Деградация геля

Трудности подачи порошкового компонента в камеру сгорания и малое газообразование являются причиной того, что до сих пор высококалорийное металлическое горючее не используется в двигателях. Поиски путей повышения плотности топлив привели к использованию металлических порошков как энергетических присадок в твердых топливах, в желеобразных топливах — гелях и органозолях. Эти топлива, имея высокую плотность, обеспечивают и увеличение удельного импульса, но по условиям смесеобразования не обеспечивают постоянства х и а, при хранении возможна деградация гелей — расслоение топлив в эмульсиях, а их текучесть существенно зависит от температуры. Поэтому этот вид топлива имеет пока ограниченные области применения [58, 67]. [c.227]

Опыты по гибридизации позволили исследовать гомологичность нуклеиновых кислот из разных источников. Вначале молекулы расщепляют (например, с помощью ультразвука) на фрагменты длиной 1000 нуклеотидов и подвергают денатурации. Фрагменты денатурированной ДНК смешивают с денатурированной ДНК из другого источника. Участки ДНК разных видов, имеющие близкие нуклеотидные последовательности, в той или иной степени гибридизуются, тогда как участки с сильно различающимися последовательностями гибридизации не поддаются. Рассмотрим один из вариантов постановки таких экспериментов. Денатурированную ДНК определенного организма, не подвергавшуюся деградации, заключают в агаровый гель [90] или наносят на нитроцеллюлозный фильтр [91]. Фрагменты ДНК из другого источника пропускают через колонку с ДНК-содержащим агаром или через фильтр с абсорбированной ДНК. Комплементарное спаривание соответствующих фрагментов задерживает их на колонке или фильтре, тогда как фрагменты, не нашедшие себе партнеров , свободно проходят дальше. [c.143]

Для фракционирования нуклеозидов можно использовать продажные гель-фильтрующие материалы Сефадекс G10 и G15 и Биогель Р2. Преимущества этих материалов в том, что элюируемые вещества не размываются по колонке, количественно снимаются с колонки и нет необходимости применять солевые градиенты. Также маловероятно, что в условиях гель-фильтрации будут протекать какие-либо химические процессы деградации лабильных нуклеозидов, т. е. что-либо похожее на процессы, обязательно происходящие при ионообменной и адсорбционной хроматографии. 127]. [c.74]

НОСТЬ оказывает обратное влияние на бумаги, изготовленные из целлюлозной массы и из тряпья. Другие исследователи [321, 322] проводили опыты с хлопковыми линтерами в атмосфере кислорода, свободного от озона, в атмосфере азота, свободного от кислорода, и в атмосфере гелия с использованием источников света, дающих длины волн в близком, среднем и далеком ультрафиолете примерно до 2300 А [319]. Небольшие количества окиси и двуокиси углерода, образующиеся даже при отсутствии измеримых количеств кислорода или влаги, приписываются фотохимической деградации, являющейся также причиной добавочного разрушения, наблюдаемого при последующем хранении образцов в темноте в атмосфере, содержащей кислород. Фотохимическая активность в присутствии кислорода является важным фактором в разрушении ацетата целлюлозы [322], пластмасс на основе ацетатов и нитратов [323], ацетатного искусственного шелка [324] и этил-целлюлозы [325]. В последнем случае кинетика разрушения аналогична с кинетикой деградации этилцеллюлозы [326] и значительно более устойчивого ацетата целлюлозы [327] под влиянием кислорода при 90 145 или 160°. [c.183]

Возможности этих методов ограничиваются только пригодностью изучаемых гликопротеинов для фракционирования на колонках. Автор нашел, что некоторые эпителиальные гликонротеины очень прочно прилипают к ионообменной целлюлозе и к большинству других хроматографических наполнителей. Многие эпителиальные гликопротеины хотя обычно и ведут себя нормально при гель-фильтрации, но, как уже отмечалось, имеют столь большие эффективные размеры молекул, что совершенно не удерживаются большинством крупнопористых гелей. Но даже и при этих обстоятельствах гель-фильтрация будет обнаруживать более низкомолекулярные примеси. Гель-фильтрация и ионообменные методы используются препаративно нет необходимости снова проверять материал, полученный в качестве единственного компонента при таком фракционировании, за исключение г тех случаев, когда нужно убедиться, что материал не подвергся деградации. [c.51]

ДНК из сахарозных градиентов кажется иногда деградированной. Такой вывод можно сделать, если высокомолекулярные фракции дают заметные полосы в зоне ниже 25 т. н. п. Сходные проблемы касаются солевых градиентов. Для надежности все растворы автоклавируйте (для сахарозы достаточна обработка при 110°С). Нельзя добиться успеха при создании библиотеки, если ДНК подверглась деградации. Иногда деградация ДНК происходит даже в процессе электрофореза в 0,2%-ном геле в течение ночи. Это трудно контролировать — убедитесь, что аппарат для геля чист и растворы свежие и автоклавированные. [c.69]

Фракционирование фермента, обработанного субтилизином, на колонке с фосфоцеллюлозой позволило разделить две фракции. Наиболее слабо связанная с ионообменником фракция, обладавшая активностью при pH 6,8, характеризовалась полным отсутствием зависимости фермента от ионов Са + (рис. 2) [48, 112]. Анализ этой фракции методом гель-хроматографии и электрофореза в градиенте полиакриламидного геля показал, что она представляет собой полипептид с м. в. 80 ООО—90 ООО [34, 113]. В процессе протеолиза вслед за исчезновением а-субъединицы начиналась деградация р-субъединицы [c.63]

Чтобы оценить период полужизни этих р-галактозидаз, дрожжи выращивали на протяжении нескольких поколений в присутствии радиоактивной аминокислоты. Затем синтез белков блокировали с помощью соответствующего ингибитора. Для определения скорости деградации р-галактозидазы из культуры отбирали пробы в разные моменты времени, проводили очистку р-галактозидазы с помощью специфических антител и измеряли количество радиоактивной р-галактозидазы после гель-электрофореза с детергентом-додецилсульфатом натрия (ДСН). Результаты электрофореза для пробы, отобранной через 5 мин после добавления ингибитора, представлены на рис. 8-2, А. Динамика деградации за весь период отбора проб показана на рис. 8-2, Б. [c.103]

Поскольку оба классических метода секвенирования ДНК - путем химической деградации и ферментативным построением комплементарной цепи - в условиях специфической терминации требуют разделения меченых фрагментов ДНК, различающихся по длине на один нуклеотид, в полиакриламидном гель-электрофорезе высокого разрешения, то этому процессу, а также и радиоавтографии, и чтению нуклео- [c.10]

Биогель А (фирма Bio-Rad). Носители сферической формы на основе гелей агарозы, содержащие очень мало заряженных групп. Интервал фракционирования определяется концентрацией агарозы в гранулах. Совместим со всеми обычными буферными растворами. Гели, содержащие >2% агарозы, устойчивы к 6 М гуанидингидрохлориду и 7 М мочевине, хотя и может произойти небольшая усадка гели с содержанием агарозы < 2% под действием указанных агентов претерпевают структурную деградацию. Гель устойчив при pH 4 10 устойчив к действию 0,1 М NaOH или 1 М НС1 в течение 2-3 ч может разрушаться под действием окислителей. Интервал рабочих температур 2-30°С размягчается при температуре > 40°С. Замораживание вызывает разрушение гелевой структуры. Поставляют в набухшем состоянии. [c.442]

Гели декстрана и агарозы подвержены действию микроорганизмов (бактерий и плесени), вызывающих деградацию геля и изменение его хроматографических свойств. Кроме того, если хроматографирование ведется на инфицированном геле, выход разделенных соединений (биополимеров) уменьшается и в элюате появляются примеси. Хотя чисто синтетические гели, например полиакриламид, полиметилметакрилат, полистирол, сами и не разрушаются микробами, эти микробы могут расти в той среде, в которой суспендирован гель, а также на поверхности геля. В результате этого в элюате, полученном на гелях этого типа, также появляются примеси. [c.376]

Табулированы и обсуждены имеющиеся данные по физическим и химическим свойствам полимеров изобутилена. Рассмотрены химические свойства и превращения олиго- и полиизобутиленов, которые подразделены на превращения концевых групп двойных связей (реакция присоединения и расщепления) звеньев основной цепи, боковых метильных групп (заместител ьные реакции) и распад основной цепи (деградация, деполимеризация, сшивка). В ряду различных воздействий на полимер проанализированы химические, физические и высокоэнергетические методы воздействия (реагенты и окислители, механохимия, ультразвук, плазма тлеющего разряда, ионизирующие излучения и др.). Особенно выделены направленные превращения полимеров изобутилена, открывающие пути технического применения полимеров изобутилена (каталитическое ионное гидрирование, алкилироваьше фенолов и аминофенолов, каталитическая деполимеризация и некоторые другие). Суммированы аналитические характеристики полиизобутилена спектроскопические (ИК, ЯМР) данные, касающиеся основной цепи и дефектов структуры вязкостные, реологические и молекулярно-массовые параметры их взаимосвязь и методы определения (фракционирование, озонолиз, гель-проникающая хроматография и др.). Совокупное сочетание различных методов обеспечивает высокую степень надежности полученной информации, касающейся аналитических характеристик полиизобутилена. [c.379]

Авторы ЭТОЙ работы [5] воздействуют на белки сои, находящиеся в диспергированной форме в концентрации 10%. Под действием тепловой обработки (80°С, 30 мин) эта диспергированная система преобразуется в прогель, характеризуемый повышенной вязкостью. Прогель при охлаждении до 40 °С в течение 1 ч превращается в гель. Превращение прогеля в метазоль происходит под действием чрезмерного нагрева, или перегрева (125°С), вызывающего химическую деградацию белков. В частности, наблюдаются деструкция цистеина, а также дезамидирование аспарагина и глутамина — явления, способные помешать гелеобразованию. [c.518]

Между тем при более глубоком анализе оказывается, что эта гипотеза противоречива и не может объяснить ряд экспериментальных фактов, что признает и сам автор В частности, он пишет Найдено, что повторная варка высокомолекулярных фракций лигносульфонатов приводит к относительно небольшому умень-пгению молекулярного веса Другими словами, высокомолекулярные лигносульфонаты цкаэались более устойчивыми к деградации, чем следовало ожидать, если бы они были частью сетки [28] Затем Горинг отмечает, что при гель-хроматографии сульфат- ного лигнина было обнаружено бимодальное молекулярно-весовое распределение, которое не должно ожидаться при беспорядочной деструкции [28] Для объяснения последнего факта Горинг привлекает гипотезу Форса с сотр [38] о наличии двух фракций природного лигнина, отличаюш ихся молекулярным весом Отметим здесь, что такое же бимодальное распределение наблюдается при гель-хроматографии лигносульфонатов, полученных при кислой сульфитной варке препарата ДЛА, первоначально обладаюш его мономодальным молекулярно-весовым распределением и незначительной физической гетерогенностью [39] [c.260]

Большие возможности структурных исследований нефтяных порфиринов открылись с началом использования масс-спектромет-рии. Первые же работы с применением этого метода, появившиеся в 1966—1967 гг., выявили значительную сложность состава порфиринов нефти и, прежде всего, наличие в них соединений нескольких изобарных серий и широкого набора молекулярных масс. В конце 60 — начале 70-х гг. опубликовано несколько работ зарубежных авторов, где затронуты весьма важные вопросы методологии исследования и выявлены некоторые структурные характеристики порфиринов нефтей. В частности, были подобраны оптимальные условия съемки масс-спектров низкого разрешения, с помощью гель-хроматографии показано наличие в порфиринах сланцев соединений с высокими молекулярными массами, анализом кислотных гидролизатов нефтяных порфиринов обнаружены связанные с ними аминокислотные остатки, предложен метод окислительной деградации порфиринов в малеинимиды, позволяющий определить заместители на каждом пиррольном кольце порфиринов. [c.319]

Для замедления процесса термической деградации резиновой прокладки вокруг впускного патрубка была уложена свернутая металлическая охлаждающая трубка. В качестве насадки применялась высоковакуумпая силиконовая смазка на целите. Прежде чем стали получаться воспроизводимые хроматограммы, новую колонку пришлось стабилизировать при 400° С в течение 2—3 ч в потоке гелия. Прибор работал удовлетворительно в области температур 25—500° С при разделении эфиров фтороспиртов и камфарных кислот, применяемых в качестве смазок для реактивных двигателей, а также при разделении изомеров н-фенилнафтил-аминов и изоцианатов толуола. Полная стоимость прибора Фелтона составляет около 100 долларов (не считая самописца). [c.307]

Рис. 45.2. Разделение методом гель-хроматографии на колонке (1,0X39 см) с сефадексом G-10 пенициллинов, 6-АПК и продуктов деградации 6-АПК [12].

При хранении в водных растворах антибиотики этой группы частично полнмеризуются. Кроме того, 6-АПК образует димер, по-видимому, за счет нуклеофильной атаки р-лактамного кольца одной молекулы аминогруппой второй молекулы. Пенициллины, 6-АПК и продукты деградации 6-АПК разделяли методом гель-хроматографии (рис. 45.2) [12]. Полимеры 6-АПК> [c.206]

В гл. IV мы показали на двух примерах (см. стр. 148), что с помощью сефадекса G-25 можно определить число центров связывания в молекуле фермента, или сродство ферментов к различным реагентам, а также изучить влияние кофакторов на фермент (см. стр. 142). Аналогичным образом, измеряя способность к связыванию восстановленного ДПН, удалось найти эквивалентный вес семи дегидрогеназ (30 000— 40000) [20]. Иногда образуются стабильные комплексы фермента с реагентом, как, например, при действии свободной от цинка карбоксипептидазы на пептидный субстрат [21]. Этот комплекс, который с помощью гель-хроматографии можно отделить от избытка субстрата, уже не активируется ионами цинка. Очистка гель-фильтрацией на сефадексе G-50 является стандартным приемом при определении металла в карбоксипепти-дазе [22]. Лизоцим образует нерастворимый комплекс с продуктом, получающимся при действии этого фермента на- определенный гликопептид. Растворение этого комплекса (в растворе Na l) и последующий анализ с помощью гель-хроматографии на сефадексе (j-75, а затем на G-25 дает информацию о кинетике ферментативной реакции [23]. При добавлении цито-хромоксидазы к избытку цитохрома с и последующем разделении на сефадексе G-200 в некоторых случаях получают высокомолекулярную фракцию, содержащую эквимолярные количества обоих ферментов эта фракция есть по сути не что иное, как часть дыхательной цепи [24]. В некоторые ферменты цикла лимонной кислоты, для которых кофактором служит биотин, удалось ввести метку (С Ог) в результате реакции с соответствующими субстратами с последующей очисткой на сефадексе G-50 это дало возможность после деградации под действием проназы [c.214]

Границы этой темы выбраны довольно произвольно. Сюда можно было бы отнести разделы, касающиеся энзимологии, эндокринологий и белков плазмы. Название этого раздела следует понимать в том смысле, что в нем мы рассмотрим лишь те случаи, когда гель-хроматография служит вспомогательным средством в диагностике. В связи с этим наибольший интерес из цитированной до сих пор литературы представляют работы, описывающие маркировку белков флуоресцеином или радиоактивным иодом (см. литературу к гл. IV, приложения I и II) и связывание медицинских препаратов или стероидных гормонов с белками плазмы (см. литературу к гл. IV, приложение III, и литературу к гл. V, приложение VIII). Естественно, что определению полисахаридов в биологических жидкостях сильно мешает наличие моносахаридов. Например, декстран, применяющийся в качестве заменителя крови, может быть легко отделен от глюкозы на сефадексе Q-25 [102, 103]. Этот метод рекомендован в качестве стандартного при исследовании функции почек, когда нужно определить количество инулина (полифруктозана) в моче в присутствии глюкозы [104, 105]. Благодаря этому методу удается избежать ферментативной деградации глюкозы. Полисахарид, необходимый для этого теста, не должен ассоциировать с белками плазмы. помощью сефадекса G-50 можно показать, что эт г иу требованию полностью удовлетворяет полифруктозан-S [106]. [c.225]

На основании аналогии с автокаталитическим ростом разветвленных цепей к второму классу могут быть, вероятно, сведены и любые процессы, в которых разветвления и сшивки происходят уже в ансамбле предварительно заполимеризованных цепей. В частности, распределения типа Бизли должны получаться при ограниченной вулканизации линейных полимеров или при достаточно далеко прошедшем статистическом распаде трех-дшрных полимеров ( обращение процесса вулканизации ). Соответственно аналогичные МВР должны получаться и в комбинированном процессе, когда сосуществуют реакции сшивки и деградации. Эти процессы имеют место при облучении полимеров ионизирующей радиацией всегда существует доза играющая роль критической степени завершенности реакции Уд, или гель-точки. Но ниже Гд МВР должно быть типа Бизли. [c.253]

Полиакриламидный гель наименее химически активен. Его> слабое сродство к красителям позволяет осуществлять быстрое обнаружение биополимеров, главным образом белков, нуклеиновых кислот и продуктов их деградации, с помощью окрашивания. Прозрачный полиакриламидный гель обладает хорошими механическими свойствами, допускающими изменение концентрации полиакриламида в самых широких пределах. Электроос-мотические эффекты в этом геле очень малы. Условия аналитических и препаративных разделений на полиакриламидном геле путем зонного электрофореза в гомогенных и дискретных системах буферных растворов [48, 77], а также изотахофореза и изо-электрического фракционирования хорошо изучены. [c.299]

В результате препаративного фракционирования лигносульфо-яатов ЛС методом гель-фильтрации на сефадексе 0-=75 полу-leHO 11 фракций, отличающихся по величине молекул. Для выделения из водных растворов и очищенных от минеральных со-пей фракций определены молекулярные веса МВ, оптическое поглощение в УФ-области, содержание серы и метоксильных групп. Данные по УФ-поглощению и содержанию серы и метоксилов во фракциях показывают, что ЛС ip MB больше 35.000 и менее 35.00 химически и структурно различны. По МВ и выходам фракций построены кривые молекулярно-весового распределения ЛС, которые свидетельствуют о том, что ЛС являются продуктом сложных превращений лигнина, включающих в себя как реакции деградации макромолекулы лигнина, так и реакции сщивки. - Табл. 1. Ил. 5. Библ. 14. [c.207]

В то же время инъекция водной эмульсии полидиметилсилоксана (Mw = 7800) или экстракта из геля, применяемого для заполнения имплантатов грудных желез (Mw = 14000), не вызывала какой-либо заметной реакции ткани, в том числе не приводила к образованию капсулы за период до 72 дней. При этом методом ЯМР 29Si экстрактов из лимфатических узлов опытных животных было установлено, что введенные в составе эмульсий полисилоксаны подвергаются деградации в организме, причем полимеры высокого молекулярного веса подвергаются биотрансформации со значительно меньшими скоростями [7]. [c.289]

РНК-зонды обладают всеми преимуществами одноцепочечных ДНК-зондов это отсутствие конкурентной гибридизации молекул зонда друг с другом, высокая удельная радиоактивность по сравнению с продуктом ник-трансляции и не представляющее трудностей определение длины молекул. Дополнительное преимущество этих зондов по сравнению с одноцепочечной ДНК — большая простота их получения. Транскрипты можно отделить от матрицы путем ее ДНКазного расщепления и фенольной экстракции, тогда как получение одноцепочечных ДНК-зондов требует более трудоемкой процедуры выделения их из геля. В то же время РНК-зонды в большей степени подвержены деградации, чем соответствующие им ДНК-зонды, и об этом нельзя забывать. Самая распространенная проблема, встающая при использовании РНК-зондов, — неоднозначность интерпретации в случае получения отрицательного результата. [c.13]

Для предварительной оценки степени деградации ДНК проводят ее электрофорез в агарозном геле. Молекулы ДНК представляют собой полианионы, которые в электрическом поле движутся к аноду. ДНК (одно- и двухцепочеч- [c.197]

Более тонкий метод оценки генетического сходства организмов — метод гибридизации их ДНК, позволяющий количественно оценивать степень гомологичности ДНК этих организмов. В основе его лежит способность денатурированной (одноцепочечной) ДНК в подходящих условиях ренатурироваться, т. е. соединяться с комплементарной нитью с образованием двухцепочечной молекулы ДНК. Для этого ДНК, выделенную из организмов одного вида, денатурируют нагреванием и в таком виде фиксируют в каком-нибудь носителе, например в геле. Из другого вида организмов приготавливают меченую ДНК, подвергают ее денатурации и деградации на отдельные более или меиее мелкие фрагменты, после чего создают условия для реассоциации с ДНК, закрепленной в носителе. Количество двухцепочечной ДНК, образованной в результате взаимодействия однонитевых ДНК из разных организмов, служит мерой сходства этих организмов. (Количество образовав [c.138]

Очищенную ДНК проверьте на нативность и на присутствие нуклеаз. Для этого инкубируйте половину содержимого блока при 37°С 3 ч с 10 мМ Mg l2 и нанесите эту смесь, а также необработанную половину на ОРАОЕ-гель [7] или на гель для электрофореза в инвертированном поле [8]. Определите размер ДНК. Необработанная ДНК должна практически полностью остаться в лунке, а в обработанном магнием препарате не должно быть низкомолекулярных примесей. Только в этом случае можно использовать препараты для прыжков по хромосоме . Если же в препаратах, обработанных магнием, налицо признаки деградации, значит они загрязнены нуклеазами и надо повторить обработку протеиназой К. Как правило, этого бывает достаточно, чтобы избавиться от загрязнений. [c.102]

Примечание по оригинальной методике инкубацию проводили в течение 30 мин. За это время РНКаза А расщепляет многие неспаренные участки лишь частично, что приводит к появлению радиоактивных сигналов в участках геля, соответствующих фрагментам дикого типа. При более длительной обработке удается расщепить эти уже частично расщепленные РНКазой сайты полностью [15]. Легче всего интерпретировать результаты РНКазной обработки, отбирая в процессе реакции аликвоты после 30, 60 и 90 мин инкубации. В ряде случаев полуторачасовая обработка бывает чрезмерной и приводит помимо прочего к деградации концевых областей фрагментов РНК. Поэтому если кинетика реакции не исследована, то оптимальным временем обработки следует считать примерно 60 мин. [c.152]

Следует отметить, что классические методы секвенирования ДНК химической деградацией и ферментативным построением комплементарной цепи в условиях специфической терминации, являющиеся главным предметом рассмотрения в этой книге, кардинально различаясь в своих подходах, требуют разделения меченых фрагментов ДНК, отличающихся по длине на один нуклеотид, в полиакриламидном гель-элек-трофорезе высокого разрешения. Все составляющие процесса секвенирования ДНК как тем, так и другим методами за годы прошедшие с их разработки, подверглись сильной модификации, и производительность сегодняшнего секвенирования ДНК просто поражает. Однако отражение только нынешнего состояния дел в этой области молекулярной биологии в отрыве от некой цепочки последовательных улучшений той или иной составляющей этих методов не способно показать тот огромный прогресс, который был достигнут усилиями очень многих ученых. [c.17]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология