коровых последовательностях

КОР-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК. 146 нуклеотидных пар ДНК, находящихся в составе кор-частицы. [c.522]

Прогнозирование катализаторов на основе принципа перцептрона производится с помощью алгоритмов, при реализации которых ЭВМ запоминает в ходе предъявления ей реализаций обучающей последовательности, какие комбинации признаков соответствуют одному из классов, а какие другому, а затем в соответствии с этим классифицирует новые прогнозируемые реализации. При этом в качестве признаков фигурирует не только наличие или отсутствие у реализаций некоторых свойств, например окраски, но и наличие или отсутствие некоторого свойства в заданных границах значений, нанример электропроводности в интервале 10—20 1/Ом. На принципе перцептрона основан алгоритм программы Прогноз-73 [2], программы перцептрона Кора [42] и др. [c.87]

Интересно сравнить относительную распространенность элементов с оценками их потребления в мировой экономике, представленными в табл. 22,2. Последовательности расположения элементов в этих двух таблицах, соответствующие относительной роли различных элементов в земной коре и в мировой экономике, не совпадают для указанных элементов так, некоторые элементы мало распространены, но щироко используются человеком. Это показывает, какое значение имеют распространенность и распределение концентрированных залежей некоторых злементов в литосфере. Разумеет- [c.339]

Если последовательно, насколько позволяют опытные данные, сопоставить формально аналогичные соединения кремния и углерода, то сразу обнаруживается общая особенность химии кремния— тенденция к образованию прочных связей с кислородом (табл. 12). Эта тенденция, выражающаяся в относительно быстром превращении разнообразных производных кремневодородов в водной среде в продукты гидролиза, наряду с практической необратимостью ряда равновесных систем при невысоких температурах привела к такому разделению функций в химической эволюции, которое ограничило роль кремния в биологии и сделало ее главенствующей в области химии земной коры. [c.170]

К настоящему времени генетический код расшифрован по всем данным он универсален одни и те же основания кодируют определенную аминокислоту в организмах животных, растений и даже в бактериях. X. Корана с сотрудниками в большой серии работ синтезировали полинуклеотиды с заданной последовательностью нуклеотидов (модели ДНК). На этих полинуклеотидах удалось синтезировать модели м-РНК и на них уже, как на матрицах, были получены полипептиды в бесклеточной среде. Эти выдающиеся исследования окончательно подтвердили правильность генетического кода. [c.394]

Чем выше атомный вес элемента, тем реже он встречается в природе. Обращает на себя внимание также факт повышенной распространенности элементов с четными порядковыми номерами. Содержание их составляет в целом для Земли 97,21 вес.%, по числу атомов — 97,35%. Содержание нечетных элементов значительно меньше. Преобладание четных элементов над нечетными особенно резко проявляется в группе редкоземельных элементов. Эти элементы имеют чрезвычайно близкие химические свойства, что обусловлено одинаковым строением их наружных электронных оболочек. Все 14 элементов этой группы сопутствуют друг другу при различных геологических и геохимических процессах, и соотношение их содержания практически не изменяется. На рис. 28 показаны кривые распространенности элементов этой группы в земной коре и Метеоритах. Видно последовательное повышение распространенности четных элементов по сравнению с нечетными. [c.83]

