргинина и лизина в белке и числу разных пептидов, получаемых при триптическом гидролизе. Теоретически общее число пептидов должно равняться сумме числа остатков аргинина и лизина плюс один, [c.401]

ДОВ. При расщеплении белковой части хлоропластов ими были обнаружены следующие аминокислоты аргинин, лизин, тирозин, фенилаланин и глютаминовая кислота, т. е. почти все основные аминокислоты, имеющиеся и в глобине, за исключением гистидина, чем, по их мнению, белок хлорофилла и отличается от белка гемоглобина. Однако через восемь лет советские физиологи Осипова и Тимофеева показали наличие гистидина и в хлоро-филл-белковом комплексе. [c.187]

Структурный рибосомальный белок, подобно гистонам и протаминам, содержит значительные количества основных аминокислот (аргинина, лизина, гистидина), характеризуется низким содержанием цистеина, остальные аминокислоты представлены полностью [c.462]

Ферментативные методы гидролиза особенно ценны благодаря присущей им во многих случаях специфичности. Трипсин, представляющий собой так называемую эндопептидазу, быстро расщепляет пептидные связи лишь в том случае, если карбонильная группа расщепляемой амидной связи принадлежит одной из основных аминокислот — лизину или аргинину. Таким образом, трипсин превращает белок в сравнительно малое число триптических пептидов, которые можно разделить и охарактеризовать. Трипсин расщепляет только денатурированные белки, причем для получения хороших результатов нужно предварительно разорвать дисульфидные мостики. [c.166]

Из белого вещества головного мозга сначала извлекаются кислые белки, а затем из них выделяют липиды. После соответствующей обработки выделяется основной белок, количество которого составляет примерно 1% от сырого веса белого вещества мозга. Этот белок делится на 2 и более фракций, в которых обнаружено большое количество основных аминокислот. [c.160]

Б. Для G-белка VSV минимальная длина трансмембранного сегмента, по-видимому, составляет 8 аминокислотных остатков или даже меньше это видно из того, что трансмембранный сегмент всего из 8 аминокислотных остатков закреплял модифицированный G-белок практически так же, как закреплен нормальный G-белок. Этот результат удивителен тем, что цепочка из 8 аминокислотных остатков, уложенная в структуру типа а-спирали, казалось бы недостаточно длинна, чтобы пересечь мембрану по толщине. Имеется несколько возможностей короткие сегменты, проходящие сквозь мембрану, могут быть полностью вытянуты, а не уложены в виде а-спирали толщина мембраны в месте проникновения этих сегментов может быть менее 3 нм соседние с этим сегментом части G-белка, включая по крайней мере одну основную аминокислоту (К или R), могут тоже заходить в мембрану. [c.379]

Белок и РНК в рибосомных частицах соединены очень непрочными связями уже при инкубации с 0,5—1 М растворами солей при низкой температуре происходит отделение белка от нуклеиновой кислоты. Аналогичная диссоциация происходит, например, при pH 12 в условиях электрофореза. Связи белков с нуклеиновыми кислотами в рибосомах оценивают в основном как электростатические. Высокое содержание в суммарных рибосомальных белках основных аминокислот (12% лизина, 11 % аргинина и 3% гистидина), заряженных положительно, и большое число межнуклеотидных фосфатов в рибосомальных РНК, заряженных отрицательно, обеспечивают условия для возникновения достаточного количества ионных связей между первыми и вторыми. [c.286]

Гистон — белок с повышенным содержанием основных аминокислот, который встречается в хромосомах всех эукариотических клеток, за исключением спермы. [c.540]

И неполноценные, в которых отсутствует одна или несколько незаменимых аминокислот. С этой точки зрения казеин — основной белок молока— является полноценным белком, тогда как желатина — белок, получаемый из костей и сухожилий (при частичном гидролизе нерастворимого белка коллагена образуется желатина), — неполноценный белок. Желатина не содержит триптофана, валина и очень мало содержит или совсем не содержит треонина. [c.390]

Быстро возрастающий интерес к этой проблеме, помимо ее фундаментального значения, связан с тем, что лишь с недавнего времени промежуточные стадии биосинтеза белка стали доступны для химического изучения. Так, недавно было обнаружено, что системы, активирующие внедрение аминокислот, меченных С , в белок, могут быть разделены центрифугированием на две основные фракции — микросомы и растворимые энзимы. [c.263]

Преждевременное превращение таких проферментов, как трипсиноген, в активные протеиназы в поджелудочной железе может иметь губительные последствия. Чтобы предотвратить такую преждевременную активацию, поджелудочная железа должна вырабатывать также специфические ингибиторы. Панкреатический ингибитор трипсина представляет собой небольшой белок с мол. весом 6500, специфически связывающийся в активном центре трипсина (Л[г=10 М в щелочной среде) . Определение кристаллической структуры самого трипсина и его ингибитора показало, что эти две молекулы плотно прилегают друг к другуб. Ингибитор связывается таким образом, как будто он является пептидным субстратом один край молекулы ингибитора образует антипараллельную р-структуру с пептидной цепью фермента. Лизин-15, образующий часть этой р-структуры, входит в специфический связывающий центр для основной аминокислоты субстрата. Таким образом, ингибитор протеиназы представляет собой модифицированный субстрат, который фактически может подвергаться атаке в активном центре. Однако подгонка двух молекул является настолько тесной, что молекула воды не может участвовать в завершающей стадии каталитического акта, и комплекс остается нереакционноспособным. (В тонкой кишке количество ингиби- [c.113]

Другой внутренней монооксигеназой является лизиноксигеназа, тет-рамерный РАО-содержащий белок, состоящий нз субъединиц с мол. весом - 61000 [140]1. Монооксигеназы сходного типа, продуцируемые бактериями, атакуют аргинин и другие основные аминокислоты. Опять-таки, судя по образующимся продуктам [уравнение (10-49)], и здесь за отщеплением водородов следует окислительное декарбоксилирование под действием Н2О2, как и в уравнении (8-67). [c.437]

Используя технику клонирования ДНК [599] и анализа нуклеотидных последовательностей [600], Наканнши и сотр. foOl] установили нуклеотидную последовательность мРНК-предшественника. Нумерация аминокислотной последовательности положительная справа от N-концевой аминокислоты АКТГ, в левую сторону отсчет идет со знаком минус. Белок-предшественник содержит 8 пар основных аминокислот и одну двойную пару -Lys-Lys-Arg-Arg. В этих местах происходит ферментативное расщепление белка с образованием различных пептидов. /3-Липотропин образует С-концевую область и, вероятно, отщепляется непосредственно от предшественника. Общая схема ферментативного расщепления и вид фрагментации к настоящему времени еще не установлены. В отличие от известных последовательностей /3-липотропинов свиньи и овцы /3-липотропин теленка содержит между 35 и 36 аминокислотными остатками два дополнительных (-Ala-Glu-) этим объясняются различные длины цепей липотропинов (см. схему). Анализ на ЭВМ аминокислотной последовательности отрицательной части предшественника дал интересный результат между позициями —55 и —44 найдена аминокислотная последовательность -Tyr-Val-Met-Gly-His-Phe-Arg-Trp-Asn-Arg-Phe-Gly-, имеющая большое сходство с а- н /3-МСГ. Так как в области аминокислотной последовательности предшественника от —111 до —105 присутствует еще один участок, имеющий структурное сходство с МСГ-пептидами, предполагается существование серии дупликаций гена, аналогично имеющей место в случае иммуноглобулинов. О [c.242]

Последовательность аминокислотных остатков в полипептид-,ной цепи называется ее первичной структурой. Определение пер.-вичной структуры производится путем частичного гидролиза белка с помощью специфических протеаз, катализирующих расщепление пептидной связи лишь между определенными остатками. Так, трипсин атакует лишь те пептидные связи, которые образованы СО-группами остатков основных аминокислот — Apr или Лиз. В результате образуется смесь коротких полипептидных цепей, олигомеров. Такие короткие цепи называются пептидами. Их исследование производится посредством химических и физико-химических методов (хроматография, масс-спектроскопия). Воздействуя другим ферментом, можно разрезать белок по другим связям, получить смесь других пептидов. N- и С-конце-вые остатки белка (см. стр. 68) определяются в результате их химической модификации, предшествующей частичному гидролизу. Зная строение пептидов, полученных при специфическом расщеплении различными ферментами, можно установить первичную структуру белка. Допустим, что белковая цепь имеет структуру [c.73]

В последнее время появилась возможность определять аминокислотный состав белков с помощью автоматических аминокислотных анализаторов. Когда в 1948 г. Мур и Стейн [551 в дополнение к классическим методам органической химии, а также манометрическому и бактериологическому анализу ввели ионообменную хроматографию, наступил поворотный момент в развитии химии аминокислот. В основу работы созданных сотрудниками Рокфеллеровского института современных автоматических аминокислотных анализаторов была положена ионообменная хроматография. Принцип работы этих приборов заключается в следующем. Исследуемый белок гидролизуют, затем гидролизат подвергают хроматографии на смоле типа дауэкс 50 х8 в Na-форме. Элюирование производят с помощью непрерывной подачи буферного раствора. Выходящий из колонки элюат попадает в пластмассовую ячейку особой формы, где он смешивается с раствором нингидрина. Подачу нингидрина осуществляет специальный насос, работающий синхронно с насосом, подающим буферный раствор на колонку. Затем смесь элюата с нингидрином проходит через тефлоновый капилляр, который погружен в кипящую баню. В этих условиях в растворах происходит нингидриновое окрашивание, интенсивность которого измеряется в проточной кювете спектрофотометрически. Поглощение света регистрируется самописцем. Применение сферических смол [80] позволило сократить время исследования одного образца примерно в четыре раза, а использование особых ячеек сделало вполне допустимыми для анализа очень малые количества исследуемого вещества — порядка 0,01—0,05 мкмоля [38]. Введение одноколоночной процедуры значительно упрощает метод [9, 29, 43, 60]. С помощью этой методики в одной и той же пробе можно определить кислые, нейтральные и основные аминокислоты, что не только экономит исследуемый материал, но и повышает точность и сокращает время исследования. Работая на стандартном аминокислотном анализаторе и пользуясь некоторыми модификациями известных методов, можно полностью закончить анализ одного вещества в течение 3 ч [91. [c.32]

Эластин. Этот белок почти совсе.м не содержит основных аминокислот. [c.66]

При определенной величине pH раствора в молекуле белка устанавливается равенство пололсительных и отрицательных зарядов. В зависимости от числа и природы основных и кислых групп в белке это равенство (изоэлектрическая точка) достигается у разных белков при разных концентрациях водородных ионов. Так, например, у клупеина (белок спермы рыбы), содержащего большое количество основных аминокислот, изоэлектрическая точка лежит в щелочной зоне. [c.699]

Рибосомный белок гороха содержит значительное количество основных аминокислот, что естественно для белка, который должен взаимодействовать с отрицательно заряженными фосфатными группами рибосомной РНК. Рибосомный белок содержит также значительные количества дикарбоновых аминокислот — глутаминовой [c.21]

Гены — это структуры, которые обеспечивают сохранение видов из поколения в поколение путем передачи информации от материнской клетки к дочерней. В каждом полимере ДНК содержится несколько основных единиц генетической информации. Единственной структурной переменной в цепи ДНК, ответственной за хранение информации, является последовательность четырех оснований. Наименьшая единица информации в ДНК — кодон — состоит из последовательности трех нуклеотидных остатков. Ксдон контролирует включение данной аминокислоты в определенный белок. [c.483]

Установлено, что на поверхности антитела имеются чаш е всего две чрезвычайно специфические группы — активные центры, жадно соединяющиеся с некоторыми группами на поверхности антигенных белков. Специфичность соединения антитела с антигеном, т. е. бе.ттком, к которому выработаны антитела, очень велика. Антигеном может служить почти каждый белок организма чуждого вида. Антигенами служат белки, составляющие поверхностную оболочку бактерий или вирусов. В последнее время показано, что антигеном может явиться ДПК, подвергнутая тепловой денатурации,некоторые синтетические полипептиды, содержащие основные аминокислоты, в особенности гистидин. Однако в последних случаях нет уверенности, что ДПК или полипептид не соединяются предварительно с одним из белков крови животного, подвергнутого иммунизации, и уже в таком виде становятся антигенами. [c.501]

Цитохром с в нативном состоянии не окисляется молекулярным кислородом и не присоединяет окиси углерода. Он термостабилен и при кратковременном кипячении его растворов сохраняет свою активность. Молекулярный вес максимально очищенных препаратов цитохрома с около 15 000, белок цитохрома с богат основными аминокислотами, и его изоэлект-рическая точка расположена при pH 10. [c.267]

Чтобы удалить белок из плазмы крови, к последней добавляют пикрат [184] или лучше (чтобы избежать потери основных аминокислот) сульфосалициловую кислоту [185], смесь фильтруют, не содержащий белков фильтрат очищают методом катионообменной хроматографии на колонке (50X8 мм) с дауэксом AG50W-X8. Методики очистки образцов мочи перед разделением и количественным определением в нем аминокислот и пептидов описаны в работах [2, 182]. [c.69]

Аминокислотный анализ исследуемого белка, проведенный на анализаторе аминокислот JL -3B фирмы JEOL, свидетельствует о явном преобладании в нем основных аминокислот (лизина, гистидина и аргинина). Сумма этих аминокислот в два раза превышает содержание дикар-боновых аминокислот. По аминокислотному составу выделенный белок практически идентичен энцефалитогенному белку, полученному другими авторами из ткани головного и спинного мозга (Паллад1н и др., 1970). [c.25]

