Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Коэффициент седиментации ДНК формы

    Предположив, что белок с молекулярным весом 16 ООО имеет в водном растворе форму сферы, рассчитать а) коэффициент диффузии О, б) стандартное отклонение о диффузной границы после 10 ч, в) коэффициент седиментации, г) расстояние оседающей молекулы от оси вращения центрифуги спустя 1 ч (скорость вращения 60 000 об/мин, начальное расстояние от оси 6,0 см). При 20° С т]=0,001005 Па-с, v = =0,75 см /г, Рн,о =0,9982 г/см . [c.623]


    Аналитическую кювету помеш ают обычно на расстоянии —6,5 см от оси враш ения ротора. С другой стороны осп враш,ения в ротор помещают противовес Цилиндрический вкладыш ячейки имеет сквозной вырез в форме сектора с секториальным углом 2—4°. На рис. 4.25 приведена схема аналитической кюветы. Благодаря тому, что линий, являющиеся продолжением стенки кюветы, сходятся на оси вращения, устраняется возможность конвекции из-за соударений седиментирующих молекул со стенками. Однако такая форма кюветы приводит к секториальному разбавлению уменьшению числа молекул в единице объема, связанному с тем, что объем слоя раствора увеличивается с ростом г. Концентрация с на расстоянии г в момент i связана с первоначальной концентрацией Со соотношением с = с (Га/г) , где — положение мениска. Секториальное разбавление учитывается при нахождении зависимости коэффициента седиментации от концентрации и нри пересчете экспериментальных кривых зависимости концентрации раствора от г. [c.141]

    Следует также отметить данные табл, 16 и 17, показывающие, что глобулярные белки имеют компактные и относительно симметричные формы. Он были получены в водных солевых растворах, имеющих величины pH, близкие к изоэлектрическим точкам белков. Эксперименты, проведенные в других условиях, показывают, что компактные формы легко теряются, на это указывают заметные изменения коэффициента диффузии. Два примера таких изменений будут даны на рис. 110 и 111 в связи с соответствующими изменениями коэффициентов седиментации [c.416]

    Только что приведенный вывод был дан Гольдбергом . Его важность заключается в том, что он зависит, по существу, только от закона сохранения массы. Более того, он является независимым от формы седиментационной границы или от типа зависимости 5 от концентрации. Он не только дает критерий, с помощью которого мы можем решить, является ли уравнение (22-6) применимым, но также показывает, как лучше определить з, когда этот критерий не удовлетворяется. Наконец, этот вывод показывает, что коэффициент седиментации, который мы определяем, соответствует концентрации Ср в области плато, а не концентрации при г . [c.428]

    Итак, очевидным является то, что никакое сушествующее соотношение между электрофоретической подвижностью и молекулярными параметрами не является строго применимым к макроионам. Уравнение (24-7) можно рассматривать как дающее полу-количественную информацию относительно молекулярного заряда, размера или формы, но от него нельзя ожидать той же степени точности, как от уравнений для коэффициента седиментации или для коэффициента диффузии макроионов, хотя последние являются сами в некоторой степени приближенными, так как при их выводе пренебрегают силами, обусловленными взаимодействием между потоками различных компонентов и электрическим зарядом. [c.477]


Рис. У.З. Комбинация графического и обычного фракционирования для определения ММР (б) в интегральной (1) и дифференциальной (2) форме, исходя из распределения (а) по коэффициентам седиментации (I), полученного для нефракционированного образца, и распределения по характеристическим вязкостям (2), полученного для набора фракций. Рис. У.З. Комбинация графического и обычного фракционирования для определения ММР (б) в интегральной (1) и дифференциальной (2) форме, исходя из распределения (а) по <a href="/info/128926">коэффициентам седиментации</a> (I), полученного для нефракционированного образца, и распределения по <a href="/info/5998">характеристическим вязкостям</a> (2), полученного для набора фракций.
    Крис и Найт [19] приложили этот подход к изучению веществ, определяющих группу крови. Эта работа содержит множество экспериментальных данных и обсуждение, в которых заключено гораздо больше информации, чем можно привести в этом вводном курсе. Значения коэффициентов седиментации упомянутых веществ сильно зависят от концентрации и удовлетворяют приведенному выше линейному закону для обратной величины 1/5. Предельные значения несколько зависят от температуры. В случае характеристической вязкости температурная зависимость выражена сильнее, что говорит о весьма асимметричной или вытянутой молекулярной конформации этих гликопротеидов. Судя по величине отношения Й8/[т1], их конформация близка к сферической. Вместе с тем по уравнению вязкости Эйнштейна фактор формы оказался равным 60. Эти результаты согласуются с тем, что исследуемые молекулы представляют собой гибкие нити, свернутые в статистические клубки. Добавление додецилсульфата натрия не вызывает заметных изменений во вторичной структуре и в серологических свойствах этих молекул. Все эти данные говорят о том, что вещества, определяющие группу крови, не обладают вторичной структурой. [c.144]

    Отношение коэффициентов седиментации очень близко к 2 / (см. ответ на 1-й вопрос). Следовательно, очень высока вероятность димеризации фермента без заметных изменений формы или эффективного объема. [c.237]

Рис. 12.2. Форма и размеры частиц гемоцианинов моллюсков, наблюдаемые через электронный микроскоп после негативного окрашивания, и соответствующие им коэффициенты седиментации. Рис. 12.2. Форма и <a href="/info/4442">размеры частиц</a> гемоцианинов моллюсков, наблюдаемые <a href="/info/105815">через электронный</a> микроскоп после <a href="/info/1345028">негативного окрашивания</a>, и соответствующие им коэффициенты седиментации.
    Одним из наиболее часто употребляемых и наиболее старых критериев гомогенности является наблюдение единственной границы при исследовании седиментации в ультрацентрифуге. Важно провести этот эксперимент, но при этом следует иметь в виду некоторые положения. Хотя гетерогенность по коэффициентам седиментации обычно легко обнаружить, если примеси присутствуют в количествах, достаточных для наблюдения с помощью используемой оптической системы, форма границы является очень плохим показателем степени полидисперсности. Асимметричные или гибкие молекулы взаимодействуют гидродинамически даже при достаточно высоких разбавлениях раствора, вызывая уменьшение коэффициентов седиментации с увеличением концентрации, что ведет к искусственному обострению границы. Более того, как уже отмечалось, для больших гибких молекул даже в очень разбавленных растворах может происходить интенсивное физическое взаимодействие, а именно переплетение и спутывание цепей. Образование исклю- [c.48]

    Существует еще один параметр, зависящий от формы молекул,— коэффициент вращательной диффузии. Эта величина аналогична коэффициенту поступательной диффузии, который зависит от скорости выравнивания первоначально существующего градиента концентраций и является мерой средней скорости движения молекул под влиянием броуновского движения. Точно так же коэффициент вращательной диффузии зависит от скорости, с которой система, первоначально включающая молекулы с упорядоченной ориентацией какой-либо оси, приходит в состояние со случайным распределением ориентаций, и является мерой средней скорости вращения молекул под влиянием броуновского движения. Отношения вращательных коэффициентов трения полностью аналогичны отношениям коэффициентов трения при прямолинейном движении. Вопросы, связанные с вращательной диффузией, обсуждаются в ряде работ [200, 201]. Шерага и Манделькерн [196] описали еще одну функцию, названную б и аналогичную функции Р, в которую вместо коэффициента седиментации входит коэффициент вращательной диффузии. В отличие от функции р функция б весьма чувствительна к отношению осей (вплоть до величины этого отношения, равной 15). Теоретически эта функция приводит к построению другого гидродинамически эквивалентного эллипсоида. Эти два эллипсоида не должны быть идентичны в одном примере (фибриноген) различие между ними достигало почти максимально возможного значения. Этот интересный случай будет обсуждаться ниже. Он выран<ает тот факт, что гидродинамически эквивалентный эллипсоид связан с гипотетической концепцией, предназначенной для оценки формы молекулы. Не следует думать, что он обязательно соответствует геометрической модели молекулы. [c.76]


    Если молекулы не имеют сферической формы, то коэффициент седиментации сам по себе нельзя использовать для определения молекулярного веса оседающего вещества. Однако при измерении и коэффициента седиментации и коэффициента диффузии молекулярный вес вещества можно вычислить, не делая никаких предположений о форме молекул. Уравнение, на котором основывается это вычисление, может быть выведено путем приравнивания центробежной силы, действующей на частицу, силе трения (где / — коэффициент трения молекулы, а б.г1й1 — скорость седиментации). Центробежная сила, действующая на частицу с массой т и парциальным удельным объемом V, суспендированную в среде с плотностью р, равна [c.614]

    Использование радиолигандного метода позволило приступить к выделению и очистке рецепторов гормонов из мембран. В настоящее время многие рецепторы получены в достаточно гомогенной форме, определены их коэффициент седиментации, молекулярная масса, радиус Стокса, степень гидрофобности и т. д. Рецепторы нескольких гормонов выделены в высокоочищенном виде. Удалось показать, что в большинстве случаев гормональные рецепторы — это гликопротеины. [c.239]

    Препараты рибосом из гороха и других организмов содержат частицы, различающиеся по молекулярному весу и по форме. По-видимому, имеются два основных вида частиц, которые обратимо агрегируют с повышением концентрации магния. Часто различные частицы характеризуют коэффициентом седиментации (S) при ультрацентрифугировании. Связь между коэффициентом седиментации и молекулярным весом, предложенная для частиц, выделенных из Е. oli, показана на фиг. 135. [c.474]

Рис. 25-26. Схема, иллюстрирующая действие эстрогена на клетки-мишени в яйцеводе курицы. Будучи жирорастворимым соединением, эстроген проходит через клеточную мембрану и связывается с эстрогенным рецептором-белком с коэффициентом седиментации 48. Далее эстро-ген-рецепторный комплекс превращается в активную 58-форму и в качестве вторичного посредника проникает в ядро, где, взаимодействуя со специфическими участками хроматина, вызывает транскрипцию определенных генов с образованием соответствующих мРНК. Последние выходят из ядра и используются в качестве матриц белкового синтеза на рибосомах. В результате синтезируется ряд белков, характерных для яйцеводов в стимулированном состоянии, например овальбумин. Рис. 25-26. Схема, иллюстрирующая действие эстрогена на <a href="/info/200568">клетки-мишени</a> в <a href="/info/567571">яйцеводе курицы</a>. Будучи жирорастворимым соединением, эстроген <a href="/info/336204">проходит через</a> <a href="/info/1532051">клеточную мембрану</a> и связывается с <a href="/info/91045">эстрогенным рецептором</a>-белком с <a href="/info/128926">коэффициентом седиментации</a> 48. Далее эстро-ген-<a href="/info/292453">рецепторный комплекс</a> превращается в активную 58-форму и в <a href="/info/1768817">качестве вторичного</a> посредника проникает в ядро, где, взаимодействуя со специфическими участками хроматина, вызывает <a href="/info/1386118">транскрипцию определенных</a> генов с образованием соответствующих мРНК. Последние выходят из ядра и используются в <a href="/info/1321278">качестве матриц</a> <a href="/info/91070">белкового синтеза</a> на рибосомах. В результате синтезируется ряд белков, характерных для яйцеводов в стимулированном состоянии, например овальбумин.
    ДО 2,0 М (в присутствии 0,1 М р-меркаптоэтанола при pH 6,3 и температуре 20 °С) коэффициент седиментации АТФ-креа-тинтрансфосфорилазы, 5 изменялся от 5,1 до 1,9 5. При концентрации гуанидингидрохлорида 0,25 М и ниже ( о, что характерно для ассоциированной формы молекулы нативный фермент имеет коэффициент седиментации 5° , = 5,3 5), а также выше 2,0 М в растворе имеется только по одному компоненту (полностью ассоциированная и полностью диссоциирован- ная, 1,4 5, формы молекулы соответственно). В промежуточном диапазоне концентраций система, кроме того, проявляла тенденцию к образованию агрегатов с коэффициентами седиментации вблизи 20 5 [148]. [c.425]

    Существование молекул ДНК в циклической форме было впервые обнаружено при электронно-микроскопических исследованиях. Ковалентный характер связи в упомянутых выше соединениях доказывается неспособностью их подвергаться гидролизу под действием экзонуклеаз (см. стр. 67) даже в присутствии фосфомоноэстеразы. Появление единичных разрывов в полинуклеотидной цепи циклических ДНК под действием эндодезоксирибонуклеаз приводит к характерным изменениям конформации молекул (см. гл. 4), которые могут быть обнаружены по изменению коэффициента седиментации, вязкости и при наблюдении под электронным микроскопом, причем измеренная длина молекул, а следовательно, и молекулярный вес при этом не изменяются. [c.48]

    Доказательства существования таких ДНК были рассмотрены в гл. 1 (см. стр. 48). Эти молекулы отличаются от линейных и не-ковалентно-замкнутых циклических ДНК значительно более высоким коэффициентом седиментации 2. Так, например, репликативная форма ДНК фага ФХ174, обладающая ковалентно-замкнутой структурой "2, имеет коэффициент седиментации г 2 М ЫаС при нейтральных значениях pH, равный 21 5, тогда как эта же ДНК, но с разрывами в одной из цепей имеет коэффициент седи- [c.256]

    В том случае, когда уже в исходной молекуле а > р, молекула ДНК не будет превращаться под действием этидийбромида в исходную плоскую форму, закручиваясь сильнее по мере увеличения количества внедрившегося в нее красителя. Есть данные, что по мере увеличения количества внедрившегося красителя коэффициент седиментации циклических ДНК сначала убывает, а затем, пройдя через минимум, начинает возрастать, стремясь в пределе к постоянному значению [c.260]

    При дальнейшем подщелачиванш ДНК Г продолжается раскручивание двойной спирали Уотсона — Крика, однако в отличие от линейной и нековалентно-замкнутой ДНК этот процесс происходит без разделения цепей, что понижает энтропию денатурированного состояния и, следовательно, делает денатурацию менее выгодной (чем в случае линейной и нековалентно-замкнутой ДНК). Конечным итогом денатурации является образование плотного клубка с высоким коэффициентом седиментации (IV на рис. 4.19). Если в такой денатурированной молекуле провести разрыв в одной из цепей, то возникают циклическая одноцепочечная ДНК с коэффициентом седиментации 18S (V на рис. 4.19) и линейная одноцепочечная ДНК с коэффициентом седиментации 16S (VI). Формы V и VI получаются также при щелочной денатурации ДНК П. [c.270]

    Дальнейшие подтверждения такого вывода были найдены при изучении процесса тепловой денатурации тРНК. Если среда не содержит ионов магния, то в момент, когда оптическая плотность раствора тРНК меняется еще незначительно, гидродинамические характеристики молекулы (такие, как характеристическая вязкость и коэффициент седиментации) претерпевают существенное изменение (рис. 4.24). Поскольку оптические свойства в основном определяются межплоскостными взаимодействиями между основаниями (и парами оснований) цепи, а гидродинамические — объемом и формой молекулы, эти результаты означают, что при малом изменении степени мел -плоскостных взаимодействий (т. е. вторичной структуры молекулы) происходят значительные изменения в пространственном расположении отдельных частей молекулы тРНК, т. е. в ее третичной структуре. [c.295]

    В седиментационном анализе можно проводить два типа экспериментов. При анализе методом скоростной седиментации проводят определения скорости оседания и диффузии частиц при бioльшиx скоростях вращения ротора, тогда как при анализе методом седиментационного равновесия выжидают установления равновесия между процессами седиментации и диффузии в процессе центрифугирования при меньших скоростях вращения ротора. Теоретически неоднородность распределения по молекулярным весам в образце можно охарактеризовать с помощью обоих указанных методов, получая методом скоростной седиментации распределение по коэффициентам седиментации, а методом седиментационного равновесия — распределение по молекулярным весам. Распределение по молекулярным весам легче интерпретировать хими-ку-полимерщику, не имеющему специальной подготовки. Было показано, что детализированный характер распределения по коэффициентам седиментации можно получить методом скоростной седиментации в отсутствие дополнительных предположений о форме кривой распределения. Такие дополнительные предположения, как правило, необходимы при анализе методом седиментационного равновесия. Скоростное ультрацентрифугирование приобрело, следовательно, наиболее широкое распространение при исследовании неоднородности распределения но молекулярным весам полученные этим методом данные обычно комбинируют с результатами других измерений, преобразуя кривую распределения по коэффициентам седиментации в кривую распределения по мол екулярным весам, в ряде случаев более подходящую для целей исследования. Метод седиментационного равновесия применяется в основном в качестве способа определения абсолютных величин средних молекулярных весов, но применение этого метода для растворов в смешанных растворителях ультрацентрифугирование в градиенте плотности), как недавно было показано, позволяет оценить распределение полимера по плотности. [c.216]

    Расчет коэффициентов седиментации по данным экспериментов более общего характера, проведенных методом скоростной седиментации, с учетом диффузии требует более сложного решения уравнения Ламма. Первое решение полного уравнения Ламма было предлон<ено Факсепом [13]. Такое решение представляло собой первое приближение и имело ограниченную применимость для практических целей, и все же оно послун ило основой для проведения седиментационного анализа на ранних этапах развития метода ультрацентрифугирования. Расчет, проведенный с помощью уравнения Факсена в предположении независимости от концентрации как седиментации, так и диффузии, показал, что при седиментации растворенного вещества одного типа (в отличие от седиментации в отсутствие диффузии с резкой ступенчатой границей) образуется размытая граница примерно гауссовой формы. Образование подобной диффузной границы седиментации не зависело от положения самой границы и от концентрации впереди границы седиментации. Метод расчета Факсена свидетельствует о том, что путем исследования методом скоростной седиментации формы диффузной границы седиментации можно определить коэффициент диффузии. Для градиентной кривой, полученной Факсе-ном в результате решения уравнения Ламма, отношение площади к высоте А1Н) можно записать в виде [c.225]

    Метод использования x yi" не зависит от формы седиментационной кривой и от типа зависимости 5 (С). При использовании абсциссы максимума седиментационной кривой вместо (или х)) получается [31 ] кажущийся коэффициент седиментации 5, отличающийся от истинного 5 5 = 5 4- (D/ o xo). Эта поправка может быть существенной для низкомолекулярных и широких образцов. Если седиментационная кривая симметрична относительно максимума х, т. е. x ,ax = х), использование лгщах или приводит К совпздающим (в пределах погрешности определения) результатам. Поэтому на практике очень часто для таких кривых в качестве х используют Определяемый коэффициент седиментации соответствует концентрации в области плато, а не локальной концентрации при х = (х ) / . [c.18]

    При концентрационно зависимой седиментации полидисперсного полимера из-за характера зависимости 5 (С) наблюдается замедление седиментации легких компонентов в области седиментации тяжелых, что приводит к увеличению относительной концентрации легких частиц в области седиментационной границы (так называемый эффект Джонстона—Огстона). Наиболее ярко эта разновидность эффекта автосжатия проявляется в эксперименте с двумя полимерными компонентами, достаточно различающимися по коэффициентам седиментации, когда образование отрицательного градиента концентрации медленного компонента в области седиментационной границы быстрого приводит к наблюдаемому уменьшению площади (под быстро седиментирующим пиком). Последнее более значительно, нежели то, которое обусловлено только секториальным разбавлением [2, 221 ]. При седиментации полимолекул яр ного вещества с непрерывным ММР эффект приводит к обогащению смеси легкими компонентами и получению искаженного ММР [222 ], причем эффект не исчезает и в 9-условиях [223]. Исключение влияния эффекта Джонстона—Огстона на форму седиментационной кривой экстраполяцией экспериментальных данных к С = О является наиболее надежным, но весьма трудоемким. [c.116]

    В первой главе мы установили, ч о в центробежном поле сила, действующая на частицу, и скорость ее передвижения пропорциональны. Эти величины связываются между собой с помощью коэффициента трения (т. е. сила = / X скорость). Существует ряд математических подходов, позволяющих связать величину коэффициента трения с формой и размерами частицы. Для простого случая сферических частиц мы уже приводили уравнение Стокса (1.2). Уравнение (1.9) дает возможность определять коэффициент трения с помощью данных, полученных на аналитической ультрацентрифуге. Анализ этого уравнения показывает, что скорость седиментации зависит от массы частицы (а следовательно, и от ее объема) и от коэффициента трения, который в свою очередь зависит от формы частицы. Существуют приближенные зависимости между величиной коэффициента трения, формой, массой частицы и ее седиментационными свойствами, хотя они и не имеют достаточно строгого теоретического обоснования. В частности, недостаточно строго учитывается влияние растворителя на частицу. Эти зависимости позволяют получать лищь полуколиче-ственные результаты. [c.131]

    Следовательно, при известном значении М знание величины S дает возможность определить коэффициент трения. Это уравнение позволяет получать такую же информацию о форме частиц, как и при использовании характеристической вязкости. Однако, как указывает Тенфорд [2], измерения коэффициента седиментации, хотя и более простые, чем измерения характеристической вязкости, дают менее точные сведения. Действи- [c.132]

    Дальнейшее усложнение состоит в том, что на величины площадей под пиками оказывает влияние концентрационная зависимость коэффициентов седиментации компонентов смеси (эффект Джонстона — Огстона), а при наличии обратимого взаимодействия между макромолекулами, сказывающегося на площадях и формах пиков, также величины 5 (теория Джилберта). [c.152]

    Первые роторы Андерсона были двух типов А и В. Ротор типа А имеет большой радиус и малую высоту, в то время как ротор типа В по форме ближе к ротору, изображенному на фиг. 40. Ротор типа А служил для фракционирования крупных частиц, таких, как целые клетки, при 6000 об/мин, а ротор типа В вращался со скоростью 40 ООО об/мин и пременялся для фракционирования частиц с коэффициентами седиментации свыше 10S. К настоящему времени сконструировано много вариантов ротора Андерсона, в том числе титановых роторов, выдерживающих большие скорости вращения. [c.187]

    Экспериментально это показали Кроуфорд и Уоринг (фиг. 46). Переход из суперспирализованной в простую кольцевую форму и последующий переход в суперспираль, закрученную в противоположном направлении (наблюдаемый по мере увеличения концентрации вклинивающихся молекул) хорошо прослеживаются по различиям в скорости седиментации. Движение границ седиментации в этой работе наблюдали при помощи абсорбционной оптики, оценивая затем по седиментационным диаграммам относительные количества разных форм в растворе. На фиг. 46 показан результат вклинивания молекул красителя в кольцевые молекулы ДНК, имеющие в одной из двух цепей разрыв. Происходящее в результате простое увеличение периметра кольцевой молекулы приводит к относительно медленному уменьшению коэффициента седиментации. [c.214]

    Молекулярная масса углевод-белковых полимеров является величиной усредненной, учитывающей полидисперсность полимеров. Уже на стадии выделения, очистки и определения гомогенности этих биополимеров можно приблизительно оценить их свойства и молекулярную массу. Предварительное определение вязкости веществ и содержания в них сиаловых кислот позволяет выбрать те или иные пути дальнейшего исследования. Молекулярная масса углевод-белковых полимеров может быть рассчитана на основании гидродинамических данных, коэффициентов седиментации, диффузии, характеристической вязкости. Молекулярная масса и форма молекул могут быть вычислены по данным све- [c.75]

    Очень чувствительным тестом на монодисперсность является разработанная недавно методика [43, 44], в какой-то мере аналогичная электрофоретической методике Хоха [25]. Для системы, в которой происходит как обострение границы, вызванное изменением коэффициента седиментации с концентрацией, так и диффузия, можно найти условия, при которых оба эти эффекта равны и противоположны. В этих условиях граница принимает такую форму, что все точки с определенной концентрацией фракций имеют одинаковые коэффициенты седиментации. Это может происходить только при одной определенной скорости ротора. Из-за радиального разбавления приходится несколько усложнить измерения, чтобы установить, что описанные выше условия достигнуты из предварительных экспериментов необходимо знать как коэффициент диффузии, так и истинную зависимость от с. Максимальная высота кривой градиента концентрации, расстояние от оси вращения и угловая скорость ротора при этих условиях могут быть связаны с О — кажущимся коэффициентом диффузии. О учитывает факторы рас-1иирения границы как за счет диффузии, так и за счет нолидиснерсности. Если полидисперсность отсутствует, равно — коэффициенту диф- [c.49]

    Уравнение, предложенное Фудзита [45], описывает форму границы раздела монодисперсного раствора в ультрацентрифуге в том случае, когда коэффициент диффузии не зависит от концентрации, а коэффициент седиментации находится от нее в линейной зависимости. Это уравнение можно использовать и, оно действительно было применено [46] для определения примерно аналогичным способом кажущегося коэффициента диффузии для сравнения с наблюдаемым коэффициентом. Это также является чувствительным критерием монодисперсности, хотя следует иметь в виду, что используемое уравнение выведено в предположении, что изменения коэффициента седиментации в зависимости от концентрации малы. [c.50]

    Большая часть литературы по этому вопросу посвящена нативным белкам. Эти соединения характеризуются наличием вторичной и третичной структуры, которая, за немногими исключениями, достаточно устойчива и компактна. Многие гликонротеины, сходные с простыми белками и содержащие относительно мало углеводов (такие, как овальбумин и у-гло-булин), с точки зрения исследования физико-химическими методами могут рассматриваться как белки. Исследование многих более распространенных гликонротеинов, в которых гетерополисахаридный компонент составляет большую, часто превалирующую часть молекулы, представляет некоторые трудности. Тем не менее для гликонротеинов этого типа без каких-либо предположений о форме молекулы и изменений в теоретической обработке был определен молекулярный вес, хотя на практике в растворах таких гликонротеинов, даже нри большом разбавлении, сохраняется значительное межмолекулярное взаимодействие, что делает экстраполяцию менее надежной. Серьезные трудности могут возникать также и при обычном определении нолидиснерсности таких гликопротеинов по молекулярным весам. Более того, необходимо также но возможности охарактеризовать распределение по молекулярным весам или коэффициентам седиментации. При использовании в качестве одного из первичных параметров величины характеристиче- [c.55]

    Сейчас можно по анализу формы кривой подвижной границы в ультрацентрифуге получить данные о степени полидисперспости по коэффициентам седиментации и описать их распределение. Это может быть достигнуто путем улучшенной регистрации границы в результате введения фазовой пластинки и точного установления положения базальной линии благодаря использованию двухсекторной ячейки. Эти два фактора позволяют определить йс/йг и, после интегрирования, с как функцию от г в зоне границы, причем точность будет достаточно высока для того, чтобы стало возможным применение недавно разработанной теории, связывающей эти параметры с распределением коэффициентов седиментации. Математически эта теория сложна [91, 118], и для ее использования требуется много точных измерений, расчетов и экстраполяций. Наблюдаемая градиентная кривая может быть пересчитана в кривую, описывающую функцию распределения коэффициентов седиментации (я), путем введения поправок к каждой точке наблюдаемой кривой, как это описано Зингером и Гроссом [119]. Последующая экстра- [c.60]

    Коэффициенты диффузии. Коэффициенты диффузии почти всех биологических макромолекулярных препаратов были определены методом свободной диффузии, при котором наблюдают изменение во времени формы первоначально резкой границы между раствором и чистым растворителем. При этом используют шлирен- или интерференционную оптические системы. Исчерпывающее квалифицированное изложение этого вопроса содержится в обзоре Гостинга [53]. Две доступные интерферометрические системы (Гои [126—128] и Релея [129—132]) обеспечивают высокую степень прецизионности. Шлирен-оптика также дает точность, достаточную для многих целей. При изучении более вязких гликонротеинов основная практическая трудность состоит в создании хорошей первоначальной границы при соблюдении этого условия нет необходимости в очень высокой точности измерений. Эта трудность в известной степени может иметь место при применении для измерения диффузии ячейки ультрацентрифуги для искусственного образования границы. Очень резкие и симметричные границы позволяют проводить определения при малом расходовании изучаемого вещества. Ультрацентрифуга нри подобных экспериментах должна работать на низких скоростях вращения ротора, чтобы не происходило перераспределение компонентов полидисперсной смеси [133] и не было обострения границы за счет седиментации. Если благодаря высокому коэффициенту седиментации это невозможно, тогда Т) можно определить при различных скоростях вращения ротора и экстраполировать полученные данные к нулевой скорости вращения ротора [134]. [c.61]

    Оиределеннг,[о указания на форму молекулы дает также изменение коэффициента седиментации с концентрацией. Количественное соотногиенпе, [c.83]


Смотреть страницы где упоминается термин Коэффициент седиментации ДНК формы: [c.53]    [c.54]    [c.564]    [c.567]    [c.201]    [c.16]    [c.218]    [c.58]    [c.407]    [c.280]    [c.278]    [c.119]    [c.74]    [c.91]   
Биофизическая химия Т.3 (1985) -- [ c.166 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Коэффициент седиментации

Седиментация

Седиментация седиментации

Седиментация формы



© 2025 chem21.info Реклама на сайте