В основе всех поисков предсказательных алгоритмов лежит конформационная концепция Полинга, согласно которой трехмерная структура белка представляет собой ансамбль регулярных вторичных структур. Позднее, развивая идею Полинга и Кори о взаимодействии вторичных структур, в конформационный ансамбль были включены супервторичные структуры. Единство всех исследований по отношению к этой концепции неизбежно, поскольку в противном случае очевидна бесперспективность поиска эмпирических корреляций и предсказательных алгоритмов, базирующихся на статистической обработке известных кристаллографических данных. Если основу пространственного строения сложных белковых макромолекул образуют не только отдельные немногочисленные стандартные блоки, но и практически неограниченное количество разнообразных нерегулярных структурных сегментов, то, очевидно, нельзя рассчитывать на его описание с помощью простых правил, выведенных путем статистической обработки всегда ограниченного экспериментального материала. Результаты рентгеноструктурного анализа свидетельствуют о том, что общее содержание вторичных форм полипептидной цепи в белках сравнительно невелико, во всяком случае его доверительное значение не превышает 50%. Реализующиеся в нативных конформациях белковых молекул а-спирали и р-структуры в действительности не являются, более того, у гетерогенных аминокислотных последовательностей никогда не могут являться, строго регулярными (отклонения соответствующих двугранных углов (ф, (/) от их значений в гомогенной цепи составляют, как правило, десятки градусов, а иногда достигают 100-120°). Анализ также показал, что все стандартные аминокислотные остатки (за исключением Pro) имеют практически одинаковые возможности для встраивания в а-спираль, р-структуру и неупорядоченные участки. Выбор определяется не индивидуальными свойствами остатков, а их комбинацией в последовательности. [c.78]

Развитый в работах Ф. Коэна, М. Стернберга и соавт. [156-158, 168, 169, 171] подход не опирается на общую физическую теорию и единый метод расчета, устанавливающие логические и количественные связи между аминокислотной последовательностью белка и координатами атомов нативной конформации молекулы. Каждая стадия комбинированного подхода следует своим эмпирическим правилам, корреляционным соотношениям, предсказательным алгоритмам и методологическим приемам. Объединяющим (скорее, отягощающим) все его составные части началом служит традиционное, сложившееся еще в 1950-е годы, представление о пространственной организации белковой глобулы в виде ансамбля регулярных вторичных структур (концепция Полинга и Кори) с внутренним гидрофобным ядром и внешней гидрофильной оболочкой (концепция Козмана). Несмотря на отсутствие заметного прогресса и разочаровывающие результаты предсказаний, стремление решить проблему пространственной организации белков на основе эмпирического подхода не ослабевает ни в 1980-е, ни в 1990-е годы [107. Гл. 6, 7]. Оставаясь на тех же идейных позициях, работы последнего десятилетия приобретают большее разнообразие. [c.510]

ГВО), обычно содержащие короткие, ГЦ-обога-щенные и тандемно повторенные единицы ГВО рекомендуются в качестве маркеров-зондов при картировании генов Варианты кор-последовательности ГВО гена человеческого миоглобина были названы минисателлитными [c.163]

Недавно появились данные, свидетельствующие о том, что ГВР существуют в виде разбросанных по всему геному семейств, родство членов которых определяется гомологией с ток или иной кор-последовательностью — основной единицей соответствующих тандемных повторов [14, 15]. Клонированные участки ГВР были использованы для приготовления проб (зондов), которые при гибридизации с геномной ДНК в мягких условиях выявляют множественные аллели ГВР. Получающийся сложный набор гипервариабельных полос и заключает в себе специфичную для данного индивидуума картину геномного дактоотпечатка (DNA fingerprint) [14] аллели, формирующие эту картину, обладают соматической стабильностью, ста- [c.191]

Джеффризу с соавторами [14] удалось впервые показать, что зонды на основе кор-последовательности ГВР могут быть использованы для одновременного выявления большого количества соответствующих генетических локусов. С помощью зонда, синтезированного путем тандемного лигирования 33 повторяющихся элементов ГВР из гена человеческого миоглобина, они обнаружили на Саузерн- блотах, несущих гидролизат геномной ДНК человека, картину из большого числа полос. Некоторые из них оказались полиморфными шоследовательностями. Для выделения этих родственных участков исследователи отобрали из геномной библиотеки соответствующие клоны, используя в качестве зонда при гибридизации в мягких условиях конкатенированные повторы из гена миоглобина. Когда же эти выделенные клоны, в свою очередь, выступили в роли зондов, с помощью некоторых из них в геномной ДНК удалось выявить сложную картину гипервариабельных полос. Клоны содержали последовательности, имеющие области гомологии с тандемными повторами миоглобиновых ГВР, которые и представляли собой общие для этой группы кор-последовательности. Последовательности этого семейства были названы минисателлитами. Для изучения доступны два из них, являющиеся вариантами основной кор-последовательности. Соответствующие зонды, названные 33.6 и 33.15, существуют в виде рекомбинантных форм векторов, полученных на основе бактериофага М13 [17] (рис. 1). Каждая из них выявляет около 15 высокополиморфных полос в диапазоне 4—20 т.п.н. Среднее значение гетерозиготности по [c.192]