Основные закономерности белок-нуклеинового взаимодействия можно понять, изучая отдельные этапы, лежащие в основе экспрессии генов. Как синтетаза узнает нужные ей тРНК и аминокислоты Как рибосомы узнают только ту тРНК, кодон которой находится в участке А Как ДНК- и РНК-полимеразы выбирают основание, комплементарное матрице В каждом из этих случаев возникает одна и та же проблема как из целого набора элементов выбрать один нужный, при условии что все они обладают одинаковыми основными характеристиками. [c.92]

Наиболее радикальная модификация, которой подвергаются белки перед секрецией, происходит в последнюю очередь. Многие полипептидные гормоны и нейропептиды синтезируются в форме неактивного белка-предшественника, из которого затем в результате протеолиза образуется активная молекула. Полагают, что это расщепление начинается в транс-сети Голъджи и продолжается в секреторных пузырьках. Сначала связанная с мембраной протеаза расщепляет белок по связям основных аминокислот (Lys-Arg, Lys-Lys, Arg-Lys, или Arg-Arg), после чего происходит окончательная доделка секретируемого продукта (рис. 8-66). В простейшем случае полипептид часто имеет только один N-концевой про-участок, который отщепляется с образованием зрелого белка незадолго до секреции. Следовательно, такие белки синтезируются в виде пре-про-белков, у которых пре-часть является сигнальным пептидом ЭР, удаляемым в шероховатом ЭР. В более сложном случае пептидные молекулы синтезируются в виде полипротеинов, содержащих множество копий одной и той же аминокислотной последовательности (см. рис. 8-66). И наконец, в клетке существуют пептиды, выступающие в роли предшественников для множества различных конечных продуктов. Эти конечные продукты по одному отщепляются от исходной полипептидной цепи. В разных типах клеток одни и те же полипротеины могут расщепляться, различным образом, увеличивая тем самым разнообразие молекул, участвующих в химической передаче сигнала между клетками. [c.64]

Белок РВ1 содержит много кластеров основных аминокислот в участках, которые, очевидно, лишены вторичной структуры (т. е. аминокислотные остатки, которые начинаются от 187, 207, 429 и 479 [58]). Эти кластеры содержат 3—4 аргинина и лизин, расположенные в непосредственной близости без прерывания аминокислотными остатками. Такие кластеры основных аминокислот подобны присутствующим в белке РВ2, но более выражены, чем кластеры в белке NP штамма РЕ/8 [62, 68] и белке М [67]. Кластеры основных аминокислот обнаружены в а-спиральных участках молекулы белка. Поскольку белок РВ1, вероятно, взаимодействует с матрицей вирусной РНК во время инициации транскрипции, эти кластеры основных остатков могут играть существенную роль в катализе этого процесса. Было высказано предположение о существовании подобных взаимодействий РНК — белок через кластеры основных аминокислот для белка РВ2 вируса гриппа [36], белка NP вируса гриппа [68], нуклеокапсида вируса леса Семлики [29], белка VP1 SV40 [63] и вируса полиомы [60] и антигена кора вируса гепатита [52]. [c.254]

Локализация гистонов относительно ДНК была установлена в работах А. Д. Мирзабекова и сотр. Для этого изолированные сердцевины или полные нуклеосомы обрабатывали диметилсульфатом в условиях, когда он реагировал с небольшим числом пуриновых оснований ДНК. При последующей обработке эти метилированные пурины отщеплялись, и освободившаяся альдегидная группа дезо-ксирибозы взаимодействовала с основными аминокислотами белка. ДНК при этом расщеплялась. В результате образовывался комплекс 5 -концевого фрагмента ДНК с белком, пришитым к его З -концу. Полученные ковалентно связанные комплексы ДНК и индивидуальных гистонов разделяли электрофорезом в полиакриламидном геле. Затем разрушали либо ДНК, либо белок и вели электрофорез в другом направлении. В результате можно было определить с высокой точностью природу гистона, вошедшего в комплекс, и длину ДНК от ее 5 -конца в нуклеосоме до места контакта с данным гистоном. [c.91]

Заряд на макромолекулах белка в водных растворах возникает обычно в результате диссоциации ионогенных групп. Белковые молекулы как продукты конденсации аминокислот содержат основные группы ЫНо и кислотные СООН. Такие соединения являются амфолитами, т. е. они способны диссоциировать и по кислотному, и по основному типу, в зависимости от pH среды. В сильнокислой среде белок ведет себя как основание его молекулы диссоциируют за счет групп N4-12 по основному типу HONH ,-R- СООН ЫН , Р-СООН ++ ОН [c.206]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология