Олигомерная последовательность

О происхождении разных кодирующих генов, содержащих идентичные повторяющиеся олигомерные последовательности. Открытие большого числа семейств повторяющейся ДНК (разд. 2.3.1.1) породило спекуляции относительно происхождения генетического кода и кодирующих последовательностей. Оно, например, провел сравнение множества нуклеотидных последовательностей ДНК и установил, что одни и те же последовательности, чаще всего длиной около 10 оснований, а иногда и до 28 оснований, имеются во многих, причем соверщенно разных, генах и в различных рамках считывания [1967]. Вероятно, в ходе эволюции последовательности повторяющейся ДНК адаптировались к различным функциональным требованиям. [c.27]

Пусть фермент катализирует гидролиз линейного олигомерногО субстрата, исходная степень полимеризации которого равна N. В ходе последовательного превращения текущая степень полимеризации его соответствует п (rк.N). При связывании линейного субстрата с ферментом образуется позиционный изомер Е5 , где / обозначает сайт (реальный или умозрительный), который занимает восстанавливающий конец субстрата (см. рис, 4), Позиционный изомер может быть продуктивным (Е5 ,/) или непродуктивным (Е8 , ) , в зависимости от того, перекрываются ли они при связывании с каталитическим участком фермента. [c.93]

Последовательность реакций, приводящая к периодическому образованию коротких фрагментов поли- или олигомерного субстрата за счет множественной атаки, может быть представлена в следующем виде [14, 20] [c.97]

Сформулированные принципы структурной организации природных олигопептидов являются необходимой основой для решения задачи структурно-функциональной организации этих соединений, обсуждаемой в следующем томе. Сейчас же важно отметить, что установление таких принципов подвело наше рассмотрение непосредственно к самому ответственному моменту исследования одной из фундаментальных задач проблемы белка - завершающему этапу изучения структурной организации белковых молекул и к решению вопроса о возможности априорного расчета их нативных трехмерных структур на основе известной аминокислотной последовательности, предложенной автором теории и разработанного им метода расчета. Перед обсуждением результатов конформационного анализа белков и количественной оценки функций дальних взаимодействий еще раз напомню о роли ближних и средних взаимодействий в структурной организации олигомерной аминокислотной последовательности. [c.403]

Вторая часть книги, двадцать две ее главы (т. 2 и 3 в русском переводе), содержит систематическое описание строения молекул, молекулярных, олигомерных или бесконечно-полимер-ных ионов и кристаллов соединений разных химических классов. Очередность изложения материала можно назвать классической это именно тот порядок, который принят в большинстве учебников по неорганической химии. Просмотрев оглавление, читатель убедится, что автор движется по группам периодической таблицы Д. И. Менделеева последовательно рассматриваются соединения с участием водорода, галогенов, кислорода, серы и других халькогенов, азота, фосфора и их аналогов по группе и т. д. Такой порядок расположения материала делает монографию, с одной стороны, очень удобным и нужным дополнением к учебникам по неорганической химии (особенно полезным для аспирантов и соискателей степени кандидата наук), с другой стороны, хорошим источником сведений о структурных основах для научных работников — специалистов в той или иной области неорганической химии. Каждая глава (или группа глав) книги может служить фундаментом для разработки углубленных концепций о связи между реакционной способностью, строением и физико-химическими свойствами соответствующих классов соединений. [c.6]

Характерной особенностью белков с четвертичной структурой является их способность к самосборке. Легко происходит, например, самосборка гемоглобина из смеси а- и (1-цепей. Таким образом, в аминокислотной последовательности полипептидных цепей олигомерного белка закодированы как бы два уровня информации один [c.122]

Если олигомерный зародыш имеет изометрическую форму, активные центры полимеризации и роста находятся в нем на концах цепей. При замедленном присоединении молекул в процессе полимеризации к растущему кристаллу возможно формирование фибриллярной морфологии. По мере того как зародыш все больше становится похожим на зародыш типа бахромчатой мицеллы (вследствие последовательного протекания полимеризации и кристаллизации), тенденция образования из него фибриллярного кристалла увеличивается вследствие возрастания стерических затруднений на гранях роста. [c.56]

В присутствии КО эффективность зарождения радикалов резко возрастает (механизм явления рассмотрен в [30]). При медленном размораживании облученных таким образом систем (см. рис. 2) удается наблюдать последовательность реакций, приводящих к образованию макромолекул (спектры ЭПР первичных (б), олигомерных (в) и полимерных радикалов (г) метакрило-вых мономеров отличны друг от друга). Установлено, что реакция роста цепи как в отсутствие, так и в присутствии КО происходит путем последовательного присоединения молекул мономера к накопленным при облучении радикалам. Следовательно,, описанные выше изменения эффективных констант роста цепи [c.62]

Точное название ЭО можно дать лишь по основному веществу, что оправдано преимущественно для мономерных продуктов. В олигомер-гомологических смесях можно выделить группу олигомерных соединений идентичного строения. Номенклатура ЭО тесно связана с их классификацией. Общепринятая классификация ЭО отсутствует каждый автор пользуется своей [1—51. Наиболее последовательно ЭО классифицируются автором [2]. Исходя из химического строения целесообразно по типу ЭГ выделить две основные группы ЭО I — ЭГ входит в состав алифатической цепи (алифатические ЭО) П — ЭГ связана с алифатическим пяти- или шестичленным циклом, например [c.8]

Если бы процесс раскрытия циклоолефинов протекал через последовательные стадии образования димеров, тримеров-и других олигомерных форм, например, по схеме [c.262]

Поликонденсация фенола с формальдегидом — сложная совокупность последовательных и параллельных реакций. Наиболее типичные и многократно повторяющиеся — присоединение формальдегида к фенолу (гидроксиметилирование фенола) и поликонденсация образовавшихся метилолфенолов между собой и с олигомерными продуктами. При гидроксиметилировании формальдегид присоединяется к фенолу по орто- и лара-полол<ениям, атомы углерода в которых имеют повышенную электродную плотность [c.165]

Таким образом, образование надмолекулярных структур в пограничном слое в олигомерных и полимерных пленкообразующих является основной причиной последовательной ориентации молекул пленкообразующего от одного слоя к другому при формировании покрытий. [c.43]

Упорядочение структуры наполненных покрытий путем регулирования взаимодействия на границе полимер-наполнитель по аналогии с ненаполненными покрытиями может быть осуществлено двумя различными методами путем последовательного регулярного чередования на поверхности частиц наполнителя активных и неактивных центров или в результате упорядочения структуры полимера до добавления в него наполнителя. Последнее достигается при введении в олигомерные системы добавок, диспергирующих структурные элементы и препятствующих их агрегации при введении наполнителей и в процессе формирования покрытий. [c.170]

Пленкообразование значительной части лакокрасочных материалов осуществляется в результате физических процессов испарения растворителей, астабилизации и обезвоживания ла-тексов, охлаждения расплавов. Возможно, хотя и менее распространено, формирование покрытий коагуляцией пленкообразователей из растворов. Другая часть материалов, в основном олигомерного и мономерного типа, образует покрытия в результате либо химических процессов полимеризации или поликонденсации, либо одновременного (а часто последовательного) протекания физических и химических процессов. [c.38]

Следует также отметить, что при проведении картирования активного центра ферментов необходимо использовать деполимеразы чистые если не в физическом, то хотя бы в функциональном отношении. Даже малейшие примеси, присутствующие в ферментных препаратах, предназначенных для картирования активного центра, могут значительно исказить результаты эксперимента. Далее, для проведения исследований следует располагать серией структурно-гомологичных олигомерных субстратов с последовательно изменяющейся длиной цепи (предпочтительно от степени полимеризации п, равной двум-трем, до п, равной или превышающей число сайтов в активном центре фермента, обычна до семидевяти. Субстраты должны быть также гомогенными по хроматографическим показателям [5]. [c.39]

Помимо подразделения ферментов на группы по направленности их атаки, ферменты-деиолимеразы также делят по способу образования продуктов реакции. При этом выявляют два крайних случая — максимально неупорядоченная и максимально упорядоченная атака. В первом случае эндофермент, расщепив какую-либо связь в полимерной молекуле, отходит от продуктов реакции и производит следующую атаку на другую молекулу субстрата или продукты его деградации ио закону случая (статистически). Во втором случае после завершения каталитического акта один из поли- или олигомерных фрагментов субстрата остается в комплексе с ферментом и реакция продолжается в виде серии последовательных атак вплоть до полного превращения данного [c.77]

Многие представления о действии и взаимодействии белков появились в ходе исследования гемоглобина. Многие представления и модели, относящиеся к взаимодействиям белок — лиганд и белок — белок, были развиты в процессе исследований гемоглобина к ним относятся сигмоидное связывание [674—676], коэффициент Хилла [677], константы последовательного связывания лигандов в олигомерных белках [678], кооперативность, основанная на конформационных изменениях [679, 680], и аллостерический контроль белков [92, 681, 682]. Следует отметить, что многие из этих концепций были введены и математически формализованы до того, как стала известна структура какого-либо белка. Очевидно поэтому актуальное значение и полезность этих конце1щий должны подвергаться постоянной проверке. Пример дифосфоглицерата, влияние которого на действие и структуру гемоглобина игнорировалось десятилетиями, свидетельствует о потенциальной опасности жестких формулировок в биологии. [c.259]

Фенолоальдегидные олигомеры образуются при взаимодействии различных фенолов (фенол, крезолы, ксиленолы, двухатомные и трехатомные фенолы) с альдегидами (формальдегид, уксусный альдегид, фурфурол). При отверждении олигомерных продуктов они превращаются в соответствующие полимеры, обычно трехмерной структуры. Пластические массы на основе фенолоальдегидных олигомеров называют фенопластами. Поликонденсация фенолов с альдегидами - это многостадийный процесс, при котором протекает ряд последовательно-параллельных реакций. В результате этих реакций могут образоваться как термопластичные, так называемые новолачные, так и термореактивные - резольные олигомеры. Основными факторами, определяющими строение и свойства фенолоальдегидных олигомеров, являются функциональность исходного фенольного компонента, природа альдегида, соотношение исходных мономеров и pH реакционной среды. Фенолы, используемые для синтеза олигомеров, могут иметь различную функциональность, под которой понимают число атомов водорода фенола, способных к замещению в реакции с альдегидами. Например, при гидроксиметилировании формальдегид присоединяется к фенолу по орто- и и<зр<з-положениям, атомы углерода в которых имеют повышенную электронную плотность благодаря влиянию гидроксильной Фуппы. В табл. 3.1 приведены некоторые характеристики фенолов, наиболее часто используемых при синтезе фенолоальдегндных олигомеров. [c.62]

Об этом грворит низкое содержание водорода в АПСЕ и то, что 2/3 фенольных гидроксилов макромолекулы химически связаны. Кроме того, поскольку эфирные связи обнаружены в бензиловом положении, естественно полагать, что они могут образоваться в Р и V положениях пропановой цели. Решая задачу о типах связей между АПСЕ, их последовательности в макромолекуле, т.е. по сути задачу ее строения, шли несколькими путями использовали окислительную деструкцию лигнина синтезировали модели фрагментов макромолекулы сопоставляли химические свойства со свойствами препаратов ЛМР и протолигнином продолжали поиск способов деструкции лигнина до олигомерных фрагментов осуществляли биосинтез лигнина, причем в процессе образования полимера выделяли и идентифицировали образовавшиеся олигомеры. [c.104]

Следующим важным событием было определение аминокислотной последовательности в двух типах полипептидных цепей гемоглобина. Это бьша первая последовательность, установленная для олигомерного белка. Молекула гемоглобина состоит из четырех полипептидных цепей, назьшаемых глобинами [c.154]

О2, СО2, ионами Н и ДФГ, а также изменениями в четвертичной структуре гемоглобина в цикле оксигенация-де-зоксигенация. Таким образом, субъединицы гемоглобина, подобно субъединицам других олигомерных белков, способны передавать сигналы о регуляторных взаимодействиях посредством конформациопных изменений молекулы белка. Изменения в аминокислотной последовательности глобулярных белков, обусловленные генными мутациями, например замена двух аминокислотных остатков в молекуле гемоглобина при серповидноклеточной анемии, могут вызвать значительные изменения конформации белка и, следовательно, сказаться на его биологических функциях. [c.222]

После инициирования рост полимерной молекулы осуществляется в результате последовательного присоединения молекул мономера. В связи с этим общее число растущих молекул и промежуточных олигомерных молекул, образующих зародьши, определяется условия-инициирования. Молекулярновесовое распределение в гомогенной фазе зависит от механизма инициирования и скорости удаления полимерных и олигомерных молекул в результате зародышеобразования и кристаллизации. В то же время конечный молекулярный вес молекул в кристаллах зависит от механизма обрыва, который, возможно, обусловлен окклюзией активного конца молекулы внутри кристалла, а также прекращением дальнейшего роста молекулы вследствие определенной морфологии кристалла (см. рис. 5.20). [c.49]

Эйнгер [89] обнаружил, что в начале кристаллизации иглы растут на поверхности подложки. Это наблюдение согласуется с представлением об образовании зародышей из предварительно возникших олигомерных молекул, которые должны быть полностью адсорбированы на поверхности подложки (разд. 3.4.3). На более поздних стадиях иг.лы растут главным образом под углом к поверхности подложки. При температурах кристаллизации, близких к температуре плавления, кроме игл, образуются также ламели. Ламели, по-видимому, растут в результате последовательного,протекания полимеризации и кристаллизации и обусловленного этим складывания присоединяющихся к кристаллу цепей, в то время как иглы являются следствием одновременного протекания полимеризации и кристаллизации. [c.350]

Реакция полимеризации олефинов обычно должна быть инициирована, после чего она протекает как реакция последовательного присоединения мономера. Процесс может быть гомогенным при использовании растворимого инициатора или гетерогенным на поверхности твердой частички катализатора. Для нас представляют интерес те реакции, которые приводят к образованию кристаллического полимера. В гомогенных реакщмх образование первичного кристаллического зародыша происходит или из активных растущих олигомерных молекул, или при складывании продолжающей расти полимерной молекулы, как это показано в разд., 5.1.2.3 и 5.1.2.4. В гетерогенных реакциях сама частица катализатора может служить первичным гетерогенным зародышем кристалла. [c.361]

Рассмотренные примеры показывают, что одновременные полимеризация и кристаллизация возможны и обычно протекают при проведении реакции вблизи предельной температуры полимеризации (разд. 6.1.8). При условиях, далеких от равновесных, более вероятным является последовательное протекание полимеризации и кристаллизации. При одновременном осуществлении полимеризации и кристаллизации, образующиеся вначале олигомерные ламели могут вырастать в кристаллы из вытянутых цепей. При последовательном протекании полимеризации и кристал.шзации морфология кристаллов изменяется от ламелярной до фибриллярной, а макроконформация цепей — от регулярных складок до нерегулярных и даже до макрокон-формации типа бахромчатой мицеллы. Основное влияние кристаллизащи на химическую реакцию полимеризации заключается в изменении ее скорости и механизма, а также з возможном обрыве реакции роста цепей вследствие окклюзии их активных концов. Однако в любом случае должна быть достигнута достаточно высокая концентрация олигомеров в результате гомогенной реакции полимеризации (разд. 5.1.2). В ступенчатых реакциях полимеризации после образования кристаллических зародышей концентрация олигомеров уменьшается и далее реакщ1И протекают по механизму полиприсоединения. Олигомерные молекулы могут участвовать в образовании молекулярных зародышей и затем расти далее. В результате этого происходит полное превращение мономера в полимер. В реакциях полиприсоединения возникшие молекулы олигомеров растут далее только в результате последовательного присоединения к ним молекул мономера. При большой начальной концентрации олигомеров количество образующихся длинных молекул уменьшается. [c.395]

Рассмотрим взаимное влияние функциональности и полидисперсности на примере линейных олигомерных нолидиэтиленгликоль-адипинатов (ПДЭГА), МВР которых исследовали методами адсорбционной, осадительной и гель-проникающей хроматографии и экстракцией из тонкой пленки. В работе для функционирования ПДЭГА использовался метод осадительной хроматографии. При разделении исходных образцов различного молекулярного веса только при помощи системы растворитель—осадитель наблюдался возврат фракций , т. е. нарушалась последовательность выхода фракций по молекулярному весу. [c.223]

Химическая структура полученных олигомерных продуктов изучена по их ИК-спектрам. Олигомеры образуются при полимеризации ВЦГ по двойной связи путем 1,2-присоединения мономерных звеньев, о чем свидетельствует сохранение полос поглощения 850, 890 см и др., характеризующих деформационные колебания циклогексильного кольца, и отсутствие полос, обусловленных колебаниями четвертичного атома углерода, который мог бы появиться в результате 1,3-присоединения. ИК-спектр олигомера в целом аналогичен спектру высокомолекулярного ПВЦГ, особенностью его является лишь большая интенсивность полос поглощения, связанных с ненасыщенностью (919, 1640 и 3040 см ). Наличие в ИК-спек-трах олигомеров полосы 820 см обусловленной колебаниями внутренней двойной связи, объясняется, по-видимому, возможностью миграции концевой двойной связи в олигомерах. Кроме того, в спектре присутствует полоса 730 см , характеризующая последовательность метиленовых групп, равную трем [166], т.е. в данном случае, очевидно, имеет место образование статистического сополимера ВЦГ с этиленом, выделяющимся при взаимодействии ВЦГ с ГМДСЭА или при формировании каталитического комплекса. В спектре олигомера отсутствуют полосы, связанные с микротактичностью ПВЦГ (830, 960 см ). [c.111]

При формировании одновременных или последовательных ВПС в ходе реакции происходит микрофазовое разделение системы вследствие возникающей термодинамической несовместимости межузло-вых цепей составляющих сеток. Можно проследить здесь некоторую аналогию с осадительной полимеризацией. Эти три основные фактора должны обусловить различия в кинетике формирования ВПС по сравнению с формированием индивидуальных олигомерных сеток. [c.227]

В работах [127-130] описаны различные системы ловушек, хладоаген-тов и сорбентов для вымораживания самых разнообразных веществ. Устройство, описанное в работе [131], позволяет одновременно удерживать широкий набор продуктов деструкции. Олигомерные продукты конденсируются на спирали, нагретой до 150 °С. За спиралью последовательно смонтированы две ловушки в первой ловушке, охлажденной до — 75°С, конденсируются низкомолекулярные продукты, во второй, заполненной молекулярными ситами и охлажденной до температуры жидкого азота-газообразные продукты. Каждая ловушка соединена с отдельным хроматографом олигомерные продукты деструкции исследуют другими методами. Некоторые варианты устройства горизонтальной установки, включая хроматографическую колонку в форме незамкнутого кольца, описаны в работах [132-134]. [c.54]

Цепная реакция — это особый тип ступенчатой реакции, замкнутая реакционная последовательность. Отдельные ступени реакции зависят друг от друга промежуточные ступени могут быть выделены только в исключительных случаях. В результате первичного акта возникает очень реакционноспособное образование, которое в состоянии вызвать цепную реакцию присоединения мономера, реакцию роста . Активное состояние конца растущей молекулы при этом сохраняется. Обратной реакцией, при которой от активного конца отщепляется молекула мономера, во многих случаях можно пренебречь. Она, однако, обусловливает для определенной реакции полимеризации предельную температуру ( eiling temperature), выще которой полимер неустойчив и, следовательно, полимеризация не происходит (стр. 32), Равновесие играет роль в самых различных реакциях полимеризации, В связи с этим была выдвинута общая теория равновесной но.чимеризации [54]. Исчезновение активного состояния приводит к обрыву цепи реакции. Таким образом, промежуточные ступени полимеризации представляют собой не олигомерные или полимерные молекулы, а растущие цепи, имеющие, но крайней мере, один активный конец цепи. [c.21]

На ранних стадиях поликонденсации олигомерная цепь растет в основном за счет последовательного присоединения монотидроксиметильных производных фенола к ФНО, на конечных стадиях - за счет реакции ФНО с гидроксиметильными производными ФНО [120, 370]. [c.207]