С. Н. Щелкунова (2001-2003 г.) в геном вируса оспы коров последовательно ввели делеции по пяти различным генам. [c.395]

Порядок, в котором расположены слои земной коры в исторической хронологической последовательности, называется стратиграфией (от 51га о5 — слой). Под действием различных геологических факторов первоначальное горизонтальное положение пластов может измениться, поэтому встречаются наклонные, перевернутые и складчатые пласты. Геологи различают антиклинальные (рис. 1,а) и синклинальные (рис. 1,6) складки. [c.10]

Основными факторами, интенсифицирующими повреждения оборудования для подготовки и переработки нефти, являются высокая коррозионная активность рабочих сред, напряженность материала и нестационарность нагружения. Агрессивное воздействие рабочих сред обусловлено обводненностью нефти, наличием в ней кислых компонентов, сернистых и хлористых соединений, а также применением в процессах подготовки и переработки кор-розионно-активкых реагентов. Наиболее интенсивному коррозионному разрушению подвержено оборудование, испытывающее одновременное или последовательное воздействие нескольких коррозионно-активных сред, например, теплообменники, конденсаторы, реакторы и др. [c.7]

Наряду с указанными примерами полного или преобладающего контроля скорости коррозии каким-либо одним фактором встречаются случаи смешанного контроля. Этим и определяется необходимость точной оценки степени контроля каждого фактора для харак теристики работы коррозионного эле мента. На практике такие определени могут быть проведены на модели кор розионного элемента с электродами ма кроскопических размеров. Электриче ская схема установки для этой работь приведена на рис. 140. Основная часть установки — коррозионный элемент, состоящий из двух электродов, помещенных в ячейку. Электроды изготовлены из различных металлов (если преследуется цель моделирования процессов структурной коррозии гетерофазного сплава) они могут состоять также из одного и того же материала, но тогда различаться должна либо подготовка поверхности электродов, либо состав среды. Оба электрода коррозионной пары последовательно замкнуты на переменное сопротивление R и токоизмеряющий прибор (микро- или миллиамперметр). В процессе работы коррозионном пары потенциалы электродов измеряют с помощью потенциометра или же регистрируют на автоматическом электронном самописце. [c.254]

В качестве примера на рис. 17 приведены результаты исследования многостадийной реакции эфира фосфорной кислоты КОРО с арилсульфохлоридом в пиридине. Конечным продуктом реакции является фосфорилпиридиниевое производное (В), которое является активным фосфорилирующим реагентом, широко используемым для получения различных органических производных фосфорной кислоты. В этой реакции идет последовательное превращение КОРОз [c.61]

Ретросинтетическое упрощение любой целсзой молекулы состоит в последовательных разборках ( dis onne tions , по оригинальной терминологии Кори) входящих в ее состав связей. В принципе такой анализ можно начать с любой связи и шаг за шагом довести его до простейших предшественников. Однако если такую последовательную разборку вести бессистемно, то это приведет к почти бесконечному числу вариантов, что сделает сам подход бесполезным с практической точки зрения, В то же время продуманный ретросинтетичсский анализ, управляемый химической логикой и подчиненный тщательно отобранным критериям выбора каждого шага, оказывается мощным инструментом для разработки эффективной стратегии синтеза. При таком использовании этого инструмента можно обнаружить несколько достаточно хорошо различимых этапов. Среди них наиболее труден и наиболее важен первый шаг в разборке целевой структуры. [c.308]

Рассмотрим общие принципы функционирования системы LHASA при поиске путей синтеза полициклических систем. Система может по указанию химрпса работать в одном из двух режимов поиска. Первый из них предполагает компьютерный анализ стратегического кора целевой молекулы, направленный на поиск стратегических связей и предложение методов, пригодных для их сборки. Такой поиск может повторяться последовательно для всех генерируемых субструктур вплоть до выхода к исходным соединениям. Во втором режиме система ориентирована на поиск возможностей построения целевой структуры с помощью одной из наиболее эффективных стратегаче-ских реакций (Дильса-Альдера, аннелирования по Робинсону и т. п.). Обсудим сначала работу системы в первом из этих режимов [26Ь]. [c.352]

Иной принцип положен в основу системы SYNGET, разработанной в лаборатории Хендриксона [271. Эта система не интерактивная, независимая от предвзятого мнения пользователя . Она направлена на генерацию oптимaJ ьныx путей для конвергентной сборки целевой молекулы из доступных исходных материалов. На первом этапе работы системы структура подвергается анализу с целью обнаружения набора связей, особенно пригодных для двух последовательных разборок, ведущих к четырем (или меньше) предшественникам, скелет которых отвечает скелету соединений, содержащихся в каталоге (последний включает около 6000 соединений). После этого система генерирует изменения функциональности, требующиеся для образования каждой образуемой связи, иначе говоря, генерирует необходимый ретрон (используя терминологию Кори, хотя Хендриксон не использует этот термин), т. с. устанавливает необходимую кар- [c.361]

Образование кора 86 достигалось путем присоединения аммиака к метил-акрилату по Михаэлю с последующим аминолизом промежуточного полиэфира этилендиамином. Повторение тех же реакций с этим кором как с нуклеофилом приводило последовательно к дендримерам 1-, 2-го и т. д. поколений (87,88 и т. д.). Наличие более длинного спейсера, а также более низкий коэффициент разветвления (и = 3) обеспечивали этой модели гораздо более позднее по ходу синтеза появление существенных стерических препятствий, так что в этом случае оказа,тось возможным дойти таким итеративным путем до дендримера девятого поколения (Gen-9), Это соединение имеет мо-лекулярньгй вес 349 883, диаметр его молекулы составляет 100 Л, а на ее поверхности располагается 1536 аминофупп, Компьютерное моделирование дендримеров этого типа показало, что если Gen-3 по форме молекулы еще напоминает плоскую звезду, то начиная с Gen-5 форма молекулы последовательно приближается к шарообразной. [c.411]

Особый интерес представляет адренокортикотропный гормон (АКТГ), который переносится кровью от мозга к коре надпочечников, где стимулирует образование кортизона. АКТГ применялся в медицине, пока синтетический кортизон не стал доступен в нужных количествах. АКТГ широко использовался для лечения кетозов скота. Белл с сотр. выделил из АКТГ свииьи пептид (р-кортикотропин), содержащий 39 аминокислотных остатков, и определил их последовательность [c.701]

Описанный ниже эксперимент показывает, каким образом был расшифрован генетический код. Раствор ферментов, полученный из бактериальных клеток и добавленный к раствору, содержащему все 20 аминокислот, вызывает синтез полипептидной цепи, состоящей только из остатков аминокислоты фенилаланина, если к нему добавить синтетическую РНК, состоящую из полиурацила (т. е. последовательность iJ-U-U-U-...). Следовательно, кодоном для фенилаланина служит иии, как показано в табл. 15.1. Основную работу по расшифровке генетического кода выполнили американские ученые М. У. Ниренберг, X. Г. Корана и Р. Г. Холли со своими сотрудниками при этом они использовали ферменты, открытые А. Корнбергом и С. Очоа. [c.461]

Описанная Полингом и Кори а-спираль является правоврапцающей . Почему левовращающая спираль, построенная из нескольких аминокислот, будет отличаться от правовращающей спирали, представляющей собой ту же последовательность тех же аминокислот [c.419]

Связь хранимой биологической информации с аминокислотной последовательностью АКТГ интенсивно исследовалась в различных лабораториях, особенно группой Швицера. В N-концевом (1-18) участке молекулы содержится практически вся информашм для коры надпочечников, для жировых и меланофорных клеток, причем процесс пигментации последних, вероят- [c.241]

Эмпирическое направление, рассмотрение которого было начато во втором томе настоящего издания, базируется на данных статистического анализа известных кристаллических структур белков, равновесной термодинамики, формальной кинетики и концепциях Полинга-Кори и Козмана, т.е. исходит из предположения об исключительной роли в сборке гетерогенной аминокислотной последовательности регулярных вторичных структур и представления о гидрофобных взаимодействиях как главной упаковочной силе. Считается, что по сравнению с множеством мыслимых нерегулярных локальных структур вторичные структуры являются самыми стабильными их возникновение, инициирующее процесс и обусловливающее дальнейшее его развитие, осуществляется с наибольшей скоростью. Благодаря гидрофобным взаимодействиям вторичные структуры образуют супервторичные, т.е. полярные остатки стремятся расположиться на внешней оболочке глобулы, а неполярные - в ее интерьере. Идеальная модель трехмерной структуры белка, согласно эмпирическому подходу, должна представлять собой ансамбль вторичных и супервто-ричных структур и иметь гидрофобное ядро, экранированное от водной среды гидрофильной оболочкой. Процесс создания такой модели из статистического клубка должен быть равновесным фазовым переходом первого рода, подчиняющимся классической термодинамике, статистической физике и формальной кинетике так же, как им подчиняются процессы кристаллизации малых молекул и образования линейных спиральных сегментов гомополипептидов. [c.6]

При поиске решения структурной проблемы белка особенно вдохновляющими примерами явились результаты теоретических исследований Л. Полинга и Р. Кори регулярных структур полипептидов [53] и Дж. Уотсона и Ф. Крика двойной спирали ДНК [54]. В этих работах с помощью простейшего варианта конформационного анализа - проволочных моделей, получивших позднее название моделей Кендрью-Уотсона, а также ряда экспериментальных данных, прежде всего результатов рентгеноструктурного анализа волокон (в случае ДНК еще и специфических соотношений оснований Э. Чаргаффа), удалось предсказать наиболее выгодные пространственные структуры полимеров. Собственно, предсказана была как в случае пептидов, так и нуклеиновых кислот, геометрия лишь одного звена, которое в силу регулярности обоих полимеров явилось трансляционным элементом. Белок же - гетерогенная аминокислотная последовательность, и поэтому таким путем предсказать его трехмерную структуру нельзя. Но то обстоятельство, что простейший, почти качественный, конформационный анализ привел к количественно правильным геометрическим параметрам низкоэнергетических форм звеньев, повторяющихся в гомополипептидах и ДНК, указывало на большие потенциальные возможности классического подхода и его механической модели в описании пространственного строения молекул. [c.108]

В упомянутых исследованиях основное внимание уделялось спиральным конформациям гомополипептидов, на которые в то время возлагали большие надежды как на ближайших структурных аналогов белков. Действительно, пространственное строение синтетических полипептидов и белков определяется одними и теми же видами взаимодействий между валентнонесвязанными атомами и одинаковой природой этих взаимодействий. Химическая регулярность синтетических полипептидов допускает реализацию ограниченного числа периодических структур, которые, как показали рассмотренные исследования, сравнительно легко оцениваются теоретически. Они-то прежде всего и привлекали к себе внимание, поскольку трехмерные структуры белков представлялись в соответствии с концепцией Полинга-Кори набором регулярных вторичных структур. Автор не стоял на этих позициях и уже тогда был убежден, что гетерогенность аминокислотных последовательностей белков должна вести не только к регулярным, но главным образом к множеству апериодических структур. Наши исследования в данной области, начавшиеся в 1968 г, [20] также под влиянием работы Рамачандрана и соавт. [58], имели иное назначение. Они были направлены исключительно на изучение конформационных возможностей свободных монопептидов и после своего завершения составили содержание первого этапа на пути к решению структурной проблемы белковых молекул. Главные цели этих первых конформационных иссле- [c.156]

Смотреть страницы где упоминается термин коровых последовательностях: [c.454] [c.154] [c.156] [c.63] [c.356] [c.7] [c.30] [c.308] [c.346] [c.409] [c.414] [c.416] [c.739] [c.336] [c.194] [c.268] [c.314] [c.422] [c.242] [c.105]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология