Анализ последовательности методом

Последовательный метод расчета. Этот метод основан на исполь- зовании структуры ХТС (топологии ХТС) и моделей ее элементов в виде уравнений у = f (х). Он заключается в последовательном, элемент за элементом, расчете ХТС. Для этого необходимо знать параметры всех входных потоков в элементы. Для разомкнутых ХТС данный метод не вызывает затруднений, если найдена последовательность расчета элементов ХТС. Однако современные ХТС обычно содержат большое число рециклов по материальным и энергетическим потокам. Последовательный расчет таких замкнутых систем требует разрыва всех рециклов и проведения многократного расчета полученной разомкнутой ХТС до достижения требуемой точности значений параметров потоков в местах разрывов. Места разрывов рециклов находят с помощью структурного анализа. Кроме эффективных методов анализа структуры, этот метод требует использования надежных и быстродействующих итерационных процедур, так как размерность задач может быть достаточно велика (например, при расчете АВТ она составляет 45). [c.33]

Под прогрессивной нормой времени понимается такая норма, которая предусматривает нормальные условия труда надлежащей интенсивности при использовании всех возможностей оборудования. Нормирование следует проводить высококвалифицированным работникам, хорошо знающим оборудование, инструмент, технологическую оснастку. Имеются следующие методы нормирования метод технического расчета, заключающийся в определении длительности нормируемой операции по элементам, с использованием нормативов (норму времени устанавливают в результате анализа последовательности и содержания действий рабочего и оборудования при наивыгоднейшем использовании эксплуатационных свойств) метод расчета норм на основе изучения затрат времени, основанный на [c.184]

Изучение состояния организации труда включает анализ применяемых методов и приемов труда, т. е. последовательности выполнения трудовых операций и возможности сокращения и.х длительности, а также соответствие условий труда требованиям техники безопасности. [c.129]

В связи со сложностью точного анализа последовательных реакций в химической кинетике используются. приближенные методы, позволяющие упростить системы дифференциальных уравнении. Основным методом такого рода является метод стационарных концентраций, предложенный М. Боденштейном. В нем предполагается, что если концентрации промежуточных продуктов малы, то их можно считать стационарными, т. е. не меняющимися в течение всего процесса. [c.265]

Прежде всего необходимо знать суммарную электродную реакцию, а именно число электронов, участвующих в процессе, и конечные продукты реакции. Для определения последних используют самые разнообразные методы классические методы неорганического и органического анализа, электроаналитические методы, хроматографию, спектральные методы и т. п. Далее можно записать последовательность стадий перехода от исходных веществ к продуктам реакции и сопоставить выводы, вытекающие при предположении о медленности той или иной стадии суммарного процесса, с экспериментальными данными. В последнее время для выбора оптимальной схемы электродного [c.348]

Спектрометрический анализ. Спектрометрический метод используют преимущественно для количественного анализа растворов или металлов. Часто интересуются определением только отдельных элементов. При одновременном присутствии нескольких элементов для каждого элемента необходимо иметь свой фотоэлектрический приемник (многоканальный спектрометр) или, используя эффективную автоматику, регистрировать аналитические линии определяемых элементов только одним приемником. В первом случае измерение интенсивностей всех линий происходит одновременно (установки прямого отсчета), во втором — последовательно, через небольшие интервалы-(установки последовательного отсчета). [c.195]

По существу метод динамического программирования представляет собой алгоритм определения оптимальной стратегии управления на всех стадиях процесса. При этом закон управления на каждой стадии находят путем решения частных задач оптимизации последовательно для всех стадий процесса с помощью методов исследования функций классического анализа или методов нелинейного программирования. Результаты решения обычно не могут быть выражены в аналитической форме, а получаются в виде таблиц. [c.32]

Для решения такой задачи обычно широко используется метод, получивший в экономическом анализе название метода цепных подстановок. Его сущность заключается в последовательной замене начальной (базисной) величины каждого фактора величиной конечной (последующей). После каждой замены новый результат сравнивают с предыдущим. [c.89]

Смесь пептидов, образующихся в результате использования различны> методов расщепления, сначала должна быть разделена, и каждый из пептидов очищен. Целевой компонент перед анализом последовательности должен быть гомогенен по данным как минимум четырех различных методов разделения ионообменной хроматографии, электрофореза, бумажной или тонкослойной хроматографии и противоточного распределения. [c.366]

Физическая теория и результаты расчета моно-, ди- и трипептидов, подтвержденные сопоставлением с экспериментальным материалом, позволили разработать количественный фрагментарный метод конформационного анализа олигопептидов. Метод основывается на предположении о возможности исследования конформационного состояния сложной аминокислотной последовательности путем предварительного анализа пространственного строения ее простых перекрывающихся фрагментов, конформационные возможности которых рассчитываются с использованием в качестве нулевых приближений всех комбинаций низкоэнергетических оптимальных конформаций свободных аминокислотных остатков (молекул метиламидов N-ацетил-а-аминокислот). Наборы лучших по энергии оптимальных состояний простых фрагментов служат исходными для формирования нулевых структурных вариантов более сложных фрагментов и т.д. В основе метода лежит построенная по принципу "дерева" классификация пептидных структур на конформации, формы и шейпы. Предложенная классификация полностью отвечает известным эксперимен- [c.587]

В случае применения подобной методики для анализа последовательности аминокислот необходима идентификация разделенных соединений, однако возможности ГХ в, данном случае довольно ограничены. Кроме того, что необходимы колонки различной избирательности, нужно знать и относительные удерживаемые объемы исследуемых соединений. Идентификация непосредственно зависит также от доступности подходящего стандарта. Если дипептиды можно синтезировать химически, то для более длинных пептидов это очень трудная задача. Применение ГХ только в целях разделения оправдано лишь тогда, когда выделенные пептидные производные можно уверенно идентифицировать и определить их последовательность с помощью других методов. [c.338]

Как показано многочисленными исследованиями, убедительную идентификацию производных пептидов можно провести с помощью масс-спектрометрии [34, 85, 123]. Комбинация этих двух методов может значительно облегчить анализ последовательности пептидов — к тому же для обоих методов требуются очень малые количества вещества. Газовая хроматография пептидов изучалась только в двух лабораториях, в которых были предложены различные методики получения их производных. Для последующей идентификации крайне важно, чтобы структуру исходных соединений можно было узнавать по их производным. Хотя детальное рассмотрение масс-спектрометрии выходит за рамки рассматриваемого ниже процесса ГХ пептидов, многие операции, которые будут описаны, должны рассматриваться с учетом возможного использования масс-спектрометрического метода. Соединение капиллярной или набивной колонки непосредственно с масс-спектрометром дает возможность измерять полный масс-спектр каждого пика и, таким образом, с помощью этого способа получать необходимую информацию. [c.339]

При использовании подобного метода разделения для анализа последовательности аминокислот избирательность разделяюш,их [c.342]

Метод квазистационарных концентраций (КСК) — щи-роко используемый метод анализа последовательных реакций. В ходе реакции концентрация интермедиата (интермедиатов) увеличивается от нулевой при г = О до максимальной при [c.93]

Синтез процессов перегонки и ректификации заключается в определении такой технологической схемы процесса, которая должна удовлетворять оптимальной ее структуре и оптимальным параметрам разделения. Этап синтеза всегда предшествует анализу системы, однако последний оказывает существенное влияние на последующие этапы синтеза. В связи с этим проектирование разделительных установок проводится итерационным путем с применением последовательно методов синтеза и анализа систем. Следовательно, синтез разделительных установок — это определение оптимальной технологической схемы процесса с одновременным поиском оптимальных режимных параметров процесса и конструктивных размеров агапаратов. [c.99]

ЗС ОХТС имеет очевидный комбинаторный характер, поэтому для ее решения могут быть применены и средства комбинаторного анализа. Основное средство последнего — это полный перебор вариантов синтезируемой системы. Такая операция обычно формализуется в виде ветвящегося дерева вариантов (рис. IV.5). Из всего дерева должна быть выбрана одна ветвь, соответствующая оптимальной ХТС. По построению комбинаторные методы — последовательные методы. [c.117]

Введение отдельного практикума по физическим и физико-химическим методам анализа в курс аналитической химии для сту-дентов-технологов подчеркивает ведущую роль этих методов в аналитической химии. Все большее число возможных принципов анализа реализуется в инструментальных методах, появляются узко специализированные приборы для анализа того или иного конкретного продукта, а также приборы для автоматического контроля химико-технологических процессов. Увеличивается число приборов, предназначенных для анализа комбинированными методами, например в газовых и жидкостных хроматографах применяются датчики, действие которых основано на самых разнообразных физических и физико-химических методах. Все это усложнило выбор методов анализа для практикума и поставило проблему рациональной последовательности подачи материала. [c.6]

Навеску анализируемого продукта (0,05—2,0 г) окисляют в калориметрической самоуплотняющейся бомбе, в которую предварительно для поглощения продуктов разложения вносят 20 мл дистиллированной воды. Полученный после разложения пробы раствор количественно переносят в стакан, упаривают и фильтруют в мерную колбу емкостью 50 мл. Затем последовательно добавляют 5 мл 10%-ного раствора тиосульфата натрия, 0,5 мл 107о-ного раствора фторида аммония,. 10 мл буферного раствора с рН = 5 и 0,5 мл 20%-ного раствора пирокатехина и доливают до метки дистиллированную воду. Определяют оптическую плотность полученного раствора на фотоэлектроколориметре ФЭК-М с желтым светофильтром в кювете толщина слоя 50 мм. Чувствительность метода 10- %. Сходимость определений 10% отн. Продолжительность анализа около 1 ч вместо 24 ч, затрачиваемых при анализе по методу ГОСТ 10364—63. Результаты анализа полностью согласуются с данными, полученными по методу ГОСТ. [c.186]

Химические методы анализа. Химические методы основаны на последовательной обработке нефтепродукта различными реагентами, каждый из которых способен взаимодействовать только с определенной группой сернистых соединений. Яти методы дают удовлетворительные результаты только при анализе легких бензиновых прямогонпых фракций. Исследование более тяжелых фракций практически невозможно снижается точность определения. Причина этого — сильное ухудшение селективности реагентов по отношению к различным сернистым соединениям (функциональные свойства их в тяжелых фракциях проявляются слабее). [c.76]

В последние годы изучены уникальные по сочетанию свойств ПСК, содержащие аммонийные кислородсодержащие соли Мо, W, V, со сложными анионами, исследования проводились по теме 2.56.98, а с 2000г. в рамках темы 2.51.98. Создан метод управляемого синтеза высокогомогенных сложных оксидов заданного состава с использованием ПСК. Он позволяет вводить допирующие добавки в манганиты, кобальтиты и пр., получать сложные молибдаты, вольфраматы, ванадаты, имеющие техническое значение как катализаторы, люминисцентные материалы и др. Изучены взаимодействия ионов, включающих Мо, W, V с катионами РЗЭ, ЩЗЭ, d-металлов в присутствии полимеров, устойчивость образующихся гелей. В этой связи исследованы процессы пиролиза ПСК, комплексом методов поведен анализ последовательности физико-химических процессов. Проведены нейтронографические исследования получаемых наноразмерных частиц. Показана возможность возникновения оксидных фаз непосредственно из аморфизированного прекурсора. [c.125]

Расщепление нуклеиновых кислот под влклнием специфических ферментов — эндо- и экзонуклеаз — сопровождается разрывом фосфо-диэфирной связи и образованием продуктов различной величины, которые могут быть разделены методами электрофореза и хроматографии. Это широко используется при анализе последовательности нуклеотидов в молекулах РНК и ДНК., Особое значение при развитии генной инженерии получило расщепление ДНК специфическими эндонуклеазами (рестриктазами), позволяющее получать отрезки ДНК определенной длины и нуклеотидного состава. > [c.175]

Обработка и отнесение спектров в случае длинных пептидов и пептидов с полифункциональными аминокислотными остатками особенно сложны, так как в этих случаях фрагментация на А и В часто перекрывается множеством других типов фрагментации. Первый метод масс-спектрометрического анализа последовательности был разработан в 1959 г. Биманном с сотр. [136] и основан на легкой расщепляемости С — С-связей в группах -NH- HR- Hj-NH-, образующихся при восстановлении пептида литийалюминийгидридом [c.374]

При анализе последовательности особенно удачна комбинация методов масс-спектрометрии и газовой хроматографии [137 — 140]. Сложные олигопептидные смеси, образующиеся при частичном гидролизе, после превращения в летучие производные разделяют на газовом хроматографе и идентифицируют с помощью Ma q- neKTpoM Tpa. Установление последовательности осуществляют с помощью ЭВМ, основываясь на данных идентификации всех олигопептидов. Серин, тирозин и триптофан не вносят каких-либо трудностей. [c.374]

Разработка термодинамической бифуркационной теории свертывания белковой цепи, физической теории структурной организации природной аминокислотной последовательности, метода теоретического конформационного анализа, а также результаты расчета конформационных возможностей простейших производных двадцати стандартных а-амино-кислот и большого числа молекул с двумя и тремя аминокислотными остатками в цепи, представленные в первых двух частях книги, позволили перейти к изучению пространственного строения более сложных природных пептидных объектов. Главная цель исследования заключалась в количественной оценке вкладов средних межостаточных взаимодействий в конформационную энергию олигопептидов постепенно увеличиваюшейся длины и выяснении роли этих взаимодействий в структурировании фрагментов белковой цепи. [c.256]

Каковы же ближайшие перспективы Можно ли, продолжая изучение Met- и Ьеи-энкефалинов и других пептидных гормонов в том же плане, получить со временем полную и объективную количественную информацию об их структурной организации и зависимости между структурой и функцией Чтобы ответить на этот вопрос, предположим, что такой информацией мы уже располагаем, и попытаемся представить, что она могла бы дать для понимания структурно-функциональной организации энкефалинов и описания механизмов их многочисленных функций. Как можно было бы логически связать данные, например, о 10 низкоэнергетических конформациях каждого нейропептида с приблизительно таким же количеством его функций Очевидно, установить прямую связь при неизвестных пространственных структурах рецепторов не представляется возможным. Число возможных комбинаций, особенно если учесть существование нескольких рецепторов (ц, а,5) для осуществления только одной опиатной функции энкефалина, слишком велико, чтобы надеяться даже в гипотетическом идеальном случае найти искомые соотношения интуитивным путем. Многие полагают, что к достижению цели ведет косвенный путь, заключающийся в привлечении синтетических аналогов, изучении их структуры и биологической активности. В принципе подобный подход вот уже не одно столетие применяется в поиске фармацевтических препаратов. Однако такой путь в его сегодняшнем состоянии не только длителен, сложен и дорогостоящ, но, главное, он не может привести к окончательному решению проблемы. Замена аминокислот в природной последовательности, укорочение цепи или добавление новых остатков, иными словами, любая модификация химического строения природного пептида, неизбежно сопровождается изменением конформационных возможностей молекулы и одновременно затрагивает склонные к специфическому взаимодействию с рецептором остатки, что сказывается на характере внутри- и межмолекулярных взаимодействий, в том числе на устойчивости аналогов к действию протеиназ. Для учета последствий химической модификации на характер внутримолекулярных взаимодействий можно использовать теоретический конформационный анализ и методы кванто- [c.352]

В анализе таким методом [18, 19] 15 мл 0,2 М раствора Е1А1 Н4 (удельная радиоактивность 0,5—2,0 мкКн/мМ) в диэтиловом эфире диэтиленгликоля высокой степени чистоты переносят в реакционную ячейку с полезным объемом около 25 мл. В этой ячейке имеется трубка для пропускания через раствор потока газа, причем нижний конец этой трубки должен быть погружен в раствор на достаточную глубину. В верхней части ячейки имеется выводная трубка, соединенная со счетчиком радиоактивности. Сначала через раствор в ячейке пропускают поток газа со скоростью 40 мл/мин и измеряют радиоактивность фона. После этого из бюретки с отводной трубкой в ячейку вводят раствор пробы в тетрагидрофуране (ТГФ), полученном путем перегонки из раствора Ь1А1Н4, и в течение 10 мин измеряют радиоактивность газа, текуш,его через пропорциональный счетчик. В такой же последовательности проводят анализ чистого ТГФ. С одной порцией реагента в ячейке можно провести анализ 50 или более проб, однако после того, как израсходуется половина от первоначального количества реагента, его рекомендуется заменять. [c.252]

Выл предложен также и метод определения других первичных алифатических аминов, основанный на приведенной выше последовательности реакций. Указывалось на применимость этого метода и к анализу вторичных алифатических аминов [114]. Однако в присутствии 130сстаповителей, когда образуется металлическое серебро, или в случае, когда ион серебра сильно абсорбируется субстратом, может быть трудно добиться высокой чувствительности анализа этим методом. Но хорошей чувствительности от этого метода ожидать можно, поскольку на каждый эквивалент амина образуется до двух эквивалентов серебра в форме нерастворимого соединения. [c.318]

Первым достижением при использовании более быстрого метода определения последовательности [70], чем метод Холли, было установление нуклеотидной последовательности 120 мономерных звеньев 5S РНК из Е. oli. Свойства ее растворов указывают на наличие структуры высшего порядка с некоторой жесткостью и с большим числом спаренных оснований. Однако ее нуклеотидная последовательность позволяет при свободном выборе построить слишком много вторичных структур, в этом случае для их выбора был применен анализ РНК методом температурно-варьируемой ЯМР-спектроскопии высокого разрешения. Данные, полученные Этим методом [71], отдают предпочтение структуре, содержащей [c.61]

Сенжер и Коулсон создали метод анализа последовательности ДНК, который основан на ферментативном копировании однонитевых частиц ДНК [18]. Максам и Гилберт создали метод, в основу которого положена химическая модификация четырех оснований, входящих в состав ДНК, и который с одинаковым успехом применим как к однонитевым, так и к двунитевым молекулам ДНК [19]. Оба метода используют авторадиографическое определение згр-меченных олигонуклеотидов, которые разделяют в зависимости от их длины электрофорезом денатурированных фрагментов в полиакриламидном геле. На практике, успех этих методов во многом определяется недавними достижениями в энзимологии нуклеиновых кислот, особенно использованием ферментов рестрикции, расщепляющих молекулы ДНК, и обратной транскриптазы, с помощью которой получают циклические ДНК, комплиментарные РНК-матрице. Нижеследующее описание методики анализа будет, однако, предполагать наличие гомогенных образцов ДНК подходящей длины. [c.188]

Существует три этапа в этом классическом методе анализа последовательности. Первоначально РНК расщепляют иа фрагменты умеренной длины (примерно 50 пар оснований) частичным гидролизом РНазой. Затем анализируют общий состав оснований этих дискретных фрагментов с последующим их расщеплением до маленьких блоков, для которых можно непосредственно установить последовательность оснований. И наконец, большие по размеру фрагменты располагают в нужном порядке, используя частичное перекрывание последовательностей. Такие частичные перекрывания возникают в результате различных способов расщепления, получаемых при действии панкреатической РНазы (специфичной к пиримидинам) и такадиастазы Т] (специфичной к гуанозину). Сложное разделение большого числа фрагментов, получаемых в результате частичного расщепления нуклеазами, удается наилучшим образом осуществить при использовании двумерного разделения ( фингерпринт ), сочетая ионофорез на ацетате целлюлозы при pH 3,5 в одном направлении и ионофорез- на ДЕАЕ-целлюлозной бумаге при кислых значениях pH [30]. Во всех случаях фрагменты детектируют без деструкции с использованием Р-меченных нуклеотидов. [c.193]

В свою очередь этот метод может быть заменен прямым определением последовательностей РНК способом, аналогичным разработанному Максамом-Гплбертом для ДНК. Можно осуществить раздельное картирование аденинов, гуанинов и пиримидинов в РНК с помощью электрофоретического фракционирования по размеру в полиакриламидных гелях [33] продуктов щелочного и эндону-клеазного гидролизов. Как только станет возможным отличать уридин от цитидина, метод станет столь же мощным и быстрым, как и используемый в настоящее время метод анализа последовательности ДНК. [c.194]

Все перечисленные выше твердые носители содержат свободные аминогруппы, за которые и прикрепляются пептиды или белки для анализа последовательности. Используются три основных метода связывания. В первом пептид обрабатывают Л -(3-диметиламино)-Л -этоксипропилкарбодиимидом в отсутствие нуклеофилов. Карбоксильные группы пептида сначала образуют 0-ацилизомоче-вины аналогичные производные, расположенные в боковых радикалах аспарагиновой и глутаминовой кислот, легко перегруппи- [c.268]

Специфическое химическое рсхш пление пептидных связей можно осуществить с помощью двух окисляющих агентов. Один из них, Ы-бромсукцинимид, вызывает расщепление пептидной связи, в которой участвует остаток триптофана, с одновременным разрушением этого остатка и его окислением [64]. Успешное использование этого метода удалось лишь в нескольких случаях. Помимо изучения структуры полипептида, выделенного из вируса табачной мозаики, Ы-бромсукцинимид был использован при анализе последовательности низкомолекулярного глюкагона [58 и М-кон-цевой последовательности гемоглобина [79]. Существенный недостаток этого метода заключается в том,что М-бромсукцинимид расщепляет не все пептидные связи, образуемые остатками триптофана. [c.36]

Д. АНАЛИЗ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ АМИНОКИСЛОТ В ПЕПТИДАХ МЕТОДОМ ЭДМАНА В ДАНСИЛЬНОМ ВАРИАНТЕ [7—9] [c.284]

Количественный анализ аминокислот методом ГХ представляет несомненный интерес. Как правило, количественное определение аминокислотного состава пептида является одним из решающих моментов анализа последовательности. Поскольку при деградации крупного белка образуется большое число фрагментов, желательно затрачивать на анализ каждого из них минимальное количество времени и вещества. Привлечение в данном случае ГХ достаточно хорошо удовлетворяет этим условиям. Многочисленные исследования по ГХ аминокислот в конечном итоге направлены на решение этой задачи. Однако к действительно эффективному количественному методу предъявляются несоизмеримо более высокие требования, чем к качественному. Если учесть к тому же трудности получения и разделения производных аминокислот, станет ясно, почему до сих пор не разработан стандартный метод их количественного определения с помощью газового хроматографа. Основные трудности связаны, как подчеркивалось в разделе о получении производных, с полифункциональными аминокислотами. Метод, игнорирующий их идентификацию, может найти лишь ограниченное применение. Количественный анализ только простых аминокислот не может удовлетворять экспериментатора [40]. Вопрос о том, все ли аминокислоты, встречающиеся в белках, можно определять ГХ с достаточной точностью, все еще остается открытым. Здссь можно только вкратце рассмотреть имеющиеся условия и возможности. Проблемы, связанные с аппаратурой, необходимой для количественной ГХ, уже обсуждались ранее (см. стр. 302). [c.335]